MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021005	GCA	2	6	1204989	1204994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531424
19502	NC_021005	GAA	2	6	1205001	1205006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531424
19503	NC_021005	AACC	2	8	1205020	1205027	50 %	0 %	0 %	50 %	480531424
19504	NC_021005	AGCTAC	2	12	1205054	1205065	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480531424
19505	NC_021005	TCT	2	6	1205067	1205072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531424
19506	NC_021005	CAT	2	6	1205104	1205109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531424
19507	NC_021005	TCG	2	6	1205188	1205193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531424
19508	NC_021005	CAT	2	6	1205236	1205241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531424
19509	NC_021005	CTT	2	6	1205254	1205259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531424
19510	NC_021005	CCA	2	6	1205260	1205265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531424
19511	NC_021005	ACT	2	6	1205298	1205303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531424
19512	NC_021005	CG	3	6	1205311	1205316	0 %	0 %	50 %	50 %	480531424
19513	NC_021005	GAA	2	6	1205353	1205358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531424
19514	NC_021005	CCA	2	6	1205367	1205372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531424
19515	NC_021005	CTG	2	6	1205377	1205382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531424
19516	NC_021005	GTA	2	6	1205387	1205392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531424
19517	NC_021005	AAC	2	6	1205468	1205473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531424
19518	NC_021005	ATC	2	6	1205573	1205578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531424
19519	NC_021005	CTG	2	6	1205608	1205613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531424
19520	NC_021005	CAAG	2	8	1205614	1205621	50 %	0 %	25 %	25 %	480531424
19521	NC_021005	T	7	7	1205625	1205631	0 %	100 %	0 %	0 %	480531424
19522	NC_021005	TGAT	3	12	1205681	1205692	25 %	50 %	25 %	0 %	480531424
19523	NC_021005	TCC	2	6	1205696	1205701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531424
19524	NC_021005	AGG	2	6	1205712	1205717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531424
19525	NC_021005	CAC	2	6	1205725	1205730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531424
19526	NC_021005	T	6	6	1205932	1205937	0 %	100 %	0 %	0 %	480531425
19527	NC_021005	TCA	2	6	1205962	1205967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531425
19528	NC_021005	GAT	2	6	1206064	1206069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531425
19529	NC_021005	ATA	2	6	1206095	1206100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531425
19530	NC_021005	GTA	2	6	1206197	1206202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531425
19531	NC_021005	TTCT	2	8	1206212	1206219	0 %	75 %	0 %	25 %	480531425
19532	NC_021005	CTT	2	6	1206229	1206234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531425
19533	NC_021005	TGCTCT	2	12	1206243	1206254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	480531425
19534	NC_021005	ATC	2	6	1206299	1206304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531425
19535	NC_021005	T	6	6	1206325	1206330	0 %	100 %	0 %	0 %	480531425
19536	NC_021005	TTC	2	6	1206371	1206376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531425
19537	NC_021005	T	6	6	1206553	1206558	0 %	100 %	0 %	0 %	480531425
19538	NC_021005	TTTCAT	2	12	1206650	1206661	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480531425
19539	NC_021005	CAA	2	6	1206962	1206967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531426
19540	NC_021005	GAT	2	6	1206994	1206999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531426
19541	NC_021005	CTT	2	6	1207037	1207042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531426
19542	NC_021005	TTG	2	6	1207142	1207147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531426
19543	NC_021005	ATTG	2	8	1207197	1207204	25 %	50 %	25 %	0 %	480531426
19544	NC_021005	CA	3	6	1207251	1207256	50 %	0 %	0 %	50 %	480531426
19545	NC_021005	AAC	2	6	1207269	1207274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531426
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19548	NC_021005	T	7	7	1207415	1207421	0 %	100 %	0 %	0 %	480531426
19549	NC_021005	TAG	2	6	1207492	1207497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531426
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19551	NC_021005	CCA	2	6	1207512	1207517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531426
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19553	NC_021005	CGT	2	6	1207551	1207556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531426
19554	NC_021005	T	7	7	1207574	1207580	0 %	100 %	0 %	0 %	480531426
19555	NC_021005	CAT	2	6	1207598	1207603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531426
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19558	NC_021005	TGA	2	6	1207672	1207677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531426
19559	NC_021005	TCT	2	6	1207699	1207704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531426
19560	NC_021005	GGA	2	6	1207705	1207710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531426
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19562	NC_021005	TTG	2	6	1207742	1207747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531426
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19567	NC_021005	GAA	2	6	1208002	1208007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531427
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19601	NC_021005	A	6	6	1209611	1209616	100 %	0 %	0 %	0 %	480531428
