MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_021005	ATC	2	6	1849939	1849944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532020
29502	NC_021005	AAC	2	6	1849948	1849953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532020
29503	NC_021005	GTT	2	6	1850012	1850017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532020
29504	NC_021005	CTT	3	9	1850037	1850045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532020
29505	NC_021005	GTT	2	6	1850102	1850107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532020
29506	NC_021005	TTC	2	6	1850227	1850232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532020
29507	NC_021005	TTTG	2	8	1850234	1850241	0 %	75 %	25 %	0 %	480532020
29508	NC_021005	AAG	2	6	1850264	1850269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532020
29509	NC_021005	TGC	2	6	1850275	1850280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532020
29510	NC_021005	CCA	2	6	1850300	1850305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532020
29511	NC_021005	CAG	2	6	1850349	1850354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532020
29512	NC_021005	TTC	2	6	1850374	1850379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532020
29513	NC_021005	AAG	2	6	1850414	1850419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532020
29514	NC_021005	CTG	3	9	1850457	1850465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532020
29515	NC_021005	CAA	2	6	1850502	1850507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532020
29516	NC_021005	AAT	2	6	1850526	1850531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532020
29517	NC_021005	TTCA	2	8	1850726	1850733	25 %	50 %	0 %	25 %	480532021
29518	NC_021005	AAT	2	6	1850745	1850750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532021
29519	NC_021005	TCT	2	6	1850763	1850768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532021
29520	NC_021005	TCG	2	6	1850817	1850822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532021
29521	NC_021005	CTTT	2	8	1850928	1850935	0 %	75 %	0 %	25 %	480532021
29522	NC_021005	CCA	2	6	1850950	1850955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532021
29523	NC_021005	CTTC	2	8	1850958	1850965	0 %	50 %	0 %	50 %	480532021
29524	NC_021005	TTGA	2	8	1851026	1851033	25 %	50 %	25 %	0 %	480532021
29525	NC_021005	CCA	2	6	1851039	1851044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532021
29526	NC_021005	CTTC	2	8	1851109	1851116	0 %	50 %	0 %	50 %	480532021
29527	NC_021005	ATC	2	6	1851155	1851160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532021
29528	NC_021005	TC	3	6	1851178	1851183	0 %	50 %	0 %	50 %	480532021
29529	NC_021005	CCT	2	6	1851210	1851215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532021
29530	NC_021005	TCA	2	6	1851264	1851269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532021
29531	NC_021005	ACC	2	6	1851293	1851298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532021
29532	NC_021005	ATGA	3	12	1851337	1851348	50 %	25 %	25 %	0 %	480532021
29533	NC_021005	GCA	2	6	1851381	1851386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532021
29534	NC_021005	ATG	2	6	1851408	1851413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532021
29535	NC_021005	ATTG	2	8	1851562	1851569	25 %	50 %	25 %	0 %	480532022
29536	NC_021005	TGG	2	6	1851612	1851617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532022
29537	NC_021005	AAT	2	6	1851653	1851658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532022
29538	NC_021005	ACC	2	6	1851723	1851728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532022
29539	NC_021005	TCA	2	6	1851811	1851816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532022
29540	NC_021005	TCA	3	9	1851870	1851878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532022
29541	NC_021005	TGC	2	6	1851938	1851943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532022
29542	NC_021005	ACC	2	6	1852100	1852105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532022
29543	NC_021005	CAT	2	6	1852114	1852119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532022
29544	NC_021005	TGA	2	6	1852129	1852134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532022
29545	NC_021005	ATA	2	6	1852140	1852145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532022
29546	NC_021005	CAA	2	6	1852171	1852176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532022
29547	NC_021005	CTG	2	6	1852177	1852182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532022
29548	NC_021005	TCC	2	6	1852317	1852322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532022
29549	NC_021005	ATA	2	6	1852401	1852406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532022
29550	NC_021005	GTA	2	6	1852412	1852417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532022
29551	NC_021005	CTG	2	6	1852418	1852423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532022
29552	NC_021005	TTC	2	6	1852576	1852581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532022
29553	NC_021005	CAT	2	6	1852631	1852636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532022
