MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_020566	ACA	2	6	2328060	2328065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223411
42003	NC_020566	CCA	2	6	2328099	2328104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223411
42004	NC_020566	AAT	2	6	2328180	2328185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223411
42005	NC_020566	AAAG	2	8	2328209	2328216	75 %	0 %	25 %	0 %	470223411
42006	NC_020566	TCT	2	6	2328271	2328276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223411
42007	NC_020566	TAATGA	2	12	2328642	2328653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223412
42008	NC_020566	CA	3	6	2328729	2328734	50 %	0 %	0 %	50 %	470223412
42009	NC_020566	TAA	2	6	2328822	2328827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223412
42010	NC_020566	AC	3	6	2328829	2328834	50 %	0 %	0 %	50 %	470223412
42011	NC_020566	CTT	2	6	2328916	2328921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223412
42012	NC_020566	A	6	6	2328926	2328931	100 %	0 %	0 %	0 %	470223412
42013	NC_020566	CAA	2	6	2328944	2328949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223412
42014	NC_020566	ATG	2	6	2329043	2329048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223412
42015	NC_020566	TAT	2	6	2329101	2329106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223412
42016	NC_020566	ATT	2	6	2329131	2329136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223412
42017	NC_020566	TAC	2	6	2329185	2329190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223412
42018	NC_020566	ATA	2	6	2329199	2329204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223412
42019	NC_020566	TCA	2	6	2329286	2329291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223412
42020	NC_020566	AT	3	6	2329298	2329303	50 %	50 %	0 %	0 %	470223412
42021	NC_020566	TAC	2	6	2329340	2329345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223412
42022	NC_020566	TTG	2	6	2329426	2329431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223413
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42024	NC_020566	T	6	6	2329507	2329512	0 %	100 %	0 %	0 %	470223413
42025	NC_020566	TCTT	2	8	2329543	2329550	0 %	75 %	0 %	25 %	470223413
42026	NC_020566	ATA	2	6	2329567	2329572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223413
42027	NC_020566	A	6	6	2329606	2329611	100 %	0 %	0 %	0 %	470223413
42028	NC_020566	GTT	2	6	2329731	2329736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223413
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42031	NC_020566	TCTT	2	8	2329829	2329836	0 %	75 %	0 %	25 %	470223413
42032	NC_020566	TTTCAA	2	12	2329881	2329892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223413
42033	NC_020566	T	6	6	2330124	2330129	0 %	100 %	0 %	0 %	470223414
42034	NC_020566	TAAA	2	8	2330143	2330150	75 %	25 %	0 %	0 %	470223414
42035	NC_020566	TAA	2	6	2330174	2330179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223414
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42037	NC_020566	AGC	2	6	2330278	2330283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223414
42038	NC_020566	AT	3	6	2330290	2330295	50 %	50 %	0 %	0 %	470223414
42039	NC_020566	CAT	2	6	2330326	2330331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223414
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42046	NC_020566	TAG	2	6	2330588	2330593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223414
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42049	NC_020566	TAA	2	6	2330681	2330686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223414
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42053	NC_020566	TTG	2	6	2330881	2330886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223414
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42055	NC_020566	GCA	2	6	2331003	2331008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223414
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42057	NC_020566	AAT	2	6	2331071	2331076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223414
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42059	NC_020566	TAAAA	2	10	2331164	2331173	80 %	20 %	0 %	0 %	470223414
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42063	NC_020566	TAA	2	6	2331260	2331265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223415
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42101	NC_020566	T	6	6	2333571	2333576	0 %	100 %	0 %	0 %	470223417
42102	NC_020566	CAA	2	6	2333711	2333716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223418
42103	NC_020566	TCT	2	6	2333842	2333847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223418
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42105	NC_020566	TCA	2	6	2333929	2333934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223418
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42107	NC_020566	AATT	2	8	2333969	2333976	50 %	50 %	0 %	0 %	470223418
42108	NC_020566	TCCG	2	8	2334000	2334007	0 %	25 %	25 %	50 %	470223418
42109	NC_020566	TAC	2	6	2334135	2334140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223418
42110	NC_020566	TCA	2	6	2334145	2334150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223418
42111	NC_020566	AGAT	2	8	2334156	2334163	50 %	25 %	25 %	0 %	470223418
42112	NC_020566	CTA	2	6	2334166	2334171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223418
