MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_021005	ATTT	2	8	866559	866566	25 %	75 %	0 %	0 %	480531133
14003	NC_021005	T	7	7	866564	866570	0 %	100 %	0 %	0 %	480531133
14004	NC_021005	AGA	2	6	866649	866654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531133
14005	NC_021005	AGC	2	6	866664	866669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531133
14006	NC_021005	TA	3	6	866710	866715	50 %	50 %	0 %	0 %	480531133
14007	NC_021005	AATG	2	8	866740	866747	50 %	25 %	25 %	0 %	480531133
14008	NC_021005	GAC	2	6	866761	866766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531133
14009	NC_021005	TGG	2	6	866784	866789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531133
14010	NC_021005	AGA	2	6	866814	866819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531133
14011	NC_021005	TAT	2	6	866833	866838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531133
14012	NC_021005	AGA	2	6	866916	866921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531133
14013	NC_021005	AGAA	2	8	866984	866991	75 %	0 %	25 %	0 %	480531133
14014	NC_021005	TAT	2	6	867016	867021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531133
14015	NC_021005	GGT	2	6	867031	867036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531133
14016	NC_021005	GTG	2	6	867083	867088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531133
14017	NC_021005	ACAA	2	8	867116	867123	75 %	0 %	0 %	25 %	480531133
14018	NC_021005	TAT	3	9	867196	867204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531133
14019	NC_021005	TGG	2	6	867213	867218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531133
14020	NC_021005	AATG	2	8	867232	867239	50 %	25 %	25 %	0 %	480531133
14021	NC_021005	TAC	2	6	867331	867336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531133
14022	NC_021005	AATG	2	8	867364	867371	50 %	25 %	25 %	0 %	480531133
14023	NC_021005	TAC	2	6	867463	867468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531133
14024	NC_021005	GGT	2	6	867478	867483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531133
14025	NC_021005	AATG	2	8	867496	867503	50 %	25 %	25 %	0 %	480531133
14026	NC_021005	TAC	2	6	867595	867600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531133
14027	NC_021005	TGG	2	6	867609	867614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531133
14028	NC_021005	GGA	2	6	867676	867681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531133
14029	NC_021005	TGC	2	6	867699	867704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531133
14030	NC_021005	AGT	2	6	867714	867719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531133
14031	NC_021005	TA	3	6	867766	867771	50 %	50 %	0 %	0 %	480531133
14032	NC_021005	TGA	2	6	867813	867818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531133
14033	NC_021005	AGA	2	6	867867	867872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531133
14034	NC_021005	TTA	2	6	867909	867914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531133
14035	NC_021005	ATT	2	6	868010	868015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531133
14036	NC_021005	CCTT	2	8	868058	868065	0 %	50 %	0 %	50 %	480531133
14037	NC_021005	GAA	2	6	868102	868107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531133
14038	NC_021005	GAA	2	6	868183	868188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531133
14039	NC_021005	GAA	2	6	868247	868252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531133
14040	NC_021005	AAT	2	6	868273	868278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531133
14041	NC_021005	TGA	2	6	868332	868337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531133
14042	NC_021005	GAA	2	6	868397	868402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531133
14043	NC_021005	A	6	6	868466	868471	100 %	0 %	0 %	0 %	480531133
14044	NC_021005	TGA	3	9	868481	868489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531133
14045	NC_021005	T	6	6	868588	868593	0 %	100 %	0 %	0 %	480531134
14046	NC_021005	T	7	7	868605	868611	0 %	100 %	0 %	0 %	480531134
14047	NC_021005	CCA	2	6	868670	868675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531134
14048	NC_021005	T	6	6	868690	868695	0 %	100 %	0 %	0 %	480531134
14049	NC_021005	GA	3	6	868740	868745	50 %	0 %	50 %	0 %	480531134
14050	NC_021005	CTG	2	6	868761	868766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531134
14051	NC_021005	GTCT	2	8	868768	868775	0 %	50 %	25 %	25 %	480531134
14052	NC_021005	ACA	2	6	868811	868816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531134
14053	NC_021005	TCC	2	6	868853	868858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531134
14054	NC_021005	GAT	2	6	868915	868920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531134
14055	NC_021005	T	6	6	868954	868959	0 %	100 %	0 %	0 %	480531134
14056	NC_021005	TCT	2	6	868984	868989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531134
14057	NC_021005	TTC	2	6	869014	869019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531134
14058	NC_021005	TCCAG	2	10	869039	869048	20 %	20 %	20 %	40 %	480531134
14059	NC_021005	TCAA	2	8	869105	869112	50 %	25 %	0 %	25 %	480531134
14060	NC_021005	CTT	2	6	869133	869138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531134
14061	NC_021005	GGTT	2	8	869216	869223	0 %	50 %	50 %	0 %	480531134
14062	NC_021005	TAG	2	6	869228	869233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531134
14063	NC_021005	TGG	2	6	869270	869275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531134
14064	NC_021005	TTC	2	6	869311	869316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531134
14065	NC_021005	TGTC	2	8	869322	869329	0 %	50 %	25 %	25 %	480531134
14066	NC_021005	T	6	6	869350	869355	0 %	100 %	0 %	0 %	480531134
14067	NC_021005	ACG	2	6	869392	869397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531134
14068	NC_021005	CTG	2	6	869413	869418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531134
14069	NC_021005	CCTTAT	2	12	869439	869450	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480531134
