MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021006	CCAG	2	8	209454	209461	25 %	0 %	25 %	50 %	480532348
3502	NC_021006	C	6	6	209574	209579	0 %	0 %	0 %	100 %	480532348
3503	NC_021006	CCA	2	6	209590	209595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532348
3504	NC_021006	TGAT	2	8	209670	209677	25 %	50 %	25 %	0 %	480532348
3505	NC_021006	TCTT	2	8	209773	209780	0 %	75 %	0 %	25 %	480532349
3506	NC_021006	TTA	2	6	209785	209790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532349
3507	NC_021006	CAG	2	6	209805	209810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532349
3508	NC_021006	ACC	2	6	209856	209861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532349
3509	NC_021006	TCA	2	6	209897	209902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532349
3510	NC_021006	ACTA	2	8	209925	209932	50 %	25 %	0 %	25 %	480532349
3511	NC_021006	CCA	2	6	210176	210181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532349
3512	NC_021006	CTT	2	6	210182	210187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532349
3513	NC_021006	CTG	2	6	210188	210193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532349
3514	NC_021006	GAC	2	6	210225	210230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532349
3515	NC_021006	ACC	2	6	210286	210291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532349
3516	NC_021006	AGA	2	6	210307	210312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532349
3517	NC_021006	AGA	2	6	210343	210348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532349
3518	NC_021006	TC	3	6	210362	210367	0 %	50 %	0 %	50 %	480532349
3519	NC_021006	TTC	2	6	210703	210708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532349
3520	NC_021006	GAA	2	6	210882	210887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532350
3521	NC_021006	A	6	6	210886	210891	100 %	0 %	0 %	0 %	480532350
3522	NC_021006	ATT	2	6	211036	211041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532350
3523	NC_021006	GCA	2	6	211099	211104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532350
3524	NC_021006	TACT	2	8	211194	211201	25 %	50 %	0 %	25 %	480532350
3525	NC_021006	CTA	2	6	211223	211228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532350
3526	NC_021006	CA	3	6	211235	211240	50 %	0 %	0 %	50 %	480532350
3527	NC_021006	AAC	2	6	211375	211380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532350
3528	NC_021006	ATG	2	6	211408	211413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532350
3529	NC_021006	ATGG	2	8	211471	211478	25 %	25 %	50 %	0 %	480532350
3530	NC_021006	A	6	6	211510	211515	100 %	0 %	0 %	0 %	480532350
3531	NC_021006	TGAAA	2	10	211563	211572	60 %	20 %	20 %	0 %	480532350
3532	NC_021006	A	6	6	211570	211575	100 %	0 %	0 %	0 %	480532350
3533	NC_021006	TCA	2	6	211615	211620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532350
3534	NC_021006	CAG	2	6	211625	211630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532350
3535	NC_021006	AT	3	6	211683	211688	50 %	50 %	0 %	0 %	480532350
3536	NC_021006	TTC	2	6	211701	211706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532350
3537	NC_021006	TGAAAT	2	12	211797	211808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480532350
3538	NC_021006	TGC	2	6	211827	211832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532350
3539	NC_021006	TGTC	2	8	211880	211887	0 %	50 %	25 %	25 %	480532350
3540	NC_021006	TAC	2	6	211927	211932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532350
3541	NC_021006	CTT	2	6	211976	211981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532350
3542	NC_021006	TTC	2	6	212094	212099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532350
3543	NC_021006	GAT	2	6	212143	212148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532350
3544	NC_021006	A	6	6	212239	212244	100 %	0 %	0 %	0 %	480532350
3545	NC_021006	CAA	2	6	212274	212279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532350
3546	NC_021006	CTAG	2	8	212335	212342	25 %	25 %	25 %	25 %	480532350
3547	NC_021006	CAA	2	6	212360	212365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532350
3548	NC_021006	AAC	2	6	212379	212384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532350
3549	NC_021006	GCTT	2	8	212393	212400	0 %	50 %	25 %	25 %	480532350
3550	NC_021006	ACAA	2	8	212411	212418	75 %	0 %	0 %	25 %	480532350
3551	NC_021006	TGA	2	6	212576	212581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532350
3552	NC_021006	TCT	2	6	212597	212602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532350
3553	NC_021006	CAA	2	6	212638	212643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532350
3554	NC_021006	CTCA	2	8	212682	212689	25 %	25 %	0 %	50 %	480532350
3555	NC_021006	GCT	2	6	212695	212700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532350
3556	NC_021006	TCGT	2	8	212714	212721	0 %	50 %	25 %	25 %	480532350
3557	NC_021006	GGT	2	6	212722	212727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532350
3558	NC_021006	AGCC	2	8	212757	212764	25 %	0 %	25 %	50 %	480532350
3559	NC_021006	TCT	2	6	212978	212983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532350
3560	NC_021006	GACTA	2	10	213006	213015	40 %	20 %	20 %	20 %	480532350
3561	NC_021006	A	6	6	213092	213097	100 %	0 %	0 %	0 %	480532351
3562	NC_021006	TGT	2	6	213140	213145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532351
3563	NC_021006	ATC	2	6	213150	213155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532351
