MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_020568	ATAC	2	8	2488173	2488180	50 %	25 %	0 %	25 %	470225505
45002	NC_020568	CTT	2	6	2488185	2488190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225505
45003	NC_020568	TTCA	2	8	2488268	2488275	25 %	50 %	0 %	25 %	470225505
45004	NC_020568	TGA	2	6	2488505	2488510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225506
45005	NC_020568	CAA	2	6	2488522	2488527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225506
45006	NC_020568	A	6	6	2488565	2488570	100 %	0 %	0 %	0 %	470225506
45007	NC_020568	AAAT	2	8	2488575	2488582	75 %	25 %	0 %	0 %	470225506
45008	NC_020568	TG	4	8	2488613	2488620	0 %	50 %	50 %	0 %	470225506
45009	NC_020568	ATT	2	6	2488650	2488655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45010	NC_020568	ATG	2	6	2488718	2488723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225506
45011	NC_020568	GAT	2	6	2488731	2488736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225506
45012	NC_020568	AATG	2	8	2488737	2488744	50 %	25 %	25 %	0 %	470225506
45013	NC_020568	TGA	2	6	2488796	2488801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225506
45014	NC_020568	TGT	2	6	2488854	2488859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225506
45015	NC_020568	CAC	2	6	2488868	2488873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225506
45016	NC_020568	TAT	2	6	2488893	2488898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45017	NC_020568	GTA	2	6	2488916	2488921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225506
45018	NC_020568	TGC	2	6	2488932	2488937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225506
45019	NC_020568	GCC	2	6	2488950	2488955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470225506
45020	NC_020568	GCA	2	6	2488960	2488965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225506
45021	NC_020568	TTA	2	6	2488973	2488978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45022	NC_020568	GGA	2	6	2489032	2489037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470225506
45023	NC_020568	GCA	2	6	2489041	2489046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225506
45024	NC_020568	GTT	2	6	2489053	2489058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225506
45025	NC_020568	AAAC	2	8	2489126	2489133	75 %	0 %	0 %	25 %	470225506
45026	NC_020568	ATT	2	6	2489212	2489217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45027	NC_020568	ATG	2	6	2489234	2489239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225506
45028	NC_020568	ATG	2	6	2489252	2489257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225506
45029	NC_020568	GAA	2	6	2489263	2489268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225506
45030	NC_020568	AAG	2	6	2489291	2489296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225506
45031	NC_020568	ATT	2	6	2489338	2489343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45032	NC_020568	TTA	2	6	2489344	2489349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45033	NC_020568	ATT	2	6	2489350	2489355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45034	NC_020568	T	6	6	2489376	2489381	0 %	100 %	0 %	0 %	470225506
45035	NC_020568	ATTA	2	8	2489421	2489428	50 %	50 %	0 %	0 %	470225506
45036	NC_020568	ATTA	2	8	2489439	2489446	50 %	50 %	0 %	0 %	470225506
45037	NC_020568	T	6	6	2489575	2489580	0 %	100 %	0 %	0 %	470225506
45038	NC_020568	GCA	2	6	2489581	2489586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225506
45039	NC_020568	GCT	2	6	2489629	2489634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225506
45040	NC_020568	ATT	2	6	2489649	2489654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45041	NC_020568	GTATT	2	10	2489669	2489678	20 %	60 %	20 %	0 %	470225506
45042	NC_020568	TAT	2	6	2489688	2489693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45043	NC_020568	CCAAT	2	10	2489840	2489849	40 %	20 %	0 %	40 %	470225506
45044	NC_020568	GAT	2	6	2489856	2489861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225506
45045	NC_020568	TAT	2	6	2489876	2489881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45046	NC_020568	TCA	2	6	2489984	2489989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225506
45047	NC_020568	TTA	2	6	2489998	2490003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225506
45048	NC_020568	TAA	2	6	2490172	2490177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225507
45049	NC_020568	ACA	2	6	2490210	2490215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225507
45050	NC_020568	AAT	2	6	2490227	2490232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225507
45051	NC_020568	TTC	2	6	2490236	2490241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225507
45052	NC_020568	AAT	2	6	2490266	2490271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225507
45053	NC_020568	CTT	2	6	2490278	2490283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225507
45054	NC_020568	TTGA	2	8	2490291	2490298	25 %	50 %	25 %	0 %	470225507
45055	NC_020568	TAAA	2	8	2490343	2490350	75 %	25 %	0 %	0 %	470225507
45056	NC_020568	TCA	2	6	2490375	2490380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225507
45057	NC_020568	T	6	6	2490416	2490421	0 %	100 %	0 %	0 %	470225507
45058	NC_020568	AAT	2	6	2490436	2490441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225507
45059	NC_020568	TAA	2	6	2490464	2490469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225507
45060	NC_020568	TCA	2	6	2490489	2490494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225507
45061	NC_020568	TGAT	2	8	2490503	2490510	25 %	50 %	25 %	0 %	470225507
45062	NC_020568	TC	3	6	2490587	2490592	0 %	50 %	0 %	50 %	470225507
45063	NC_020568	TAC	2	6	2490622	2490627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225507
45064	NC_020568	T	6	6	2492186	2492191	0 %	100 %	0 %	0 %	470225508
45065	NC_020568	TCA	2	6	2492195	2492200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225508
45066	NC_020568	TAA	2	6	2492227	2492232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225508
45067	NC_020568	CCA	2	6	2492264	2492269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225508
45068	NC_020568	CAA	2	6	2492301	2492306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225508
45069	NC_020568	ATC	2	6	2492308	2492313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225508