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14072	NC_021005	A	6	6	869561	869566	100 %	0 %	0 %	0 %	480531134
14073	NC_021005	T	6	6	869657	869662	0 %	100 %	0 %	0 %	480531134
14074	NC_021005	GA	3	6	869725	869730	50 %	0 %	50 %	0 %	480531134
14075	NC_021005	TGC	2	6	870114	870119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531134
14076	NC_021005	TGAT	2	8	870152	870159	25 %	50 %	25 %	0 %	480531134
14077	NC_021005	TTCGC	2	10	870184	870193	0 %	40 %	20 %	40 %	480531134
14078	NC_021005	A	8	8	870215	870222	100 %	0 %	0 %	0 %	480531134
14079	NC_021005	CAA	2	6	870393	870398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531135
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14089	NC_021005	GGTTTT	2	12	870967	870978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531136
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14092	NC_021005	TGG	2	6	871067	871072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531136
14093	NC_021005	GGC	2	6	871125	871130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480531136
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14097	NC_021005	CTG	2	6	871509	871514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531137
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14099	NC_021005	TCCA	2	8	871608	871615	25 %	25 %	0 %	50 %	480531137
14100	NC_021005	TGA	2	6	871636	871641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531137
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14102	NC_021005	AGAC	2	8	871896	871903	50 %	0 %	25 %	25 %	480531137
14103	NC_021005	CAT	2	6	871924	871929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531137
14104	NC_021005	ATC	2	6	871958	871963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531137
14105	NC_021005	CGT	2	6	872006	872011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531137
14106	NC_021005	GTCAAG	2	12	872057	872068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480531137
14107	NC_021005	AGA	2	6	872241	872246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531138
14108	NC_021005	GAT	2	6	872275	872280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531138
14109	NC_021005	CGT	2	6	872342	872347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531138
14110	NC_021005	GACA	2	8	872371	872378	50 %	0 %	25 %	25 %	480531138
14111	NC_021005	TAT	2	6	872420	872425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531138
14112	NC_021005	TTC	2	6	872462	872467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531138
14113	NC_021005	A	6	6	872567	872572	100 %	0 %	0 %	0 %	480531138
14114	NC_021005	AGACC	2	10	872665	872674	40 %	0 %	20 %	40 %	480531138
14115	NC_021005	CAG	2	6	872760	872765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531138
14116	NC_021005	AAG	2	6	872766	872771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531138
14117	NC_021005	GACCA	2	10	872786	872795	40 %	0 %	20 %	40 %	480531138
14118	NC_021005	CCA	2	6	872832	872837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531138
14119	NC_021005	TCA	2	6	872887	872892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531138
14120	NC_021005	CAT	2	6	872935	872940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531138
14121	NC_021005	AGG	2	6	872993	872998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531138
14122	NC_021005	TGA	2	6	873002	873007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531138
14123	NC_021005	ATC	2	6	873013	873018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531139
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14127	NC_021005	CTAG	2	8	873211	873218	25 %	25 %	25 %	25 %	480531139
14128	NC_021005	GA	3	6	873300	873305	50 %	0 %	50 %	0 %	480531139
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14133	NC_021005	GCCA	2	8	873514	873521	25 %	0 %	25 %	50 %	480531139
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14140	NC_021005	TGG	2	6	874057	874062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531140
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14157	NC_021005	TTTG	2	8	875016	875023	0 %	75 %	25 %	0 %	480531142
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14161	NC_021005	GAA	2	6	875385	875390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531143
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14231	NC_021005	ATCAA	2	10	879530	879539	60 %	20 %	0 %	20 %	480531146
14232	NC_021005	A	6	6	879599	879604	100 %	0 %	0 %	0 %	480531146
14233	NC_021005	AGGACA	2	12	879626	879637	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480531146
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14238	NC_021005	CCA	2	6	879874	879879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531146
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14351	NC_021005	A	7	7	886735	886741	100 %	0 %	0 %	0 %	480531153
14352	NC_021005	TCT	2	6	886756	886761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531153
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14354	NC_021005	GA	3	6	886775	886780	50 %	0 %	50 %	0 %	480531153
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14482	NC_021005	CAG	2	6	895270	895275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531162
14483	NC_021005	AAACT	2	10	895282	895291	60 %	20 %	0 %	20 %	480531162
14484	NC_021005	T	7	7	895613	895619	0 %	100 %	0 %	0 %	480531163
14485	NC_021005	GAT	2	6	895667	895672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531163
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14487	NC_021005	TC	4	8	895758	895765	0 %	50 %	0 %	50 %	480531163
14488	NC_021005	TAT	3	9	895846	895854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531163
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14490	NC_021005	A	6	6	895908	895913	100 %	0 %	0 %	0 %	480531163
14491	NC_021005	A	6	6	895925	895930	100 %	0 %	0 %	0 %	480531163
14492	NC_021005	T	6	6	895957	895962	0 %	100 %	0 %	0 %	480531163
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