MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_020566	ACA	2	6	2438606	2438611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223499
44002	NC_020566	AT	3	6	2438616	2438621	50 %	50 %	0 %	0 %	470223499
44003	NC_020566	ATT	2	6	2438653	2438658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223499
44004	NC_020566	TGT	2	6	2438930	2438935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223500
44005	NC_020566	AAT	2	6	2438947	2438952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223500
44006	NC_020566	CAAT	2	8	2438994	2439001	50 %	25 %	0 %	25 %	470223500
44007	NC_020566	CTT	2	6	2439030	2439035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223500
44008	NC_020566	T	6	6	2439039	2439044	0 %	100 %	0 %	0 %	470223500
44009	NC_020566	GTT	2	6	2439132	2439137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223500
44010	NC_020566	CAC	2	6	2439141	2439146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223500
44011	NC_020566	TAA	2	6	2439304	2439309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223500
44012	NC_020566	CAA	2	6	2439324	2439329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223500
44013	NC_020566	GTT	2	6	2439348	2439353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223500
44014	NC_020566	TTTATA	2	12	2439368	2439379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223500
44015	NC_020566	CGA	2	6	2439465	2439470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223500
44016	NC_020566	ATT	2	6	2439481	2439486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223500
44017	NC_020566	ATT	2	6	2439556	2439561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223500
44018	NC_020566	CTT	2	6	2439586	2439591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223500
44019	NC_020566	TTG	2	6	2439597	2439602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223500
44020	NC_020566	CTA	2	6	2439705	2439710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223500
44021	NC_020566	ATA	2	6	2439720	2439725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223500
44022	NC_020566	GATA	2	8	2439763	2439770	50 %	25 %	25 %	0 %	470223500
44023	NC_020566	T	6	6	2439904	2439909	0 %	100 %	0 %	0 %	470223500
44024	NC_020566	GATT	2	8	2439923	2439930	25 %	50 %	25 %	0 %	470223500
44025	NC_020566	ATT	2	6	2439988	2439993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223500
44026	NC_020566	T	6	6	2440039	2440044	0 %	100 %	0 %	0 %	470223500
44027	NC_020566	AAATTG	2	12	2440053	2440064	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223500
44028	NC_020566	TAA	2	6	2440075	2440080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223500
44029	NC_020566	CAAT	2	8	2440097	2440104	50 %	25 %	0 %	25 %	470223500
44030	NC_020566	AGC	2	6	2440126	2440131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223500
44031	NC_020566	AAGT	2	8	2440138	2440145	50 %	25 %	25 %	0 %	470223500
44032	NC_020566	AT	3	6	2440209	2440214	50 %	50 %	0 %	0 %	470223500
44033	NC_020566	T	6	6	2440214	2440219	0 %	100 %	0 %	0 %	470223500
44034	NC_020566	T	6	6	2440282	2440287	0 %	100 %	0 %	0 %	470223500
44035	NC_020566	ACA	2	6	2440348	2440353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223500
44036	NC_020566	ATC	2	6	2440427	2440432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223500
44037	NC_020566	AAT	2	6	2440438	2440443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223500
44038	NC_020566	TGA	2	6	2440485	2440490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223500
44039	NC_020566	ACA	2	6	2440494	2440499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223500
44040	NC_020566	CTA	2	6	2442171	2442176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223501
44041	NC_020566	A	6	6	2442186	2442191	100 %	0 %	0 %	0 %	470223501
44042	NC_020566	TGG	2	6	2442316	2442321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223501
44043	NC_020566	ATGC	2	8	2442344	2442351	25 %	25 %	25 %	25 %	470223501
44044	NC_020566	AAC	2	6	2442432	2442437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223501
44045	NC_020566	ATT	2	6	2442446	2442451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223501
44046	NC_020566	GGC	2	6	2442457	2442462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470223501
44047	NC_020566	TTA	2	6	2442479	2442484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223501
44048	NC_020566	CAT	3	9	2442513	2442521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223501
44049	NC_020566	ATT	2	6	2442572	2442577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223501
44050	NC_020566	TGG	2	6	2442586	2442591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223501
44051	NC_020566	CAA	2	6	2442597	2442602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223501
