MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_021005	TCT	2	6	1109111	1109116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531338
18003	NC_021005	TAG	2	6	1109223	1109228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531338
18004	NC_021005	TTCT	2	8	1109317	1109324	0 %	75 %	0 %	25 %	480531339
18005	NC_021005	TCT	2	6	1109478	1109483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531339
18006	NC_021005	GTT	2	6	1109562	1109567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531339
18007	NC_021005	CAT	2	6	1109607	1109612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531339
18008	NC_021005	ATC	2	6	1109707	1109712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531339
18009	NC_021005	CAT	2	6	1109745	1109750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531339
18010	NC_021005	GGTTTT	2	12	1109788	1109799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531339
18011	NC_021005	GAA	2	6	1109825	1109830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531339
18012	NC_021005	CCATA	2	10	1109895	1109904	40 %	20 %	0 %	40 %	480531339
18013	NC_021005	TCT	2	6	1109975	1109980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531339
18014	NC_021005	CTT	2	6	1110049	1110054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531339
18015	NC_021005	T	6	6	1110053	1110058	0 %	100 %	0 %	0 %	480531339
18016	NC_021005	TCT	2	6	1110138	1110143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531340
18017	NC_021005	TCC	2	6	1110150	1110155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531340
18018	NC_021005	CTT	3	9	1110160	1110168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531340
18019	NC_021005	TGT	2	6	1110252	1110257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531340
18020	NC_021005	TAA	2	6	1110259	1110264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531340
18021	NC_021005	ACC	2	6	1110296	1110301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531340
18022	NC_021005	ATC	2	6	1110402	1110407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531340
18023	NC_021005	ATT	2	6	1110470	1110475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531340
18024	NC_021005	TCCA	2	8	1110519	1110526	25 %	25 %	0 %	50 %	480531340
18025	NC_021005	TC	3	6	1110546	1110551	0 %	50 %	0 %	50 %	480531340
18026	NC_021005	T	6	6	1110563	1110568	0 %	100 %	0 %	0 %	480531340
18027	NC_021005	TAA	2	6	1110616	1110621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531340
18028	NC_021005	GGA	2	6	1110685	1110690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531340
18029	NC_021005	CAT	2	6	1110707	1110712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531340
18030	NC_021005	TCA	2	6	1110723	1110728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531340
18031	NC_021005	CA	3	6	1110763	1110768	50 %	0 %	0 %	50 %	480531340
18032	NC_021005	TTCG	2	8	1110856	1110863	0 %	50 %	25 %	25 %	480531340
18033	NC_021005	TTC	2	6	1110866	1110871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531340
18034	NC_021005	CGT	2	6	1110884	1110889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531340
18035	NC_021005	CCA	2	6	1110904	1110909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531340
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18037	NC_021005	AATCA	2	10	1111019	1111028	60 %	20 %	0 %	20 %	480531340
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18039	NC_021005	AACC	2	8	1111094	1111101	50 %	0 %	0 %	50 %	480531340
18040	NC_021005	CTT	2	6	1111109	1111114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531340
18041	NC_021005	CT	3	6	1111206	1111211	0 %	50 %	0 %	50 %	480531340
18042	NC_021005	TGAG	2	8	1111227	1111234	25 %	25 %	50 %	0 %	480531340
18043	NC_021005	ATT	2	6	1111262	1111267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531340
18044	NC_021005	AAT	2	6	1111315	1111320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531340
18045	NC_021005	TGAT	2	8	1111347	1111354	25 %	50 %	25 %	0 %	480531340
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18048	NC_021005	GATAAA	2	12	1111433	1111444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	480531340
18049	NC_021005	GTTT	2	8	1111461	1111468	0 %	75 %	25 %	0 %	480531340
18050	NC_021005	ATT	2	6	1111482	1111487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531340
18051	NC_021005	TCT	2	6	1111553	1111558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531341
18052	NC_021005	CGT	2	6	1111567	1111572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531341
18053	NC_021005	CAAG	2	8	1111628	1111635	50 %	0 %	25 %	25 %	480531341
18054	NC_021005	CG	3	6	1111640	1111645	0 %	0 %	50 %	50 %	480531341
18055	NC_021005	TGA	2	6	1111646	1111651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531341
18056	NC_021005	TTC	2	6	1111713	1111718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531341
18057	NC_021005	T	6	6	1111725	1111730	0 %	100 %	0 %	0 %	480531341
18058	NC_021005	ACG	2	6	1111827	1111832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531341
18059	NC_021005	AGA	2	6	1111834	1111839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531341
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18061	NC_021005	CCTT	2	8	1112107	1112114	0 %	50 %	0 %	50 %	480531341
18062	NC_021005	ATA	2	6	1112131	1112136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531341
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18065	NC_021005	T	6	6	1112282	1112287	0 %	100 %	0 %	0 %	480531342
18066	NC_021005	TTC	2	6	1112319	1112324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531342
18067	NC_021005	TCAC	2	8	1112368	1112375	25 %	25 %	0 %	50 %	480531342
18068	NC_021005	AAAC	2	8	1112437	1112444	75 %	0 %	0 %	25 %	480531342
