MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021026	CTG	2	6	865704	865709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534752
14002	NC_021026	GTT	2	6	865751	865756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534752
14003	NC_021026	TAT	2	6	865804	865809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534752
14004	NC_021026	ATG	2	6	865968	865973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534752
14005	NC_021026	AGC	2	6	865981	865986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534752
14006	NC_021026	AGA	2	6	866065	866070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534752
14007	NC_021026	CAG	2	6	866178	866183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534752
14008	NC_021026	ACA	2	6	866225	866230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534752
14009	NC_021026	G	6	6	866251	866256	0 %	0 %	100 %	0 %	480534752
14010	NC_021026	CTGG	2	8	866291	866298	0 %	25 %	50 %	25 %	480534752
14011	NC_021026	TGCC	2	8	866344	866351	0 %	25 %	25 %	50 %	480534752
14012	NC_021026	CAT	2	6	866356	866361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534752
14013	NC_021026	GAA	2	6	866408	866413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534752
14014	NC_021026	GAA	2	6	866547	866552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534753
14015	NC_021026	ATTT	2	8	866559	866566	25 %	75 %	0 %	0 %	480534753
14016	NC_021026	T	7	7	866564	866570	0 %	100 %	0 %	0 %	480534753
14017	NC_021026	AGA	2	6	866649	866654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534753
14018	NC_021026	AGC	2	6	866664	866669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534753
14019	NC_021026	TA	3	6	866710	866715	50 %	50 %	0 %	0 %	480534753
14020	NC_021026	AATG	2	8	866740	866747	50 %	25 %	25 %	0 %	480534753
14021	NC_021026	GAC	2	6	866761	866766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534753
14022	NC_021026	TGG	2	6	866784	866789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534753
14023	NC_021026	AGA	2	6	866814	866819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534753
14024	NC_021026	TAT	2	6	866833	866838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534753
14025	NC_021026	AGA	2	6	866916	866921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534753
14026	NC_021026	AGAA	2	8	866984	866991	75 %	0 %	25 %	0 %	480534753
14027	NC_021026	TAT	2	6	867016	867021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534753
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14029	NC_021026	GTG	2	6	867083	867088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534753
14030	NC_021026	ACAA	2	8	867116	867123	75 %	0 %	0 %	25 %	480534753
14031	NC_021026	TAT	3	9	867196	867204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534753
14032	NC_021026	TGG	2	6	867213	867218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534753
14033	NC_021026	AATG	2	8	867232	867239	50 %	25 %	25 %	0 %	480534753
14034	NC_021026	TAC	2	6	867331	867336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534753
14035	NC_021026	AATG	2	8	867364	867371	50 %	25 %	25 %	0 %	480534753
14036	NC_021026	TAC	2	6	867463	867468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534753
14037	NC_021026	GGT	2	6	867478	867483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534753
14038	NC_021026	AATG	2	8	867496	867503	50 %	25 %	25 %	0 %	480534753
14039	NC_021026	TAC	2	6	867595	867600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534753
14040	NC_021026	TGG	2	6	867609	867614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534753
14041	NC_021026	GGA	2	6	867676	867681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534753
14042	NC_021026	TGC	2	6	867699	867704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534753
14043	NC_021026	AGT	2	6	867714	867719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534753
14044	NC_021026	TA	3	6	867766	867771	50 %	50 %	0 %	0 %	480534753
14045	NC_021026	TGA	2	6	867813	867818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534753
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14047	NC_021026	TTA	2	6	867909	867914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534753
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14050	NC_021026	GAA	2	6	868102	868107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534753
14051	NC_021026	GAA	2	6	868183	868188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534753
14052	NC_021026	GAA	2	6	868247	868252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534753
