MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_021005	TGA	2	6	1962450	1962455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532109
31502	NC_021005	TTC	2	6	1962508	1962513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532109
31503	NC_021005	ACA	2	6	1962570	1962575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532109
31504	NC_021005	TGA	2	6	1962663	1962668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532109
31505	NC_021005	GAAG	2	8	1962671	1962678	50 %	0 %	50 %	0 %	480532109
31506	NC_021005	ACC	2	6	1962691	1962696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532109
31507	NC_021005	GACA	2	8	1962724	1962731	50 %	0 %	25 %	25 %	480532109
31508	NC_021005	GGT	2	6	1962746	1962751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532109
31509	NC_021005	GAC	2	6	1962768	1962773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532109
31510	NC_021005	ATC	2	6	1962800	1962805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532109
31511	NC_021005	GAG	2	6	1962820	1962825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532109
31512	NC_021005	GTA	2	6	1962886	1962891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532109
31513	NC_021005	ATC	2	6	1962895	1962900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532109
31514	NC_021005	GTT	2	6	1962928	1962933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532109
31515	NC_021005	CTT	2	6	1962948	1962953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532109
31516	NC_021005	AAT	2	6	1963015	1963020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532109
31517	NC_021005	CCA	2	6	1963148	1963153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532109
31518	NC_021005	AAC	2	6	1963156	1963161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532109
31519	NC_021005	GT	3	6	1963241	1963246	0 %	50 %	50 %	0 %	480532109
31520	NC_021005	AAG	2	6	1963411	1963416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532110
31521	NC_021005	AGC	2	6	1963420	1963425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532110
31522	NC_021005	AAGA	2	8	1963461	1963468	75 %	0 %	25 %	0 %	480532110
31523	NC_021005	TCA	2	6	1963490	1963495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532110
31524	NC_021005	ATC	2	6	1963850	1963855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532111
31525	NC_021005	GAA	2	6	1963985	1963990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532111
31526	NC_021005	CTT	2	6	1964006	1964011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532111
31527	NC_021005	ATA	2	6	1964045	1964050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532111
31528	NC_021005	AGC	2	6	1964136	1964141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532111
31529	NC_021005	TAA	2	6	1964241	1964246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532111
31530	NC_021005	GAA	2	6	1964272	1964277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532111
31531	NC_021005	A	6	6	1964294	1964299	100 %	0 %	0 %	0 %	480532111
31532	NC_021005	AACT	2	8	1964349	1964356	50 %	25 %	0 %	25 %	480532111
31533	NC_021005	GAA	2	6	1964420	1964425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532111
31534	NC_021005	GGTA	2	8	1964475	1964482	25 %	25 %	50 %	0 %	480532111
31535	NC_021005	TTG	2	6	1964492	1964497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532111
31536	NC_021005	AGC	2	6	1964535	1964540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532111
31537	NC_021005	TGC	2	6	1964619	1964624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532111
31538	NC_021005	CAA	3	9	1964648	1964656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532111
31539	NC_021005	ATAG	2	8	1964657	1964664	50 %	25 %	25 %	0 %	480532111
31540	NC_021005	AACT	2	8	1965423	1965430	50 %	25 %	0 %	25 %	480532112
31541	NC_021005	TAA	2	6	1965452	1965457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532112
31542	NC_021005	CTA	2	6	1965531	1965536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532112
31543	NC_021005	CCAG	2	8	1965553	1965560	25 %	0 %	25 %	50 %	480532112
31544	NC_021005	GTC	2	6	1965612	1965617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532112
31545	NC_021005	TCT	2	6	1965624	1965629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532112
31546	NC_021005	ATCC	2	8	1965725	1965732	25 %	25 %	0 %	50 %	480532112
31547	NC_021005	TTC	2	6	1965800	1965805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532112
31548	NC_021005	GAC	2	6	1965843	1965848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532112
31549	NC_021005	TGA	2	6	1965862	1965867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532112
31550	NC_021005	CTGGT	2	10	1965903	1965912	0 %	40 %	40 %	20 %	480532112
