MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 32677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021005	A	7	7	300649	300655	100 %	0 %	0 %	0 %	480530640
5002	NC_021005	CAA	2	6	300682	300687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530640
5003	NC_021005	CAA	2	6	300809	300814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530641
5004	NC_021005	GTT	2	6	300820	300825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530641
5005	NC_021005	AGT	2	6	300880	300885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530641
5006	NC_021005	GCT	2	6	300911	300916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530641
5007	NC_021005	GAA	3	9	301127	301135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530641
5008	NC_021005	CTTG	2	8	301162	301169	0 %	50 %	25 %	25 %	480530641
5009	NC_021005	TGG	2	6	301213	301218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530641
5010	NC_021005	ATG	2	6	301220	301225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530641
5011	NC_021005	AAG	2	6	301245	301250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530641
5012	NC_021005	GATG	2	8	301265	301272	25 %	25 %	50 %	0 %	480530641
5013	NC_021005	ACA	2	6	301304	301309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530641
5014	NC_021005	TTAT	2	8	301350	301357	25 %	75 %	0 %	0 %	480530641
5015	NC_021005	TG	3	6	301362	301367	0 %	50 %	50 %	0 %	480530641
5016	NC_021005	TTA	2	6	301383	301388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530641
5017	NC_021005	TGT	2	6	301450	301455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530641
5018	NC_021005	TGT	2	6	301462	301467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530641
5019	NC_021005	TCT	2	6	301483	301488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530641
5020	NC_021005	ATT	2	6	301577	301582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530641
5021	NC_021005	ACT	2	6	301597	301602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530641
5022	NC_021005	TGC	2	6	301681	301686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530641
5023	NC_021005	GGT	2	6	301739	301744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530641
5024	NC_021005	TA	3	6	301770	301775	50 %	50 %	0 %	0 %	480530641
5025	NC_021005	TAT	2	6	301876	301881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530641
5026	NC_021005	ATTT	2	8	301906	301913	25 %	75 %	0 %	0 %	480530641
5027	NC_021005	CTA	2	6	301932	301937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530641
5028	NC_021005	TTA	2	6	301939	301944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530641
5029	NC_021005	TTA	2	6	301965	301970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530641
5030	NC_021005	CAG	2	6	302031	302036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530641
5031	NC_021005	GCA	2	6	302075	302080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530641
5032	NC_021005	AGA	2	6	302131	302136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530641
5033	NC_021005	TAA	2	6	302147	302152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530641
5034	NC_021005	TAA	2	6	303306	303311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530642
5035	NC_021005	ATTT	2	8	303332	303339	25 %	75 %	0 %	0 %	480530642
5036	NC_021005	AGA	2	6	303456	303461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530642
5037	NC_021005	ATT	2	6	303466	303471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530642
5038	NC_021005	GAT	2	6	303496	303501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530642
5039	NC_021005	ATTT	2	8	303510	303517	25 %	75 %	0 %	0 %	480530642
5040	NC_021005	GA	4	8	303541	303548	50 %	0 %	50 %	0 %	480530642
5041	NC_021005	GAG	2	6	303593	303598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530642
5042	NC_021005	TTG	2	6	303637	303642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530642
5043	NC_021005	TGG	2	6	303664	303669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530642
5044	NC_021005	TATC	2	8	303743	303750	25 %	50 %	0 %	25 %	480530642
5045	NC_021005	GT	3	6	303752	303757	0 %	50 %	50 %	0 %	480530642
5046	NC_021005	CAA	2	6	303862	303867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530642
5047	NC_021005	CTG	2	6	303908	303913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480530642
5048	NC_021005	GAA	2	6	303931	303936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530642
5049	NC_021005	AGA	2	6	303981	303986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530642
5050	NC_021005	T	7	7	304002	304008	0 %	100 %	0 %	0 %	480530642
5051	NC_021005	TGG	2	6	304078	304083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530642
5052	NC_021005	CAA	2	6	304093	304098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530642
5053	NC_021005	GGT	2	6	304174	304179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530642
5054	NC_021005	TAT	2	6	304245	304250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530642
