MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021006	GTT	2	6	240759	240764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532371
4002	NC_021006	CTT	2	6	240783	240788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532371
4003	NC_021006	TAAG	2	8	240792	240799	50 %	25 %	25 %	0 %	480532371
4004	NC_021006	GAA	2	6	240800	240805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532371
4005	NC_021006	T	6	6	240807	240812	0 %	100 %	0 %	0 %	480532371
4006	NC_021006	TTC	2	6	240935	240940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532372
4007	NC_021006	CAT	2	6	240986	240991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532372
4008	NC_021006	CCAA	2	8	241035	241042	50 %	0 %	0 %	50 %	480532372
4009	NC_021006	CAT	2	6	241103	241108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532372
4010	NC_021006	CAC	3	9	241171	241179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532372
4011	NC_021006	GAC	2	6	241276	241281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532372
4012	NC_021006	ATA	2	6	241320	241325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532372
4013	NC_021006	CAT	2	6	241468	241473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532372
4014	NC_021006	CCA	2	6	241477	241482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532372
4015	NC_021006	GA	3	6	241496	241501	50 %	0 %	50 %	0 %	480532372
4016	NC_021006	CT	3	6	241508	241513	0 %	50 %	0 %	50 %	480532372
4017	NC_021006	TTC	2	6	241574	241579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532372
4018	NC_021006	GACA	2	8	241753	241760	50 %	0 %	25 %	25 %	480532372
4019	NC_021006	TTAG	2	8	241842	241849	25 %	50 %	25 %	0 %	480532372
4020	NC_021006	TCA	2	6	242020	242025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532373
4021	NC_021006	TAA	2	6	242117	242122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532373
4022	NC_021006	TAA	2	6	242228	242233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532373
4023	NC_021006	AAC	2	6	242256	242261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532373
4024	NC_021006	CAC	2	6	242336	242341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532373
4025	NC_021006	ATG	2	6	242350	242355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532373
4026	NC_021006	TCT	2	6	242395	242400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532373
4027	NC_021006	T	6	6	242438	242443	0 %	100 %	0 %	0 %	480532373
4028	NC_021006	ATC	2	6	242578	242583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532373
4029	NC_021006	TGAA	2	8	242915	242922	50 %	25 %	25 %	0 %	480532374
4030	NC_021006	ATT	2	6	242972	242977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532374
4031	NC_021006	CG	3	6	243004	243009	0 %	0 %	50 %	50 %	480532374
4032	NC_021006	A	6	6	243137	243142	100 %	0 %	0 %	0 %	480532374
4033	NC_021006	T	6	6	243168	243173	0 %	100 %	0 %	0 %	480532374
4034	NC_021006	CTG	2	6	243204	243209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532374
4035	NC_021006	CT	3	6	243228	243233	0 %	50 %	0 %	50 %	480532374
4036	NC_021006	T	6	6	243300	243305	0 %	100 %	0 %	0 %	480532374
4037	NC_021006	TTG	2	6	243423	243428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532374
4038	NC_021006	TGA	2	6	243441	243446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532374
4039	NC_021006	TGCCAA	2	12	243571	243582	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480532374
4040	NC_021006	T	6	6	243595	243600	0 %	100 %	0 %	0 %	480532374
4041	NC_021006	GTTA	2	8	243641	243648	25 %	50 %	25 %	0 %	480532374
4042	NC_021006	GAGT	2	8	243708	243715	25 %	25 %	50 %	0 %	480532374
4043	NC_021006	AAG	2	6	243753	243758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532374
4044	NC_021006	CTT	2	6	243799	243804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532374
4045	NC_021006	AT	3	6	243874	243879	50 %	50 %	0 %	0 %	480532374
4046	NC_021006	GGC	2	6	243884	243889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480532374
4047	NC_021006	CT	4	8	243898	243905	0 %	50 %	0 %	50 %	480532374
4048	NC_021006	TAC	2	6	244070	244075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532374
4049	NC_021006	AAC	2	6	244140	244145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532374
4050	NC_021006	CT	4	8	244186	244193	0 %	50 %	0 %	50 %	480532374
4051	NC_021006	ATTT	2	8	244214	244221	25 %	75 %	0 %	0 %	480532374
4052	NC_021006	A	6	6	244381	244386	100 %	0 %	0 %	0 %	480532374
4053	NC_021006	A	6	6	244394	244399	100 %	0 %	0 %	0 %	480532374
4054	NC_021006	AAC	2	6	244419	244424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532375
4055	NC_021006	CAAA	2	8	244441	244448	75 %	0 %	0 %	25 %	480532375
4056	NC_021006	CT	3	6	244479	244484	0 %	50 %	0 %	50 %	480532375
4057	NC_021006	TAT	2	6	244507	244512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532375
4058	NC_021006	GAC	2	6	244565	244570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532375
4059	NC_021006	AGA	2	6	244594	244599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532375
4060	NC_021006	TTA	2	6	244611	244616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532375
4061	NC_021006	A	6	6	244632	244637	100 %	0 %	0 %	0 %	480532375
4062	NC_021006	ACT	2	6	244674	244679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532375
4063	NC_021006	AAC	2	6	244682	244687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532375
4064	NC_021006	ATT	2	6	244718	244723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532375
4065	NC_021006	TGA	2	6	244789	244794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532375
4066	NC_021006	CTG	2	6	244838	244843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532375
4067	NC_021006	GAAA	2	8	244963	244970	75 %	0 %	25 %	0 %	480532375
4068	NC_021006	AAGGAA	2	12	245027	245038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532375
4069	NC_021006	ACC	2	6	245158	245163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532375
4070	NC_021006	AGA	2	6	245164	245169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532375
4071	NC_021006	GGA	2	6	245209	245214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532375
4072	NC_021006	A	8	8	245233	245240	100 %	0 %	0 %	0 %	480532376
4073	NC_021006	CTG	2	6	245265	245270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532376
4074	NC_021006	TGA	2	6	245279	245284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532376
4075	NC_021006	GAT	3	9	245370	245378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532376