14053	NC_021026	AAT	2	6	868273	868278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534753
14054	NC_021026	TGA	2	6	868332	868337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534753
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14056	NC_021026	A	6	6	868466	868471	100 %	0 %	0 %	0 %	480534753
14057	NC_021026	TGA	3	9	868481	868489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534753
14058	NC_021026	T	6	6	868588	868593	0 %	100 %	0 %	0 %	480534754
14059	NC_021026	T	7	7	868605	868611	0 %	100 %	0 %	0 %	480534754
14060	NC_021026	CCA	2	6	868670	868675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534754
14061	NC_021026	T	6	6	868690	868695	0 %	100 %	0 %	0 %	480534754
14062	NC_021026	GA	3	6	868740	868745	50 %	0 %	50 %	0 %	480534754
14063	NC_021026	CTG	2	6	868761	868766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534754
14064	NC_021026	GTCT	2	8	868768	868775	0 %	50 %	25 %	25 %	480534754
14065	NC_021026	ACA	2	6	868811	868816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534754
14066	NC_021026	TCC	2	6	868853	868858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534754
14067	NC_021026	GAT	2	6	868915	868920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534754
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14069	NC_021026	TCT	2	6	868984	868989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534754
14070	NC_021026	TTC	2	6	869014	869019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534754
14071	NC_021026	TCCAG	2	10	869039	869048	20 %	20 %	20 %	40 %	480534754
14072	NC_021026	TCAA	2	8	869105	869112	50 %	25 %	0 %	25 %	480534754
14073	NC_021026	CTT	2	6	869133	869138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534754
14074	NC_021026	GGTT	2	8	869216	869223	0 %	50 %	50 %	0 %	480534754
14075	NC_021026	TAG	2	6	869228	869233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534754
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14078	NC_021026	TGTC	2	8	869322	869329	0 %	50 %	25 %	25 %	480534754
14079	NC_021026	T	6	6	869350	869355	0 %	100 %	0 %	0 %	480534754
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14087	NC_021026	GA	3	6	869725	869730	50 %	0 %	50 %	0 %	480534754
14088	NC_021026	TGC	2	6	870114	870119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534754
14089	NC_021026	TGAT	2	8	870152	870159	25 %	50 %	25 %	0 %	480534754
14090	NC_021026	TTCGC	2	10	870184	870193	0 %	40 %	20 %	40 %	480534754
14091	NC_021026	A	8	8	870215	870222	100 %	0 %	0 %	0 %	480534754
14092	NC_021026	CAA	2	6	870393	870398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534755
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14100	NC_021026	AAG	2	6	870799	870804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534755
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14102	NC_021026	GGTTTT	2	12	870967	870978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534756
14103	NC_021026	CGAAT	2	10	870988	870997	40 %	20 %	20 %	20 %	480534756
14104	NC_021026	TGG	2	6	871025	871030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534756
14105	NC_021026	TGG	2	6	871067	871072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534756
14106	NC_021026	GGC	2	6	871125	871130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534756
14107	NC_021026	TAT	2	6	871205	871210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534756
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14109	NC_021026	AC	3	6	871407	871412	50 %	0 %	0 %	50 %	480534757
14110	NC_021026	CTG	2	6	871509	871514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534757
14111	NC_021026	TGG	2	6	871584	871589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534757
14112	NC_021026	TCCA	2	8	871608	871615	25 %	25 %	0 %	50 %	480534757
14113	NC_021026	TGA	2	6	871636	871641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534757
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14115	NC_021026	AGAC	2	8	871896	871903	50 %	0 %	25 %	25 %	480534757
14116	NC_021026	CAT	2	6	871924	871929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534757
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14120	NC_021026	AGA	2	6	872241	872246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534758
14121	NC_021026	GAT	2	6	872275	872280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534758
14122	NC_021026	CGT	2	6	872342	872347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534758
14123	NC_021026	GACA	2	8	872371	872378	50 %	0 %	25 %	25 %	480534758
14124	NC_021026	TAT	2	6	872420	872425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534758
