MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_020568	TTA	2	6	2381053	2381058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225423
43003	NC_020568	TTG	2	6	2381277	2381282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225423
43004	NC_020568	T	6	6	2381291	2381296	0 %	100 %	0 %	0 %	470225423
43005	NC_020568	TTG	2	6	2381304	2381309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225423
43006	NC_020568	TTG	2	6	2381346	2381351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225423
43007	NC_020568	TCT	2	6	2381356	2381361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225423
43008	NC_020568	T	6	6	2381361	2381366	0 %	100 %	0 %	0 %	470225423
43009	NC_020568	ACT	2	6	2381377	2381382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225423
43010	NC_020568	AAT	2	6	2381424	2381429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225423
43011	NC_020568	T	6	6	2381444	2381449	0 %	100 %	0 %	0 %	470225423
43012	NC_020568	TTA	2	6	2381506	2381511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225423
43013	NC_020568	TAA	2	6	2381523	2381528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225423
43014	NC_020568	T	6	6	2381541	2381546	0 %	100 %	0 %	0 %	470225423
43015	NC_020568	AAAGA	2	10	2381650	2381659	80 %	0 %	20 %	0 %	470225423
43016	NC_020568	ATA	2	6	2381696	2381701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225423
43017	NC_020568	ATTT	2	8	2381702	2381709	25 %	75 %	0 %	0 %	470225423
43018	NC_020568	AT	3	6	2381714	2381719	50 %	50 %	0 %	0 %	470225423
43019	NC_020568	AGA	2	6	2381889	2381894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225424
43020	NC_020568	TCC	2	6	2381917	2381922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225424
43021	NC_020568	TAC	2	6	2381945	2381950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225424
43022	NC_020568	AAC	2	6	2381988	2381993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225424
43023	NC_020568	TTAC	2	8	2382021	2382028	25 %	50 %	0 %	25 %	470225424
43024	NC_020568	AT	3	6	2382042	2382047	50 %	50 %	0 %	0 %	470225424
43025	NC_020568	ATTTG	2	10	2382102	2382111	20 %	60 %	20 %	0 %	470225424
43026	NC_020568	TTC	2	6	2382120	2382125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225424
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43028	NC_020568	ATA	2	6	2382272	2382277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225424
43029	NC_020568	ATCA	2	8	2382295	2382302	50 %	25 %	0 %	25 %	470225424
43030	NC_020568	CAA	2	6	2382353	2382358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225424
43031	NC_020568	ATT	2	6	2382364	2382369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225424
43032	NC_020568	TGA	2	6	2382405	2382410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225424
43033	NC_020568	ATA	2	6	2382428	2382433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225424
43034	NC_020568	AAT	2	6	2382456	2382461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225424
43035	NC_020568	TTCA	2	8	2382561	2382568	25 %	50 %	0 %	25 %	470225425
43036	NC_020568	GTA	2	6	2382637	2382642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225425
43037	NC_020568	GAA	2	6	2382655	2382660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225425
43038	NC_020568	AATAT	2	10	2382680	2382689	60 %	40 %	0 %	0 %	470225425
43039	NC_020568	AGA	2	6	2382723	2382728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225425
43040	NC_020568	ATT	2	6	2382775	2382780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225425
43041	NC_020568	ATT	3	9	2382844	2382852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225425
43042	NC_020568	TAT	2	6	2382861	2382866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225425
43043	NC_020568	CAG	2	6	2382939	2382944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225425
43044	NC_020568	ACT	2	6	2382964	2382969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225425
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43046	NC_020568	A	6	6	2383038	2383043	100 %	0 %	0 %	0 %	470225425
43047	NC_020568	AACA	2	8	2383054	2383061	75 %	0 %	0 %	25 %	470225425
43048	NC_020568	A	6	6	2383085	2383090	100 %	0 %	0 %	0 %	470225425
43049	NC_020568	ATT	2	6	2383132	2383137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225425
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43052	NC_020568	AGA	2	6	2383194	2383199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225425
43053	NC_020568	ACA	2	6	2383231	2383236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225425
43054	NC_020568	CAT	2	6	2383271	2383276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225425
43055	NC_020568	TTA	2	6	2383285	2383290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225425
43056	NC_020568	TTC	2	6	2383369	2383374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225425
43057	NC_020568	TGA	2	6	2383398	2383403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225425
43058	NC_020568	TA	3	6	2383411	2383416	50 %	50 %	0 %	0 %	470225425
43059	NC_020568	ATT	2	6	2383423	2383428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225425
43060	NC_020568	GGTA	2	8	2383431	2383438	25 %	25 %	50 %	0 %	470225425
43061	NC_020568	T	6	6	2383578	2383583	0 %	100 %	0 %	0 %	470225426
43062	NC_020568	CTT	2	6	2383593	2383598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225426
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43068	NC_020568	AAAT	2	8	2383707	2383714	75 %	25 %	0 %	0 %	470225426
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43072	NC_020568	CTT	2	6	2383903	2383908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225426
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43086	NC_020568	TA	3	6	2384577	2384582	50 %	50 %	0 %	0 %	470225426
43087	NC_020568	TAA	2	6	2384647	2384652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225426
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43090	NC_020568	AAT	3	9	2384830	2384838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225426
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43101	NC_020568	TTA	2	6	2385472	2385477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225427
43102	NC_020568	T	6	6	2385509	2385514	0 %	100 %	0 %	0 %	470225427
43103	NC_020568	TAA	2	6	2385527	2385532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225427
