MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021006	CA	3	6	883286	883291	50 %	0 %	0 %	50 %	480532960
14002	NC_021006	TCA	2	6	883292	883297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532960
14003	NC_021006	GGT	2	6	883330	883335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532960
14004	NC_021006	TTA	2	6	883354	883359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532960
14005	NC_021006	TAT	2	6	883451	883456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532960
14006	NC_021006	CAG	2	6	883622	883627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532960
14007	NC_021006	TCA	2	6	883655	883660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532960
14008	NC_021006	TTC	2	6	883676	883681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532960
14009	NC_021006	GTT	2	6	883714	883719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532960
14010	NC_021006	TTA	2	6	883757	883762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532961
14011	NC_021006	A	7	7	883799	883805	100 %	0 %	0 %	0 %	480532961
14012	NC_021006	CAA	2	6	883808	883813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532961
14013	NC_021006	GAAA	2	8	883939	883946	75 %	0 %	25 %	0 %	480532961
14014	NC_021006	ATG	2	6	883994	883999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532961
14015	NC_021006	AGA	2	6	884055	884060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532962
14016	NC_021006	AT	3	6	884067	884072	50 %	50 %	0 %	0 %	480532962
14017	NC_021006	AGC	2	6	884100	884105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532962
14018	NC_021006	ATC	2	6	884109	884114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532962
14019	NC_021006	AAG	2	6	884156	884161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532962
14020	NC_021006	GAA	2	6	884176	884181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532962
14021	NC_021006	TAG	2	6	884195	884200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532962
14022	NC_021006	AAG	2	6	884234	884239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532962
14023	NC_021006	A	6	6	884249	884254	100 %	0 %	0 %	0 %	480532962
14024	NC_021006	ATGC	2	8	884275	884282	25 %	25 %	25 %	25 %	480532962
14025	NC_021006	AGA	2	6	884283	884288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532962
14026	NC_021006	ATT	2	6	884308	884313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532962
14027	NC_021006	AAAT	2	8	884349	884356	75 %	25 %	0 %	0 %	480532962
14028	NC_021006	ATT	2	6	885224	885229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532963
14029	NC_021006	TCTT	2	8	885243	885250	0 %	75 %	0 %	25 %	480532963
14030	NC_021006	GAT	2	6	885273	885278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532963
14031	NC_021006	CTT	2	6	885467	885472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532963
14032	NC_021006	TGCG	2	8	885500	885507	0 %	25 %	50 %	25 %	480532963
14033	NC_021006	GTA	2	6	885534	885539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532963
14034	NC_021006	TG	3	6	885633	885638	0 %	50 %	50 %	0 %	480532963
14035	NC_021006	TGAG	2	8	885666	885673	25 %	25 %	50 %	0 %	480532963
14036	NC_021006	TTG	2	6	885713	885718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532963
14037	NC_021006	CAG	2	6	885887	885892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532963
14038	NC_021006	CAA	2	6	885893	885898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532963
14039	NC_021006	AGT	2	6	885956	885961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532963
14040	NC_021006	GTT	2	6	885981	885986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532963
14041	NC_021006	TCT	2	6	886064	886069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532963
14042	NC_021006	AGA	2	6	886157	886162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532963
14043	NC_021006	GCA	2	6	886177	886182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532963
14044	NC_021006	CAC	2	6	886196	886201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532963
14045	NC_021006	GAT	2	6	886209	886214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532963
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14047	NC_021006	CGA	2	6	886318	886323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532963
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14049	NC_021006	GAT	2	6	886338	886343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532963
14050	NC_021006	CATGG	2	10	886368	886377	20 %	20 %	40 %	20 %	480532963
14051	NC_021006	ATTGA	2	10	886424	886433	40 %	40 %	20 %	0 %	480532963
14052	NC_021006	GAAG	2	8	886456	886463	50 %	0 %	50 %	0 %	480532963
14053	NC_021006	T	6	6	886500	886505	0 %	100 %	0 %	0 %	480532963
14054	NC_021006	ATG	2	6	886580	886585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532963
14055	NC_021006	AAG	2	6	886588	886593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532963
14056	NC_021006	ACC	2	6	886614	886619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532963
14057	NC_021006	TTC	2	6	886686	886691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532963
