MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020568	ATG	2	6	541187	541192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224118
10003	NC_020568	ATGG	2	8	541798	541805	25 %	25 %	50 %	0 %	470224119
10004	NC_020568	GGA	2	6	541840	541845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470224119
10005	NC_020568	TTG	2	6	541848	541853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224119
10006	NC_020568	AGC	2	6	541858	541863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224119
10007	NC_020568	AAC	2	6	541936	541941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224119
10008	NC_020568	CAG	2	6	541962	541967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224119
10009	NC_020568	TGG	2	6	542020	542025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224119
10010	NC_020568	A	6	6	542087	542092	100 %	0 %	0 %	0 %	470224119
10011	NC_020568	TA	3	6	542097	542102	50 %	50 %	0 %	0 %	470224119
10012	NC_020568	GAA	2	6	542111	542116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224119
10013	NC_020568	TTAT	2	8	542202	542209	25 %	75 %	0 %	0 %	470224119
10014	NC_020568	AGA	2	6	542221	542226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224119
10015	NC_020568	TAG	2	6	542241	542246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224119
10016	NC_020568	GATTC	2	10	542249	542258	20 %	40 %	20 %	20 %	470224119
10017	NC_020568	AT	3	6	542264	542269	50 %	50 %	0 %	0 %	470224119
10018	NC_020568	AAG	2	6	542388	542393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224119
10019	NC_020568	AAT	2	6	542561	542566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224119
10020	NC_020568	AGA	2	6	542584	542589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224119
10021	NC_020568	CAA	2	6	542595	542600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224119
10022	NC_020568	CAA	2	6	542613	542618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224119
10023	NC_020568	TTG	2	6	542619	542624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224119
10024	NC_020568	TTG	2	6	542738	542743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224119
10025	NC_020568	AGAA	2	8	542760	542767	75 %	0 %	25 %	0 %	470224119
10026	NC_020568	ACA	3	9	542779	542787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224119
10027	NC_020568	CAG	2	6	542832	542837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224119
10028	NC_020568	CGT	2	6	542939	542944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224119
10029	NC_020568	AAC	2	6	542958	542963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224119
10030	NC_020568	ATT	2	6	543002	543007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224119
10031	NC_020568	ATA	2	6	543015	543020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224119
10032	NC_020568	ACT	2	6	543065	543070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224119
10033	NC_020568	TTCA	2	8	543096	543103	25 %	50 %	0 %	25 %	470224119
10034	NC_020568	TTA	3	9	543153	543161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224120
10035	NC_020568	ATT	2	6	543170	543175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224120
10036	NC_020568	AAT	2	6	543190	543195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224120
10037	NC_020568	TAT	2	6	543196	543201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224120
10038	NC_020568	A	6	6	543247	543252	100 %	0 %	0 %	0 %	470224120
10039	NC_020568	GTA	2	6	543276	543281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224120
10040	NC_020568	TATT	2	8	543306	543313	25 %	75 %	0 %	0 %	470224120
10041	NC_020568	TAT	2	6	543352	543357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224120
10042	NC_020568	CAA	2	6	543387	543392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224120
10043	NC_020568	TAA	2	6	543399	543404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224120
10044	NC_020568	TCATT	2	10	543469	543478	20 %	60 %	0 %	20 %	470224120
10045	NC_020568	A	6	6	543530	543535	100 %	0 %	0 %	0 %	470224120
10046	NC_020568	AATGTT	2	12	543544	543555	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470224120
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10049	NC_020568	TTG	2	6	543723	543728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224120
10050	NC_020568	AGCT	2	8	543867	543874	25 %	25 %	25 %	25 %	470224120
10051	NC_020568	TAT	2	6	543892	543897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224120
10052	NC_020568	TAAA	2	8	543915	543922	75 %	25 %	0 %	0 %	470224120
10053	NC_020568	GAT	2	6	544064	544069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224120
10054	NC_020568	GTT	2	6	544082	544087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224120
10055	NC_020568	AGT	2	6	544129	544134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224120
10056	NC_020568	GAA	2	6	544158	544163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224120
10057	NC_020568	A	7	7	544175	544181	100 %	0 %	0 %	0 %	470224120
10058	NC_020568	A	7	7	544755	544761	100 %	0 %	0 %	0 %	470224121
10059	NC_020568	ATT	2	6	544835	544840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224121
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10063	NC_020568	AGA	2	6	545063	545068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224121
