MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_020568	TAC	2	6	2546141	2546146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225546
46003	NC_020568	T	6	6	2546177	2546182	0 %	100 %	0 %	0 %	470225546
46004	NC_020568	A	6	6	2546394	2546399	100 %	0 %	0 %	0 %	470225547
46005	NC_020568	ATT	2	6	2546439	2546444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225547
46006	NC_020568	ACA	2	6	2546448	2546453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225547
46007	NC_020568	GAAAC	2	10	2546505	2546514	60 %	0 %	20 %	20 %	470225547
46008	NC_020568	GTTCG	2	10	2546576	2546585	0 %	40 %	40 %	20 %	470225547
46009	NC_020568	ATT	2	6	2546672	2546677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225547
46010	NC_020568	TTG	2	6	2546722	2546727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225547
46011	NC_020568	TAG	2	6	2546868	2546873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225547
46012	NC_020568	ATTA	2	8	2547357	2547364	50 %	50 %	0 %	0 %	470225548
46013	NC_020568	ATG	2	6	2547459	2547464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225548
46014	NC_020568	TCA	2	6	2547506	2547511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225548
46015	NC_020568	TGCTAA	2	12	2547535	2547546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470225548
46016	NC_020568	CTG	2	6	2547549	2547554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225548
46017	NC_020568	CAA	2	6	2547606	2547611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225548
46018	NC_020568	TAA	2	6	2547640	2547645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225548
46019	NC_020568	TCC	2	6	2547691	2547696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225548
46020	NC_020568	CTG	2	6	2547708	2547713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225548
46021	NC_020568	ATCA	2	8	2547829	2547836	50 %	25 %	0 %	25 %	470225548
46022	NC_020568	T	6	6	2547861	2547866	0 %	100 %	0 %	0 %	470225548
46023	NC_020568	ATA	2	6	2547926	2547931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225548
46024	NC_020568	GCA	2	6	2547938	2547943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225548
46025	NC_020568	TTG	2	6	2547954	2547959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225548
46026	NC_020568	ATCA	2	8	2547979	2547986	50 %	25 %	0 %	25 %	470225548
46027	NC_020568	ATG	2	6	2548006	2548011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225548
46028	NC_020568	AGC	2	6	2548036	2548041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225548
46029	NC_020568	GTC	2	6	2548085	2548090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225548
46030	NC_020568	TCA	2	6	2548148	2548153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225548
46031	NC_020568	TCT	2	6	2548178	2548183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225548
46032	NC_020568	ATT	2	6	2548210	2548215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225548
46033	NC_020568	TC	3	6	2548236	2548241	0 %	50 %	0 %	50 %	470225548
46034	NC_020568	TA	3	6	2548277	2548282	50 %	50 %	0 %	0 %	470225549
46035	NC_020568	TTTA	2	8	2548343	2548350	25 %	75 %	0 %	0 %	470225549
46036	NC_020568	ATCT	2	8	2548379	2548386	25 %	50 %	0 %	25 %	470225549
46037	NC_020568	TAA	2	6	2548387	2548392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225549
46038	NC_020568	AATGA	2	10	2548433	2548442	60 %	20 %	20 %	0 %	470225549
46039	NC_020568	CAA	2	6	2548471	2548476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225549
46040	NC_020568	TTTAAT	2	12	2548532	2548543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225549
46041	NC_020568	ACC	3	9	2548547	2548555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225549
46042	NC_020568	CAT	2	6	2548588	2548593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225549
46043	NC_020568	GAT	2	6	2548599	2548604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225549
46044	NC_020568	CTT	3	9	2548645	2548653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225549
46045	NC_020568	GAT	2	6	2548655	2548660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225549
46046	NC_020568	CAT	2	6	2548675	2548680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225549
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46049	NC_020568	ATA	2	6	2548796	2548801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225549
46050	NC_020568	CAT	2	6	2548895	2548900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225549
46051	NC_020568	ATA	2	6	2548911	2548916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225549
46052	NC_020568	ATTAA	2	10	2549009	2549018	60 %	40 %	0 %	0 %	470225550
46053	NC_020568	TTA	2	6	2549021	2549026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225550
46054	NC_020568	AAT	2	6	2549038	2549043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225550
46055	NC_020568	AAT	2	6	2549065	2549070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225550
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46065	NC_020568	TAA	2	6	2549686	2549691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225550
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46088	NC_020568	ATTTTA	2	12	2551815	2551826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225551
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46090	NC_020568	CAA	2	6	2552069	2552074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225552
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46094	NC_020568	TCTT	2	8	2552250	2552257	0 %	75 %	0 %	25 %	470225552
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46099	NC_020568	TCA	2	6	2552547	2552552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225552
