MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021005	CGC	2	6	612238	612243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480530902
10002	NC_021005	ATT	2	6	612247	612252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530902
10003	NC_021005	GAA	2	6	612277	612282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530902
10004	NC_021005	GCT	2	6	612291	612296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530902
10005	NC_021005	ATCT	2	8	612346	612353	25 %	50 %	0 %	25 %	480530902
10006	NC_021005	TGG	2	6	612389	612394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530902
10007	NC_021005	CAC	2	6	612397	612402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530902
10008	NC_021005	GAT	3	9	612432	612440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530902
10009	NC_021005	TTC	2	6	612472	612477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530902
10010	NC_021005	TCA	2	6	612482	612487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530902
10011	NC_021005	AGA	2	6	612615	612620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530902
10012	NC_021005	TGG	2	6	612629	612634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530902
10013	NC_021005	CGA	2	6	612745	612750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530903
10014	NC_021005	GCT	2	6	612751	612756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530903
10015	NC_021005	T	6	6	612756	612761	0 %	100 %	0 %	0 %	480530903
10016	NC_021005	TTC	2	6	612768	612773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530903
10017	NC_021005	GCT	2	6	612781	612786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530903
10018	NC_021005	CTTT	2	8	612809	612816	0 %	75 %	0 %	25 %	480530903
10019	NC_021005	AAT	2	6	613031	613036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530904
10020	NC_021005	TTG	2	6	613042	613047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530904
10021	NC_021005	CTG	2	6	613054	613059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530904
10022	NC_021005	AGA	2	6	613175	613180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530904
10023	NC_021005	GCAG	2	8	613181	613188	25 %	0 %	50 %	25 %	480530904
10024	NC_021005	TCA	2	6	613196	613201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530904
10025	NC_021005	AG	3	6	613215	613220	50 %	0 %	50 %	0 %	480530904
10026	NC_021005	GGACT	2	10	613318	613327	20 %	20 %	40 %	20 %	480530904
10027	NC_021005	ACC	2	6	613354	613359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530904
10028	NC_021005	CTC	2	6	613372	613377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530904
10029	NC_021005	GAG	2	6	613380	613385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530904
10030	NC_021005	TGG	2	6	613441	613446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530904
10031	NC_021005	AGCA	2	8	613447	613454	50 %	0 %	25 %	25 %	480530904
10032	NC_021005	TCG	3	9	613478	613486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530904
10033	NC_021005	GAT	2	6	613572	613577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530904
10034	NC_021005	ACC	2	6	613606	613611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530904
10035	NC_021005	GCT	2	6	613686	613691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530904
10036	NC_021005	CGT	2	6	613779	613784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530904
10037	NC_021005	GAT	2	6	613896	613901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530904
10038	NC_021005	A	6	6	613912	613917	100 %	0 %	0 %	0 %	480530905
10039	NC_021005	GAG	2	6	613918	613923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530905
10040	NC_021005	CTG	2	6	613930	613935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530905
10041	NC_021005	GAA	2	6	613981	613986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
10042	NC_021005	TCG	2	6	614069	614074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530905
10043	NC_021005	TGG	2	6	614105	614110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530905
10044	NC_021005	AGA	2	6	614115	614120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
10045	NC_021005	ACT	2	6	614125	614130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530905
10046	NC_021005	CAA	2	6	614139	614144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530905
10047	NC_021005	TTGG	2	8	614305	614312	0 %	50 %	50 %	0 %	480530905
10048	NC_021005	CAGG	2	8	614335	614342	25 %	0 %	50 %	25 %	480530905
10049	NC_021005	CGT	2	6	614389	614394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530905
10050	NC_021005	AATCA	2	10	614404	614413	60 %	20 %	0 %	20 %	480530905
10051	NC_021005	GGT	2	6	614436	614441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530905
10052	NC_021005	GAA	2	6	614713	614718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
10053	NC_021005	AGCA	2	8	614719	614726	50 %	0 %	25 %	25 %	480530905
10054	NC_021005	GAG	2	6	614773	614778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530905
10055	NC_021005	A	6	6	614783	614788	100 %	0 %	0 %	0 %	480530905
10056	NC_021005	TC	3	6	614793	614798	0 %	50 %	0 %	50 %	480530905
10057	NC_021005	CAT	2	6	614799	614804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530905
10058	NC_021005	TAA	2	6	614847	614852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530905
10059	NC_021005	TGG	2	6	614861	614866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530905
10060	NC_021005	ATT	2	6	614943	614948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530905
10061	NC_021005	AG	3	6	615027	615032	50 %	0 %	50 %	0 %	480530905
10062	NC_021005	GAA	2	6	615046	615051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
10063	NC_021005	AAAT	2	8	615102	615109	75 %	25 %	0 %	0 %	480530905
10064	NC_021005	AGA	2	6	615117	615122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530905
10065	NC_021005	TTA	2	6	615237	615242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530906