44052	NC_020566	ATG	2	6	2442603	2442608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223501
44053	NC_020566	TTA	2	6	2442665	2442670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223501
44054	NC_020566	AATG	2	8	2442673	2442680	50 %	25 %	25 %	0 %	470223501
44055	NC_020566	GAT	2	6	2442838	2442843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223501
44056	NC_020566	GATAA	2	10	2442878	2442887	60 %	20 %	20 %	0 %	470223501
44057	NC_020566	GCA	2	6	2442950	2442955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223501
44058	NC_020566	TTA	2	6	2442956	2442961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223501
44059	NC_020566	GTC	2	6	2442998	2443003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223501
44060	NC_020566	TCA	2	6	2443021	2443026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223501
44061	NC_020566	TTA	2	6	2443050	2443055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223501
44062	NC_020566	GCGTT	2	10	2443107	2443116	0 %	40 %	40 %	20 %	470223501
44063	NC_020566	AGA	2	6	2443240	2443245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223501
44064	NC_020566	TTA	2	6	2443271	2443276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223501
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44066	NC_020566	ATC	2	6	2443433	2443438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223502
44067	NC_020566	GTC	2	6	2443439	2443444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223502
44068	NC_020566	ACA	2	6	2443467	2443472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223502
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44070	NC_020566	GAA	3	9	2443549	2443557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223502
44071	NC_020566	CCG	2	6	2443569	2443574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470223502
44072	NC_020566	A	7	7	2443578	2443584	100 %	0 %	0 %	0 %	470223502
44073	NC_020566	TA	3	6	2443589	2443594	50 %	50 %	0 %	0 %	470223502
44074	NC_020566	ATT	2	6	2443597	2443602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223502
44075	NC_020566	ATT	2	6	2443615	2443620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223502
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44078	NC_020566	A	6	6	2443702	2443707	100 %	0 %	0 %	0 %	470223502
44079	NC_020566	A	6	6	2443778	2443783	100 %	0 %	0 %	0 %	470223502
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44086	NC_020566	AAT	2	6	2443906	2443911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223502
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44088	NC_020566	TAAT	2	8	2444031	2444038	50 %	50 %	0 %	0 %	470223502
44089	NC_020566	ACTA	2	8	2444299	2444306	50 %	25 %	0 %	25 %	470223503
44090	NC_020566	GTAC	2	8	2444314	2444321	25 %	25 %	25 %	25 %	470223503
44091	NC_020566	CAT	2	6	2444322	2444327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223503
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44094	NC_020566	TGTT	2	8	2444508	2444515	0 %	75 %	25 %	0 %	470223503
44095	NC_020566	ATT	2	6	2444527	2444532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223503
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44098	NC_020566	GTA	2	6	2444651	2444656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223503
44099	NC_020566	CAT	2	6	2444662	2444667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223503
44100	NC_020566	TGG	2	6	2444689	2444694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223503
44101	NC_020566	TCA	2	6	2444754	2444759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223503
44102	NC_020566	TAG	2	6	2444824	2444829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223503
44103	NC_020566	A	6	6	2444858	2444863	100 %	0 %	0 %	0 %	470223503
44104	NC_020566	TAT	2	6	2444872	2444877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223503
44105	NC_020566	TTA	2	6	2444940	2444945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223503
44106	NC_020566	CAA	2	6	2444972	2444977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223503
44107	NC_020566	GTCA	2	8	2445020	2445027	25 %	25 %	25 %	25 %	470223503
44108	NC_020566	TAG	2	6	2445042	2445047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223503
44109	NC_020566	ATT	2	6	2445067	2445072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223503
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44111	NC_020566	GTG	2	6	2445095	2445100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223503
44112	NC_020566	TTC	2	6	2445164	2445169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223503
44113	NC_020566	TG	3	6	2445175	2445180	0 %	50 %	50 %	0 %	470223503
44114	NC_020566	GAA	2	6	2445224	2445229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223503
44115	NC_020566	AT	3	6	2445340	2445345	50 %	50 %	0 %	0 %	470223503
