MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021006	TGT	2	6	949021	949026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533015
15003	NC_021006	T	6	6	949099	949104	0 %	100 %	0 %	0 %	480533015
15004	NC_021006	TTA	2	6	949175	949180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533015
15005	NC_021006	TAT	2	6	949244	949249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533015
15006	NC_021006	CTT	2	6	949270	949275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533015
15007	NC_021006	T	6	6	949324	949329	0 %	100 %	0 %	0 %	480533015
15008	NC_021006	ATT	2	6	949339	949344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533015
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15010	NC_021006	TAT	2	6	949475	949480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533015
15011	NC_021006	CAG	2	6	949563	949568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533015
15012	NC_021006	TGG	2	6	949617	949622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533015
15013	NC_021006	ATT	2	6	949637	949642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533015
15014	NC_021006	AAC	2	6	949675	949680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533015
15015	NC_021006	CAG	2	6	949743	949748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533015
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15018	NC_021006	TCA	2	6	949897	949902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533016
15019	NC_021006	ATT	2	6	949977	949982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533016
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15021	NC_021006	A	7	7	950066	950072	100 %	0 %	0 %	0 %	480533016
15022	NC_021006	TTCC	2	8	950125	950132	0 %	50 %	0 %	50 %	480533016
15023	NC_021006	CTT	2	6	950159	950164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533016
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15025	NC_021006	CT	3	6	950189	950194	0 %	50 %	0 %	50 %	480533016
15026	NC_021006	ATT	2	6	950238	950243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533016
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15029	NC_021006	TGCCA	2	10	950351	950360	20 %	20 %	20 %	40 %	480533016
15030	NC_021006	AGT	2	6	950454	950459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533016
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15033	NC_021006	TCAG	2	8	950641	950648	25 %	25 %	25 %	25 %	480533017
15034	NC_021006	A	6	6	950685	950690	100 %	0 %	0 %	0 %	480533017
15035	NC_021006	CTT	2	6	950798	950803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533017
15036	NC_021006	TAG	2	6	950847	950852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533017
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15038	NC_021006	A	6	6	950974	950979	100 %	0 %	0 %	0 %	480533017
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15043	NC_021006	CAA	2	6	951244	951249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533017
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15051	NC_021006	GAA	2	6	951741	951746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533018
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15053	NC_021006	ATT	2	6	951868	951873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533018
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15055	NC_021006	AAT	2	6	952727	952732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533019
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15062	NC_021006	AT	3	6	952939	952944	50 %	50 %	0 %	0 %	480533019
15063	NC_021006	TAAT	2	8	952988	952995	50 %	50 %	0 %	0 %	480533019
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15066	NC_021006	T	6	6	953072	953077	0 %	100 %	0 %	0 %	480533019
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15102	NC_021006	GAAAT	2	10	955031	955040	60 %	20 %	20 %	0 %	480533021
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15109	NC_021006	CTGG	2	8	955378	955385	0 %	25 %	50 %	25 %	480533022
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15119	NC_021006	CCCA	2	8	955773	955780	25 %	0 %	0 %	75 %	480533022
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15121	NC_021006	GAA	2	6	955942	955947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533022
15122	NC_021006	TCA	2	6	955983	955988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533022
15123	NC_021006	CCT	2	6	955996	956001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480533023
15124	NC_021006	AT	3	6	956051	956056	50 %	50 %	0 %	0 %	480533023
15125	NC_021006	ATA	2	6	956099	956104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533023
15126	NC_021006	TATCC	2	10	956115	956124	20 %	40 %	0 %	40 %	480533023
15127	NC_021006	TCG	2	6	956134	956139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533023
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15129	NC_021006	AG	3	6	956363	956368	50 %	0 %	50 %	0 %	480533023
15130	NC_021006	CTT	2	6	956389	956394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533023
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15132	NC_021006	CTTG	2	8	956485	956492	0 %	50 %	25 %	25 %	480533023
15133	NC_021006	CTG	2	6	956526	956531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533024
15134	NC_021006	CTT	2	6	956533	956538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533024
