MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_020568	TTG	2	6	2605208	2605213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225588
47003	NC_020568	T	6	6	2605224	2605229	0 %	100 %	0 %	0 %	470225588
47004	NC_020568	TGATA	2	10	2605297	2605306	40 %	40 %	20 %	0 %	470225588
47005	NC_020568	CATT	2	8	2605348	2605355	25 %	50 %	0 %	25 %	470225588
47006	NC_020568	T	6	6	2605485	2605490	0 %	100 %	0 %	0 %	470225588
47007	NC_020568	GCA	2	6	2605503	2605508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225588
47008	NC_020568	TTA	2	6	2605551	2605556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225588
47009	NC_020568	TGT	2	6	2605667	2605672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225588
47010	NC_020568	CAT	2	6	2605693	2605698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225588
47011	NC_020568	AT	3	6	2605705	2605710	50 %	50 %	0 %	0 %	470225588
47012	NC_020568	TTC	2	6	2605799	2605804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225588
47013	NC_020568	TAAATG	2	12	2605807	2605818	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470225588
47014	NC_020568	ATG	2	6	2605879	2605884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225588
47015	NC_020568	AATG	2	8	2605920	2605927	50 %	25 %	25 %	0 %	470225588
47016	NC_020568	AAT	2	6	2605949	2605954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225588
47017	NC_020568	ATACCT	2	12	2605992	2606003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225588
47018	NC_020568	GCA	2	6	2606004	2606009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225588
47019	NC_020568	ATA	2	6	2606019	2606024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225588
47020	NC_020568	ATG	2	6	2606033	2606038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225588
47021	NC_020568	TAAC	2	8	2607660	2607667	50 %	25 %	0 %	25 %	470225589
47022	NC_020568	TTG	2	6	2607668	2607673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225589
47023	NC_020568	AATA	2	8	2607751	2607758	75 %	25 %	0 %	0 %	470225589
47024	NC_020568	TAT	2	6	2607812	2607817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225589
47025	NC_020568	ACC	2	6	2607843	2607848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225589
47026	NC_020568	AAT	2	6	2607907	2607912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225589
47027	NC_020568	TAA	2	6	2607966	2607971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225589
47028	NC_020568	TCC	2	6	2608000	2608005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225589
47029	NC_020568	CTT	2	6	2608076	2608081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225589
47030	NC_020568	ATC	2	6	2608122	2608127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225589
47031	NC_020568	CTT	3	9	2608190	2608198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225589
47032	NC_020568	CTT	2	6	2608259	2608264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225589
47033	NC_020568	TCA	2	6	2608274	2608279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225589
47034	NC_020568	GCA	2	6	2608372	2608377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225589
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47037	NC_020568	ATTA	2	8	2608755	2608762	50 %	50 %	0 %	0 %	470225590
47038	NC_020568	ACTA	2	8	2608803	2608810	50 %	25 %	0 %	25 %	470225590
47039	NC_020568	GTC	2	6	2608855	2608860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225590
47040	NC_020568	TACG	2	8	2608914	2608921	25 %	25 %	25 %	25 %	470225590
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47043	NC_020568	ATT	2	6	2609064	2609069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225590
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47046	NC_020568	TA	3	6	2609221	2609226	50 %	50 %	0 %	0 %	470225590
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47050	NC_020568	ATC	2	6	2609467	2609472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225590
47051	NC_020568	TAA	2	6	2609514	2609519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225590
47052	NC_020568	GAA	2	6	2609524	2609529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225590
47053	NC_020568	GTC	2	6	2609543	2609548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225590
47054	NC_020568	ATT	2	6	2609550	2609555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225590
47055	NC_020568	CAAA	2	8	2609593	2609600	75 %	0 %	0 %	25 %	470225590
47056	NC_020568	GGC	2	6	2609626	2609631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470225590
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47059	NC_020568	ATC	2	6	2609765	2609770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225590
47060	NC_020568	CTT	2	6	2610459	2610464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225591
47061	NC_020568	TTG	2	6	2610490	2610495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225591
47062	NC_020568	T	6	6	2610621	2610626	0 %	100 %	0 %	0 %	470225591
47063	NC_020568	AAT	2	6	2610696	2610701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225591
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47067	NC_020568	CGT	2	6	2610914	2610919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225591
47068	NC_020568	AAAT	2	8	2610956	2610963	75 %	25 %	0 %	0 %	470225591
47069	NC_020568	TAC	2	6	2611005	2611010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225591
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47072	NC_020568	TAAT	2	8	2611097	2611104	50 %	50 %	0 %	0 %	470225591
47073	NC_020568	T	6	6	2611104	2611109	0 %	100 %	0 %	0 %	470225591
47074	NC_020568	ATA	2	6	2611127	2611132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225591
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47081	NC_020568	TAACT	2	10	2612372	2612381	40 %	40 %	0 %	20 %	470225592
