MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021005	AGA	2	6	836124	836129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531102
13503	NC_021005	CAA	2	6	836138	836143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531102
13504	NC_021005	TGT	2	6	836152	836157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531102
13505	NC_021005	GCT	2	6	836189	836194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531102
13506	NC_021005	ATGT	2	8	836201	836208	25 %	50 %	25 %	0 %	480531102
13507	NC_021005	GTCT	2	8	836220	836227	0 %	50 %	25 %	25 %	480531102
13508	NC_021005	CGT	2	6	836303	836308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531102
13509	NC_021005	GAA	3	9	836384	836392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531102
13510	NC_021005	CTT	2	6	836428	836433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531102
13511	NC_021005	CCA	2	6	836435	836440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531102
13512	NC_021005	ACT	2	6	836501	836506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531102
13513	NC_021005	CAA	2	6	836563	836568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531102
13514	NC_021005	GGA	2	6	836698	836703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531102
13515	NC_021005	CGGA	2	8	836843	836850	25 %	0 %	50 %	25 %	480531102
13516	NC_021005	GAA	2	6	836957	836962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531102
13517	NC_021005	CT	3	6	836985	836990	0 %	50 %	0 %	50 %	480531102
13518	NC_021005	A	7	7	837037	837043	100 %	0 %	0 %	0 %	480531102
13519	NC_021005	CAG	2	6	837112	837117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531103
13520	NC_021005	ACCT	2	8	837166	837173	25 %	25 %	0 %	50 %	480531103
13521	NC_021005	CAG	2	6	837211	837216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531103
13522	NC_021005	GGA	2	6	837282	837287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531103
13523	NC_021005	TAA	2	6	837317	837322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531103
13524	NC_021005	GGT	2	6	837328	837333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531103
13525	NC_021005	GTCA	2	8	837355	837362	25 %	25 %	25 %	25 %	480531103
13526	NC_021005	TGT	2	6	837369	837374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531103
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13528	NC_021005	ATTG	2	8	837456	837463	25 %	50 %	25 %	0 %	480531103
13529	NC_021005	AAAT	2	8	837479	837486	75 %	25 %	0 %	0 %	480531103
13530	NC_021005	TGG	2	6	837505	837510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531104
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13532	NC_021005	GTC	2	6	837644	837649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531104
13533	NC_021005	TCT	2	6	837895	837900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531104
13534	NC_021005	GAT	2	6	837917	837922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531104
13535	NC_021005	TC	3	6	837962	837967	0 %	50 %	0 %	50 %	480531104
13536	NC_021005	GTG	2	6	838011	838016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531104
13537	NC_021005	TAG	2	6	838134	838139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531104
13538	NC_021005	TCA	2	6	838165	838170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531104
13539	NC_021005	TGA	2	6	838213	838218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531104
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13541	NC_021005	GA	3	6	838355	838360	50 %	0 %	50 %	0 %	480531104
13542	NC_021005	T	6	6	838413	838418	0 %	100 %	0 %	0 %	480531105
13543	NC_021005	AAG	2	6	838490	838495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531105
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13545	NC_021005	TGG	2	6	838541	838546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531105
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13547	NC_021005	TCG	2	6	838650	838655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531105
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13549	NC_021005	TGA	2	6	838731	838736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531105
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13551	NC_021005	CA	3	6	838890	838895	50 %	0 %	0 %	50 %	480531105
13552	NC_021005	ATGAAA	2	12	838946	838957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	480531105
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13555	NC_021005	AGA	2	6	839079	839084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531105
13556	NC_021005	TTGAT	2	10	839111	839120	20 %	60 %	20 %	0 %	480531105
13557	NC_021005	ATC	2	6	839129	839134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531105
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13559	NC_021005	A	6	6	839160	839165	100 %	0 %	0 %	0 %	480531105
13560	NC_021005	A	6	6	839172	839177	100 %	0 %	0 %	0 %	480531105
13561	NC_021005	TCC	2	6	839206	839211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531105
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13563	NC_021005	AT	3	6	839256	839261	50 %	50 %	0 %	0 %	480531105
13564	NC_021005	CAGC	2	8	839300	839307	25 %	0 %	25 %	50 %	480531105
13565	NC_021005	ATG	2	6	839315	839320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531105
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13601	NC_021005	TCT	2	6	841252	841257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531106
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13610	NC_021005	A	7	7	841810	841816	100 %	0 %	0 %	0 %	480531107
13611	NC_021005	TAT	2	6	841840	841845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531107
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13982	NC_021005	ATCA	2	8	865324	865331	50 %	25 %	0 %	25 %	480531131
13983	NC_021005	TGA	2	6	865338	865343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531131
13984	NC_021005	TGGGA	2	10	865386	865395	20 %	20 %	60 %	0 %	480531131
13985	NC_021005	TAT	2	6	865490	865495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531131
13986	NC_021005	ATT	2	6	865562	865567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531132
13987	NC_021005	TAT	2	6	865636	865641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531132
13988	NC_021005	CTG	2	6	865704	865709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531132
13989	NC_021005	GTT	2	6	865751	865756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531132
13990	NC_021005	TAT	2	6	865804	865809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531132
13991	NC_021005	ATG	2	6	865968	865973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531132
13992	NC_021005	AGC	2	6	865981	865986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531132
13993	NC_021005	AGA	2	6	866065	866070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531132
13994	NC_021005	CAG	2	6	866178	866183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531132
13995	NC_021005	ACA	2	6	866225	866230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531132
13996	NC_021005	G	6	6	866251	866256	0 %	0 %	100 %	0 %	480531132
13997	NC_021005	CTGG	2	8	866291	866298	0 %	25 %	50 %	25 %	480531132
13998	NC_021005	TGCC	2	8	866344	866351	0 %	25 %	25 %	50 %	480531132
13999	NC_021005	CAT	2	6	866356	866361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531132
14000	NC_021005	GAA	2	6	866408	866413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531132

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