MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20003	NC_021005	CTT	2	6	1234334	1234339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531451
20004	NC_021005	ATG	2	6	1234357	1234362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531451
20005	NC_021005	TCT	2	6	1234369	1234374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531451
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20012	NC_021005	CAT	2	6	1234751	1234756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531451
20013	NC_021005	CTT	2	6	1234790	1234795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531451
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20118	NC_021005	AGC	2	6	1241976	1241981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531458
20119	NC_021005	CTG	2	6	1241982	1241987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531458
20120	NC_021005	ATG	3	9	1242004	1242012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531458
20121	NC_021005	TCT	2	6	1242043	1242048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531458
20122	NC_021005	AGGCTG	2	12	1242074	1242085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480531458
20123	NC_021005	GTT	2	6	1242143	1242148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531458
20124	NC_021005	ACC	2	6	1242153	1242158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531458
20125	NC_021005	TCAT	2	8	1242442	1242449	25 %	50 %	0 %	25 %	480531458
20126	NC_021005	GTAG	2	8	1242468	1242475	25 %	25 %	50 %	0 %	480531458
20127	NC_021005	TTTC	2	8	1242517	1242524	0 %	75 %	0 %	25 %	480531458
20128	NC_021005	TAG	2	6	1242584	1242589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531458
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20130	NC_021005	CTG	2	6	1242759	1242764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531459
20131	NC_021005	CTG	2	6	1242912	1242917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531459
20132	NC_021005	AAC	2	6	1243003	1243008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531459
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20134	NC_021005	CAC	3	9	1243204	1243212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531459
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20136	NC_021005	AAT	2	6	1243324	1243329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531459
20137	NC_021005	CAC	2	6	1243380	1243385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531459
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20145	NC_021005	GCC	2	6	1243830	1243835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480531460
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20156	NC_021005	AAAG	2	8	1244358	1244365	75 %	0 %	25 %	0 %	480531460
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20219	NC_021005	TCA	2	6	1248491	1248496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531465
20220	NC_021005	AAGGA	2	10	1248512	1248521	60 %	0 %	40 %	0 %	480531465
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20222	NC_021005	ATA	2	6	1248557	1248562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531465
20223	NC_021005	GCCTTA	2	12	1248602	1248613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480531465
20224	NC_021005	ATG	2	6	1248618	1248623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531465
20225	NC_021005	CTTTC	2	10	1248856	1248865	0 %	60 %	0 %	40 %	480531466
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20227	NC_021005	AAG	2	6	1248898	1248903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531466
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20232	NC_021005	ATC	2	6	1249002	1249007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531466
20233	NC_021005	ATC	2	6	1249078	1249083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531466
20234	NC_021005	ACT	2	6	1249093	1249098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531466
20235	NC_021005	CTA	2	6	1249190	1249195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531466
20236	NC_021005	GCT	2	6	1249246	1249251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531466
20237	NC_021005	ACGA	2	8	1249253	1249260	50 %	0 %	25 %	25 %	480531466
20238	NC_021005	TCA	2	6	1249307	1249312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531466
20239	NC_021005	TAGA	2	8	1249347	1249354	50 %	25 %	25 %	0 %	480531466
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20241	NC_021005	TCA	2	6	1249478	1249483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531466
20242	NC_021005	GCCA	2	8	1249534	1249541	25 %	0 %	25 %	50 %	480531467
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20246	NC_021005	ATG	2	6	1249688	1249693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531467
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20252	NC_021005	TTG	2	6	1250114	1250119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531467
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20333	NC_021005	CGT	2	6	1254980	1254985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531474
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20335	NC_021005	TAC	2	6	1255005	1255010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531474
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20338	NC_021005	TAAGC	2	10	1255174	1255183	40 %	20 %	20 %	20 %	480531475
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20342	NC_021005	TTGGG	2	10	1255360	1255369	0 %	40 %	60 %	0 %	480531475
20343	NC_021005	AAG	2	6	1255388	1255393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531475
20344	NC_021005	TAG	2	6	1255410	1255415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531475
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20347	NC_021005	CTTT	2	8	1255595	1255602	0 %	75 %	0 %	25 %	480531475
20348	NC_021005	TCA	2	6	1255682	1255687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531475
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20350	NC_021005	TAA	2	6	1255857	1255862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531475
20351	NC_021005	AT	3	6	1256016	1256021	50 %	50 %	0 %	0 %	480531476
20352	NC_021005	TGATTT	2	12	1256031	1256042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480531476
20353	NC_021005	ATTG	2	8	1256058	1256065	25 %	50 %	25 %	0 %	480531476
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