MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021006	TTC	2	6	275853	275858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532403
4502	NC_021006	AAC	2	6	275880	275885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532403
4503	NC_021006	CA	3	6	275901	275906	50 %	0 %	0 %	50 %	480532403
4504	NC_021006	TC	3	6	275922	275927	0 %	50 %	0 %	50 %	480532403
4505	NC_021006	ACC	2	6	275940	275945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532403
4506	NC_021006	TA	3	6	275948	275953	50 %	50 %	0 %	0 %	480532403
4507	NC_021006	CACT	2	8	276005	276012	25 %	25 %	0 %	50 %	480532403
4508	NC_021006	CTT	2	6	276316	276321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532404
4509	NC_021006	TAGC	2	8	276328	276335	25 %	25 %	25 %	25 %	480532404
4510	NC_021006	AAT	2	6	276467	276472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532405
4511	NC_021006	TAA	2	6	276508	276513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532405
4512	NC_021006	ATAA	2	8	276522	276529	75 %	25 %	0 %	0 %	480532405
4513	NC_021006	AAT	2	6	276530	276535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532405
4514	NC_021006	ATC	2	6	276578	276583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532405
4515	NC_021006	AGT	2	6	276604	276609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532405
4516	NC_021006	ATA	2	6	276783	276788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532405
4517	NC_021006	GCA	2	6	276933	276938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532405
4518	NC_021006	TA	3	6	276950	276955	50 %	50 %	0 %	0 %	480532405
4519	NC_021006	ATT	2	6	277001	277006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532405
4520	NC_021006	AGT	2	6	277026	277031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532405
4521	NC_021006	ATAA	2	8	277067	277074	75 %	25 %	0 %	0 %	480532405
4522	NC_021006	AAAG	2	8	277152	277159	75 %	0 %	25 %	0 %	480532405
4523	NC_021006	TCT	2	6	277249	277254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532405
4524	NC_021006	ACT	2	6	277302	277307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532405
4525	NC_021006	AT	3	6	277354	277359	50 %	50 %	0 %	0 %	480532405
4526	NC_021006	A	6	6	277380	277385	100 %	0 %	0 %	0 %	480532405
4527	NC_021006	TAA	3	9	277386	277394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532405
4528	NC_021006	TAA	2	6	277435	277440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532405
4529	NC_021006	C	6	6	277464	277469	0 %	0 %	0 %	100 %	480532405
4530	NC_021006	ATC	2	6	277523	277528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532405
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4532	NC_021006	TAT	2	6	277553	277558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532405
4533	NC_021006	AG	3	6	277562	277567	50 %	0 %	50 %	0 %	480532405
4534	NC_021006	AAT	2	6	277575	277580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532405
4535	NC_021006	CTC	2	6	277585	277590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532405
4536	NC_021006	ATT	2	6	277652	277657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532405
4537	NC_021006	ATTA	2	8	277664	277671	50 %	50 %	0 %	0 %	480532405
4538	NC_021006	TTA	2	6	277743	277748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532405
4539	NC_021006	TCC	2	6	277787	277792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532406
4540	NC_021006	AC	3	6	277931	277936	50 %	0 %	0 %	50 %	480532406
4541	NC_021006	CTA	2	6	277947	277952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532406
4542	NC_021006	CT	3	6	277954	277959	0 %	50 %	0 %	50 %	480532406
4543	NC_021006	AAT	2	6	277961	277966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532406
4544	NC_021006	TCA	2	6	278012	278017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532406
4545	NC_021006	TGT	2	6	278069	278074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532406
4546	NC_021006	CCA	2	6	278078	278083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532406
4547	NC_021006	CAA	2	6	278094	278099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532406
4548	NC_021006	T	8	8	278164	278171	0 %	100 %	0 %	0 %	480532406
4549	NC_021006	TTG	2	6	278331	278336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532406
4550	NC_021006	TAA	2	6	278362	278367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532406
4551	NC_021006	TAT	2	6	278460	278465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532406
4552	NC_021006	TGA	2	6	278480	278485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532406
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4554	NC_021006	A	6	6	281376	281381	100 %	0 %	0 %	0 %	480532407
4555	NC_021006	GCA	2	6	281382	281387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532407
4556	NC_021006	TAG	2	6	281398	281403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532407
4557	NC_021006	ATAC	2	8	281481	281488	50 %	25 %	0 %	25 %	480532407
4558	NC_021006	GAT	2	6	281514	281519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532407
4559	NC_021006	TTC	2	6	281605	281610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532407
4560	NC_021006	A	6	6	281825	281830	100 %	0 %	0 %	0 %	480532407
4561	NC_021006	GTA	2	6	281859	281864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532407
4562	NC_021006	AGTA	2	8	281894	281901	50 %	25 %	25 %	0 %	480532407
4563	NC_021006	TTG	2	6	281926	281931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532407
4564	NC_021006	AT	3	6	281934	281939	50 %	50 %	0 %	0 %	480532407
4565	NC_021006	ATT	2	6	281948	281953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532407
4566	NC_021006	AAAT	2	8	281973	281980	75 %	25 %	0 %	0 %	480532408
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4569	NC_021006	ATTCA	2	10	282081	282090	40 %	40 %	0 %	20 %	480532408
4570	NC_021006	TTTC	2	8	282148	282155	0 %	75 %	0 %	25 %	480532408
4571	NC_021006	AAT	2	6	282162	282167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532408
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4578	NC_021006	GAA	2	6	282531	282536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532409
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4581	NC_021006	TAGA	2	8	282573	282580	50 %	25 %	25 %	0 %	480532409
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4587	NC_021006	ATC	2	6	282889	282894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532410
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4589	NC_021006	TCA	2	6	282999	283004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532411
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4591	NC_021006	TAA	2	6	283122	283127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532411