42113	NC_020566	GCA	2	6	2334241	2334246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223418
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42115	NC_020566	CTG	2	6	2334287	2334292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223418
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42117	NC_020566	AAT	2	6	2334393	2334398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223418
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42224	NC_020566	TCATGA	2	12	2340515	2340526	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223423
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42228	NC_020566	CTTG	2	8	2340801	2340808	0 %	50 %	25 %	25 %	470223423
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42231	NC_020566	TGC	2	6	2341258	2341263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223424
42232	NC_020566	ATT	2	6	2341376	2341381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223424
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42234	NC_020566	TTTAT	2	10	2341424	2341433	20 %	80 %	0 %	0 %	470223424
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42351	NC_020566	TGT	2	6	2347569	2347574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223429
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42451	NC_020566	ATTT	2	8	2353742	2353749	25 %	75 %	0 %	0 %	470223435
42452	NC_020566	AGA	2	6	2353764	2353769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223435
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42455	NC_020566	CA	3	6	2353819	2353824	50 %	0 %	0 %	50 %	470223435
42456	NC_020566	CGT	2	6	2353825	2353830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223435
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42459	NC_020566	CA	3	6	2353934	2353939	50 %	0 %	0 %	50 %	470223435
42460	NC_020566	TTA	2	6	2354477	2354482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223436
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42465	NC_020566	T	6	6	2354759	2354764	0 %	100 %	0 %	0 %	470223436
42466	NC_020566	TTA	2	6	2354832	2354837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223436
42467	NC_020566	CAC	2	6	2354935	2354940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223436
42468	NC_020566	GATA	2	8	2355055	2355062	50 %	25 %	25 %	0 %	470223436
42469	NC_020566	CAA	2	6	2355104	2355109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223436
42470	NC_020566	AT	3	6	2355156	2355161	50 %	50 %	0 %	0 %	470223436
42471	NC_020566	ATC	2	6	2355212	2355217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223436
42472	NC_020566	GCT	2	6	2355262	2355267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223436
42473	NC_020566	T	7	7	2355272	2355278	0 %	100 %	0 %	0 %	470223436
42474	NC_020566	A	7	7	2355301	2355307	100 %	0 %	0 %	0 %	470223436
42475	NC_020566	CAAATC	2	12	2355612	2355623	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470223437
42476	NC_020566	TGA	2	6	2355640	2355645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223437
42477	NC_020566	CAA	2	6	2355653	2355658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223437
42478	NC_020566	A	6	6	2355692	2355697	100 %	0 %	0 %	0 %	470223437
42479	NC_020566	ATT	2	6	2355716	2355721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223437
42480	NC_020566	TTG	2	6	2355729	2355734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223437
42481	NC_020566	AAC	2	6	2355771	2355776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223437
42482	NC_020566	ACA	2	6	2355895	2355900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223437
42483	NC_020566	ATCG	2	8	2355905	2355912	25 %	25 %	25 %	25 %	470223437
42484	NC_020566	AGT	2	6	2356006	2356011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223437
42485	NC_020566	TAT	2	6	2356063	2356068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223437
42486	NC_020566	A	7	7	2356102	2356108	100 %	0 %	0 %	0 %	470223437
42487	NC_020566	TAT	2	6	2356109	2356114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223437
42488	NC_020566	ACC	2	6	2356123	2356128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223437
42489	NC_020566	CAT	2	6	2356168	2356173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223437
42490	NC_020566	TTC	2	6	2356214	2356219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223437
42491	NC_020566	TATTT	2	10	2356484	2356493	20 %	80 %	0 %	0 %	470223438
42492	NC_020566	GCTT	2	8	2356513	2356520	0 %	50 %	25 %	25 %	470223438
42493	NC_020566	GCTTTT	2	12	2356538	2356549	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470223438
42494	NC_020566	TTA	2	6	2356550	2356555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223438
42495	NC_020566	GAT	2	6	2356585	2356590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223438
42496	NC_020566	CAT	2	6	2356617	2356622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223438
42497	NC_020566	TTTA	2	8	2356645	2356652	25 %	75 %	0 %	0 %	470223438
42498	NC_020566	TAA	2	6	2356660	2356665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223438
42499	NC_020566	CTT	2	6	2356680	2356685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223438
42500	NC_020566	ACC	2	6	2356687	2356692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223438

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