MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_021026	TTG	2	6	524046	524051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534452
8503	NC_021026	AGC	2	6	524053	524058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534452
8504	NC_021026	ATT	2	6	524216	524221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534453
8505	NC_021026	AAT	2	6	524279	524284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534453
8506	NC_021026	ACG	2	6	524303	524308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534453
8507	NC_021026	CTAA	2	8	524378	524385	50 %	25 %	0 %	25 %	480534453
8508	NC_021026	ATT	2	6	524459	524464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534453
8509	NC_021026	TTGA	2	8	524507	524514	25 %	50 %	25 %	0 %	480534453
8510	NC_021026	ATT	2	6	524546	524551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534453
8511	NC_021026	AAG	2	6	524615	524620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534453
8512	NC_021026	CTT	2	6	524659	524664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534453
8513	NC_021026	AGC	2	6	524860	524865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534453
8514	NC_021026	AAT	2	6	524942	524947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534453
8515	NC_021026	CATC	2	8	524965	524972	25 %	25 %	0 %	50 %	480534453
8516	NC_021026	ATA	2	6	525010	525015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534453
8517	NC_021026	AAGC	2	8	525767	525774	50 %	0 %	25 %	25 %	480534454
8518	NC_021026	TGT	2	6	525784	525789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534454
8519	NC_021026	CTG	2	6	525819	525824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534454
8520	NC_021026	TTC	2	6	525857	525862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534454
8521	NC_021026	GAA	2	6	525881	525886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534454
8522	NC_021026	A	6	6	525885	525890	100 %	0 %	0 %	0 %	480534454
8523	NC_021026	TGG	2	6	525913	525918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534454
8524	NC_021026	TTGA	2	8	525971	525978	25 %	50 %	25 %	0 %	480534454
8525	NC_021026	TCA	2	6	526029	526034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534454
8526	NC_021026	ATG	2	6	526050	526055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534454
8527	NC_021026	GCT	2	6	526076	526081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534454
8528	NC_021026	ATC	3	9	526172	526180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534454
8529	NC_021026	TCT	2	6	526210	526215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534454
8530	NC_021026	AGA	2	6	526282	526287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534454
8531	NC_021026	CTT	2	6	526304	526309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534454
8532	NC_021026	ATTG	2	8	526333	526340	25 %	50 %	25 %	0 %	480534454
8533	NC_021026	AAG	2	6	526347	526352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534454
8534	NC_021026	TGC	2	6	526360	526365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534454
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8537	NC_021026	GAA	2	6	526535	526540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534454
8538	NC_021026	GAA	2	6	526556	526561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534454
8539	NC_021026	TAT	2	6	526570	526575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534454
8540	NC_021026	AGA	2	6	526636	526641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534454
8541	NC_021026	GTT	2	6	526694	526699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534454
8542	NC_021026	CTTC	2	8	526702	526709	0 %	50 %	0 %	50 %	480534454
8543	NC_021026	CAC	2	6	526838	526843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534454
8544	NC_021026	GTC	2	6	526896	526901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534454
8545	NC_021026	GAA	2	6	526961	526966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534454
8546	NC_021026	TAG	2	6	526986	526991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534454
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8549	NC_021026	AAGATT	2	12	527396	527407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480534454
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8551	NC_021026	TCTA	2	8	527492	527499	25 %	50 %	0 %	25 %	480534454
8552	NC_021026	ATT	2	6	527537	527542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534454
8553	NC_021026	TGGTT	2	10	527545	527554	0 %	60 %	40 %	0 %	480534454
8554	NC_021026	TCGT	2	8	527592	527599	0 %	50 %	25 %	25 %	480534454
8555	NC_021026	TGA	2	6	527743	527748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534454
8556	NC_021026	ATG	2	6	527808	527813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534454
8557	NC_021026	TCA	2	6	527851	527856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534454
8558	NC_021026	AAGA	2	8	527873	527880	75 %	0 %	25 %	0 %	480534454
8559	NC_021026	GTG	2	6	527932	527937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534455
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8561	NC_021026	GGC	2	6	528028	528033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534455
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8563	NC_021026	CAGT	2	8	528091	528098	25 %	25 %	25 %	25 %	480534455
8564	NC_021026	GATT	2	8	528142	528149	25 %	50 %	25 %	0 %	480534455
8565	NC_021026	TCTGG	2	10	528173	528182	0 %	40 %	40 %	20 %	480534455
8566	NC_021026	GA	3	6	528189	528194	50 %	0 %	50 %	0 %	480534455
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8569	NC_021026	TGC	2	6	528358	528363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534455
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8574	NC_021026	AAG	2	6	528584	528589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534456
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8582	NC_021026	GTCA	2	8	528864	528871	25 %	25 %	25 %	25 %	480534456
8583	NC_021026	CAGA	2	8	528877	528884	50 %	0 %	25 %	25 %	480534456
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8587	NC_021026	GA	3	6	529089	529094	50 %	0 %	50 %	0 %	480534456
8588	NC_021026	GATA	2	8	529102	529109	50 %	25 %	25 %	0 %	480534456
8589	NC_021026	TA	3	6	529145	529150	50 %	50 %	0 %	0 %	480534456
8590	NC_021026	TTA	2	6	529153	529158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534456
8591	NC_021026	CAAC	2	8	529287	529294	50 %	0 %	0 %	50 %	480534456
8592	NC_021026	A	6	6	529367	529372	100 %	0 %	0 %	0 %	480534456
8593	NC_021026	GGT	2	6	529395	529400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534456
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8595	NC_021026	TCG	2	6	529671	529676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534457
8596	NC_021026	GAT	2	6	529732	529737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534457
8597	NC_021026	GAA	2	6	529759	529764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534457
8598	NC_021026	AGG	2	6	529778	529783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534457
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8601	NC_021026	GAA	2	6	530035	530040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534457
8602	NC_021026	GGT	2	6	530200	530205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534457
8603	NC_021026	CCACA	2	10	530224	530233	40 %	0 %	0 %	60 %	480534457
8604	NC_021026	ACT	2	6	530282	530287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534457
8605	NC_021026	TCT	2	6	530399	530404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534457
8606	NC_021026	GAA	2	6	530484	530489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534457
8607	NC_021026	AAC	2	6	530498	530503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534457
8608	NC_021026	AGC	2	6	530559	530564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534457
8609	NC_021026	TGC	2	6	530583	530588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534457
8610	NC_021026	ATG	2	6	530642	530647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534457
8611	NC_021026	CAAG	2	8	530655	530662	50 %	0 %	25 %	25 %	480534457
8612	NC_021026	TTG	2	6	530699	530704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534457
8613	NC_021026	CAG	2	6	530780	530785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534457
8614	NC_021026	TGAT	2	8	530859	530866	25 %	50 %	25 %	0 %	480534457
8615	NC_021026	AAG	2	6	530979	530984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534458
8616	NC_021026	AGGCTC	2	12	531006	531017	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480534458
8617	NC_021026	GGA	2	6	531037	531042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534458
8618	NC_021026	AGA	3	9	531061	531069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534458
8619	NC_021026	CA	3	6	531101	531106	50 %	0 %	0 %	50 %	480534458
8620	NC_021026	ACCA	2	8	531297	531304	50 %	0 %	0 %	50 %	480534459
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8622	NC_021026	GGA	2	6	531361	531366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534459
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8989	NC_021026	ATC	2	6	554065	554070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534477
8990	NC_021026	GAT	2	6	554071	554076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534477
8991	NC_021026	AGC	2	6	554097	554102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534477
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