MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_020566	AT	3	6	2205657	2205662	50 %	50 %	0 %	0 %	470223320
40003	NC_020566	CAG	2	6	2205748	2205753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223320
40004	NC_020566	T	6	6	2205889	2205894	0 %	100 %	0 %	0 %	470223320
40005	NC_020566	CAA	2	6	2205895	2205900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223320
40006	NC_020566	TCA	2	6	2205903	2205908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223320
40007	NC_020566	ATTT	2	8	2205919	2205926	25 %	75 %	0 %	0 %	470223320
40008	NC_020566	TTG	2	6	2205953	2205958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223320
40009	NC_020566	CTCTT	2	10	2205968	2205977	0 %	60 %	0 %	40 %	470223320
40010	NC_020566	ATA	2	6	2206041	2206046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223320
40011	NC_020566	ACA	2	6	2206359	2206364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223321
40012	NC_020566	TC	3	6	2206388	2206393	0 %	50 %	0 %	50 %	470223321
40013	NC_020566	CGAA	2	8	2206456	2206463	50 %	0 %	25 %	25 %	470223321
40014	NC_020566	TTGAAC	2	12	2206480	2206491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223321
40015	NC_020566	ATT	2	6	2206492	2206497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223321
40016	NC_020566	ATTT	2	8	2206533	2206540	25 %	75 %	0 %	0 %	470223321
40017	NC_020566	T	8	8	2206538	2206545	0 %	100 %	0 %	0 %	470223321
40018	NC_020566	TA	3	6	2206548	2206553	50 %	50 %	0 %	0 %	470223321
40019	NC_020566	CAT	2	6	2206650	2206655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223321
40020	NC_020566	GCA	2	6	2206739	2206744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223321
40021	NC_020566	GAAG	2	8	2206779	2206786	50 %	0 %	50 %	0 %	470223321
40022	NC_020566	TAC	2	6	2206849	2206854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223321
40023	NC_020566	TAA	2	6	2206858	2206863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223321
40024	NC_020566	CCT	2	6	2206905	2206910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470223321
40025	NC_020566	AATT	2	8	2207066	2207073	50 %	50 %	0 %	0 %	470223322
40026	NC_020566	GAA	2	6	2207090	2207095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223322
40027	NC_020566	TTAA	2	8	2207126	2207133	50 %	50 %	0 %	0 %	470223322
40028	NC_020566	TTA	2	6	2207138	2207143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223322
40029	NC_020566	TTC	2	6	2207158	2207163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223322
40030	NC_020566	ATC	2	6	2207189	2207194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223322
40031	NC_020566	GCA	2	6	2207222	2207227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223322
40032	NC_020566	TAA	2	6	2207233	2207238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223322
40033	NC_020566	ACC	2	6	2207257	2207262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223322
40034	NC_020566	AAT	2	6	2207285	2207290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223322
40035	NC_020566	ATA	2	6	2207405	2207410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223322
40036	NC_020566	AAGTA	2	10	2207413	2207422	60 %	20 %	20 %	0 %	470223322
40037	NC_020566	TGT	2	6	2207453	2207458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223322
40038	NC_020566	GCT	2	6	2207486	2207491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223322
40039	NC_020566	GTAA	2	8	2207520	2207527	50 %	25 %	25 %	0 %	470223322
40040	NC_020566	AC	3	6	2207625	2207630	50 %	0 %	0 %	50 %	470223322
40041	NC_020566	AATA	2	8	2207635	2207642	75 %	25 %	0 %	0 %	470223322
40042	NC_020566	CCA	2	6	2207668	2207673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223322
40043	NC_020566	CAA	2	6	2207814	2207819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223322
40044	NC_020566	TAC	2	6	2207836	2207841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223322
40045	NC_020566	ATA	2	6	2207916	2207921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223322
40046	NC_020566	TAAA	2	8	2207973	2207980	75 %	25 %	0 %	0 %	470223322
40047	NC_020566	A	6	6	2207978	2207983	100 %	0 %	0 %	0 %	470223322
40048	NC_020566	GCA	2	6	2208026	2208031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223322
40049	NC_020566	CAC	2	6	2208072	2208077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223322
40050	NC_020566	TAA	2	6	2208106	2208111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223322
