MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021026	TCG	2	6	611379	611384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534521
10002	NC_021026	TTGA	2	8	611425	611432	25 %	50 %	25 %	0 %	480534521
10003	NC_021026	GAA	2	6	611440	611445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534521
10004	NC_021026	GAC	2	6	611485	611490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534521
10005	NC_021026	CAA	2	6	611570	611575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534521
10006	NC_021026	GGT	3	9	611584	611592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534521
10007	NC_021026	GT	3	6	611591	611596	0 %	50 %	50 %	0 %	480534521
10008	NC_021026	CTA	2	6	611672	611677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534521
10009	NC_021026	AGC	2	6	611721	611726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534521
10010	NC_021026	AAGG	2	8	611890	611897	50 %	0 %	50 %	0 %	480534522
10011	NC_021026	AAG	2	6	612047	612052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534522
10012	NC_021026	ACT	2	6	612116	612121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534522
10013	NC_021026	GTT	2	6	612175	612180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534522
10014	NC_021026	CGC	2	6	612238	612243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480534522
10015	NC_021026	ATT	2	6	612247	612252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534522
10016	NC_021026	GAA	2	6	612277	612282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534522
10017	NC_021026	GCT	2	6	612291	612296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534522
10018	NC_021026	ATCT	2	8	612346	612353	25 %	50 %	0 %	25 %	480534522
10019	NC_021026	TGG	2	6	612389	612394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534522
10020	NC_021026	CAC	2	6	612397	612402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534522
10021	NC_021026	GAT	3	9	612432	612440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534522
10022	NC_021026	TTC	2	6	612472	612477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534522
10023	NC_021026	TCA	2	6	612482	612487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534522
10024	NC_021026	AGA	2	6	612615	612620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534522
10025	NC_021026	TGG	2	6	612629	612634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534522
10026	NC_021026	CGA	2	6	612745	612750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534523
10027	NC_021026	GCT	2	6	612751	612756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534523
10028	NC_021026	T	6	6	612756	612761	0 %	100 %	0 %	0 %	480534523
10029	NC_021026	TTC	2	6	612768	612773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534523
10030	NC_021026	GCT	2	6	612781	612786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534523
10031	NC_021026	CTTT	2	8	612809	612816	0 %	75 %	0 %	25 %	480534523
10032	NC_021026	AAT	2	6	613031	613036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534524
10033	NC_021026	TTG	2	6	613042	613047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534524
10034	NC_021026	CTG	2	6	613054	613059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534524
10035	NC_021026	AGA	2	6	613175	613180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534524
10036	NC_021026	GCAG	2	8	613181	613188	25 %	0 %	50 %	25 %	480534524
10037	NC_021026	TCA	2	6	613196	613201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534524
10038	NC_021026	AG	3	6	613215	613220	50 %	0 %	50 %	0 %	480534524
10039	NC_021026	GGACT	2	10	613318	613327	20 %	20 %	40 %	20 %	480534524
10040	NC_021026	ACC	2	6	613354	613359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534524
10041	NC_021026	CTC	2	6	613372	613377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534524
10042	NC_021026	GAG	2	6	613380	613385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534524
10043	NC_021026	TGG	2	6	613441	613446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534524
10044	NC_021026	AGCA	2	8	613447	613454	50 %	0 %	25 %	25 %	480534524
10045	NC_021026	TCG	3	9	613478	613486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534524
10046	NC_021026	GAT	2	6	613572	613577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534524
10047	NC_021026	ACC	2	6	613606	613611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534524
10048	NC_021026	GCT	2	6	613686	613691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534524
10049	NC_021026	CGT	2	6	613779	613784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534524
10050	NC_021026	GAT	2	6	613896	613901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534524
10051	NC_021026	A	6	6	613912	613917	100 %	0 %	0 %	0 %	480534525
10052	NC_021026	GAG	2	6	613918	613923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534525
10053	NC_021026	CTG	2	6	613930	613935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534525
10054	NC_021026	GAA	2	6	613981	613986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534525
10055	NC_021026	TCG	2	6	614069	614074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534525
10056	NC_021026	TGG	2	6	614105	614110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534525
10057	NC_021026	AGA	2	6	614115	614120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534525
10058	NC_021026	ACT	2	6	614125	614130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534525
10059	NC_021026	CAA	2	6	614139	614144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534525
10060	NC_021026	TTGG	2	8	614305	614312	0 %	50 %	50 %	0 %	480534525
10061	NC_021026	CAGG	2	8	614335	614342	25 %	0 %	50 %	25 %	480534525
10062	NC_021026	CGT	2	6	614389	614394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534525
10063	NC_021026	AATCA	2	10	614404	614413	60 %	20 %	0 %	20 %	480534525
10064	NC_021026	GGT	2	6	614436	614441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534525
10065	NC_021026	GAA	2	6	614713	614718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534525
10066	NC_021026	AGCA	2	8	614719	614726	50 %	0 %	25 %	25 %	480534525
10067	NC_021026	GAG	2	6	614773	614778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534525
10068	NC_021026	A	6	6	614783	614788	100 %	0 %	0 %	0 %	480534525