47082	NC_020568	TCA	2	6	2612397	2612402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225592
47083	NC_020568	TGAA	2	8	2612403	2612410	50 %	25 %	25 %	0 %	470225592
47084	NC_020568	TCC	2	6	2612421	2612426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225592
47085	NC_020568	CTG	2	6	2612429	2612434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225592
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47087	NC_020568	TAC	2	6	2612488	2612493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225592
47088	NC_020568	TTG	2	6	2612519	2612524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225592
47089	NC_020568	TCT	2	6	2612535	2612540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225592
47090	NC_020568	CA	3	6	2612704	2612709	50 %	0 %	0 %	50 %	470225593
47091	NC_020568	ACAA	2	8	2612736	2612743	75 %	0 %	0 %	25 %	470225593
47092	NC_020568	TA	3	6	2612923	2612928	50 %	50 %	0 %	0 %	470225593
47093	NC_020568	ATA	2	6	2612998	2613003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225593
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47099	NC_020568	CAT	2	6	2613298	2613303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225593
47100	NC_020568	CCA	2	6	2613309	2613314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225593
47101	NC_020568	CAA	2	6	2613474	2613479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225593
47102	NC_020568	GAT	2	6	2613495	2613500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225593
47103	NC_020568	CTA	2	6	2613546	2613551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225593
47104	NC_020568	AGA	2	6	2613623	2613628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225593
47105	NC_020568	TAC	2	6	2613669	2613674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225593
47106	NC_020568	AGA	2	6	2613725	2613730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225593
47107	NC_020568	AT	3	6	2613762	2613767	50 %	50 %	0 %	0 %	470225593
47108	NC_020568	TCAGCG	2	12	2613804	2613815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470225593
47109	NC_020568	CA	3	6	2613867	2613872	50 %	0 %	0 %	50 %	470225593
47110	NC_020568	TAG	2	6	2613890	2613895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225593
47111	NC_020568	AGTT	2	8	2613973	2613980	25 %	50 %	25 %	0 %	470225593
47112	NC_020568	ATTT	2	8	2614033	2614040	25 %	75 %	0 %	0 %	470225593
47113	NC_020568	TCG	2	6	2614061	2614066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225593
47114	NC_020568	TGGT	2	8	2614124	2614131	0 %	50 %	50 %	0 %	470225593
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47116	NC_020568	GAA	2	6	2614362	2614367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225593
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47235	NC_020568	CATT	2	8	2621116	2621123	25 %	50 %	0 %	25 %	470225600
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47467	NC_020568	CTTCAA	2	12	2636089	2636100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
47468	NC_020568	TAA	3	9	2636125	2636133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225611
47469	NC_020568	CAT	3	9	2636167	2636175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
47470	NC_020568	GTA	2	6	2636201	2636206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225611
47471	NC_020568	TCA	2	6	2636325	2636330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
47472	NC_020568	CTA	2	6	2636332	2636337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
47473	NC_020568	GTG	2	6	2636386	2636391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225611
47474	NC_020568	TTAAA	2	10	2636452	2636461	60 %	40 %	0 %	0 %	470225611
47475	NC_020568	ACT	2	6	2636481	2636486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
47476	NC_020568	CAT	2	6	2636567	2636572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
47477	NC_020568	ACA	2	6	2636591	2636596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225611
47478	NC_020568	TGC	2	6	2636732	2636737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225611
47479	NC_020568	CCAT	2	8	2636810	2636817	25 %	25 %	0 %	50 %	470225611
47480	NC_020568	ATC	2	6	2636879	2636884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
47481	NC_020568	CGT	2	6	2636888	2636893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225611
47482	NC_020568	ATCC	2	8	2636946	2636953	25 %	25 %	0 %	50 %	470225611
47483	NC_020568	CAT	2	6	2636989	2636994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
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47485	NC_020568	ATTT	2	8	2637047	2637054	25 %	75 %	0 %	0 %	470225611
47486	NC_020568	CGTG	2	8	2637058	2637065	0 %	25 %	50 %	25 %	470225611
47487	NC_020568	AGC	2	6	2637134	2637139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225611
47488	NC_020568	AT	3	6	2637141	2637146	50 %	50 %	0 %	0 %	470225611
47489	NC_020568	CAT	2	6	2637173	2637178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225611
47490	NC_020568	TTA	2	6	2637234	2637239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225611
47491	NC_020568	AT	3	6	2637271	2637276	50 %	50 %	0 %	0 %	470225611
47492	NC_020568	TAT	2	6	2637289	2637294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225611
47493	NC_020568	AAT	2	6	2637347	2637352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225611
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47495	NC_020568	ATTA	2	8	2637633	2637640	50 %	50 %	0 %	0 %	470225612
47496	NC_020568	TG	3	6	2637677	2637682	0 %	50 %	50 %	0 %	470225612
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47498	NC_020568	T	6	6	2637811	2637816	0 %	100 %	0 %	0 %	470225612
47499	NC_020568	TTA	2	6	2637823	2637828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225612
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