MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021006	TTC	2	6	816834	816839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532904
13002	NC_021006	GAT	2	6	816896	816901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532904
13003	NC_021006	TCT	2	6	816916	816921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532904
13004	NC_021006	CCA	2	6	816969	816974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532904
13005	NC_021006	AAG	2	6	816981	816986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532904
13006	NC_021006	TGT	2	6	817085	817090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532904
13007	NC_021006	TTG	2	6	817128	817133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532904
13008	NC_021006	CTGT	2	8	817137	817144	0 %	50 %	25 %	25 %	480532904
13009	NC_021006	CTT	2	6	817246	817251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532904
13010	NC_021006	AGT	3	9	817261	817269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532904
13011	NC_021006	CAG	2	6	817336	817341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532904
13012	NC_021006	CTT	2	6	817372	817377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532904
13013	NC_021006	ATCA	2	8	817469	817476	50 %	25 %	0 %	25 %	480532904
13014	NC_021006	CTT	2	6	817555	817560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532904
13015	NC_021006	CCA	2	6	817594	817599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532904
13016	NC_021006	GCT	2	6	817608	817613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532904
13017	NC_021006	CAC	2	6	817696	817701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532904
13018	NC_021006	GAC	2	6	817855	817860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532904
13019	NC_021006	ACG	2	6	817862	817867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532904
13020	NC_021006	TCAA	2	8	817875	817882	50 %	25 %	0 %	25 %	480532904
13021	NC_021006	CTT	2	6	817894	817899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532904
13022	NC_021006	GAT	2	6	817925	817930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532904
13023	NC_021006	GTT	2	6	817967	817972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532904
13024	NC_021006	CGG	2	6	817986	817991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480532904
13025	NC_021006	CCA	2	6	818025	818030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532904
13026	NC_021006	TGG	2	6	818057	818062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532904
13027	NC_021006	ATC	2	6	818085	818090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532904
13028	NC_021006	GTTT	2	8	818098	818105	0 %	75 %	25 %	0 %	480532904
13029	NC_021006	ACG	2	6	818138	818143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532904
13030	NC_021006	TTC	2	6	818183	818188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532904
13031	NC_021006	CAA	2	6	818263	818268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532904
13032	NC_021006	AACCAT	2	12	818272	818283	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480532904
13033	NC_021006	GTG	2	6	818338	818343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532904
13034	NC_021006	ATCA	2	8	818354	818361	50 %	25 %	0 %	25 %	480532904
13035	NC_021006	ACG	2	6	818501	818506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532904
13036	NC_021006	TCA	2	6	818622	818627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532904
13037	NC_021006	ATTG	2	8	818663	818670	25 %	50 %	25 %	0 %	480532904
13038	NC_021006	T	6	6	818678	818683	0 %	100 %	0 %	0 %	480532904
13039	NC_021006	CAG	2	6	818811	818816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13040	NC_021006	CTT	2	6	818817	818822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13041	NC_021006	TTG	2	6	818838	818843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532905
13042	NC_021006	CTT	2	6	818853	818858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13043	NC_021006	GCT	2	6	818870	818875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13044	NC_021006	GCT	2	6	818888	818893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13045	NC_021006	CTT	2	6	818970	818975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13046	NC_021006	CCA	2	6	819209	819214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532905
13047	NC_021006	GTT	2	6	819237	819242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532905
13048	NC_021006	CG	3	6	819272	819277	0 %	0 %	50 %	50 %	480532905
13049	NC_021006	TGG	2	6	819299	819304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532905
13050	NC_021006	CTT	2	6	819405	819410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13051	NC_021006	ATG	2	6	819557	819562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532905
13052	NC_021006	TCT	2	6	819596	819601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13053	NC_021006	GA	3	6	819615	819620	50 %	0 %	50 %	0 %	480532905
13054	NC_021006	ACGA	2	8	819760	819767	50 %	0 %	25 %	25 %	480532905
13055	NC_021006	TTC	2	6	819850	819855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13056	NC_021006	CTT	2	6	819909	819914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13057	NC_021006	TTC	2	6	820000	820005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13058	NC_021006	CG	3	6	820023	820028	0 %	0 %	50 %	50 %	480532905
13059	NC_021006	TTC	2	6	820042	820047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13060	NC_021006	GTTG	2	8	820245	820252	0 %	50 %	50 %	0 %	480532905
13061	NC_021006	ACG	2	6	820273	820278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13062	NC_021006	ACG	2	6	820318	820323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13063	NC_021006	GTAA	2	8	820348	820355	50 %	25 %	25 %	0 %	480532905
13064	NC_021006	CAT	2	6	820362	820367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532905
13065	NC_021006	GCT	2	6	820400	820405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13066	NC_021006	CAA	2	6	820575	820580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532905
13067	NC_021006	TCT	2	6	820629	820634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13068	NC_021006	TTCA	2	8	820651	820658	25 %	50 %	0 %	25 %	480532905
13069	NC_021006	TCT	2	6	820691	820696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13070	NC_021006	TCA	2	6	820697	820702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532905
13071	NC_021006	TCGT	2	8	820721	820728	0 %	50 %	25 %	25 %	480532905