31551	NC_021005	CA	3	6	1966018	1966023	50 %	0 %	0 %	50 %	480532112
31552	NC_021005	ATC	2	6	1966024	1966029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532112
31553	NC_021005	AG	3	6	1966101	1966106	50 %	0 %	50 %	0 %	480532112
31554	NC_021005	TCC	2	6	1966117	1966122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532112
31555	NC_021005	ATA	2	6	1966166	1966171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532112
31556	NC_021005	TGAA	2	8	1966174	1966181	50 %	25 %	25 %	0 %	480532112
31557	NC_021005	ATCT	2	8	1966245	1966252	25 %	50 %	0 %	25 %	480532112
31558	NC_021005	ATG	2	6	1966334	1966339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532112
31559	NC_021005	TAA	2	6	1966410	1966415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532112
31560	NC_021005	ATA	2	6	1966671	1966676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532112
31561	NC_021005	TTG	2	6	1967751	1967756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532113
31562	NC_021005	TGA	2	6	1967764	1967769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532113
31563	NC_021005	TCA	2	6	1967825	1967830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532113
31564	NC_021005	ACG	2	6	1967917	1967922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532113
31565	NC_021005	AT	3	6	1967988	1967993	50 %	50 %	0 %	0 %	480532113
31566	NC_021005	G	6	6	1968127	1968132	0 %	0 %	100 %	0 %	480532113
31567	NC_021005	AAT	2	6	1968145	1968150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532113
31568	NC_021005	TGG	2	6	1968151	1968156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532113
31569	NC_021005	TAC	2	6	1968215	1968220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532113
31570	NC_021005	AAC	2	6	1968316	1968321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532113
31571	NC_021005	T	6	6	1968454	1968459	0 %	100 %	0 %	0 %	480532114
31572	NC_021005	AGCTC	2	10	1968467	1968476	20 %	20 %	20 %	40 %	480532114
31573	NC_021005	TTC	2	6	1968490	1968495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532114
31574	NC_021005	CTA	2	6	1968561	1968566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532114
31575	NC_021005	GCT	2	6	1968849	1968854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532115
31576	NC_021005	ACA	2	6	1968870	1968875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532115
31577	NC_021005	GTCTCC	2	12	1968896	1968907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	480532115
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31579	NC_021005	CCTG	2	8	1969044	1969051	0 %	25 %	25 %	50 %	480532115
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31582	NC_021005	AACCA	2	10	1969215	1969224	60 %	0 %	0 %	40 %	480532115
31583	NC_021005	ACC	2	6	1969292	1969297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532115
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31585	NC_021005	CAA	2	6	1969453	1969458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532115
31586	NC_021005	AGA	2	6	1969470	1969475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532115
31587	NC_021005	ATTC	2	8	1969510	1969517	25 %	50 %	0 %	25 %	480532115
31588	NC_021005	ATC	2	6	1969518	1969523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532115
31589	NC_021005	T	6	6	1969596	1969601	0 %	100 %	0 %	0 %	480532116
31590	NC_021005	GTT	2	6	1969616	1969621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532116
31591	NC_021005	GCT	2	6	1969629	1969634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532116
31592	NC_021005	TCT	3	9	1969662	1969670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532116
31593	NC_021005	TGGT	2	8	1969749	1969756	0 %	50 %	50 %	0 %	480532116
31594	NC_021005	ACG	2	6	1969757	1969762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532116
31595	NC_021005	AAG	2	6	1969763	1969768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532116
31596	NC_021005	AGCT	2	8	1969787	1969794	25 %	25 %	25 %	25 %	480532116
31597	NC_021005	TCA	2	6	1970154	1970159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532116
31598	NC_021005	CAG	2	6	1970236	1970241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532116
31599	NC_021005	T	6	6	1970260	1970265	0 %	100 %	0 %	0 %	480532116
31600	NC_021005	GA	3	6	1970271	1970276	50 %	0 %	50 %	0 %	480532116
31601	NC_021005	TCA	2	6	1970313	1970318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532116
31602	NC_021005	CCA	2	6	1970337	1970342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532116
31603	NC_021005	CAAT	2	8	1970368	1970375	50 %	25 %	0 %	25 %	480532116
31604	NC_021005	GCT	2	6	1970393	1970398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532116
