MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_020568	CAA	2	6	2354971	2354976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225403
42503	NC_020568	AT	3	6	2355023	2355028	50 %	50 %	0 %	0 %	470225403
42504	NC_020568	ATC	2	6	2355079	2355084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225403
42505	NC_020568	GCT	2	6	2355129	2355134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225403
42506	NC_020568	T	7	7	2355139	2355145	0 %	100 %	0 %	0 %	470225403
42507	NC_020568	A	7	7	2355168	2355174	100 %	0 %	0 %	0 %	470225403
42508	NC_020568	CAAATC	2	12	2355479	2355490	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470225404
42509	NC_020568	TGA	2	6	2355507	2355512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225404
42510	NC_020568	CAA	2	6	2355520	2355525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225404
42511	NC_020568	A	6	6	2355559	2355564	100 %	0 %	0 %	0 %	470225404
42512	NC_020568	ATT	2	6	2355583	2355588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225404
42513	NC_020568	TTG	2	6	2355596	2355601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225404
42514	NC_020568	AAC	2	6	2355638	2355643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225404
42515	NC_020568	ACA	2	6	2355762	2355767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225404
42516	NC_020568	ATCG	2	8	2355772	2355779	25 %	25 %	25 %	25 %	470225404
42517	NC_020568	AGT	2	6	2355873	2355878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225404
42518	NC_020568	TAT	2	6	2355930	2355935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225404
42519	NC_020568	A	7	7	2355969	2355975	100 %	0 %	0 %	0 %	470225404
42520	NC_020568	TAT	2	6	2355976	2355981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225404
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42524	NC_020568	TATTT	2	10	2356351	2356360	20 %	80 %	0 %	0 %	470225405
42525	NC_020568	GCTT	2	8	2356380	2356387	0 %	50 %	25 %	25 %	470225405
42526	NC_020568	GCTTTT	2	12	2356405	2356416	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470225405
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42530	NC_020568	TTTA	2	8	2356512	2356519	25 %	75 %	0 %	0 %	470225405
42531	NC_020568	TAA	2	6	2356527	2356532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225405
42532	NC_020568	CTT	2	6	2356547	2356552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225405
42533	NC_020568	ACC	2	6	2356554	2356559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225405
42534	NC_020568	ACA	2	6	2356594	2356599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225405
42535	NC_020568	TGT	2	6	2356639	2356644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225405
42536	NC_020568	GTT	2	6	2356645	2356650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225405
42537	NC_020568	TGT	2	6	2356653	2356658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225405
42538	NC_020568	GTC	2	6	2356742	2356747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225405
42539	NC_020568	CAT	2	6	2356782	2356787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225405
42540	NC_020568	AT	3	6	2356837	2356842	50 %	50 %	0 %	0 %	470225405
42541	NC_020568	ATTTA	2	10	2356854	2356863	40 %	60 %	0 %	0 %	470225405
42542	NC_020568	TAA	3	9	2356986	2356994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225405
42543	NC_020568	TAAA	2	8	2357034	2357041	75 %	25 %	0 %	0 %	470225405
42544	NC_020568	TAA	2	6	2357046	2357051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225405
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42551	NC_020568	TGT	2	6	2357325	2357330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225405
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42554	NC_020568	TAA	3	9	2357528	2357536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225405
42555	NC_020568	CAT	2	6	2357595	2357600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225405
42556	NC_020568	AAT	2	6	2357668	2357673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225405
42557	NC_020568	TTA	2	6	2357689	2357694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225405
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42561	NC_020568	T	7	7	2357916	2357922	0 %	100 %	0 %	0 %	470225405
42562	NC_020568	T	6	6	2357924	2357929	0 %	100 %	0 %	0 %	470225405
42563	NC_020568	TTC	2	6	2357943	2357948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225405
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42596	NC_020568	TA	3	6	2359422	2359427	50 %	50 %	0 %	0 %	470225407
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42601	NC_020568	AT	3	6	2359505	2359510	50 %	50 %	0 %	0 %	470225407