43104	NC_020568	ATG	2	6	2385535	2385540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225427
43105	NC_020568	TAC	2	6	2385550	2385555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225427
43106	NC_020568	AGAT	2	8	2385585	2385592	50 %	25 %	25 %	0 %	470225427
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43109	NC_020568	TAT	2	6	2387240	2387245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225428
43110	NC_020568	TTAA	2	8	2387247	2387254	50 %	50 %	0 %	0 %	470225428
43111	NC_020568	T	6	6	2387314	2387319	0 %	100 %	0 %	0 %	470225428
43112	NC_020568	CAA	2	6	2387328	2387333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225428
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43236	NC_020568	ATT	2	6	2395610	2395615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225432
43237	NC_020568	ACA	2	6	2395720	2395725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225432
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43242	NC_020568	TAAA	2	8	2395980	2395987	75 %	25 %	0 %	0 %	470225432
43243	NC_020568	GGT	2	6	2395994	2395999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225432
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43351	NC_020568	TAA	2	6	2401143	2401148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225438
43352	NC_020568	TCA	2	6	2401247	2401252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
43353	NC_020568	TTC	2	6	2401338	2401343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225438
43354	NC_020568	GTG	2	6	2401415	2401420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225438
43355	NC_020568	CAATC	2	10	2401523	2401532	40 %	20 %	0 %	40 %	470225438
43356	NC_020568	CTT	2	6	2401568	2401573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225438
43357	NC_020568	AT	3	6	2401592	2401597	50 %	50 %	0 %	0 %	470225438
43358	NC_020568	CTG	2	6	2401631	2401636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225438
43359	NC_020568	CAT	2	6	2401661	2401666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
43360	NC_020568	ATA	2	6	2401667	2401672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225438
43361	NC_020568	TCA	2	6	2401873	2401878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
43362	NC_020568	GCAAC	2	10	2401909	2401918	40 %	0 %	20 %	40 %	470225438
43363	NC_020568	CAT	2	6	2401956	2401961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225438
43364	NC_020568	TCT	3	9	2401990	2401998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225438
43365	NC_020568	T	6	6	2402000	2402005	0 %	100 %	0 %	0 %	470225438
43366	NC_020568	ACC	2	6	2402037	2402042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225438
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43368	NC_020568	GTT	2	6	2402146	2402151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225438
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43372	NC_020568	ACC	2	6	2402295	2402300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225438
43373	NC_020568	CCT	2	6	2402499	2402504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225439
43374	NC_020568	ATA	2	6	2402554	2402559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225439
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43381	NC_020568	ACC	2	6	2402947	2402952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225439
43382	NC_020568	GGC	2	6	2402987	2402992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470225439
43383	NC_020568	TA	3	6	2403003	2403008	50 %	50 %	0 %	0 %	470225439
43384	NC_020568	TTG	2	6	2403028	2403033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225439
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43424	NC_020568	GGT	2	6	2405498	2405503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470225439
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43428	NC_020568	T	7	7	2405635	2405641	0 %	100 %	0 %	0 %	470225439
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43432	NC_020568	GCA	2	6	2405771	2405776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225439
43433	NC_020568	TCT	2	6	2405795	2405800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225439
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43436	NC_020568	TGT	2	6	2406031	2406036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225439
43437	NC_020568	CTT	2	6	2406042	2406047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225439
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43439	NC_020568	TACTTT	2	12	2406090	2406101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470225439
43440	NC_020568	AT	3	6	2406520	2406525	50 %	50 %	0 %	0 %	470225440
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43444	NC_020568	CGA	2	6	2406573	2406578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225440
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43447	NC_020568	ACT	2	6	2406739	2406744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225440
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43451	NC_020568	AT	4	8	2406934	2406941	50 %	50 %	0 %	0 %	470225440
43452	NC_020568	ACC	2	6	2406951	2406956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225440
43453	NC_020568	TCT	2	6	2406988	2406993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225440
43454	NC_020568	GCA	2	6	2407075	2407080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225440
43455	NC_020568	GTT	2	6	2407125	2407130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225440
43456	NC_020568	GT	3	6	2407133	2407138	0 %	50 %	50 %	0 %	470225440
43457	NC_020568	CTT	3	9	2407142	2407150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225440
43458	NC_020568	TGC	2	6	2407212	2407217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225440
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43460	NC_020568	T	6	6	2407238	2407243	0 %	100 %	0 %	0 %	470225440
43461	NC_020568	AGT	2	6	2407293	2407298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225440
43462	NC_020568	AAT	2	6	2407391	2407396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225440
43463	NC_020568	AT	4	8	2407453	2407460	50 %	50 %	0 %	0 %	470225440
43464	NC_020568	T	6	6	2407841	2407846	0 %	100 %	0 %	0 %	470225441
43465	NC_020568	CTT	2	6	2407900	2407905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225441
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