31605	NC_021005	ATC	2	6	1970405	1970410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532116
31606	NC_021005	GTT	2	6	1970438	1970443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532116
31607	NC_021005	TCT	2	6	1970469	1970474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532116
31608	NC_021005	AAGT	2	8	1970529	1970536	50 %	25 %	25 %	0 %	480532116
31609	NC_021005	TTA	2	6	1970682	1970687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532116
31610	NC_021005	TGT	2	6	1970720	1970725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532116
31611	NC_021005	TAA	2	6	1970728	1970733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532116
31612	NC_021005	ACA	2	6	1970784	1970789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532116
31613	NC_021005	TTGG	2	8	1970861	1970868	0 %	50 %	50 %	0 %	480532116
31614	NC_021005	GTT	2	6	1970903	1970908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532116
31615	NC_021005	CCT	2	6	1970931	1970936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532116
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31617	NC_021005	TGGC	2	8	1970960	1970967	0 %	25 %	50 %	25 %	480532116
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31962	NC_021005	TCA	2	6	1990035	1990040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532133
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31966	NC_021005	AACC	2	8	1990232	1990239	50 %	0 %	0 %	50 %	480532134
31967	NC_021005	TTC	2	6	1990305	1990310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532134
31968	NC_021005	TCT	2	6	1990316	1990321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532134
31969	NC_021005	CAA	2	6	1990367	1990372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532134
31970	NC_021005	ACA	2	6	1990378	1990383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532134
31971	NC_021005	TCT	2	6	1990387	1990392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532134
31972	NC_021005	ATC	2	6	1990429	1990434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532134
31973	NC_021005	TTC	2	6	1990449	1990454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532134
31974	NC_021005	CTT	2	6	1990499	1990504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532134
31975	NC_021005	T	6	6	1990569	1990574	0 %	100 %	0 %	0 %	480532134
31976	NC_021005	TTC	2	6	1990613	1990618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532134
31977	NC_021005	TCCTTT	2	12	1990623	1990634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532135
31978	NC_021005	GCT	2	6	1990701	1990706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532135
31979	NC_021005	TAC	2	6	1990765	1990770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532135
31980	NC_021005	GAGATA	2	12	1990782	1990793	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480532135
31981	NC_021005	TTC	2	6	1990806	1990811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532135
31982	NC_021005	CTG	2	6	1990858	1990863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532135
31983	NC_021005	TAA	2	6	1990870	1990875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532135
31984	NC_021005	TTC	2	6	1990973	1990978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532135
31985	NC_021005	CG	3	6	1991023	1991028	0 %	0 %	50 %	50 %	480532135
31986	NC_021005	TAGC	2	8	1991037	1991044	25 %	25 %	25 %	25 %	480532135
31987	NC_021005	CAT	2	6	1991096	1991101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532135
31988	NC_021005	CTTG	2	8	1991118	1991125	0 %	50 %	25 %	25 %	480532135
31989	NC_021005	ACT	2	6	1991192	1991197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532135
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31991	NC_021005	TAA	2	6	1991218	1991223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532135
31992	NC_021005	TGG	2	6	1991256	1991261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532135
31993	NC_021005	TAAA	2	8	1991281	1991288	75 %	25 %	0 %	0 %	480532135
31994	NC_021005	CAA	2	6	1991342	1991347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532135
31995	NC_021005	ACA	2	6	1991386	1991391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532135
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31997	NC_021005	ATGA	2	8	1991415	1991422	50 %	25 %	25 %	0 %	480532135
31998	NC_021005	TTC	2	6	1991453	1991458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532135
31999	NC_021005	AAC	2	6	1991499	1991504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532135
32000	NC_021005	CAG	2	6	1991515	1991520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532135

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