45070	NC_020568	TAT	2	6	2492415	2492420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225508
45071	NC_020568	TGT	2	6	2492447	2492452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225508
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45073	NC_020568	TAAA	2	8	2492503	2492510	75 %	25 %	0 %	0 %	470225508
45074	NC_020568	TATACA	2	12	2492524	2492535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470225508
45075	NC_020568	AAT	2	6	2492548	2492553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225508
45076	NC_020568	T	6	6	2492566	2492571	0 %	100 %	0 %	0 %	470225508
45077	NC_020568	TGG	2	6	2492597	2492602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225508
45078	NC_020568	T	7	7	2492612	2492618	0 %	100 %	0 %	0 %	470225508
45079	NC_020568	TCG	2	6	2492667	2492672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225508
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45081	NC_020568	CTG	2	6	2493045	2493050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225509
45082	NC_020568	TCG	2	6	2493054	2493059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225509
45083	NC_020568	TAC	2	6	2493072	2493077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225509
45084	NC_020568	TAA	2	6	2493114	2493119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225509
45085	NC_020568	TA	3	6	2493168	2493173	50 %	50 %	0 %	0 %	470225509
45086	NC_020568	ATCA	2	8	2493193	2493200	50 %	25 %	0 %	25 %	470225509
45087	NC_020568	ACC	2	6	2493280	2493285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225509
45088	NC_020568	TGTT	2	8	2493289	2493296	0 %	75 %	25 %	0 %	470225509
45089	NC_020568	TCA	2	6	2493306	2493311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225509
45090	NC_020568	CTT	3	9	2493321	2493329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225509
45091	NC_020568	CTT	2	6	2493435	2493440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225509
45092	NC_020568	GTA	2	6	2493444	2493449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225509
45093	NC_020568	ACT	2	6	2493491	2493496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225509
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45096	NC_020568	T	6	6	2495204	2495209	0 %	100 %	0 %	0 %	470225510
45097	NC_020568	ATCACC	2	12	2495233	2495244	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	470225510
45098	NC_020568	TAA	2	6	2495251	2495256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225510
45099	NC_020568	GTTG	2	8	2495269	2495276	0 %	50 %	50 %	0 %	470225510
45100	NC_020568	TTTCT	2	10	2495442	2495451	0 %	80 %	0 %	20 %	470225510
45101	NC_020568	TAT	2	6	2495490	2495495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225510
45102	NC_020568	T	6	6	2495517	2495522	0 %	100 %	0 %	0 %	470225510
45103	NC_020568	CAT	2	6	2495523	2495528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225510
45104	NC_020568	ATA	2	6	2495572	2495577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225510
45105	NC_020568	CTT	2	6	2495721	2495726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225510
45106	NC_020568	ATC	2	6	2495737	2495742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225510
45107	NC_020568	TTGG	2	8	2495750	2495757	0 %	50 %	50 %	0 %	470225510
45108	NC_020568	TATT	2	8	2495808	2495815	25 %	75 %	0 %	0 %	470225510
45109	NC_020568	CAAT	2	8	2495838	2495845	50 %	25 %	0 %	25 %	470225510
45110	NC_020568	TGAA	2	8	2495887	2495894	50 %	25 %	25 %	0 %	470225510
45111	NC_020568	TCA	2	6	2495895	2495900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225510
45112	NC_020568	CAT	2	6	2497053	2497058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225511
45113	NC_020568	CAT	2	6	2497154	2497159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225511
45114	NC_020568	ATC	2	6	2497176	2497181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225511
45115	NC_020568	ATTTC	2	10	2497276	2497285	20 %	60 %	0 %	20 %	470225511
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45117	NC_020568	T	6	6	2497299	2497304	0 %	100 %	0 %	0 %	470225511
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45473	NC_020568	CATT	2	8	2518586	2518593	25 %	50 %	0 %	25 %	470225524
45474	NC_020568	TTA	2	6	2518621	2518626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225524
45475	NC_020568	TTA	2	6	2518633	2518638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225524
45476	NC_020568	AAC	2	6	2518695	2518700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225524
45477	NC_020568	T	6	6	2518709	2518714	0 %	100 %	0 %	0 %	470225524
45478	NC_020568	TTC	2	6	2518719	2518724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225524
45479	NC_020568	ATTTA	2	10	2518728	2518737	40 %	60 %	0 %	0 %	470225524
45480	NC_020568	AATA	2	8	2518782	2518789	75 %	25 %	0 %	0 %	470225524
45481	NC_020568	ATT	2	6	2518953	2518958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225524
45482	NC_020568	AAT	2	6	2518976	2518981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225524
45483	NC_020568	CTC	2	6	2518982	2518987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225524
45484	NC_020568	CTG	2	6	2519165	2519170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225524
45485	NC_020568	TCT	3	9	2519335	2519343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225524
45486	NC_020568	CTT	2	6	2519402	2519407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225524
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45489	NC_020568	TCT	2	6	2519470	2519475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225524
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45491	NC_020568	GTT	2	6	2519497	2519502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225524
45492	NC_020568	TAT	2	6	2519519	2519524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225524
45493	NC_020568	TCT	2	6	2519545	2519550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225524
45494	NC_020568	TGC	2	6	2519574	2519579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225524
45495	NC_020568	CTT	2	6	2519582	2519587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225524
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45497	NC_020568	TGC	2	6	2519634	2519639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225524
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