MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021006	GAGAGG	2	12	336779	336790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532462
5502	NC_021006	TCA	2	6	336828	336833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532462
5503	NC_021006	GCCA	2	8	336884	336891	25 %	0 %	25 %	50 %	480532463
5504	NC_021006	CTT	2	6	336892	336897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532463
5505	NC_021006	GTC	2	6	336915	336920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532463
5506	NC_021006	AAT	2	6	336970	336975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532463
5507	NC_021006	ATG	2	6	337038	337043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532463
5508	NC_021006	AGC	2	6	337092	337097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532463
5509	NC_021006	GCC	2	6	337284	337289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532463
5510	NC_021006	CGA	2	6	337318	337323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532463
5511	NC_021006	TCAT	2	8	337350	337357	25 %	50 %	0 %	25 %	480532463
5512	NC_021006	CT	3	6	337443	337448	0 %	50 %	0 %	50 %	480532463
5513	NC_021006	TTG	2	6	337464	337469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532463
5514	NC_021006	TC	3	6	337519	337524	0 %	50 %	0 %	50 %	480532463
5515	NC_021006	CAG	2	6	337525	337530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532463
5516	NC_021006	T	6	6	337612	337617	0 %	100 %	0 %	0 %	480532464
5517	NC_021006	TGCT	2	8	337675	337682	0 %	50 %	25 %	25 %	480532464
5518	NC_021006	TCCAG	2	10	337684	337693	20 %	20 %	20 %	40 %	480532464
5519	NC_021006	A	6	6	337780	337785	100 %	0 %	0 %	0 %	480532464
5520	NC_021006	T	6	6	337926	337931	0 %	100 %	0 %	0 %	480532464
5521	NC_021006	CAT	2	6	338019	338024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532464
5522	NC_021006	A	6	6	338075	338080	100 %	0 %	0 %	0 %	480532464
5523	NC_021006	TTC	2	6	338118	338123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532464
5524	NC_021006	ACC	2	6	338143	338148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532464
5525	NC_021006	CCAGA	2	10	338172	338181	40 %	0 %	20 %	40 %	480532464
5526	NC_021006	ATTTTC	2	12	338311	338322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480532464
5527	NC_021006	AAAT	2	8	338355	338362	75 %	25 %	0 %	0 %	480532465
5528	NC_021006	CT	3	6	338394	338399	0 %	50 %	0 %	50 %	480532465
5529	NC_021006	TTG	2	6	338440	338445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532465
5530	NC_021006	TCT	2	6	338555	338560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532465
5531	NC_021006	TCT	2	6	338588	338593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532465
5532	NC_021006	GAC	2	6	338736	338741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532465
5533	NC_021006	CGCT	2	8	338791	338798	0 %	25 %	25 %	50 %	480532465
5534	NC_021006	ATG	2	6	338810	338815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532465
5535	NC_021006	TCC	2	6	338840	338845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532465
5536	NC_021006	ATCCA	2	10	338935	338944	40 %	20 %	0 %	40 %	480532465
5537	NC_021006	AAATC	2	10	339000	339009	60 %	20 %	0 %	20 %	480532465
5538	NC_021006	TGT	2	6	339018	339023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532465
5539	NC_021006	CCAG	2	8	339029	339036	25 %	0 %	25 %	50 %	480532465
5540	NC_021006	CGAT	2	8	339044	339051	25 %	25 %	25 %	25 %	480532465
5541	NC_021006	ATC	2	6	339106	339111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532465
5542	NC_021006	AGAC	2	8	339219	339226	50 %	0 %	25 %	25 %	480532465
5543	NC_021006	CCA	2	6	339296	339301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532465
5544	NC_021006	CAG	2	6	339352	339357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532465
5545	NC_021006	TGA	2	6	339390	339395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532465
5546	NC_021006	AAT	2	6	339414	339419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532465
5547	NC_021006	T	6	6	339466	339471	0 %	100 %	0 %	0 %	480532465
5548	NC_021006	TTC	2	6	339564	339569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532466
5549	NC_021006	ATCA	2	8	339576	339583	50 %	25 %	0 %	25 %	480532466
5550	NC_021006	TCT	2	6	339589	339594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532466
5551	NC_021006	TCA	2	6	339598	339603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532466
5552	NC_021006	ATT	2	6	339639	339644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532466
5553	NC_021006	T	6	6	339652	339657	0 %	100 %	0 %	0 %	480532466