4076	NC_021006	ATT	2	6	245424	245429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532376
4077	NC_021006	GAA	3	9	245430	245438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532376
4078	NC_021006	TCT	2	6	245475	245480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532376
4079	NC_021006	AGA	2	6	245528	245533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532376
4080	NC_021006	A	6	6	245661	245666	100 %	0 %	0 %	0 %	480532376
4081	NC_021006	CTC	2	6	245800	245805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532376
4082	NC_021006	AGG	2	6	245813	245818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532376
4083	NC_021006	AAGG	2	8	245832	245839	50 %	0 %	50 %	0 %	480532376
4084	NC_021006	GAAA	2	8	245843	245850	75 %	0 %	25 %	0 %	480532376
4085	NC_021006	A	6	6	245919	245924	100 %	0 %	0 %	0 %	480532376
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4088	NC_021006	CAG	2	6	246432	246437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532377
4089	NC_021006	TTC	2	6	246474	246479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532377
4090	NC_021006	TCA	2	6	246512	246517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532377
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4092	NC_021006	ACG	2	6	246613	246618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532377
4093	NC_021006	CTT	3	9	246633	246641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532377
4094	NC_021006	CAT	2	6	246645	246650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532377
4095	NC_021006	GAC	2	6	246664	246669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532377
4096	NC_021006	AAG	2	6	246696	246701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532377
4097	NC_021006	AG	3	6	246717	246722	50 %	0 %	50 %	0 %	480532377
4098	NC_021006	TCA	2	6	247029	247034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532377
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4101	NC_021006	CAG	2	6	247281	247286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532377
4102	NC_021006	TCT	2	6	247307	247312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532377
4103	NC_021006	CCA	2	6	247340	247345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532377
4104	NC_021006	GCT	2	6	247400	247405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532377
4105	NC_021006	TCT	2	6	247406	247411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532377
4106	NC_021006	TGG	2	6	247432	247437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532377
4107	NC_021006	ACC	2	6	247573	247578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532377
4108	NC_021006	GTT	2	6	247602	247607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532377
4109	NC_021006	ATG	2	6	247709	247714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532377
4110	NC_021006	ATC	2	6	247969	247974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532377
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4112	NC_021006	GT	3	6	248148	248153	0 %	50 %	50 %	0 %	480532377
4113	NC_021006	ACG	2	6	248158	248163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532377
4114	NC_021006	AGA	2	6	248181	248186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532377
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4119	NC_021006	AGCT	2	8	248623	248630	25 %	25 %	25 %	25 %	480532377
4120	NC_021006	AAT	2	6	248665	248670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532377
4121	NC_021006	TG	3	6	248749	248754	0 %	50 %	50 %	0 %	480532377
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4123	NC_021006	TCAA	2	8	248861	248868	50 %	25 %	0 %	25 %	480532377
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4241	NC_021006	A	6	6	255666	255671	100 %	0 %	0 %	0 %	480532384
4242	NC_021006	GCA	2	6	255782	255787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532384
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4244	NC_021006	CAAAC	2	10	255851	255860	60 %	0 %	0 %	40 %	480532384
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4247	NC_021006	CGT	2	6	255969	255974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532384
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4253	NC_021006	CAT	2	6	256311	256316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532385
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4265	NC_021006	AACC	2	8	257004	257011	50 %	0 %	0 %	50 %	480532385
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4360	NC_021006	ACTATC	2	12	262362	262373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532391
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4364	NC_021006	CAT	2	6	262514	262519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532391
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4367	NC_021006	ATC	2	6	262712	262717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532392
4368	NC_021006	AAC	2	6	262764	262769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532392
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4473	NC_021006	AAT	2	6	268304	268309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532400
4474	NC_021006	AT	3	6	269709	269714	50 %	50 %	0 %	0 %	480532401
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4489	NC_021006	TGG	2	6	270813	270818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532401
4490	NC_021006	GAA	2	6	270877	270882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532401
4491	NC_021006	TGA	2	6	270885	270890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532401
4492	NC_021006	CAT	2	6	270903	270908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532401
4493	NC_021006	TGC	2	6	270987	270992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532401
4494	NC_021006	CCT	2	6	275115	275120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532402
4495	NC_021006	AGC	2	6	275132	275137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532402
4496	NC_021006	CTT	2	6	275142	275147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532402
4497	NC_021006	TC	3	6	275207	275212	0 %	50 %	0 %	50 %	480532402
4498	NC_021006	TGA	2	6	275324	275329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532402
4499	NC_021006	ACC	2	6	275347	275352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532402
4500	NC_021006	AATC	2	8	275830	275837	50 %	25 %	0 %	25 %	480532403

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