MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_020568	AAC	2	6	2409461	2409466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225441
43503	NC_020568	CAT	2	6	2409514	2409519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225441
43504	NC_020568	TAA	2	6	2409674	2409679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225441
43505	NC_020568	CCA	2	6	2409711	2409716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225441
43506	NC_020568	CTTT	2	8	2409727	2409734	0 %	75 %	0 %	25 %	470225441
43507	NC_020568	TCA	2	6	2409751	2409756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225441
43508	NC_020568	ATC	2	6	2409767	2409772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225441
43509	NC_020568	CCAA	2	8	2409782	2409789	50 %	0 %	0 %	50 %	470225441
43510	NC_020568	CTGGAA	2	12	2409811	2409822	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470225441
43511	NC_020568	AGT	2	6	2409887	2409892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225441
43512	NC_020568	TGAT	2	8	2409896	2409903	25 %	50 %	25 %	0 %	470225441
43513	NC_020568	TTC	2	6	2409989	2409994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225441
43514	NC_020568	ATTTT	2	10	2410002	2410011	20 %	80 %	0 %	0 %	470225441
43515	NC_020568	ATG	2	6	2410029	2410034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225441
43516	NC_020568	GC	3	6	2410092	2410097	0 %	0 %	50 %	50 %	470225441
43517	NC_020568	TTC	2	6	2410106	2410111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225441
43518	NC_020568	TTTGC	2	10	2410156	2410165	0 %	60 %	20 %	20 %	470225441
43519	NC_020568	TAA	2	6	2410335	2410340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225442
43520	NC_020568	TCAT	2	8	2410346	2410353	25 %	50 %	0 %	25 %	470225442
43521	NC_020568	TGC	2	6	2410355	2410360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225442
43522	NC_020568	AAT	2	6	2410394	2410399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225442
43523	NC_020568	CAAT	2	8	2410407	2410414	50 %	25 %	0 %	25 %	470225442
43524	NC_020568	TC	3	6	2410461	2410466	0 %	50 %	0 %	50 %	470225442
43525	NC_020568	TTA	2	6	2410493	2410498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225442
43526	NC_020568	CAA	2	6	2410572	2410577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225442
43527	NC_020568	TTG	2	6	2410591	2410596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225442
43528	NC_020568	GTT	2	6	2410626	2410631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225442
43529	NC_020568	TG	3	6	2410655	2410660	0 %	50 %	50 %	0 %	470225442
43530	NC_020568	CGT	2	6	2410700	2410705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225442
43531	NC_020568	TTCAT	2	10	2410706	2410715	20 %	60 %	0 %	20 %	470225442
43532	NC_020568	CGT	2	6	2410807	2410812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225442
43533	NC_020568	ATC	2	6	2410873	2410878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225442
43534	NC_020568	AAAT	2	8	2410893	2410900	75 %	25 %	0 %	0 %	470225442
43535	NC_020568	GTC	2	6	2410920	2410925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225442
43536	NC_020568	CAA	2	6	2410944	2410949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225442
43537	NC_020568	TTTTGT	2	12	2411004	2411015	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470225442
43538	NC_020568	TGG	2	6	2411201	2411206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225443
43539	NC_020568	CAT	3	9	2411275	2411283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225443
43540	NC_020568	T	6	6	2411314	2411319	0 %	100 %	0 %	0 %	470225443
43541	NC_020568	CTT	2	6	2411404	2411409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225443
43542	NC_020568	TAAG	2	8	2411415	2411422	50 %	25 %	25 %	0 %	470225443
43543	NC_020568	ACC	2	6	2411470	2411475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225443
43544	NC_020568	TCA	3	9	2411547	2411555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225443
43545	NC_020568	GTA	2	6	2411571	2411576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225443
43546	NC_020568	CAAT	2	8	2411628	2411635	50 %	25 %	0 %	25 %	470225443
43547	NC_020568	CATG	2	8	2411665	2411672	25 %	25 %	25 %	25 %	470225443
43548	NC_020568	GTT	2	6	2411674	2411679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225443
43549	NC_020568	ATC	2	6	2411715	2411720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225443
43550	NC_020568	ATT	2	6	2411964	2411969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225444
43551	NC_020568	T	6	6	2412068	2412073	0 %	100 %	0 %	0 %	470225444
43552	NC_020568	ATACC	2	10	2412111	2412120	40 %	20 %	0 %	40 %	470225444
43553	NC_020568	GAA	2	6	2412193	2412198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225444
43554	NC_020568	GCC	2	6	2412211	2412216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470225444
43555	NC_020568	TAA	2	6	2412249	2412254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225444
43556	NC_020568	ATA	2	6	2412423	2412428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225444