5554	NC_021006	TCT	2	6	339823	339828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532466
5555	NC_021006	ATC	2	6	339834	339839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532466
5556	NC_021006	T	6	6	339962	339967	0 %	100 %	0 %	0 %	480532467
5557	NC_021006	T	6	6	339969	339974	0 %	100 %	0 %	0 %	480532467
5558	NC_021006	TGA	2	6	340041	340046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532467
5559	NC_021006	ATC	2	6	340155	340160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532467
5560	NC_021006	CAA	2	6	340182	340187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532467
5561	NC_021006	CACATC	2	12	340209	340220	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	480532467
5562	NC_021006	CAA	2	6	340322	340327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532467
5563	NC_021006	AT	3	6	340330	340335	50 %	50 %	0 %	0 %	480532467
5564	NC_021006	TCC	2	6	340357	340362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532468
5565	NC_021006	CTT	2	6	340383	340388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532468
5566	NC_021006	ATAA	2	8	340398	340405	75 %	25 %	0 %	0 %	480532468
5567	NC_021006	GAA	2	6	340464	340469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532468
5568	NC_021006	CTT	2	6	340721	340726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532468
5569	NC_021006	TGA	2	6	340808	340813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532468
5570	NC_021006	ACC	2	6	340860	340865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532468
5571	NC_021006	ACC	2	6	340878	340883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532468
5572	NC_021006	TC	3	6	340901	340906	0 %	50 %	0 %	50 %	480532468
5573	NC_021006	TAG	2	6	340945	340950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532468
5574	NC_021006	CTA	2	6	340982	340987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532468
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5576	NC_021006	CTT	2	6	341033	341038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532468
5577	NC_021006	TCGT	2	8	341173	341180	0 %	50 %	25 %	25 %	480532469
5578	NC_021006	GAATAC	2	12	341277	341288	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480532469
5579	NC_021006	GAA	2	6	341396	341401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532469
5580	NC_021006	ATA	2	6	341441	341446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532469
5581	NC_021006	TCAA	2	8	341462	341469	50 %	25 %	0 %	25 %	480532469
5582	NC_021006	AG	3	6	341499	341504	50 %	0 %	50 %	0 %	480532469
5583	NC_021006	CCCAT	2	10	341624	341633	20 %	20 %	0 %	60 %	480532469
5584	NC_021006	AGC	2	6	341761	341766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532469
5585	NC_021006	ACC	2	6	341786	341791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532469
5586	NC_021006	CAA	2	6	341802	341807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532469
5587	NC_021006	CTG	2	6	341811	341816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532469
5588	NC_021006	T	7	7	341835	341841	0 %	100 %	0 %	0 %	480532469
5589	NC_021006	TAG	2	6	341927	341932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532469
5590	NC_021006	CTT	2	6	342045	342050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532469
5591	NC_021006	CAT	2	6	342064	342069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532469
5592	NC_021006	T	6	6	342202	342207	0 %	100 %	0 %	0 %	480532470
5593	NC_021006	TTTACG	2	12	342229	342240	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480532470
5594	NC_021006	CGT	2	6	342330	342335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532470
5595	NC_021006	ATTC	2	8	342342	342349	25 %	50 %	0 %	25 %	480532470
5596	NC_021006	TAC	2	6	342355	342360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532470
5597	NC_021006	T	7	7	342372	342378	0 %	100 %	0 %	0 %	480532470
5598	NC_021006	T	6	6	342508	342513	0 %	100 %	0 %	0 %	480532471
5599	NC_021006	TAAGC	2	10	342524	342533	40 %	20 %	20 %	20 %	480532471
5600	NC_021006	GAT	2	6	342548	342553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532471
5601	NC_021006	AGGT	2	8	342587	342594	25 %	25 %	50 %	0 %	480532471
5602	NC_021006	AAT	2	6	342662	342667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532471
5603	NC_021006	TTGGG	2	10	342710	342719	0 %	40 %	60 %	0 %	480532471
5604	NC_021006	AAG	2	6	342738	342743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532471
5605	NC_021006	TAG	2	6	342760	342765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532471
5606	NC_021006	CTA	2	6	342778	342783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532471
