MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021006	CAT	2	6	625126	625131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532718
10002	NC_021006	CAT	2	6	625204	625209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532718
10003	NC_021006	ATT	2	6	625262	625267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532718
10004	NC_021006	TGT	2	6	625300	625305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532718
10005	NC_021006	CTC	2	6	625306	625311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532718
10006	NC_021006	TGG	2	6	625324	625329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532718
10007	NC_021006	TGC	2	6	625336	625341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532718
10008	NC_021006	ATC	2	6	625373	625378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532718
10009	NC_021006	CAATTC	2	12	625396	625407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532718
10010	NC_021006	TAT	2	6	625459	625464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532718
10011	NC_021006	AGAAA	2	10	625493	625502	80 %	0 %	20 %	0 %	480532718
10012	NC_021006	GAT	2	6	625556	625561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532718
10013	NC_021006	ATG	2	6	625638	625643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532718
10014	NC_021006	TAC	2	6	625664	625669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532718
10015	NC_021006	CTA	2	6	625680	625685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532718
10016	NC_021006	TCT	2	6	625726	625731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532718
10017	NC_021006	CTT	2	6	625774	625779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532718
10018	NC_021006	CTA	2	6	625919	625924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532719
10019	NC_021006	TAG	2	6	626097	626102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532719
10020	NC_021006	TTC	2	6	626190	626195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532719
10021	NC_021006	CAG	2	6	626215	626220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532719
10022	NC_021006	TAT	2	6	626336	626341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532719
10023	NC_021006	AGC	2	6	626346	626351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532719
10024	NC_021006	TC	3	6	626405	626410	0 %	50 %	0 %	50 %	480532719
10025	NC_021006	GGC	2	6	626426	626431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480532719
10026	NC_021006	CTGA	2	8	626517	626524	25 %	25 %	25 %	25 %	480532719
10027	NC_021006	TTC	2	6	626526	626531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532719
10028	NC_021006	AAC	2	6	626610	626615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532719
10029	NC_021006	TCT	2	6	626738	626743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532719
10030	NC_021006	ATC	2	6	626791	626796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532719
10031	NC_021006	ACC	2	6	626823	626828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532719
10032	NC_021006	TGA	2	6	626837	626842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532719
10033	NC_021006	GCC	2	6	626860	626865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532719
10034	NC_021006	TTC	2	6	626880	626885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532719
10035	NC_021006	CAC	2	6	626964	626969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532719
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10037	NC_021006	T	6	6	627090	627095	0 %	100 %	0 %	0 %	480532719
10038	NC_021006	ATT	2	6	627121	627126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532719
10039	NC_021006	TGG	2	6	627150	627155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532720
10040	NC_021006	GTTT	2	8	627212	627219	0 %	75 %	25 %	0 %	480532720
10041	NC_021006	A	6	6	627239	627244	100 %	0 %	0 %	0 %	480532720
10042	NC_021006	GTTG	2	8	627280	627287	0 %	50 %	50 %	0 %	480532720
10043	NC_021006	CAC	2	6	627340	627345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532720
10044	NC_021006	GAA	2	6	627347	627352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532720
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10047	NC_021006	AGGC	2	8	627536	627543	25 %	0 %	50 %	25 %	480532720
10048	NC_021006	T	7	7	627556	627562	0 %	100 %	0 %	0 %	480532720
10049	NC_021006	AAAC	2	8	627600	627607	75 %	0 %	0 %	25 %	480532720
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10052	NC_021006	TTG	2	6	627683	627688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532720
10053	NC_021006	ATG	2	6	627747	627752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532720
10054	NC_021006	ATT	2	6	627776	627781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532720
10055	NC_021006	CAT	2	6	627788	627793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532720
10056	NC_021006	CTT	2	6	627967	627972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532720
10057	NC_021006	CTT	2	6	628084	628089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532720
10058	NC_021006	TCTT	2	8	628091	628098	0 %	75 %	0 %	25 %	480532720
10059	NC_021006	GCC	2	6	628128	628133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532720
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10061	NC_021006	GGA	2	6	628490	628495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532721
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10063	NC_021006	ACTG	2	8	628547	628554	25 %	25 %	25 %	25 %	480532721