29554	NC_021005	CTG	2	6	1852721	1852726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532022
29555	NC_021005	TGA	2	6	1852801	1852806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532022
29556	NC_021005	GGA	2	6	1852903	1852908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532022
29557	NC_021005	TAT	2	6	1852909	1852914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532022
29558	NC_021005	AAAG	2	8	1852964	1852971	75 %	0 %	25 %	0 %	480532022
29559	NC_021005	CG	3	6	1853038	1853043	0 %	0 %	50 %	50 %	480532022
29560	NC_021005	CAG	2	6	1853090	1853095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532022
29561	NC_021005	ATC	2	6	1853241	1853246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532022
29562	NC_021005	AAT	2	6	1853284	1853289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532022
29563	NC_021005	A	7	7	1853293	1853299	100 %	0 %	0 %	0 %	480532022
29564	NC_021005	TTG	2	6	1854126	1854131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532023
29565	NC_021005	CAAT	2	8	1854160	1854167	50 %	25 %	0 %	25 %	480532023
29566	NC_021005	T	6	6	1854217	1854222	0 %	100 %	0 %	0 %	480532023
29567	NC_021005	AAT	3	9	1854227	1854235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532023
29568	NC_021005	GTC	2	6	1854240	1854245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532023
29569	NC_021005	CTT	2	6	1854268	1854273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532023
29570	NC_021005	CCA	2	6	1854381	1854386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532023
29571	NC_021005	TTC	2	6	1854404	1854409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532023
29572	NC_021005	ATGA	2	8	1854440	1854447	50 %	25 %	25 %	0 %	480532023
29573	NC_021005	GC	3	6	1854474	1854479	0 %	0 %	50 %	50 %	480532023
29574	NC_021005	TTCCC	2	10	1854502	1854511	0 %	40 %	0 %	60 %	480532023
29575	NC_021005	TCAC	2	8	1854594	1854601	25 %	25 %	0 %	50 %	480532023
29576	NC_021005	ACCA	2	8	1854710	1854717	50 %	0 %	0 %	50 %	480532023
29577	NC_021005	CCAA	2	8	1854810	1854817	50 %	0 %	0 %	50 %	480532023
29578	NC_021005	ACG	2	6	1854878	1854883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532023
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29581	NC_021005	AG	3	6	1855031	1855036	50 %	0 %	50 %	0 %	480532023
29582	NC_021005	AACC	2	8	1855051	1855058	50 %	0 %	0 %	50 %	480532023
29583	NC_021005	CAT	2	6	1855061	1855066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532023
29584	NC_021005	ACT	2	6	1855077	1855082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532023
29585	NC_021005	AAG	2	6	1855115	1855120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532023
29586	NC_021005	AAG	2	6	1855229	1855234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532023
29587	NC_021005	CAT	2	6	1855262	1855267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532023
29588	NC_021005	CAT	2	6	1855271	1855276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532023
29589	NC_021005	CAG	2	6	1855279	1855284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532023
29590	NC_021005	CACC	2	8	1855319	1855326	25 %	0 %	0 %	75 %	480532023
29591	NC_021005	AAGGT	2	10	1855333	1855342	40 %	20 %	40 %	0 %	480532023
29592	NC_021005	TCA	2	6	1855405	1855410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532023
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29596	NC_021005	AGG	2	6	1855659	1855664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532023
29597	NC_021005	TCA	2	6	1855726	1855731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532023
29598	NC_021005	CTA	2	6	1855950	1855955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532024
29599	NC_021005	TAGGA	2	10	1856014	1856023	40 %	20 %	40 %	0 %	480532024
29600	NC_021005	GAG	2	6	1856085	1856090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532024
29601	NC_021005	CT	3	6	1856093	1856098	0 %	50 %	0 %	50 %	480532024
29602	NC_021005	CTG	2	6	1856151	1856156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532024
29603	NC_021005	GAAG	2	8	1856223	1856230	50 %	0 %	50 %	0 %	480532024
29604	NC_021005	AT	3	6	1856357	1856362	50 %	50 %	0 %	0 %	480532024
29605	NC_021005	GAT	2	6	1856365	1856370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532024
29606	NC_021005	TCA	2	6	1856420	1856425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532024
29607	NC_021005	GA	3	6	1856434	1856439	50 %	0 %	50 %	0 %	480532024
29608	NC_021005	ATT	2	6	1856464	1856469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532024
29609	NC_021005	CAT	2	6	1856476	1856481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532024
29610	NC_021005	CCA	2	6	1856484	1856489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532024
29611	NC_021005	TGAC	2	8	1856497	1856504	25 %	25 %	25 %	25 %	480532024
29612	NC_021005	CTG	2	6	1856520	1856525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532024
29613	NC_021005	CAG	2	6	1856574	1856579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532024
29614	NC_021005	CCG	2	6	1856607	1856612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532024
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