42602	NC_020568	TTA	2	6	2359534	2359539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225407
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42615	NC_020568	CAA	2	6	2360229	2360234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225408
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42617	NC_020568	AAT	2	6	2360329	2360334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225408
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42723	NC_020568	ATTT	2	8	2365903	2365910	25 %	75 %	0 %	0 %	470225412
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42729	NC_020568	GTT	3	9	2366184	2366192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225412
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42731	NC_020568	TTA	2	6	2366225	2366230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225412
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42840	NC_020568	TGT	2	6	2371887	2371892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225417
42841	NC_020568	AAT	2	6	2371917	2371922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225417
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42843	NC_020568	TGC	2	6	2372027	2372032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225417
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42850	NC_020568	AATG	2	8	2372369	2372376	50 %	25 %	25 %	0 %	470225417
42851	NC_020568	CATG	2	8	2372382	2372389	25 %	25 %	25 %	25 %	470225417
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42967	NC_020568	CAT	2	6	2378706	2378711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225422
42968	NC_020568	ATC	2	6	2378785	2378790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225422
42969	NC_020568	AAT	2	6	2378822	2378827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225422
42970	NC_020568	TAA	2	6	2378853	2378858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225422
42971	NC_020568	AAC	2	6	2378911	2378916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225422
42972	NC_020568	TCA	3	9	2378933	2378941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225422
42973	NC_020568	TCT	2	6	2379032	2379037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470225422
42974	NC_020568	AAC	2	6	2379046	2379051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225422
42975	NC_020568	TCC	2	6	2379106	2379111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225422
42976	NC_020568	ATCTTT	2	12	2379127	2379138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470225422
42977	NC_020568	ACA	2	6	2379158	2379163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225422
42978	NC_020568	TC	3	6	2379187	2379192	0 %	50 %	0 %	50 %	470225422
42979	NC_020568	TAA	2	6	2379222	2379227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470225422
42980	NC_020568	TA	3	6	2379264	2379269	50 %	50 %	0 %	0 %	470225422
42981	NC_020568	TTCA	2	8	2379334	2379341	25 %	50 %	0 %	25 %	470225422
42982	NC_020568	GCC	2	6	2379418	2379423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470225422
42983	NC_020568	T	6	6	2379438	2379443	0 %	100 %	0 %	0 %	470225422
42984	NC_020568	CCA	2	6	2379551	2379556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470225422
42985	NC_020568	CCT	2	6	2379583	2379588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470225422
42986	NC_020568	CT	3	6	2379593	2379598	0 %	50 %	0 %	50 %	470225422
42987	NC_020568	TTTC	2	8	2379606	2379613	0 %	75 %	0 %	25 %	470225422
42988	NC_020568	ATT	2	6	2379635	2379640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470225422
42989	NC_020568	AAACT	2	10	2380496	2380505	60 %	20 %	0 %	20 %	470225423
42990	NC_020568	ATG	2	6	2380566	2380571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470225423
42991	NC_020568	TTG	2	6	2380598	2380603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470225423
42992	NC_020568	GT	3	6	2380608	2380613	0 %	50 %	50 %	0 %	470225423
42993	NC_020568	GAA	2	6	2380707	2380712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470225423
42994	NC_020568	CCATA	2	10	2380737	2380746	40 %	20 %	0 %	40 %	470225423
42995	NC_020568	AAATC	2	10	2380819	2380828	60 %	20 %	0 %	20 %	470225423
42996	NC_020568	AAAT	2	8	2380846	2380853	75 %	25 %	0 %	0 %	470225423
42997	NC_020568	TGC	2	6	2380875	2380880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470225423
42998	NC_020568	AAC	2	6	2380881	2380886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470225423
42999	NC_020568	ATC	2	6	2380894	2380899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470225423
43000	NC_020568	ACG	2	6	2380930	2380935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470225423

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