5055	NC_021005	TGG	2	6	304315	304320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530642
5056	NC_021005	T	7	7	304456	304462	0 %	100 %	0 %	0 %	480530642
5057	NC_021005	ACA	2	6	304468	304473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530642
5058	NC_021005	GAA	2	6	304485	304490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530642
5059	NC_021005	GAT	2	6	304512	304517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530642
5060	NC_021005	CTAT	2	8	304521	304528	25 %	50 %	0 %	25 %	480530642
5061	NC_021005	TAT	2	6	304582	304587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480530642
5062	NC_021005	ATG	2	6	304601	304606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530642
5063	NC_021005	T	6	6	304633	304638	0 %	100 %	0 %	0 %	480530642
5064	NC_021005	TGG	2	6	304652	304657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530642
5065	NC_021005	CTT	2	6	304737	304742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530642
5066	NC_021005	A	6	6	304750	304755	100 %	0 %	0 %	0 %	480530642
5067	NC_021005	GGT	2	6	304762	304767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530642
5068	NC_021005	GTG	2	6	304820	304825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530642
5069	NC_021005	TTGG	2	8	304837	304844	0 %	50 %	50 %	0 %	480530642
5070	NC_021005	GTAT	2	8	304890	304897	25 %	50 %	25 %	0 %	480530642
5071	NC_021005	ACA	2	6	304908	304913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530642
5072	NC_021005	AATTG	2	10	305076	305085	40 %	40 %	20 %	0 %	480530642
5073	NC_021005	ATA	2	6	305123	305128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530642
5074	NC_021005	ACT	2	6	305160	305165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530642
5075	NC_021005	AGAT	2	8	305196	305203	50 %	25 %	25 %	0 %	480530642
5076	NC_021005	TCA	2	6	305216	305221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530642
5077	NC_021005	CAT	2	6	305257	305262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530642
5078	NC_021005	TTG	2	6	305287	305292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530642
5079	NC_021005	TAG	2	6	305544	305549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530643
5080	NC_021005	GAA	2	6	305590	305595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530643
5081	NC_021005	ATTCG	2	10	305648	305657	20 %	40 %	20 %	20 %	480530643
5082	NC_021005	AG	3	6	305699	305704	50 %	0 %	50 %	0 %	480530643
5083	NC_021005	GGT	2	6	305751	305756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530643
5084	NC_021005	GTT	2	6	305976	305981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530643
5085	NC_021005	CCA	2	6	310667	310672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530644
5086	NC_021005	CAG	2	6	310692	310697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530644
5087	NC_021005	TGT	2	6	310713	310718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480530644
5088	NC_021005	CTC	2	6	310728	310733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530644
5089	NC_021005	AT	3	6	310781	310786	50 %	50 %	0 %	0 %	480530644
5090	NC_021005	TAC	2	6	310800	310805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530644
5091	NC_021005	TGA	2	6	310818	310823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530644
5092	NC_021005	AAC	2	6	310939	310944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530644
5093	NC_021005	TGA	2	6	311052	311057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530644
5094	NC_021005	CTT	2	6	311139	311144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530644
5095	NC_021005	T	7	7	311182	311188	0 %	100 %	0 %	0 %	480530644
5096	NC_021005	AAT	2	6	311194	311199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530644
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5098	NC_021005	ATG	2	6	311362	311367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530645
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5101	NC_021005	TCA	2	6	311501	311506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530645
5102	NC_021005	CTT	2	6	311547	311552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530645
5103	NC_021005	TCA	2	6	311624	311629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530645
5104	NC_021005	ATC	2	6	311711	311716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530645
5105	NC_021005	CTT	2	6	311766	311771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530645
5106	NC_021005	AAAATG	2	12	311830	311841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	480530645
5107	NC_021005	AG	3	6	311856	311861	50 %	0 %	50 %	0 %	480530645
5108	NC_021005	GAC	2	6	311934	311939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530645
5109	NC_021005	TAG	2	6	311960	311965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530645
5110	NC_021005	TGG	2	6	312168	312173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530645
