MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_021006	ACTCT	2	10	1114844	1114853	20 %	40 %	0 %	40 %	480533157
18004	NC_021006	TGA	4	12	1114889	1114900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533157
18005	NC_021006	TGA	2	6	1114913	1114918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533157
18006	NC_021006	GAT	2	6	1114941	1114946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533157
18007	NC_021006	GTA	2	6	1114954	1114959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533157
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18011	NC_021006	TGA	2	6	1115308	1115313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533157
18012	NC_021006	TGA	2	6	1115318	1115323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533157
18013	NC_021006	GAA	2	6	1115369	1115374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533157
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18109	NC_021006	TA	3	6	1119932	1119937	50 %	50 %	0 %	0 %	480533162
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18115	NC_021006	A	6	6	1120057	1120062	100 %	0 %	0 %	0 %	480533163
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18117	NC_021006	TGG	2	6	1120171	1120176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533163
18118	NC_021006	AGT	2	6	1120184	1120189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533163
18119	NC_021006	AGA	2	6	1120252	1120257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533163
18120	NC_021006	GAA	2	6	1120282	1120287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533163
18121	NC_021006	AAAG	2	8	1120304	1120311	75 %	0 %	25 %	0 %	480533163
18122	NC_021006	AGC	2	6	1120315	1120320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533163
18123	NC_021006	TTG	2	6	1120340	1120345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533163
18124	NC_021006	GTA	2	6	1120415	1120420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533163
18125	NC_021006	AGAA	2	8	1120500	1120507	75 %	0 %	25 %	0 %	480533163
18126	NC_021006	A	6	6	1120520	1120525	100 %	0 %	0 %	0 %	480533164
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18128	NC_021006	TTAA	2	8	1120538	1120545	50 %	50 %	0 %	0 %	480533164
18129	NC_021006	TTA	2	6	1120562	1120567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533164
18130	NC_021006	AGG	2	6	1120621	1120626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533164
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18132	NC_021006	AAG	2	6	1120755	1120760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533164
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18135	NC_021006	ATTCT	2	10	1120952	1120961	20 %	60 %	0 %	20 %	480533164
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18137	NC_021006	GAG	2	6	1120992	1120997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533164
18138	NC_021006	GTA	2	6	1121028	1121033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533164
18139	NC_021006	AGC	2	6	1121041	1121046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533164
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18144	NC_021006	TGCT	2	8	1121220	1121227	0 %	50 %	25 %	25 %	480533164
18145	NC_021006	CT	3	6	1121323	1121328	0 %	50 %	0 %	50 %	480533164
18146	NC_021006	A	6	6	1121342	1121347	100 %	0 %	0 %	0 %	480533164
18147	NC_021006	GCA	2	6	1121348	1121353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533164
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18156	NC_021006	TGC	2	6	1121734	1121739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533164
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18220	NC_021006	TTGG	2	8	1131607	1131614	0 %	50 %	50 %	0 %	480533167
18221	NC_021006	AACA	2	8	1131653	1131660	75 %	0 %	0 %	25 %	480533167
18222	NC_021006	T	7	7	1131924	1131930	0 %	100 %	0 %	0 %	480533168
18223	NC_021006	TGT	2	6	1131956	1131961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533168
18224	NC_021006	AAT	2	6	1132061	1132066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533168
18225	NC_021006	GAA	2	6	1132079	1132084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533168
18226	NC_021006	CAT	2	6	1132091	1132096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533168
18227	NC_021006	TTCA	2	8	1132124	1132131	25 %	50 %	0 %	25 %	480533168
18228	NC_021006	TGA	2	6	1132165	1132170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533168
18229	NC_021006	ACC	2	6	1132172	1132177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480533168
18230	NC_021006	TA	3	6	1132193	1132198	50 %	50 %	0 %	0 %	480533168
18231	NC_021006	ATA	2	6	1132262	1132267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533168
18232	NC_021006	ATC	2	6	1132286	1132291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533168
18233	NC_021006	CCT	2	6	1132329	1132334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480533168
18234	NC_021006	TCT	2	6	1132497	1132502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533168
18235	NC_021006	GCA	2	6	1132551	1132556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533168
18236	NC_021006	CAT	2	6	1132624	1132629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533168
18237	NC_021006	TTA	2	6	1132770	1132775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533168
18238	NC_021006	GTA	2	6	1132793	1132798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533168
18239	NC_021006	TTCTTG	2	12	1132889	1132900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	480533168
18240	NC_021006	TTG	2	6	1132904	1132909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533168
18241	NC_021006	ACTTTT	2	12	1132958	1132969	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480533168