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10065	NC_020568	GTG	2	6	545134	545139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224121
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10077	NC_020568	TGA	2	6	545672	545677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224121
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10087	NC_020568	TTAT	2	8	546099	546106	25 %	75 %	0 %	0 %	470224121
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10089	NC_020568	GA	3	6	546658	546663	50 %	0 %	50 %	0 %	470224122
10090	NC_020568	A	8	8	546783	546790	100 %	0 %	0 %	0 %	470224122
10091	NC_020568	GCA	2	6	546797	546802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470224122
10092	NC_020568	CG	3	6	546803	546808	0 %	0 %	50 %	50 %	470224122
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10100	NC_020568	ATC	2	6	547182	547187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224122
10101	NC_020568	GA	3	6	547257	547262	50 %	0 %	50 %	0 %	470224122
10102	NC_020568	GAT	2	6	547268	547273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224122
10103	NC_020568	TA	3	6	547279	547284	50 %	50 %	0 %	0 %	470224122
10104	NC_020568	AAG	2	6	547303	547308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224123
10105	NC_020568	ATGT	3	12	547341	547352	25 %	50 %	25 %	0 %	470224123
10106	NC_020568	TA	3	6	547363	547368	50 %	50 %	0 %	0 %	470224123
10107	NC_020568	AATT	2	8	547400	547407	50 %	50 %	0 %	0 %	470224123
10108	NC_020568	GAT	2	6	547479	547484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224123
10109	NC_020568	ATTA	2	8	547487	547494	50 %	50 %	0 %	0 %	470224123
10110	NC_020568	AT	3	6	547541	547546	50 %	50 %	0 %	0 %	470224123
10111	NC_020568	GCT	2	6	547548	547553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470224123
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10113	NC_020568	TTA	2	6	547639	547644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224123
10114	NC_020568	TGG	2	6	547651	547656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224123
10115	NC_020568	GTG	2	6	547678	547683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224123
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10118	NC_020568	A	6	6	547818	547823	100 %	0 %	0 %	0 %	470224123
10119	NC_020568	GGT	2	6	547941	547946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470224123
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10361	NC_020568	AAGTTG	2	12	562142	562153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470224132
10362	NC_020568	CA	3	6	562254	562259	50 %	0 %	0 %	50 %	470224132
10363	NC_020568	AGA	2	6	562341	562346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470224132
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10365	NC_020568	TTG	2	6	562379	562384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224132
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10397	NC_020568	A	6	6	564602	564607	100 %	0 %	0 %	0 %	470224134
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10477	NC_020568	TTC	2	6	567844	567849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224135
10478	NC_020568	TAC	2	6	567879	567884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224135
10479	NC_020568	GTT	2	6	567898	567903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224135
10480	NC_020568	GTT	2	6	568039	568044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470224135
10481	NC_020568	AAT	2	6	568058	568063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224135
10482	NC_020568	TACAGC	2	12	568389	568400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470224136
10483	NC_020568	TCA	2	6	568417	568422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224136
10484	NC_020568	AGAA	2	8	568486	568493	75 %	0 %	25 %	0 %	470224136
10485	NC_020568	AAT	2	6	568514	568519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224136
10486	NC_020568	TCT	2	6	568528	568533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224136
10487	NC_020568	ATC	2	6	568537	568542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470224136
10488	NC_020568	CTT	2	6	568586	568591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224136
10489	NC_020568	TAA	2	6	568592	568597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470224136
10490	NC_020568	TTA	2	6	568615	568620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224136
10491	NC_020568	TTGCTA	2	12	568670	568681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470224136
10492	NC_020568	GATC	2	8	568838	568845	25 %	25 %	25 %	25 %	470224136
10493	NC_020568	ATT	2	6	568855	568860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470224136
10494	NC_020568	T	6	6	568859	568864	0 %	100 %	0 %	0 %	470224136
10495	NC_020568	ACC	2	6	568932	568937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470224136
10496	NC_020568	TGAA	2	8	568995	569002	50 %	25 %	25 %	0 %	470224136
10497	NC_020568	TCTA	2	8	569046	569053	25 %	50 %	0 %	25 %	470224136
10498	NC_020568	ACC	2	6	569091	569096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470224136
10499	NC_020568	TTC	2	6	569106	569111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470224136
10500	NC_020568	ACA	2	6	569131	569136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470224136

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