18069	NC_021005	CTG	2	6	1112475	1112480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531342
18070	NC_021005	CT	3	6	1112485	1112490	0 %	50 %	0 %	50 %	480531342
18071	NC_021005	TTC	2	6	1112517	1112522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531342
18072	NC_021005	TGA	2	6	1112530	1112535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531342
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18074	NC_021005	T	7	7	1112623	1112629	0 %	100 %	0 %	0 %	480531342
18075	NC_021005	TTC	2	6	1112769	1112774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531342
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18087	NC_021005	GAAA	2	8	1113351	1113358	75 %	0 %	25 %	0 %	480531342
18088	NC_021005	TCC	2	6	1113367	1113372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531342
18089	NC_021005	GCT	2	6	1113788	1113793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531343
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18101	NC_021005	ACG	2	6	1114930	1114935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531343
18102	NC_021005	TCAA	2	8	1114976	1114983	50 %	25 %	0 %	25 %	480531343
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18104	NC_021005	GCAT	2	8	1115015	1115022	25 %	25 %	25 %	25 %	480531343
18105	NC_021005	CAC	2	6	1115076	1115081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531343
18106	NC_021005	CAG	2	6	1115082	1115087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531343
18107	NC_021005	CAC	2	6	1115088	1115093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531343
18108	NC_021005	TCG	2	6	1115324	1115329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531343
18109	NC_021005	ACA	2	6	1115351	1115356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531343
18110	NC_021005	CAA	2	6	1115358	1115363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531343
18111	NC_021005	TTCA	2	8	1115405	1115412	25 %	50 %	0 %	25 %	480531343
18112	NC_021005	GTTT	2	8	1115765	1115772	0 %	75 %	25 %	0 %	480531344
18113	NC_021005	CCTAA	2	10	1115810	1115819	40 %	20 %	0 %	40 %	480531344
18114	NC_021005	TACCAA	2	12	1115833	1115844	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480531344
18115	NC_021005	AAGC	2	8	1115983	1115990	50 %	0 %	25 %	25 %	480531344
18116	NC_021005	ATC	2	6	1115994	1115999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531344
18117	NC_021005	TTC	2	6	1116010	1116015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531344
18118	NC_021005	TGA	2	6	1116019	1116024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531344
18119	NC_021005	GGAAT	2	10	1116076	1116085	40 %	20 %	40 %	0 %	480531344
18120	NC_021005	CTA	2	6	1116087	1116092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531344
18121	NC_021005	CTG	2	6	1116113	1116118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531344
18122	NC_021005	ATC	2	6	1116135	1116140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531344
18123	NC_021005	ATC	2	6	1116188	1116193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531344
18124	NC_021005	TTG	2	6	1116240	1116245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531344
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18126	NC_021005	CTC	2	6	1116293	1116298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531344
18127	NC_021005	A	6	6	1116303	1116308	100 %	0 %	0 %	0 %	480531344
18128	NC_021005	A	7	7	1116411	1116417	100 %	0 %	0 %	0 %	480531345
18129	NC_021005	GCT	2	6	1116451	1116456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531345
18130	NC_021005	A	7	7	1116564	1116570	100 %	0 %	0 %	0 %	480531345
18131	NC_021005	ATTT	2	8	1116575	1116582	25 %	75 %	0 %	0 %	480531345
18132	NC_021005	ACA	2	6	1116638	1116643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531345
18133	NC_021005	TAA	2	6	1116689	1116694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531345
18134	NC_021005	AAT	2	6	1116739	1116744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531345
18135	NC_021005	CTA	2	6	1116796	1116801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531345
18136	NC_021005	GAG	2	6	1116821	1116826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531345
18137	NC_021005	ATT	2	6	1116844	1116849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531345
18138	NC_021005	AGAA	2	8	1116852	1116859	75 %	0 %	25 %	0 %	480531345
18139	NC_021005	A	6	6	1116878	1116883	100 %	0 %	0 %	0 %	480531345
18140	NC_021005	T	6	6	1116911	1116916	0 %	100 %	0 %	0 %	480531346
18141	NC_021005	TTTCCA	2	12	1116965	1116976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480531346
18142	NC_021005	ATT	2	6	1117007	1117012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531346
18143	NC_021005	ATT	2	6	1117019	1117024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531346
18144	NC_021005	ACGATT	2	12	1117088	1117099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480531346
18145	NC_021005	TC	3	6	1117119	1117124	0 %	50 %	0 %	50 %	480531346
18146	NC_021005	CTTA	2	8	1117197	1117204	25 %	50 %	0 %	25 %	480531346
18147	NC_021005	TGA	2	6	1117215	1117220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531346
18148	NC_021005	GGA	2	6	1117286	1117291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531346
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18150	NC_021005	CTT	2	6	1117334	1117339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531346
18151	NC_021005	CAA	2	6	1117356	1117361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531346
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18153	NC_021005	ATGACA	2	12	1117747	1117758	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480531347