14058	NC_021006	TG	3	6	886698	886703	0 %	50 %	50 %	0 %	480532963
14059	NC_021006	GCT	2	6	886708	886713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532963
14060	NC_021006	CTT	2	6	886841	886846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532963
14061	NC_021006	GCA	2	6	886855	886860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532963
14062	NC_021006	TGTT	2	8	886865	886872	0 %	75 %	25 %	0 %	480532963
14063	NC_021006	AAG	2	6	886998	887003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532963
14064	NC_021006	CTTTTT	2	12	887006	887017	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	480532963
14065	NC_021006	AAGT	2	8	887026	887033	50 %	25 %	25 %	0 %	480532963
14066	NC_021006	TGC	2	6	887151	887156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532963
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14068	NC_021006	ACC	2	6	887259	887264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532963
14069	NC_021006	TTG	2	6	887309	887314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532963
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14071	NC_021006	GAT	2	6	887407	887412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532963
14072	NC_021006	GATG	2	8	887422	887429	25 %	25 %	50 %	0 %	480532963
14073	NC_021006	TGT	2	6	887502	887507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532963
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14077	NC_021006	TAC	2	6	887613	887618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532963
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14079	NC_021006	GCT	2	6	887719	887724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532963
14080	NC_021006	TTC	2	6	887778	887783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532963
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14085	NC_021006	CTT	2	6	888295	888300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532964
14086	NC_021006	TTG	2	6	888336	888341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532964
14087	NC_021006	CATT	2	8	888391	888398	25 %	50 %	0 %	25 %	480532964
14088	NC_021006	CAT	2	6	888418	888423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532964
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14090	NC_021006	ACT	2	6	888510	888515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532964
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14092	NC_021006	ATCTT	2	10	888709	888718	20 %	60 %	0 %	20 %	480532965
14093	NC_021006	ATA	2	6	888775	888780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532965
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14096	NC_021006	T	6	6	889008	889013	0 %	100 %	0 %	0 %	480532965
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14100	NC_021006	CAT	2	6	889318	889323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532966
14101	NC_021006	A	6	6	889340	889345	100 %	0 %	0 %	0 %	480532966
14102	NC_021006	AAC	2	6	889494	889499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532967
14103	NC_021006	ACG	2	6	889647	889652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532967
14104	NC_021006	GAA	2	6	889667	889672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532967
14105	NC_021006	ACA	2	6	889843	889848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532967
14106	NC_021006	GCT	2	6	889960	889965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532967
14107	NC_021006	CTG	2	6	889982	889987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532967
14108	NC_021006	AGA	2	6	890153	890158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532967
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14110	NC_021006	CCA	2	6	890188	890193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532967
14111	NC_021006	TGAG	2	8	890313	890320	25 %	25 %	50 %	0 %	480532967
14112	NC_021006	CTTGA	2	10	890381	890390	20 %	40 %	20 %	20 %	480532967
14113	NC_021006	CTG	2	6	890435	890440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532967
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14115	NC_021006	GAT	2	6	890469	890474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532967
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14117	NC_021006	TTGT	2	8	890697	890704	0 %	75 %	25 %	0 %	480532967
14118	NC_021006	CTTCA	2	10	890730	890739	20 %	40 %	0 %	40 %	480532967
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14120	NC_021006	ATGG	2	8	890784	890791	25 %	25 %	50 %	0 %	480532967
14121	NC_021006	AAC	2	6	890919	890924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532967
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14361	NC_021006	TGA	2	6	903980	903985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532981
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14369	NC_021006	TCA	2	6	904298	904303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532981
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14377	NC_021006	T	6	6	905351	905356	0 %	100 %	0 %	0 %	480532982
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