MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_020566	TTCA	2	8	2382694	2382701	25 %	50 %	0 %	25 %	470223458
43003	NC_020566	GTA	2	6	2382770	2382775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223458
43004	NC_020566	GAA	2	6	2382788	2382793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223458
43005	NC_020566	AATAT	2	10	2382813	2382822	60 %	40 %	0 %	0 %	470223458
43006	NC_020566	AGA	2	6	2382856	2382861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223458
43007	NC_020566	ATT	2	6	2382908	2382913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223458
43008	NC_020566	ATT	3	9	2382977	2382985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223458
43009	NC_020566	TAT	2	6	2382994	2382999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223458
43010	NC_020566	CAG	2	6	2383072	2383077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223458
43011	NC_020566	ACT	2	6	2383097	2383102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223458
43012	NC_020566	TAA	2	6	2383138	2383143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223458
43013	NC_020566	A	6	6	2383171	2383176	100 %	0 %	0 %	0 %	470223458
43014	NC_020566	AACA	2	8	2383187	2383194	75 %	0 %	0 %	25 %	470223458
43015	NC_020566	A	6	6	2383218	2383223	100 %	0 %	0 %	0 %	470223458
43016	NC_020566	ATT	2	6	2383265	2383270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223458
43017	NC_020566	GAA	2	6	2383307	2383312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223458
43018	NC_020566	GAA	2	6	2383316	2383321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223458
43019	NC_020566	AGA	2	6	2383327	2383332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223458
43020	NC_020566	ACA	2	6	2383364	2383369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223458
43021	NC_020566	CAT	2	6	2383404	2383409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223458
43022	NC_020566	TTA	2	6	2383418	2383423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223458
43023	NC_020566	TTC	2	6	2383502	2383507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223458
43024	NC_020566	TGA	2	6	2383531	2383536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223458
43025	NC_020566	TA	3	6	2383544	2383549	50 %	50 %	0 %	0 %	470223458
43026	NC_020566	ATT	2	6	2383556	2383561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223458
43027	NC_020566	GGTA	2	8	2383564	2383571	25 %	25 %	50 %	0 %	470223458
43028	NC_020566	T	6	6	2383711	2383716	0 %	100 %	0 %	0 %	470223459
43029	NC_020566	CTT	2	6	2383726	2383731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223459
43030	NC_020566	CTTTT	2	10	2383738	2383747	0 %	80 %	0 %	20 %	470223459
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43032	NC_020566	CAA	2	6	2383798	2383803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223459
43033	NC_020566	AGT	2	6	2383804	2383809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223459
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43035	NC_020566	AAAT	2	8	2383840	2383847	75 %	25 %	0 %	0 %	470223459
43036	NC_020566	CAG	2	6	2383858	2383863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223459
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43038	NC_020566	AT	3	6	2383899	2383904	50 %	50 %	0 %	0 %	470223459
43039	NC_020566	CTT	2	6	2384036	2384041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223459
43040	NC_020566	TAA	3	9	2384050	2384058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223459
43041	NC_020566	TGC	2	6	2384072	2384077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223459
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43044	NC_020566	TAA	2	6	2384194	2384199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223459
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43051	NC_020566	TGC	2	6	2384621	2384626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223459
43052	NC_020566	TAA	2	6	2384648	2384653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223459
43053	NC_020566	TA	3	6	2384710	2384715	50 %	50 %	0 %	0 %	470223459
43054	NC_020566	TAA	2	6	2384780	2384785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223459
43055	NC_020566	ACC	2	6	2384786	2384791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223459
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43059	NC_020566	TTCTC	2	10	2385102	2385111	0 %	60 %	0 %	40 %	470223459
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43062	NC_020566	TCA	2	6	2385456	2385461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223460
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43070	NC_020566	TAA	2	6	2385660	2385665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223460
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43072	NC_020566	TAC	2	6	2385683	2385688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223460
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43077	NC_020566	TTAA	2	8	2387380	2387387	50 %	50 %	0 %	0 %	470223461
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43090	NC_020566	CAA	2	6	2388053	2388058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223461
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43094	NC_020566	A	7	7	2388320	2388326	100 %	0 %	0 %	0 %	470223461
43095	NC_020566	CAACA	2	10	2388353	2388362	60 %	0 %	0 %	40 %	470223461
43096	NC_020566	CAAG	2	8	2388422	2388429	50 %	0 %	25 %	25 %	470223461
43097	NC_020566	CAG	2	6	2388473	2388478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223461
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43101	NC_020566	TATTGA	2	12	2388624	2388635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470223461
43102	NC_020566	ATC	2	6	2388680	2388685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223461
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43104	NC_020566	ATC	2	6	2388738	2388743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223461
43105	NC_020566	TA	3	6	2388755	2388760	50 %	50 %	0 %	0 %	470223461
43106	NC_020566	CTGT	2	8	2388766	2388773	0 %	50 %	25 %	25 %	470223461
43107	NC_020566	ATG	2	6	2388794	2388799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223461