5111	NC_021005	CTT	2	6	312273	312278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530646
5112	NC_021005	AGC	2	6	312286	312291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530646
5113	NC_021005	TCA	2	6	312296	312301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530646
5114	NC_021005	AAG	2	6	312317	312322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530646
5115	NC_021005	TCA	2	6	312390	312395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530646
5116	NC_021005	GCGTT	2	10	312437	312446	0 %	40 %	40 %	20 %	480530646
5117	NC_021005	TTC	2	6	312487	312492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530646
5118	NC_021005	C	6	6	312534	312539	0 %	0 %	0 %	100 %	480530646
5119	NC_021005	ACC	2	6	312577	312582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480530646
5120	NC_021005	ACA	2	6	312635	312640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530646
5121	NC_021005	AGCA	2	8	312658	312665	50 %	0 %	25 %	25 %	480530646
5122	NC_021005	AAC	2	6	312694	312699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480530646
5123	NC_021005	CTT	2	6	312774	312779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530646
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5126	NC_021005	CTT	2	6	312828	312833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530646
5127	NC_021005	AAT	2	6	312847	312852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480530646
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5131	NC_021005	ATG	2	6	313070	313075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530647
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5137	NC_021005	GCG	2	6	313394	313399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480530647
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5142	NC_021005	TTGA	2	8	313588	313595	25 %	50 %	25 %	0 %	480530647
5143	NC_021005	TAG	2	6	313611	313616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530647
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5154	NC_021005	AATG	2	8	314254	314261	50 %	25 %	25 %	0 %	480530648
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5233	NC_021005	AAG	2	6	318068	318073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530654
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5235	NC_021005	GAT	2	6	318270	318275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530654
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5237	NC_021005	GATTG	2	10	318387	318396	20 %	40 %	40 %	0 %	480530654
5238	NC_021005	GA	3	6	318404	318409	50 %	0 %	50 %	0 %	480530654
5239	NC_021005	TGA	2	6	318427	318432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530654
5240	NC_021005	ACT	2	6	318476	318481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530654
5241	NC_021005	CTC	2	6	318486	318491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480530654
5242	NC_021005	CTA	2	6	318572	318577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530654
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5244	NC_021005	TGCT	2	8	318628	318635	0 %	50 %	25 %	25 %	480530654
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5252	NC_021005	AAAG	2	8	319383	319390	75 %	0 %	25 %	0 %	480530654
5253	NC_021005	CAG	2	6	319426	319431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530654
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5310	NC_021005	T	7	7	322009	322015	0 %	100 %	0 %	0 %	480530658
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5331	NC_021005	A	6	6	323624	323629	100 %	0 %	0 %	0 %	480530661
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5363	NC_021005	TGA	2	6	324950	324955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530662
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5489	NC_021005	AGC	2	6	332100	332105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480530666
5490	NC_021005	TCT	2	6	332113	332118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480530666
5491	NC_021005	T	6	6	332226	332231	0 %	100 %	0 %	0 %	480530666
5492	NC_021005	T	6	6	332234	332239	0 %	100 %	0 %	0 %	480530666
5493	NC_021005	TGG	2	6	332398	332403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530667
5494	NC_021005	ATGGAG	2	12	332453	332464	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	480530667
5495	NC_021005	AGCTA	2	10	332505	332514	40 %	20 %	20 %	20 %	480530667
5496	NC_021005	GAT	2	6	332560	332565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480530667
5497	NC_021005	GGA	2	6	332619	332624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480530667
5498	NC_021005	AAG	2	6	332650	332655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480530667
5499	NC_021005	ATC	2	6	332668	332673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480530667
5500	NC_021005	TGG	2	6	332681	332686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480530667

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