19602	NC_021005	CTT	2	6	1209694	1209699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531428
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19612	NC_021005	CAT	2	6	1210236	1210241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531428
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19615	NC_021005	TAAT	2	8	1210341	1210348	50 %	50 %	0 %	0 %	480531428
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19617	NC_021005	TTTGT	2	10	1210393	1210402	0 %	80 %	20 %	0 %	480531429
19618	NC_021005	TTG	2	6	1210412	1210417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531429
19619	NC_021005	CTT	2	6	1210525	1210530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531429
19620	NC_021005	CTT	2	6	1210615	1210620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531429
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19648	NC_021005	T	7	7	1211446	1211452	0 %	100 %	0 %	0 %	480531429
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19717	NC_021005	A	6	6	1215043	1215048	100 %	0 %	0 %	0 %	480531433
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19722	NC_021005	ATC	2	6	1215350	1215355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531434
19723	NC_021005	CCTTGA	2	12	1215429	1215440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480531434
19724	NC_021005	CTC	2	6	1215442	1215447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531434
19725	NC_021005	CTTGGG	2	12	1215471	1215482	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480531434
19726	NC_021005	AAT	2	6	1215496	1215501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531434
19727	NC_021005	TCA	2	6	1215509	1215514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531434
19728	NC_021005	AGA	2	6	1215562	1215567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531434
19729	NC_021005	CAA	2	6	1215570	1215575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531434
19730	NC_021005	AAT	2	6	1215649	1215654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531434
19731	NC_021005	GCA	2	6	1215687	1215692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531434
19732	NC_021005	ACC	2	6	1215764	1215769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531434
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19734	NC_021005	ACC	2	6	1215832	1215837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531434
19735	NC_021005	TTG	2	6	1215841	1215846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531434
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19753	NC_021005	T	6	6	1216915	1216920	0 %	100 %	0 %	0 %	480531436
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19847	NC_021005	TAC	2	6	1221818	1221823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531441
19848	NC_021005	T	6	6	1221831	1221836	0 %	100 %	0 %	0 %	480531441
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19853	NC_021005	GTTT	2	8	1222036	1222043	0 %	75 %	25 %	0 %	480531441
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19857	NC_021005	TCA	2	6	1222367	1222372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531441
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19969	NC_021005	TTA	2	6	1232288	1232293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531448
19970	NC_021005	AAT	2	6	1232355	1232360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531448
19971	NC_021005	TCT	2	6	1232510	1232515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531448
19972	NC_021005	T	7	7	1232670	1232676	0 %	100 %	0 %	0 %	480531448
19973	NC_021005	TGCT	2	8	1232679	1232686	0 %	50 %	25 %	25 %	480531448
19974	NC_021005	CCT	2	6	1232687	1232692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531449
19975	NC_021005	GA	3	6	1232699	1232704	50 %	0 %	50 %	0 %	480531449
19976	NC_021005	TAA	2	6	1232710	1232715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531449
19977	NC_021005	ATA	2	6	1232728	1232733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531449
19978	NC_021005	AAG	2	6	1232842	1232847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531449
19979	NC_021005	ATC	2	6	1232859	1232864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531449
19980	NC_021005	CATT	2	8	1232990	1232997	25 %	50 %	0 %	25 %	480531449
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19982	NC_021005	AAG	2	6	1233109	1233114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531449
19983	NC_021005	ATT	2	6	1233153	1233158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531449
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19985	NC_021005	ATC	2	6	1233351	1233356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531449
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19988	NC_021005	TGA	2	6	1233481	1233486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531450
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19991	NC_021005	ATAG	2	8	1233669	1233676	50 %	25 %	25 %	0 %	480531450
19992	NC_021005	ATGAC	2	10	1233684	1233693	40 %	20 %	20 %	20 %	480531450
19993	NC_021005	TGA	2	6	1233736	1233741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531450
19994	NC_021005	ATT	2	6	1233743	1233748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531450
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19997	NC_021005	AGGT	2	8	1234083	1234090	25 %	25 %	50 %	0 %	480531450
19998	NC_021005	CTAAA	2	10	1234126	1234135	60 %	20 %	0 %	20 %	480531450
19999	NC_021005	TTC	2	6	1234245	1234250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531450
20000	NC_021005	TCC	2	6	1234258	1234263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531451

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