4592	NC_021006	ATT	2	6	283167	283172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532411
4593	NC_021006	TCA	2	6	283208	283213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532412
4594	NC_021006	TCA	2	6	283241	283246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532412
4595	NC_021006	TGA	2	6	283315	283320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532412
4596	NC_021006	TCCT	2	8	283324	283331	0 %	50 %	0 %	50 %	480532412
4597	NC_021006	TAT	2	6	283523	283528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532413
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4599	NC_021006	TTC	2	6	283573	283578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532413
4600	NC_021006	CTT	2	6	283599	283604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532413
4601	NC_021006	CAA	2	6	283626	283631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532413
4602	NC_021006	CTT	2	6	283641	283646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532413
4603	NC_021006	AAGACC	2	12	283648	283659	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	480532413
4604	NC_021006	T	6	6	283693	283698	0 %	100 %	0 %	0 %	480532413
4605	NC_021006	GAAT	2	8	283726	283733	50 %	25 %	25 %	0 %	480532413
4606	NC_021006	AGC	2	6	283738	283743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532413
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4608	NC_021006	AGC	2	6	283783	283788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532413
4609	NC_021006	TTC	3	9	283804	283812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532413
4610	NC_021006	TTCAA	2	10	283832	283841	40 %	40 %	0 %	20 %	480532413
4611	NC_021006	CTT	2	6	283851	283856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532413
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4614	NC_021006	AGAA	2	8	284056	284063	75 %	0 %	25 %	0 %	480532414
4615	NC_021006	TGCAAG	2	12	284086	284097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480532414
4616	NC_021006	TCT	2	6	284102	284107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532414
4617	NC_021006	CAC	2	6	284133	284138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532414
4618	NC_021006	CAA	2	6	284235	284240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532414
4619	NC_021006	ACG	2	6	284281	284286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532414
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4621	NC_021006	ACG	2	6	284338	284343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532414
4622	NC_021006	ACG	2	6	284387	284392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532414
4623	NC_021006	GCA	2	6	284399	284404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532414
4624	NC_021006	T	6	6	284412	284417	0 %	100 %	0 %	0 %	480532414
4625	NC_021006	CTA	2	6	284421	284426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532414
4626	NC_021006	T	6	6	284443	284448	0 %	100 %	0 %	0 %	480532414
4627	NC_021006	AAT	2	6	284452	284457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532414
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4629	NC_021006	CAT	2	6	284778	284783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532415
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4631	NC_021006	TTCCA	2	10	284917	284926	20 %	40 %	0 %	40 %	480532415
4632	NC_021006	CTGG	2	8	284980	284987	0 %	25 %	50 %	25 %	480532415
4633	NC_021006	TCT	2	6	285003	285008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532415
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4636	NC_021006	AGTC	2	8	285069	285076	25 %	25 %	25 %	25 %	480532415
4637	NC_021006	ACT	3	9	285086	285094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532415
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4639	NC_021006	ACGG	2	8	285233	285240	25 %	0 %	50 %	25 %	480532415
4640	NC_021006	TTC	2	6	285259	285264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532415
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4646	NC_021006	AG	3	6	285525	285530	50 %	0 %	50 %	0 %	480532415
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4654	NC_021006	ATG	2	6	286386	286391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532416
4655	NC_021006	GAA	2	6	286461	286466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532416
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4657	NC_021006	AG	4	8	286544	286551	50 %	0 %	50 %	0 %	480532416
4658	NC_021006	GTATC	2	10	286575	286584	20 %	40 %	20 %	20 %	480532416
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4661	NC_021006	TG	3	6	286698	286703	0 %	50 %	50 %	0 %	480532416
4662	NC_021006	CTG	2	6	286733	286738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532416
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4715	NC_021006	ATAG	2	8	289787	289794	50 %	25 %	25 %	0 %	480532418
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4731	NC_021006	ATA	2	6	290493	290498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532418
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4733	NC_021006	CTTC	2	8	290522	290529	0 %	50 %	0 %	50 %	480532418
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4741	NC_021006	GCA	2	6	291271	291276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532419
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4743	NC_021006	AGTTG	2	10	291509	291518	20 %	40 %	40 %	0 %	480532419
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4988	NC_021006	TCA	2	6	302848	302853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532430
4989	NC_021006	AGA	2	6	302901	302906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532430
4990	NC_021006	CAA	2	6	302909	302914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532430
4991	NC_021006	AAT	2	6	302988	302993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532430
4992	NC_021006	GCA	2	6	303026	303031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532430
4993	NC_021006	ACC	2	6	303103	303108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532430
4994	NC_021006	CTGTC	2	10	303111	303120	0 %	40 %	20 %	40 %	480532430
4995	NC_021006	ACC	2	6	303171	303176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532430
4996	NC_021006	TTG	2	6	303180	303185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532430
4997	NC_021006	ATA	2	6	303226	303231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532430
4998	NC_021006	TGACT	2	10	303273	303282	20 %	40 %	20 %	20 %	480532430
4999	NC_021006	T	7	7	303392	303398	0 %	100 %	0 %	0 %	480532430
5000	NC_021006	ATC	2	6	303441	303446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532430

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