46100	NC_020568	CTG	2	6	2552725	2552730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225552
46101	NC_020568	T	6	6	2552743	2552748	0 %	100 %	0 %	0 %	470225552
46102	NC_020568	CTT	3	9	2552764	2552772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225552
46103	NC_020568	ACG	2	6	2552783	2552788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225552
46104	NC_020568	TGC	2	6	2552870	2552875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225552
46105	NC_020568	T	6	6	2552906	2552911	0 %	100 %	0 %	0 %	470225552
46106	NC_020568	ATT	2	6	2554225	2554230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225553
46107	NC_020568	TAA	2	6	2554306	2554311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225553
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46109	NC_020568	CAT	2	6	2554589	2554594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225553
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46112	NC_020568	CAC	2	6	2554747	2554752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225553
46113	NC_020568	TTTTC	2	10	2554935	2554944	0 %	80 %	0 %	20 %	470225553
46114	NC_020568	TCTTCA	2	12	2555007	2555018	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470225553
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46116	NC_020568	TAA	2	6	2555108	2555113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225553
46117	NC_020568	TAA	2	6	2555135	2555140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225553
46118	NC_020568	ACC	2	6	2555165	2555170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225553
46119	NC_020568	TAA	2	6	2555198	2555203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225553
46120	NC_020568	ATG	2	6	2555218	2555223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225553
46121	NC_020568	TAA	2	6	2555231	2555236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225553
46122	NC_020568	CTG	2	6	2555323	2555328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225553
46123	NC_020568	ACC	2	6	2555339	2555344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225553
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46132	NC_020568	GTT	2	6	2555619	2555624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225553
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46155	NC_020568	AACA	2	8	2556346	2556353	75 %	0 %	0 %	25 %	470225553
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46179	NC_020568	TAAT	2	8	2557516	2557523	50 %	50 %	0 %	0 %	470225554
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46184	NC_020568	T	6	6	2557825	2557830	0 %	100 %	0 %	0 %	470225554
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46216	NC_020568	CT	3	6	2560036	2560041	0 %	50 %	0 %	50 %	470225556
46217	NC_020568	GTA	2	6	2560076	2560081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225556
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46224	NC_020568	A	6	6	2560359	2560364	100 %	0 %	0 %	0 %	470225556
46225	NC_020568	CATTT	2	10	2560423	2560432	20 %	60 %	0 %	20 %	470225556
46226	NC_020568	AT	3	6	2560472	2560477	50 %	50 %	0 %	0 %	470225556
46227	NC_020568	CCT	2	6	2560502	2560507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225556
46228	NC_020568	CAT	2	6	2560555	2560560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225556
46229	NC_020568	TTG	2	6	2561899	2561904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225557
46230	NC_020568	TCA	2	6	2561987	2561992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225557
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46232	NC_020568	GC	3	6	2562069	2562074	0 %	0 %	50 %	50 %	470225557
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46333	NC_020568	CTG	2	6	2567193	2567198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225560
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46340	NC_020568	TGGCAA	2	12	2567413	2567424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470225560
46341	NC_020568	GAA	2	6	2567432	2567437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225560
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46345	NC_020568	A	6	6	2567585	2567590	100 %	0 %	0 %	0 %	470225560
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46466	NC_020568	TCT	2	6	2574334	2574339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225564
46467	NC_020568	TTG	2	6	2574377	2574382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225564
46468	NC_020568	ATC	2	6	2574405	2574410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225564
46469	NC_020568	GCC	2	6	2574414	2574419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470225564
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46472	NC_020568	TAA	2	6	2574491	2574496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225564
46473	NC_020568	TGAT	2	8	2574554	2574561	25 %	50 %	25 %	0 %	470225564
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46480	NC_020568	CTT	2	6	2574908	2574913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225564
46481	NC_020568	CAG	2	6	2574956	2574961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225564
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46485	NC_020568	CGA	3	9	2575246	2575254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225564
46486	NC_020568	TGC	2	6	2575332	2575337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225564
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46499	NC_020568	T	6	6	2576348	2576353	0 %	100 %	0 %	0 %	470225565
46500	NC_020568	A	7	7	2577048	2577054	100 %	0 %	0 %	0 %	470225566

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