14125	NC_021026	TTC	2	6	872462	872467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534758
14126	NC_021026	A	6	6	872567	872572	100 %	0 %	0 %	0 %	480534758
14127	NC_021026	AGACC	2	10	872665	872674	40 %	0 %	20 %	40 %	480534758
14128	NC_021026	CAG	2	6	872760	872765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534758
14129	NC_021026	AAG	2	6	872766	872771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534758
14130	NC_021026	GACCA	2	10	872786	872795	40 %	0 %	20 %	40 %	480534758
14131	NC_021026	CCA	2	6	872832	872837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534758
14132	NC_021026	TCA	2	6	872887	872892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534758
14133	NC_021026	CAT	2	6	872935	872940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534758
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14135	NC_021026	TGA	2	6	873002	873007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534758
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14140	NC_021026	CTAG	2	8	873211	873218	25 %	25 %	25 %	25 %	480534759
14141	NC_021026	GA	3	6	873300	873305	50 %	0 %	50 %	0 %	480534759
14142	NC_021026	CAGA	2	8	873316	873323	50 %	0 %	25 %	25 %	480534759
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14145	NC_021026	A	7	7	873497	873503	100 %	0 %	0 %	0 %	480534759
14146	NC_021026	GCCA	2	8	873514	873521	25 %	0 %	25 %	50 %	480534759
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14150	NC_021026	GAGG	2	8	873580	873587	25 %	0 %	75 %	0 %	480534759
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14152	NC_021026	TCTT	2	8	873906	873913	0 %	75 %	0 %	25 %	480534760
14153	NC_021026	TGG	2	6	874057	874062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534760
14154	NC_021026	CAA	2	6	874110	874115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534760
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14157	NC_021026	TCT	2	6	874252	874257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534760
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14174	NC_021026	GAA	2	6	875385	875390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534763
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14184	NC_021026	CAAG	2	8	875800	875807	50 %	0 %	25 %	25 %	480534763
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14224	NC_021026	CG	3	6	877986	877991	0 %	0 %	50 %	50 %	480534764
14225	NC_021026	TGA	2	6	877994	877999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534764
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14227	NC_021026	ATTGA	2	10	878170	878179	40 %	40 %	20 %	0 %	480534765
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14232	NC_021026	TTCA	2	8	878354	878361	25 %	50 %	0 %	25 %	480534765
14233	NC_021026	GTT	2	6	878605	878610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534765
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14480	NC_021026	ATG	2	6	893253	893258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534780
14481	NC_021026	TGC	2	6	893279	893284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534780
14482	NC_021026	TGT	2	6	893330	893335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534780
14483	NC_021026	ATG	2	6	893353	893358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534780
14484	NC_021026	TCA	2	6	893377	893382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534780
14485	NC_021026	GAT	2	6	893565	893570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534780
14486	NC_021026	AAG	2	6	893605	893610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534780
14487	NC_021026	A	6	6	893637	893642	100 %	0 %	0 %	0 %	480534780
14488	NC_021026	CA	3	6	894722	894727	50 %	0 %	0 %	50 %	480534781
14489	NC_021026	TCC	2	6	894841	894846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534781
14490	NC_021026	AAAC	2	8	895039	895046	75 %	0 %	0 %	25 %	480534782
14491	NC_021026	CCT	2	6	895085	895090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534782
14492	NC_021026	AAGA	2	8	895122	895129	75 %	0 %	25 %	0 %	480534782
14493	NC_021026	A	6	6	895200	895205	100 %	0 %	0 %	0 %	480534782
14494	NC_021026	AGA	2	6	895256	895261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534782
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14497	NC_021026	T	7	7	895613	895619	0 %	100 %	0 %	0 %	480534783
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14499	NC_021026	TTTG	2	8	895696	895703	0 %	75 %	25 %	0 %	480534783
14500	NC_021026	TC	4	8	895758	895765	0 %	50 %	0 %	50 %	480534783

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