18242	NC_021006	T	6	6	1132966	1132971	0 %	100 %	0 %	0 %	480533168
18243	NC_021006	T	7	7	1132975	1132981	0 %	100 %	0 %	0 %	480533168
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18249	NC_021006	CAA	2	6	1133373	1133378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533169
18250	NC_021006	CAA	2	6	1133397	1133402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533169
18251	NC_021006	GT	3	6	1133414	1133419	0 %	50 %	50 %	0 %	480533169
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18253	NC_021006	GCA	2	6	1133456	1133461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533169
18254	NC_021006	CTT	2	6	1133472	1133477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533169
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18256	NC_021006	TCT	3	9	1133558	1133566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533169
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18262	NC_021006	CAA	2	6	1133958	1133963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533169
18263	NC_021006	ATC	2	6	1134040	1134045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533169
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18338	NC_021006	TCG	2	6	1138177	1138182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533180
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18342	NC_021006	TTA	2	6	1138383	1138388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533181
18343	NC_021006	GCT	2	6	1138492	1138497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533181
18344	NC_021006	A	6	6	1138506	1138511	100 %	0 %	0 %	0 %	480533181
18345	NC_021006	AGGC	2	8	1138522	1138529	25 %	0 %	50 %	25 %	480533181
18346	NC_021006	TGAT	2	8	1138651	1138658	25 %	50 %	25 %	0 %	480533182
18347	NC_021006	CCTGAT	2	12	1138665	1138676	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480533182
18348	NC_021006	TGA	3	9	1138741	1138749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533182
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18350	NC_021006	GAT	2	6	1138847	1138852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533182
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18352	NC_021006	A	6	6	1138962	1138967	100 %	0 %	0 %	0 %	480533182
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18465	NC_021006	AAG	2	6	1148564	1148569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
18466	NC_021006	TGA	2	6	1148624	1148629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533195
18467	NC_021006	AAG	2	6	1148636	1148641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
18468	NC_021006	ACAAG	2	10	1148646	1148655	60 %	0 %	20 %	20 %	480533195
18469	NC_021006	GAA	2	6	1148761	1148766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
18470	NC_021006	AACC	2	8	1148783	1148790	50 %	0 %	0 %	50 %	480533195
18471	NC_021006	CGT	2	6	1148821	1148826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533195
18472	NC_021006	TGA	2	6	1148856	1148861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533195
18473	NC_021006	AAAC	2	8	1148893	1148900	75 %	0 %	0 %	25 %	480533195
18474	NC_021006	TAC	2	6	1149022	1149027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533195
18475	NC_021006	GCT	2	6	1149061	1149066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533195
18476	NC_021006	CAAGGA	2	12	1149078	1149089	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480533195
18477	NC_021006	TTG	2	6	1149155	1149160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533195
18478	NC_021006	GAT	2	6	1149169	1149174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533195
18479	NC_021006	ACT	2	6	1149256	1149261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533195
18480	NC_021006	GTA	2	6	1149322	1149327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533195
18481	NC_021006	AGG	2	6	1149381	1149386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533195
18482	NC_021006	TGA	2	6	1149550	1149555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533196
18483	NC_021006	AGA	2	6	1149560	1149565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533196
18484	NC_021006	GAA	2	6	1149612	1149617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533196
18485	NC_021006	GTA	2	6	1149624	1149629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533196
18486	NC_021006	GAG	2	6	1149654	1149659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533196
18487	NC_021006	ATC	2	6	1149746	1149751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533197
18488	NC_021006	AGA	2	6	1149772	1149777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533197
18489	NC_021006	AGA	2	6	1149811	1149816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533197
18490	NC_021006	GGGTG	2	10	1149856	1149865	0 %	20 %	80 %	0 %	480533197
18491	NC_021006	A	7	7	1149963	1149969	100 %	0 %	0 %	0 %	480533198
18492	NC_021006	TAC	2	6	1149988	1149993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533198
18493	NC_021006	TGT	2	6	1150024	1150029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533198
18494	NC_021006	CAGG	2	8	1150074	1150081	25 %	0 %	50 %	25 %	480533198
18495	NC_021006	GCAA	2	8	1150153	1150160	50 %	0 %	25 %	25 %	480533198
18496	NC_021006	CCTAT	2	10	1150177	1150186	20 %	40 %	0 %	40 %	480533198
18497	NC_021006	TGA	2	6	1150279	1150284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533199
18498	NC_021006	GAA	2	6	1150292	1150297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533199
18499	NC_021006	TGA	2	6	1150324	1150329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533199
18500	NC_021006	AGA	2	6	1150395	1150400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533199

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