10064	NC_021006	CAAT	2	8	628616	628623	50 %	25 %	0 %	25 %	480532721
10065	NC_021006	TA	3	6	629448	629453	50 %	50 %	0 %	0 %	480532722
10066	NC_021006	TAT	2	6	629546	629551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532722
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10068	NC_021006	GTT	2	6	629575	629580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532722
10069	NC_021006	GA	3	6	629587	629592	50 %	0 %	50 %	0 %	480532722
10070	NC_021006	CAG	2	6	629636	629641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532722
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10072	NC_021006	AGAT	2	8	629740	629747	50 %	25 %	25 %	0 %	480532722
10073	NC_021006	TCA	2	6	629883	629888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532723
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10075	NC_021006	ATA	2	6	629981	629986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532723
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10079	NC_021006	AAG	2	6	630411	630416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532723
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10086	NC_021006	GTC	2	6	630881	630886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532724
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10088	NC_021006	T	6	6	630997	631002	0 %	100 %	0 %	0 %	480532724
10089	NC_021006	CAT	2	6	631038	631043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532724
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10091	NC_021006	CTT	2	6	631104	631109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532724
10092	NC_021006	CTT	2	6	631138	631143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532724
10093	NC_021006	TCG	2	6	631203	631208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532724
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10100	NC_021006	CTT	2	6	631461	631466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532724
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10102	NC_021006	TCT	2	6	631536	631541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532724
10103	NC_021006	T	6	6	631564	631569	0 %	100 %	0 %	0 %	480532724
10104	NC_021006	CCA	2	6	631665	631670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532724
10105	NC_021006	CAA	2	6	631684	631689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532724
10106	NC_021006	T	6	6	631717	631722	0 %	100 %	0 %	0 %	480532724
10107	NC_021006	TGGT	2	8	631732	631739	0 %	50 %	50 %	0 %	480532724
10108	NC_021006	TGAT	2	8	631773	631780	25 %	50 %	25 %	0 %	480532724
10109	NC_021006	TCTG	2	8	631787	631794	0 %	50 %	25 %	25 %	480532724
10110	NC_021006	TCA	2	6	631871	631876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532724
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10112	NC_021006	CTA	2	6	631916	631921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532724
10113	NC_021006	ATA	2	6	631988	631993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532724
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10115	NC_021006	AAT	2	6	632128	632133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532724
10116	NC_021006	ACGG	2	8	632386	632393	25 %	0 %	50 %	25 %	480532724
10117	NC_021006	CTT	2	6	632394	632399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532724
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10119	NC_021006	CCT	2	6	632666	632671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532724
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10121	NC_021006	TCC	2	6	632737	632742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532725
10122	NC_021006	TGT	2	6	632771	632776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532725
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10483	NC_021006	CTT	2	6	656444	656449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532752
10484	NC_021006	GTCCAA	2	12	656553	656564	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480532752
10485	NC_021006	ATG	2	6	656653	656658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532752
10486	NC_021006	CTT	2	6	656693	656698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532752
10487	NC_021006	AGA	2	6	656707	656712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532752
10488	NC_021006	GCT	2	6	656782	656787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532752
10489	NC_021006	T	6	6	657042	657047	0 %	100 %	0 %	0 %	480532752
10490	NC_021006	ACC	2	6	657121	657126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532752
10491	NC_021006	AAG	2	6	657139	657144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532752
10492	NC_021006	CGT	2	6	657222	657227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532752
10493	NC_021006	CTA	2	6	657492	657497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532753
10494	NC_021006	GA	3	6	657611	657616	50 %	0 %	50 %	0 %	480532753
10495	NC_021006	CTT	2	6	657699	657704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532753
10496	NC_021006	TTC	2	6	657712	657717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532753
10497	NC_021006	CTA	2	6	657723	657728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532753
10498	NC_021006	T	6	6	657769	657774	0 %	100 %	0 %	0 %	480532753
10499	NC_021006	GCTT	2	8	657807	657814	0 %	50 %	25 %	25 %	480532753
10500	NC_021006	GCT	2	6	657821	657826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532753

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