18154	NC_021005	TGGC	2	8	1117928	1117935	0 %	25 %	50 %	25 %	480531347
18155	NC_021005	AT	3	6	1117970	1117975	50 %	50 %	0 %	0 %	480531347
18156	NC_021005	TGT	2	6	1118067	1118072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531347
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18179	NC_021005	GC	3	6	1119418	1119423	0 %	0 %	50 %	50 %	480531350
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18187	NC_021005	TCA	2	6	1119709	1119714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531350
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18199	NC_021005	TCCA	2	8	1120070	1120077	25 %	25 %	0 %	50 %	480531351
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18203	NC_021005	CAT	2	6	1120236	1120241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531351
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18205	NC_021005	CT	3	6	1120302	1120307	0 %	50 %	0 %	50 %	480531351
18206	NC_021005	TAAA	2	8	1120318	1120325	75 %	25 %	0 %	0 %	480531351
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18210	NC_021005	TTGT	2	8	1120459	1120466	0 %	75 %	25 %	0 %	480531352
18211	NC_021005	TTTC	2	8	1120539	1120546	0 %	75 %	0 %	25 %	480531352
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18216	NC_021005	CCTT	2	8	1120736	1120743	0 %	50 %	0 %	50 %	480531352
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18219	NC_021005	T	7	7	1120979	1120985	0 %	100 %	0 %	0 %	480531352
18220	NC_021005	TCA	2	6	1121015	1121020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531352
18221	NC_021005	CGGA	2	8	1121035	1121042	25 %	0 %	50 %	25 %	480531352
18222	NC_021005	TGA	2	6	1121150	1121155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531352
18223	NC_021005	CTC	2	6	1121170	1121175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531352
18224	NC_021005	ATC	2	6	1121317	1121322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531352
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18227	NC_021005	TCCA	2	8	1121368	1121375	25 %	25 %	0 %	50 %	480531352
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18229	NC_021005	CCTT	2	8	1121480	1121487	0 %	50 %	0 %	50 %	480531352
18230	NC_021005	TTC	2	6	1121506	1121511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531352
18231	NC_021005	GTC	2	6	1121551	1121556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531352
18232	NC_021005	GT	3	6	1121569	1121574	0 %	50 %	50 %	0 %	480531352
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18234	NC_021005	A	6	6	1121662	1121667	100 %	0 %	0 %	0 %	480531352
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18352	NC_021005	TCG	2	6	1128568	1128573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531357
18353	NC_021005	AGCT	2	8	1128583	1128590	25 %	25 %	25 %	25 %	480531357
18354	NC_021005	CTG	2	6	1128618	1128623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531357
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18467	NC_021005	CTGCT	2	10	1134592	1134601	0 %	40 %	20 %	40 %	480531361
18468	NC_021005	CAA	2	6	1134645	1134650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531361
18469	NC_021005	ATC	2	6	1134770	1134775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531361
18470	NC_021005	GATA	2	8	1134813	1134820	50 %	25 %	25 %	0 %	480531361
18471	NC_021005	AAG	2	6	1134853	1134858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531361
18472	NC_021005	ACC	2	6	1134910	1134915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531361
18473	NC_021005	TTC	2	6	1134922	1134927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531361
18474	NC_021005	CTC	2	6	1134988	1134993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531361
18475	NC_021005	T	6	6	1135048	1135053	0 %	100 %	0 %	0 %	480531361
18476	NC_021005	TG	3	6	1135116	1135121	0 %	50 %	50 %	0 %	480531361
18477	NC_021005	ATA	2	6	1135779	1135784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531362
18478	NC_021005	ATCATG	2	12	1135858	1135869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480531362
18479	NC_021005	TCC	2	6	1135917	1135922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531362
18480	NC_021005	AGC	2	6	1135968	1135973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531362
18481	NC_021005	ACC	2	6	1135983	1135988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531362
18482	NC_021005	TAG	2	6	1136048	1136053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531362
18483	NC_021005	TTCT	2	8	1136133	1136140	0 %	75 %	0 %	25 %	480531362
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18485	NC_021005	TCA	2	6	1136326	1136331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531362
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18487	NC_021005	ATTT	2	8	1136489	1136496	25 %	75 %	0 %	0 %	480531362
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18491	NC_021005	TCT	2	6	1136764	1136769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531363
18492	NC_021005	CAT	2	6	1136778	1136783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531363
18493	NC_021005	CTT	2	6	1136835	1136840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531363
18494	NC_021005	ACTG	2	8	1136884	1136891	25 %	25 %	25 %	25 %	480531363
18495	NC_021005	T	6	6	1137000	1137005	0 %	100 %	0 %	0 %	480531363
18496	NC_021005	CAA	2	6	1137135	1137140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531363
18497	NC_021005	T	6	6	1137194	1137199	0 %	100 %	0 %	0 %	480531363
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18499	NC_021005	GATT	2	8	1137301	1137308	25 %	50 %	25 %	0 %	480531363
18500	NC_021005	AAT	2	6	1137315	1137320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531363

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