MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021026	GAA	2	6	639413	639418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534553
10503	NC_021026	CCAA	2	8	639427	639434	50 %	0 %	0 %	50 %	480534553
10504	NC_021026	AAGCTA	2	12	639600	639611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480534553
10505	NC_021026	TGA	3	9	639622	639630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534553
10506	NC_021026	CCA	2	6	639680	639685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534553
10507	NC_021026	GGT	2	6	639689	639694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534553
10508	NC_021026	CTC	2	6	639725	639730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534553
10509	NC_021026	ACA	2	6	639737	639742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534553
10510	NC_021026	CAA	2	6	639768	639773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534553
10511	NC_021026	AAAT	2	8	639776	639783	75 %	25 %	0 %	0 %	480534553
10512	NC_021026	TCA	2	6	640446	640451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534554
10513	NC_021026	CAA	2	6	640478	640483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534554
10514	NC_021026	AGC	2	6	640495	640500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534554
10515	NC_021026	AG	3	6	640544	640549	50 %	0 %	50 %	0 %	480534554
10516	NC_021026	GTG	2	6	640719	640724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534554
10517	NC_021026	C	6	6	640806	640811	0 %	0 %	0 %	100 %	480534554
10518	NC_021026	CAT	2	6	640858	640863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534554
10519	NC_021026	G	6	6	640922	640927	0 %	0 %	100 %	0 %	480534554
10520	NC_021026	TTG	2	6	640980	640985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534554
10521	NC_021026	AAC	2	6	641043	641048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534554
10522	NC_021026	TGC	2	6	641146	641151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534554
10523	NC_021026	AACC	2	8	641173	641180	50 %	0 %	0 %	50 %	480534554
10524	NC_021026	GGT	2	6	641183	641188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534554
10525	NC_021026	AAG	2	6	641229	641234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534554
10526	NC_021026	TCG	2	6	641284	641289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534554
10527	NC_021026	TTAT	2	8	641352	641359	25 %	75 %	0 %	0 %	480534554
10528	NC_021026	GGT	2	6	641372	641377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534554
10529	NC_021026	CAACC	2	10	641497	641506	40 %	0 %	0 %	60 %	480534554
10530	NC_021026	ATT	2	6	642146	642151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534555
10531	NC_021026	CAAT	2	8	642181	642188	50 %	25 %	0 %	25 %	480534555
10532	NC_021026	CTT	2	6	642266	642271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534555
10533	NC_021026	CTT	2	6	642278	642283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534555
10534	NC_021026	TCA	2	6	642492	642497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534555
10535	NC_021026	ATTC	2	8	642588	642595	25 %	50 %	0 %	25 %	480534555
10536	NC_021026	CTTT	2	8	642622	642629	0 %	75 %	0 %	25 %	480534555
10537	NC_021026	T	7	7	642740	642746	0 %	100 %	0 %	0 %	480534555
10538	NC_021026	ATT	2	6	643063	643068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534556
10539	NC_021026	ATG	2	6	643104	643109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534556
10540	NC_021026	A	6	6	643114	643119	100 %	0 %	0 %	0 %	480534556
10541	NC_021026	TAG	2	6	643137	643142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534556
10542	NC_021026	TGAG	2	8	643164	643171	25 %	25 %	50 %	0 %	480534556
10543	NC_021026	CAG	2	6	643176	643181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534556
10544	NC_021026	TGG	2	6	643207	643212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534556
10545	NC_021026	TAA	2	6	643218	643223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534556
10546	NC_021026	GCT	2	6	643265	643270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534556
10547	NC_021026	CAG	2	6	643299	643304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534556
10548	NC_021026	A	7	7	643342	643348	100 %	0 %	0 %	0 %	480534556
10549	NC_021026	GAT	2	6	643355	643360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534556
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10551	NC_021026	AGC	2	6	643381	643386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534556
10552	NC_021026	TAG	2	6	643419	643424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534556
10553	NC_021026	ATA	2	6	643467	643472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534556
10554	NC_021026	AGC	2	6	643489	643494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534556
10555	NC_021026	TAG	2	6	643518	643523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534556
10556	NC_021026	ATG	2	6	643589	643594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534556
10557	NC_021026	TTA	2	6	643619	643624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534556
10558	NC_021026	GTA	2	6	643631	643636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534556
10559	NC_021026	TATTT	2	10	643860	643869	20 %	80 %	0 %	0 %	480534557
10560	NC_021026	ACT	2	6	643878	643883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534557
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10562	NC_021026	TA	3	6	643900	643905	50 %	50 %	0 %	0 %	480534557
10563	NC_021026	GGT	2	6	643929	643934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534557
10564	NC_021026	AGCT	2	8	643996	644003	25 %	25 %	25 %	25 %	480534557
10565	NC_021026	A	6	6	644025	644030	100 %	0 %	0 %	0 %	480534557
10566	NC_021026	GAT	2	6	644109	644114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534557
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10568	NC_021026	AAT	2	6	644153	644158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534557
10569	NC_021026	GAA	3	9	644178	644186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534557
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10571	NC_021026	GAT	2	6	644256	644261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534557
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10573	NC_021026	TGA	2	6	644296	644301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534557
10574	NC_021026	TGG	2	6	644336	644341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534557
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10576	NC_021026	A	6	6	644431	644436	100 %	0 %	0 %	0 %	480534557
10577	NC_021026	A	6	6	645027	645032	100 %	0 %	0 %	0 %	480534558
10578	NC_021026	CTTG	2	8	645053	645060	0 %	50 %	25 %	25 %	480534558
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10590	NC_021026	AGTT	2	8	645719	645726	25 %	50 %	25 %	0 %	480534559
10591	NC_021026	GTCA	2	8	645768	645775	25 %	25 %	25 %	25 %	480534559
10592	NC_021026	TCG	2	6	645784	645789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534559
10593	NC_021026	ATC	2	6	645829	645834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534559
10594	NC_021026	GAG	2	6	645858	645863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534559
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10598	NC_021026	TTC	2	6	646420	646425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534559
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10600	NC_021026	AGTC	2	8	646541	646548	25 %	25 %	25 %	25 %	480534559
10601	NC_021026	GAG	2	6	646554	646559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534559
10602	NC_021026	GAAA	2	8	646584	646591	75 %	0 %	25 %	0 %	480534559
10603	NC_021026	GCAG	2	8	646631	646638	25 %	0 %	50 %	25 %	480534559
10604	NC_021026	GTG	2	6	646663	646668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534559
10605	NC_021026	A	6	6	646675	646680	100 %	0 %	0 %	0 %	480534559
10606	NC_021026	TTC	2	6	646681	646686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534559
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10611	NC_021026	ATT	2	6	646861	646866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534559
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10614	NC_021026	GAT	2	6	647127	647132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534560
10615	NC_021026	ACT	2	6	647162	647167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534560
10616	NC_021026	CAGTT	2	10	647171	647180	20 %	40 %	20 %	20 %	480534560
10617	NC_021026	TTCCT	2	10	647346	647355	0 %	60 %	0 %	40 %	480534560
10618	NC_021026	AAG	2	6	647384	647389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534560
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10620	NC_021026	A	7	7	647557	647563	100 %	0 %	0 %	0 %	480534560
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