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15140	NC_021006	A	6	6	956918	956923	100 %	0 %	0 %	0 %	480533024
15141	NC_021006	TGA	2	6	956934	956939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533024
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15153	NC_021006	CGA	2	6	957423	957428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533024
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15228	NC_021006	CATA	2	8	961032	961039	50 %	25 %	0 %	25 %	480533027
15229	NC_021006	ATAC	2	8	961180	961187	50 %	25 %	0 %	25 %	480533027
15230	NC_021006	TCA	2	6	961232	961237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533027
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15232	NC_021006	TGC	2	6	961306	961311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533027
15233	NC_021006	ACTG	2	8	961326	961333	25 %	25 %	25 %	25 %	480533027
15234	NC_021006	GCT	2	6	961358	961363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533027
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15243	NC_021006	CCGTC	2	10	961746	961755	0 %	20 %	20 %	60 %	480533027
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15250	NC_021006	TGA	2	6	962241	962246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533028
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15364	NC_021006	TA	3	6	968411	968416	50 %	50 %	0 %	0 %	480533033
15365	NC_021006	AG	3	6	968432	968437	50 %	0 %	50 %	0 %	480533033
15366	NC_021006	GAA	2	6	969376	969381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533034
15367	NC_021006	AGCA	2	8	969442	969449	50 %	0 %	25 %	25 %	480533034
15368	NC_021006	CTTTGA	2	12	969456	969467	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480533034
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15370	NC_021006	TTG	2	6	969506	969511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533034
15371	NC_021006	GCT	2	6	969635	969640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533034
15372	NC_021006	AGATGT	2	12	969681	969692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533034
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15374	NC_021006	CCAA	2	8	969701	969708	50 %	0 %	0 %	50 %	480533034
15375	NC_021006	CTT	2	6	969795	969800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533034
15376	NC_021006	TGC	2	6	969853	969858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533034
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15379	NC_021006	GCT	2	6	969983	969988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533034
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15383	NC_021006	GATT	2	8	970134	970141	25 %	50 %	25 %	0 %	480533034
15384	NC_021006	TGT	2	6	970185	970190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533034
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15390	NC_021006	TGT	2	6	970365	970370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533034
15391	NC_021006	TGC	2	6	970438	970443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533034
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15395	NC_021006	GAT	2	6	970567	970572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533034
15396	NC_021006	CTT	2	6	970593	970598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533034
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15398	NC_021006	TCG	2	6	970820	970825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533034
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15402	NC_021006	GCGA	2	8	970930	970937	25 %	0 %	50 %	25 %	480533034
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15407	NC_021006	AACC	2	8	971113	971120	50 %	0 %	0 %	50 %	480533034
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15478	NC_021006	A	6	6	974943	974948	100 %	0 %	0 %	0 %	480533036
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15482	NC_021006	TCA	2	6	975215	975220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533037
15483	NC_021006	GTG	2	6	975269	975274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533037
15484	NC_021006	TGA	2	6	975494	975499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533037
15485	NC_021006	CCA	2	6	975532	975537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480533037
15486	NC_021006	GTT	2	6	975543	975548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533037
15487	NC_021006	GGTT	2	8	975555	975562	0 %	50 %	50 %	0 %	480533037
15488	NC_021006	GTTCT	2	10	975614	975623	0 %	60 %	20 %	20 %	480533037
15489	NC_021006	CCAA	2	8	975698	975705	50 %	0 %	0 %	50 %	480533037
15490	NC_021006	CTT	2	6	975745	975750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533037
15491	NC_021006	TCA	2	6	975770	975775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533037
15492	NC_021006	TTCC	2	8	975853	975860	0 %	50 %	0 %	50 %	480533037
15493	NC_021006	ATG	2	6	975925	975930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533037
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15497	NC_021006	ACA	2	6	976222	976227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533037
15498	NC_021006	GGC	2	6	976251	976256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480533037
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15500	NC_021006	GACT	2	8	976377	976384	25 %	25 %	25 %	25 %	480533038

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