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3566	NC_021006	A	6	6	213256	213261	100 %	0 %	0 %	0 %	480532351
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3570	NC_021006	GGT	2	6	213471	213476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532351
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3573	NC_021006	CCCTT	2	10	213999	214008	0 %	40 %	0 %	60 %	480532352
3574	NC_021006	TA	3	6	214016	214021	50 %	50 %	0 %	0 %	480532352
3575	NC_021006	CTA	2	6	214167	214172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532352
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3578	NC_021006	GCAA	2	8	214399	214406	50 %	0 %	25 %	25 %	480532352
3579	NC_021006	GAA	2	6	214438	214443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532352
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3582	NC_021006	CTA	2	6	214605	214610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532352
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3584	NC_021006	CTC	2	6	214669	214674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532352
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3586	NC_021006	TGA	2	6	214758	214763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532352
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3589	NC_021006	CGAT	2	8	214908	214915	25 %	25 %	25 %	25 %	480532352
3590	NC_021006	GTG	2	6	214919	214924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532352
3591	NC_021006	CTTT	2	8	214928	214935	0 %	75 %	0 %	25 %	480532352
3592	NC_021006	GACT	2	8	214952	214959	25 %	25 %	25 %	25 %	480532352
3593	NC_021006	CAAC	2	8	215050	215057	50 %	0 %	0 %	50 %	480532352
3594	NC_021006	TC	3	6	215066	215071	0 %	50 %	0 %	50 %	480532352
3595	NC_021006	GAA	2	6	215098	215103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532352
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3598	NC_021006	AACT	2	8	215211	215218	50 %	25 %	0 %	25 %	480532352
3599	NC_021006	TTGA	2	8	215254	215261	25 %	50 %	25 %	0 %	480532352
3600	NC_021006	A	7	7	215420	215426	100 %	0 %	0 %	0 %	480532352
3601	NC_021006	GATTA	2	10	215463	215472	40 %	40 %	20 %	0 %	480532353
3602	NC_021006	ATC	2	6	215522	215527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532353
3603	NC_021006	T	6	6	215530	215535	0 %	100 %	0 %	0 %	480532353
3604	NC_021006	CAAT	2	8	215545	215552	50 %	25 %	0 %	25 %	480532353
3605	NC_021006	TTC	2	6	215570	215575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
3606	NC_021006	CCT	2	6	215595	215600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532353
3607	NC_021006	AAG	2	6	215709	215714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532353
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3609	NC_021006	GAC	2	6	215800	215805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532353
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3611	NC_021006	ATCA	2	8	215813	215820	50 %	25 %	0 %	25 %	480532353
3612	NC_021006	GCTG	2	8	215873	215880	0 %	25 %	50 %	25 %	480532353
3613	NC_021006	TAC	2	6	215903	215908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532353
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3619	NC_021006	CAA	2	6	216061	216066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532353
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3621	NC_021006	ACG	2	6	216158	216163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532353
3622	NC_021006	TCC	2	6	216213	216218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532353
3623	NC_021006	CAG	2	6	216260	216265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532353
3624	NC_021006	TTC	2	6	216266	216271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
3625	NC_021006	TTC	2	6	216287	216292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
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3648	NC_021006	AAG	2	6	217416	217421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532354
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3654	NC_021006	CAA	2	6	217773	217778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532355
3655	NC_021006	TCT	2	6	217895	217900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532355
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3663	NC_021006	AG	3	6	218283	218288	50 %	0 %	50 %	0 %	480532355
3664	NC_021006	CTA	2	6	218352	218357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532355
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3721	NC_021006	TTGAT	2	10	221299	221308	20 %	60 %	20 %	0 %	480532356
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3724	NC_021006	CTT	2	6	221417	221422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
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3732	NC_021006	GATA	2	8	222166	222173	50 %	25 %	25 %	0 %	480532357
3733	NC_021006	AAG	2	6	222206	222211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532357
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3738	NC_021006	TG	3	6	222469	222474	0 %	50 %	50 %	0 %	480532357
3739	NC_021006	ATA	2	6	223132	223137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532358
3740	NC_021006	ATCATG	2	12	223211	223222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480532358
3741	NC_021006	TCC	2	6	223270	223275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532358
3742	NC_021006	AGC	2	6	223321	223326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532358
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