10069	NC_021026	TC	3	6	614793	614798	0 %	50 %	0 %	50 %	480534525
10070	NC_021026	CAT	2	6	614799	614804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534525
10071	NC_021026	TAA	2	6	614847	614852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534525
10072	NC_021026	TGG	2	6	614861	614866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534525
10073	NC_021026	ATT	2	6	614943	614948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534525
10074	NC_021026	AG	3	6	615027	615032	50 %	0 %	50 %	0 %	480534525
10075	NC_021026	GAA	2	6	615046	615051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534525
10076	NC_021026	AAAT	2	8	615102	615109	75 %	25 %	0 %	0 %	480534525
10077	NC_021026	AGA	2	6	615117	615122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534525
10078	NC_021026	TTA	2	6	615237	615242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534526
10079	NC_021026	GTT	2	6	615257	615262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534526
10080	NC_021026	A	7	7	615290	615296	100 %	0 %	0 %	0 %	480534526
10081	NC_021026	ATT	2	6	615315	615320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534526
10082	NC_021026	TCAG	2	8	615330	615337	25 %	25 %	25 %	25 %	480534526
10083	NC_021026	TCTG	2	8	615403	615410	0 %	50 %	25 %	25 %	480534526
10084	NC_021026	GAG	2	6	615470	615475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534526
10085	NC_021026	AAG	2	6	615678	615683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534526
10086	NC_021026	CTG	2	6	615684	615689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534526
10087	NC_021026	TA	3	6	615738	615743	50 %	50 %	0 %	0 %	480534526
10088	NC_021026	ATTA	2	8	615747	615754	50 %	50 %	0 %	0 %	480534526
10089	NC_021026	TTA	2	6	615944	615949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534527
10090	NC_021026	CAGA	2	8	616024	616031	50 %	0 %	25 %	25 %	480534527
10091	NC_021026	GT	3	6	616085	616090	0 %	50 %	50 %	0 %	480534527
10092	NC_021026	CATT	2	8	616113	616120	25 %	50 %	0 %	25 %	480534527
10093	NC_021026	GCT	2	6	616273	616278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534527
10094	NC_021026	GCA	2	6	616357	616362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534527
10095	NC_021026	TGA	2	6	616491	616496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534527
10096	NC_021026	A	6	6	616496	616501	100 %	0 %	0 %	0 %	480534527
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10100	NC_021026	CTA	2	6	616720	616725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534528
10101	NC_021026	GGT	2	6	616746	616751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534528
10102	NC_021026	CTTG	2	8	616796	616803	0 %	50 %	25 %	25 %	480534528
10103	NC_021026	ATT	2	6	616840	616845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534528
10104	NC_021026	ATTG	2	8	616856	616863	25 %	50 %	25 %	0 %	480534528
10105	NC_021026	CGA	2	6	616877	616882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534528
10106	NC_021026	AAC	2	6	616947	616952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534528
10107	NC_021026	TGA	2	6	617035	617040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534528
10108	NC_021026	AGC	2	6	617076	617081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534528
10109	NC_021026	ATC	2	6	617091	617096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534528
10110	NC_021026	AGTCT	2	10	617134	617143	20 %	40 %	20 %	20 %	480534528
10111	NC_021026	ACA	2	6	617223	617228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534528
10112	NC_021026	T	6	6	617256	617261	0 %	100 %	0 %	0 %	480534528
10113	NC_021026	TTG	2	6	617388	617393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534528
10114	NC_021026	CT	3	6	617416	617421	0 %	50 %	0 %	50 %	480534528
10115	NC_021026	AGCT	2	8	617428	617435	25 %	25 %	25 %	25 %	480534528
10116	NC_021026	CTT	2	6	617542	617547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534529
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10118	NC_021026	TCA	2	6	617628	617633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534529
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10120	NC_021026	TCTT	2	8	617874	617881	0 %	75 %	0 %	25 %	480534529
10121	NC_021026	TGG	2	6	617934	617939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534529
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10125	NC_021026	TCC	2	6	618195	618200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534529
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10233	NC_021026	GTTT	2	8	624669	624676	0 %	75 %	25 %	0 %	480534537
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10484	NC_021026	CA	3	6	638701	638706	50 %	0 %	0 %	50 %	480534553
10485	NC_021026	CTTGA	2	10	638786	638795	20 %	40 %	20 %	20 %	480534553
10486	NC_021026	ATC	2	6	638840	638845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534553
10487	NC_021026	CGT	2	6	638855	638860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534553
10488	NC_021026	TTC	2	6	638901	638906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534553
10489	NC_021026	GGT	2	6	638918	638923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534553
10490	NC_021026	GCT	2	6	638924	638929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534553
10491	NC_021026	CACC	2	8	638944	638951	25 %	0 %	0 %	75 %	480534553
10492	NC_021026	GTGG	2	8	639017	639024	0 %	25 %	75 %	0 %	480534553
10493	NC_021026	CAT	2	6	639139	639144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534553
10494	NC_021026	GCT	2	6	639173	639178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534553
10495	NC_021026	TGG	2	6	639258	639263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534553
10496	NC_021026	GAA	2	6	639314	639319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534553
10497	NC_021026	GCT	2	6	639332	639337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534553
10498	NC_021026	GAA	2	6	639340	639345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534553
10499	NC_021026	ACACT	2	10	639361	639370	40 %	20 %	0 %	40 %	480534553
10500	NC_021026	CAT	2	6	639382	639387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534553

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