13072	NC_021006	ACA	2	6	820730	820735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532905
13073	NC_021006	AGTG	2	8	820869	820876	25 %	25 %	50 %	0 %	480532905
13074	NC_021006	CACGT	2	10	820882	820891	20 %	20 %	20 %	40 %	480532905
13075	NC_021006	ACC	2	6	820921	820926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532905
13076	NC_021006	TGA	2	6	821005	821010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532905
13077	NC_021006	TGT	2	6	821060	821065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532905
13078	NC_021006	TTGG	2	8	821143	821150	0 %	50 %	50 %	0 %	480532905
13079	NC_021006	ACG	2	6	821176	821181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13080	NC_021006	GGT	2	6	821190	821195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532905
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13084	NC_021006	GAA	2	6	821361	821366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532905
13085	NC_021006	TGGTT	2	10	821529	821538	0 %	60 %	40 %	0 %	480532905
13086	NC_021006	T	6	6	821563	821568	0 %	100 %	0 %	0 %	480532905
13087	NC_021006	CTG	2	6	821589	821594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13088	NC_021006	AAG	2	6	821618	821623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532905
13089	NC_021006	CAAG	2	8	821631	821638	50 %	0 %	25 %	25 %	480532905
13090	NC_021006	TTTC	2	8	821691	821698	0 %	75 %	0 %	25 %	480532905
13091	NC_021006	TCA	3	9	821795	821803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532905
13092	NC_021006	CCAA	2	8	821901	821908	50 %	0 %	0 %	50 %	480532905
13093	NC_021006	ATA	2	6	822011	822016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532905
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13095	NC_021006	TGA	3	9	822030	822038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532905
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13097	NC_021006	TAGC	2	8	822149	822156	25 %	25 %	25 %	25 %	480532905
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13099	NC_021006	CAA	2	6	822210	822215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532905
13100	NC_021006	TCAA	2	8	822320	822327	50 %	25 %	0 %	25 %	480532905
13101	NC_021006	CTT	2	6	822345	822350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532905
13102	NC_021006	ACG	2	6	822367	822372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532905
13103	NC_021006	TCT	3	9	823105	823113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532906
13104	NC_021006	TTC	2	6	823159	823164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532906
13105	NC_021006	TGTT	2	8	823189	823196	0 %	75 %	25 %	0 %	480532906
13106	NC_021006	ATA	2	6	823257	823262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532906
13107	NC_021006	TCA	2	6	823282	823287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532906
13108	NC_021006	ATT	2	6	823311	823316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532906
13109	NC_021006	TGA	2	6	823369	823374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532906
13110	NC_021006	TGC	2	6	823383	823388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532906
13111	NC_021006	TCA	3	9	823399	823407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532906
13112	NC_021006	CAA	2	6	823415	823420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532906
13113	NC_021006	ACC	2	6	823461	823466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532906
13114	NC_021006	GCCT	2	8	823608	823615	0 %	25 %	25 %	50 %	480532906
13115	NC_021006	CAT	2	6	823664	823669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532906
13116	NC_021006	AAT	2	6	823685	823690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532906
13117	NC_021006	ATC	2	6	823725	823730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532906
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13119	NC_021006	ATCTCA	2	12	823816	823827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532906
13120	NC_021006	TTC	2	6	823842	823847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532906
13121	NC_021006	TCA	2	6	823873	823878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532906
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13125	NC_021006	GACT	2	8	823967	823974	25 %	25 %	25 %	25 %	480532906
13126	NC_021006	CCAAG	2	10	824137	824146	40 %	0 %	20 %	40 %	480532906
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13133	NC_021006	GTA	2	6	824864	824869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532907
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13234	NC_021006	ACC	2	6	830642	830647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532915
13235	NC_021006	AGGCG	2	10	830682	830691	20 %	0 %	60 %	20 %	480532915
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13240	NC_021006	GCC	2	6	830876	830881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532915
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13354	NC_021006	TTGA	2	8	837460	837467	25 %	50 %	25 %	0 %	480532922
13355	NC_021006	ATC	2	6	837586	837591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532922
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13357	NC_021006	T	6	6	837682	837687	0 %	100 %	0 %	0 %	480532922
13358	NC_021006	TTC	2	6	837707	837712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532923
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13361	NC_021006	TCA	2	6	837816	837821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532923
13362	NC_021006	ACC	2	6	837869	837874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532923
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13481	NC_021006	AGA	2	6	844375	844380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532930
13482	NC_021006	ATG	2	6	844384	844389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532930
13483	NC_021006	TCT	2	6	844489	844494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532930
13484	NC_021006	CCTG	2	8	844549	844556	0 %	25 %	25 %	50 %	480532930
13485	NC_021006	CAG	2	6	844602	844607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532930
13486	NC_021006	TCT	2	6	844672	844677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532930
13487	NC_021006	GGT	2	6	844716	844721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532930
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13492	NC_021006	ATC	2	6	844975	844980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532930
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