10066	NC_021005	GTT	2	6	615257	615262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530906
10067	NC_021005	A	7	7	615290	615296	100 %	0 %	0 %	0 %	480530906
10068	NC_021005	ATT	2	6	615315	615320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530906
10069	NC_021005	TCAG	2	8	615330	615337	25 %	25 %	25 %	25 %	480530906
10070	NC_021005	TCTG	2	8	615403	615410	0 %	50 %	25 %	25 %	480530906
10071	NC_021005	GAG	2	6	615470	615475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530906
10072	NC_021005	AAG	2	6	615678	615683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530906
10073	NC_021005	CTG	2	6	615684	615689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530906
10074	NC_021005	TA	3	6	615738	615743	50 %	50 %	0 %	0 %	480530906
10075	NC_021005	ATTA	2	8	615747	615754	50 %	50 %	0 %	0 %	480530906
10076	NC_021005	TTA	2	6	615944	615949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530907
10077	NC_021005	CAGA	2	8	616024	616031	50 %	0 %	25 %	25 %	480530907
10078	NC_021005	GT	3	6	616085	616090	0 %	50 %	50 %	0 %	480530907
10079	NC_021005	CATT	2	8	616113	616120	25 %	50 %	0 %	25 %	480530907
10080	NC_021005	GCT	2	6	616273	616278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530907
10081	NC_021005	GCA	2	6	616357	616362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530907
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10084	NC_021005	CCT	2	6	616572	616577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530907
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10086	NC_021005	GAA	2	6	616678	616683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530907
10087	NC_021005	CTA	2	6	616720	616725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530908
10088	NC_021005	GGT	2	6	616746	616751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530908
10089	NC_021005	CTTG	2	8	616796	616803	0 %	50 %	25 %	25 %	480530908
10090	NC_021005	ATT	2	6	616840	616845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530908
10091	NC_021005	ATTG	2	8	616856	616863	25 %	50 %	25 %	0 %	480530908
10092	NC_021005	CGA	2	6	616877	616882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530908
10093	NC_021005	AAC	2	6	616947	616952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530908
10094	NC_021005	TGA	2	6	617035	617040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530908
10095	NC_021005	AGC	2	6	617076	617081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530908
10096	NC_021005	ATC	2	6	617091	617096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530908
10097	NC_021005	AGTCT	2	10	617134	617143	20 %	40 %	20 %	20 %	480530908
10098	NC_021005	ACA	2	6	617223	617228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530908
10099	NC_021005	T	6	6	617256	617261	0 %	100 %	0 %	0 %	480530908
10100	NC_021005	TTG	2	6	617388	617393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530908
10101	NC_021005	CT	3	6	617416	617421	0 %	50 %	0 %	50 %	480530908
10102	NC_021005	AGCT	2	8	617428	617435	25 %	25 %	25 %	25 %	480530908
10103	NC_021005	CTT	2	6	617542	617547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530909
10104	NC_021005	TAG	2	6	617549	617554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530909
10105	NC_021005	TCA	2	6	617628	617633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530909
10106	NC_021005	TCT	2	6	617790	617795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530909
10107	NC_021005	TCTT	2	8	617874	617881	0 %	75 %	0 %	25 %	480530909
10108	NC_021005	TGG	2	6	617934	617939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530909
10109	NC_021005	AAG	2	6	617997	618002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530909
10110	NC_021005	CGT	2	6	618034	618039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530909
10111	NC_021005	GAAG	2	8	618067	618074	50 %	0 %	50 %	0 %	480530909
10112	NC_021005	TCC	2	6	618195	618200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530909
10113	NC_021005	AG	3	6	618236	618241	50 %	0 %	50 %	0 %	480530909
10114	NC_021005	CCATC	2	10	618247	618256	20 %	20 %	0 %	60 %	480530909
10115	NC_021005	CATTT	2	10	618305	618314	20 %	60 %	0 %	20 %	480530909
10116	NC_021005	GA	3	6	618336	618341	50 %	0 %	50 %	0 %	480530909
10117	NC_021005	TCAT	2	8	618375	618382	25 %	50 %	0 %	25 %	480530909
10118	NC_021005	CGA	2	6	618394	618399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530909
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10120	NC_021005	TTG	2	6	618419	618424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530909
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10235	NC_021005	ACA	2	6	625382	625387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530918
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10369	NC_021005	TTTAT	2	10	632708	632717	20 %	80 %	0 %	0 %	480530926
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10484	NC_021005	GCT	2	6	639332	639337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530933
10485	NC_021005	GAA	2	6	639340	639345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530933
10486	NC_021005	ACACT	2	10	639361	639370	40 %	20 %	0 %	40 %	480530933
10487	NC_021005	CAT	2	6	639382	639387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530933
10488	NC_021005	CTT	2	6	639394	639399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530933
10489	NC_021005	GAA	2	6	639413	639418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530933
10490	NC_021005	CCAA	2	8	639427	639434	50 %	0 %	0 %	50 %	480530933
10491	NC_021005	AAGCTA	2	12	639600	639611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480530933
10492	NC_021005	TGA	3	9	639622	639630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530933
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10499	NC_021005	TCA	2	6	640446	640451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530934
10500	NC_021005	CAA	2	6	640478	640483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530934

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