44116	NC_020566	ATT	2	6	2445347	2445352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223503
44117	NC_020566	AGTC	2	8	2445376	2445383	25 %	25 %	25 %	25 %	470223503
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44234	NC_020566	AGA	2	6	2450979	2450984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223508
44235	NC_020566	TAA	2	6	2451057	2451062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223508
44236	NC_020566	AC	3	6	2451091	2451096	50 %	0 %	0 %	50 %	470223508
44237	NC_020566	CAT	2	6	2451104	2451109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223508
44238	NC_020566	TTG	2	6	2451110	2451115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223508
44239	NC_020566	CTT	2	6	2451129	2451134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223508
44240	NC_020566	AAG	2	6	2451196	2451201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223508
44241	NC_020566	ATTC	2	8	2451215	2451222	25 %	50 %	0 %	25 %	470223508
44242	NC_020566	A	6	6	2451233	2451238	100 %	0 %	0 %	0 %	470223508
44243	NC_020566	ATT	2	6	2451262	2451267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223508
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44247	NC_020566	AATT	2	8	2451473	2451480	50 %	50 %	0 %	0 %	470223508
44248	NC_020566	CAA	2	6	2451495	2451500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223508
44249	NC_020566	TTGTC	2	10	2451545	2451554	0 %	60 %	20 %	20 %	470223508
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44251	NC_020566	TAAAT	2	10	2451763	2451772	60 %	40 %	0 %	0 %	470223509
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44254	NC_020566	ACT	2	6	2451847	2451852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223509
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44257	NC_020566	TAA	2	6	2452063	2452068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223509
44258	NC_020566	CTG	2	6	2452082	2452087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223509
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44260	NC_020566	AAG	2	6	2452204	2452209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223509
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44262	NC_020566	ACC	2	6	2452302	2452307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223509
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44264	NC_020566	TAA	2	6	2452364	2452369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223509
44265	NC_020566	AATA	2	8	2452398	2452405	75 %	25 %	0 %	0 %	470223509
44266	NC_020566	AAT	2	6	2452455	2452460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223509
44267	NC_020566	AAT	2	6	2452464	2452469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223509
44268	NC_020566	ATA	2	6	2452486	2452491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223509
44269	NC_020566	AT	3	6	2452543	2452548	50 %	50 %	0 %	0 %	470223509
44270	NC_020566	GCT	2	6	2452603	2452608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223509
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44302	NC_020566	T	7	7	2453980	2453986	0 %	100 %	0 %	0 %	470223510
44303	NC_020566	GGTTAT	2	12	2453994	2454005	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470223510
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44333	NC_020566	ATT	2	6	2455211	2455216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223510
44334	NC_020566	ATA	2	6	2455268	2455273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223510
44335	NC_020566	ATT	3	9	2455359	2455367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223511
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44337	NC_020566	GTT	2	6	2455497	2455502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223511
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44339	NC_020566	CAT	2	6	2455605	2455610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223511
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44342	NC_020566	AACC	2	8	2455715	2455722	50 %	0 %	0 %	50 %	470223511
44343	NC_020566	AAC	2	6	2455732	2455737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223511
44344	NC_020566	TCT	3	9	2455760	2455768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223511
44345	NC_020566	ACCA	2	8	2455771	2455778	50 %	0 %	0 %	50 %	470223511
44346	NC_020566	CATA	2	8	2455860	2455867	50 %	25 %	0 %	25 %	470223511
44347	NC_020566	CGC	2	6	2455912	2455917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470223511
44348	NC_020566	TGC	2	6	2455960	2455965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223511
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44350	NC_020566	AT	3	6	2456055	2456060	50 %	50 %	0 %	0 %	470223511
44351	NC_020566	AT	3	6	2456066	2456071	50 %	50 %	0 %	0 %	470223511
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