5607	NC_021006	CTTCAG	2	12	342904	342915	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480532471
5608	NC_021006	CTTT	2	8	342945	342952	0 %	75 %	0 %	25 %	480532471
5609	NC_021006	TCA	2	6	343032	343037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532471
5610	NC_021006	CAA	2	6	343078	343083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532471
5611	NC_021006	TAA	2	6	343207	343212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532471
5612	NC_021006	AT	3	6	343366	343371	50 %	50 %	0 %	0 %	480532472
5613	NC_021006	TGATTT	2	12	343381	343392	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480532472
5614	NC_021006	ATTG	2	8	343408	343415	25 %	50 %	25 %	0 %	480532472
5615	NC_021006	CTC	2	6	343451	343456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532472
5616	NC_021006	TAT	2	6	343504	343509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532472
5617	NC_021006	AGG	2	6	343594	343599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532472
5618	NC_021006	TCC	2	6	343614	343619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532472
5619	NC_021006	GCC	2	6	343707	343712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532472
5620	NC_021006	AGA	2	6	343729	343734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532472
5621	NC_021006	CTG	2	6	343890	343895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532472
5622	NC_021006	CTG	2	6	343905	343910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532472
5623	NC_021006	CTTCA	2	10	343913	343922	20 %	40 %	0 %	40 %	480532472
5624	NC_021006	CTG	2	6	343931	343936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532472
5625	NC_021006	GCT	2	6	344072	344077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532472
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5627	NC_021006	TGG	2	6	344104	344109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532472
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5629	NC_021006	ACC	2	6	344334	344339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532472
5630	NC_021006	TCCA	2	8	344342	344349	25 %	25 %	0 %	50 %	480532472
5631	NC_021006	CTT	2	6	344362	344367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532472
5632	NC_021006	TTTA	2	8	344387	344394	25 %	75 %	0 %	0 %	480532472
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5635	NC_021006	TC	3	6	348662	348667	0 %	50 %	0 %	50 %	480532473
5636	NC_021006	TCA	2	6	348817	348822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532473
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5639	NC_021006	ATG	2	6	349158	349163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532473
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5645	NC_021006	GGCT	2	8	349722	349729	0 %	25 %	50 %	25 %	480532474
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5651	NC_021006	TCA	2	6	350062	350067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532474
5652	NC_021006	TTC	2	6	350136	350141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532474
5653	NC_021006	T	6	6	350226	350231	0 %	100 %	0 %	0 %	480532474
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5657	NC_021006	TTC	3	9	350333	350341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532474
5658	NC_021006	ATCA	2	8	350372	350379	50 %	25 %	0 %	25 %	480532475
5659	NC_021006	ATCTT	2	10	350385	350394	20 %	60 %	0 %	20 %	480532475
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5732	NC_021006	TAAA	2	8	360297	360304	75 %	25 %	0 %	0 %	480532481
5733	NC_021006	T	6	6	360305	360310	0 %	100 %	0 %	0 %	480532481
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5738	NC_021006	CATT	2	8	360476	360483	25 %	50 %	0 %	25 %	480532481
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5992	NC_021006	ACA	2	6	375860	375865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532492
5993	NC_021006	T	6	6	375900	375905	0 %	100 %	0 %	0 %	480532492
5994	NC_021006	TAA	2	6	375931	375936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532492
5995	NC_021006	CTC	2	6	375991	375996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532493
5996	NC_021006	TCA	2	6	376044	376049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532493
5997	NC_021006	CAT	2	6	376096	376101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532493
5998	NC_021006	TCC	2	6	376161	376166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532493
5999	NC_021006	GGA	2	6	376195	376200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532493
6000	NC_021006	AG	3	6	376249	376254	50 %	0 %	50 %	0 %	480532493

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