43557	NC_020568	TCT	2	6	2412441	2412446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225444
43558	NC_020568	TAA	2	6	2412502	2412507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225444
43559	NC_020568	AGTT	2	8	2412513	2412520	25 %	50 %	25 %	0 %	470225444
43560	NC_020568	CTAAA	2	10	2412540	2412549	60 %	20 %	0 %	20 %	470225444
43561	NC_020568	CAT	2	6	2412655	2412660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225444
43562	NC_020568	AT	3	6	2412671	2412676	50 %	50 %	0 %	0 %	470225444
43563	NC_020568	GAT	2	6	2412722	2412727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225444
43564	NC_020568	CAA	2	6	2412735	2412740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225444
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43567	NC_020568	TTG	2	6	2413358	2413363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225445
43568	NC_020568	AT	3	6	2413483	2413488	50 %	50 %	0 %	0 %	470225445
43569	NC_020568	AAT	2	6	2413642	2413647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225445
43570	NC_020568	A	6	6	2413703	2413708	100 %	0 %	0 %	0 %	470225445
43571	NC_020568	TAT	2	6	2413715	2413720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225445
43572	NC_020568	TCT	2	6	2413941	2413946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225446
43573	NC_020568	TTTA	2	8	2413958	2413965	25 %	75 %	0 %	0 %	470225446
43574	NC_020568	ATA	2	6	2413976	2413981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225446
43575	NC_020568	TAA	2	6	2414006	2414011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225446
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43577	NC_020568	TGT	2	6	2414068	2414073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225446
43578	NC_020568	GT	3	6	2414202	2414207	0 %	50 %	50 %	0 %	470225446
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43582	NC_020568	TCA	2	6	2414349	2414354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225446
43583	NC_020568	TAAG	2	8	2414369	2414376	50 %	25 %	25 %	0 %	470225446
43584	NC_020568	GTC	2	6	2414486	2414491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225446
43585	NC_020568	TGAT	2	8	2414552	2414559	25 %	50 %	25 %	0 %	470225446
43586	NC_020568	T	6	6	2414573	2414578	0 %	100 %	0 %	0 %	470225446
43587	NC_020568	TGT	2	6	2414580	2414585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225446
43588	NC_020568	TTTA	2	8	2414588	2414595	25 %	75 %	0 %	0 %	470225446
43589	NC_020568	TGT	2	6	2414605	2414610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225446
43590	NC_020568	AT	3	6	2414688	2414693	50 %	50 %	0 %	0 %	470225446
43591	NC_020568	AAAT	2	8	2414827	2414834	75 %	25 %	0 %	0 %	470225446
43592	NC_020568	TCG	2	6	2414895	2414900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225446
43593	NC_020568	T	6	6	2414906	2414911	0 %	100 %	0 %	0 %	470225446
43594	NC_020568	T	6	6	2414948	2414953	0 %	100 %	0 %	0 %	470225446
43595	NC_020568	CCA	2	6	2415027	2415032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225446
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43597	NC_020568	TTC	2	6	2415044	2415049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225446
43598	NC_020568	GCTTT	2	10	2415112	2415121	0 %	60 %	20 %	20 %	470225446
43599	NC_020568	T	6	6	2415146	2415151	0 %	100 %	0 %	0 %	470225446
43600	NC_020568	ATCTTT	2	12	2415152	2415163	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470225446
43601	NC_020568	TAG	2	6	2415166	2415171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225446
43602	NC_020568	CTTG	2	8	2415230	2415237	0 %	50 %	25 %	25 %	470225446
43603	NC_020568	AT	3	6	2415244	2415249	50 %	50 %	0 %	0 %	470225446
43604	NC_020568	CTG	2	6	2415286	2415291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225446
43605	NC_020568	TGA	2	6	2415299	2415304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225446
43606	NC_020568	CCA	2	6	2415321	2415326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225446
43607	NC_020568	ATCTTT	2	12	2415383	2415394	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470225446
43608	NC_020568	CAT	3	9	2415397	2415405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225446
43609	NC_020568	AAG	2	6	2415443	2415448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225446
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43612	NC_020568	TAA	2	6	2416628	2416633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225447
43613	NC_020568	T	7	7	2416673	2416679	0 %	100 %	0 %	0 %	470225447
43614	NC_020568	ATTTT	2	10	2416735	2416744	20 %	80 %	0 %	0 %	470225447
43615	NC_020568	GTT	2	6	2416766	2416771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225447
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43970	NC_020568	TTA	2	6	2435614	2435619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225464
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43981	NC_020568	TTA	2	6	2435984	2435989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225465
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