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43113	NC_020566	AAT	2	6	2388997	2389002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223461
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43115	NC_020566	TTA	2	6	2389039	2389044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223461
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43117	NC_020566	TGA	2	6	2389124	2389129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223461
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43232	NC_020566	AAG	2	6	2397000	2397005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223466
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43349	NC_020566	GGC	2	6	2403120	2403125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470223472
43350	NC_020566	TA	3	6	2403136	2403141	50 %	50 %	0 %	0 %	470223472
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43352	NC_020566	ATA	2	6	2403185	2403190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223472
43353	NC_020566	TCG	2	6	2403257	2403262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223472
43354	NC_020566	CTG	2	6	2403289	2403294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223472
43355	NC_020566	CAG	2	6	2403346	2403351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223472
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43359	NC_020566	GCT	2	6	2403972	2403977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223472
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43371	NC_020566	GCT	2	6	2404389	2404394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223472
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43373	NC_020566	GAC	2	6	2404588	2404593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223472
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43406	NC_020566	TACTTT	2	12	2406223	2406234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470223472
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43454	NC_020566	TGC	2	6	2408908	2408913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223474
43455	NC_020566	CTT	2	6	2408978	2408983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223474
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43458	NC_020566	GT	3	6	2409128	2409133	0 %	50 %	50 %	0 %	470223474
43459	NC_020566	T	6	6	2409153	2409158	0 %	100 %	0 %	0 %	470223474
43460	NC_020566	CAT	2	6	2409159	2409164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223474
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43462	NC_020566	T	7	7	2409239	2409245	0 %	100 %	0 %	0 %	470223474
43463	NC_020566	TTA	2	6	2409250	2409255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223474
43464	NC_020566	TGT	2	6	2409354	2409359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223474
43465	NC_020566	CGTT	2	8	2409374	2409381	0 %	50 %	25 %	25 %	470223474
43466	NC_020566	GTG	2	6	2409428	2409433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223474
43467	NC_020566	CATCA	2	10	2409507	2409516	40 %	20 %	0 %	40 %	470223474
43468	NC_020566	ACA	2	6	2409520	2409525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223474
43469	NC_020566	AAC	2	6	2409594	2409599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223474
43470	NC_020566	CAT	2	6	2409647	2409652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223474
43471	NC_020566	TAA	2	6	2409807	2409812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223474
43472	NC_020566	CCA	2	6	2409844	2409849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223474
43473	NC_020566	CTTT	2	8	2409860	2409867	0 %	75 %	0 %	25 %	470223474
43474	NC_020566	TCA	2	6	2409884	2409889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223474
43475	NC_020566	ATC	2	6	2409900	2409905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223474
43476	NC_020566	CCAA	2	8	2409915	2409922	50 %	0 %	0 %	50 %	470223474
43477	NC_020566	CTGGAA	2	12	2409944	2409955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470223474
43478	NC_020566	AGT	2	6	2410020	2410025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223474
43479	NC_020566	TGAT	2	8	2410029	2410036	25 %	50 %	25 %	0 %	470223474
43480	NC_020566	TTC	2	6	2410122	2410127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223474
43481	NC_020566	ATTTT	2	10	2410135	2410144	20 %	80 %	0 %	0 %	470223474
43482	NC_020566	ATG	2	6	2410162	2410167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223474
43483	NC_020566	GC	3	6	2410225	2410230	0 %	0 %	50 %	50 %	470223474
43484	NC_020566	TTC	2	6	2410239	2410244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223474
43485	NC_020566	TTTGC	2	10	2410289	2410298	0 %	60 %	20 %	20 %	470223474
43486	NC_020566	TAA	2	6	2410468	2410473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223475
43487	NC_020566	TCAT	2	8	2410479	2410486	25 %	50 %	0 %	25 %	470223475
43488	NC_020566	TGC	2	6	2410488	2410493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223475
43489	NC_020566	AAT	2	6	2410527	2410532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223475
43490	NC_020566	CAAT	2	8	2410540	2410547	50 %	25 %	0 %	25 %	470223475
43491	NC_020566	TC	3	6	2410594	2410599	0 %	50 %	0 %	50 %	470223475
43492	NC_020566	TTA	2	6	2410626	2410631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223475
43493	NC_020566	CAA	2	6	2410705	2410710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223475
43494	NC_020566	TTG	2	6	2410724	2410729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223475
43495	NC_020566	GTT	2	6	2410759	2410764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223475
43496	NC_020566	TG	3	6	2410788	2410793	0 %	50 %	50 %	0 %	470223475
43497	NC_020566	CGT	2	6	2410833	2410838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223475
43498	NC_020566	TTCAT	2	10	2410839	2410848	20 %	60 %	0 %	20 %	470223475
43499	NC_020566	CGT	2	6	2410940	2410945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223475
43500	NC_020566	ATC	2	6	2411006	2411011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223475

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