40051	NC_020566	CATG	2	8	2208200	2208207	25 %	25 %	25 %	25 %	470223322
40052	NC_020566	TGCAT	2	10	2208233	2208242	20 %	40 %	20 %	20 %	470223322
40053	NC_020566	CTT	2	6	2208399	2208404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223322
40054	NC_020566	TAATG	2	10	2208409	2208418	40 %	40 %	20 %	0 %	470223322
40055	NC_020566	AAAAT	2	10	2208432	2208441	80 %	20 %	0 %	0 %	470223322
40056	NC_020566	AC	3	6	2208444	2208449	50 %	0 %	0 %	50 %	470223322
40057	NC_020566	AAATA	2	10	2208454	2208463	80 %	20 %	0 %	0 %	470223322
40058	NC_020566	AATA	2	8	2208476	2208483	75 %	25 %	0 %	0 %	470223322
40059	NC_020566	GTA	2	6	2208512	2208517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223322
40060	NC_020566	CAA	2	6	2208567	2208572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223322
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40062	NC_020566	TA	3	6	2208939	2208944	50 %	50 %	0 %	0 %	470223323
40063	NC_020566	ATTG	2	8	2208966	2208973	25 %	50 %	25 %	0 %	470223323
40064	NC_020566	CAA	2	6	2208980	2208985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223323
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40089	NC_020566	CTT	2	6	2210296	2210301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223324
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40100	NC_020566	AT	3	6	2211036	2211041	50 %	50 %	0 %	0 %	470223324
40101	NC_020566	CAT	2	6	2211179	2211184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223324
40102	NC_020566	T	6	6	2211462	2211467	0 %	100 %	0 %	0 %	470223325
40103	NC_020566	AAG	2	6	2211472	2211477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223325
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40106	NC_020566	TACCTT	2	12	2211674	2211685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470223325
40107	NC_020566	ATTC	2	8	2211726	2211733	25 %	50 %	0 %	25 %	470223325
40108	NC_020566	TTCA	2	8	2211777	2211784	25 %	50 %	0 %	25 %	470223325
40109	NC_020566	TTGT	2	8	2211822	2211829	0 %	75 %	25 %	0 %	470223325
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40113	NC_020566	T	6	6	2212118	2212123	0 %	100 %	0 %	0 %	470223325
40114	NC_020566	TGCT	2	8	2212125	2212132	0 %	50 %	25 %	25 %	470223325
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40116	NC_020566	TGT	3	9	2212213	2212221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223325
40117	NC_020566	ACC	2	6	2212255	2212260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223325
40118	NC_020566	TAA	2	6	2212262	2212267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223325
40119	NC_020566	TAA	2	6	2212277	2212282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223325
40120	NC_020566	TAA	2	6	2212304	2212309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223325
40121	NC_020566	TTC	2	6	2212321	2212326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223325
40122	NC_020566	ATT	2	6	2212593	2212598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223326
40123	NC_020566	TGT	2	6	2212799	2212804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223326
40124	NC_020566	CAT	3	9	2212824	2212832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223326
40125	NC_020566	T	6	6	2212839	2212844	0 %	100 %	0 %	0 %	470223326
40126	NC_020566	AAC	2	6	2212921	2212926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223326
40127	NC_020566	ATC	2	6	2212961	2212966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223326
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40130	NC_020566	ATTTA	2	10	2213182	2213191	40 %	60 %	0 %	0 %	470223326
40131	NC_020566	AGATA	2	10	2213203	2213212	60 %	20 %	20 %	0 %	470223326
40132	NC_020566	TAT	2	6	2213277	2213282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223326
40133	NC_020566	GAT	2	6	2213284	2213289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223326
40134	NC_020566	TCT	2	6	2213291	2213296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223326
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40136	NC_020566	TTG	2	6	2213346	2213351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223326
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40140	NC_020566	CAT	2	6	2213428	2213433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223326
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40146	NC_020566	TGC	2	6	2213956	2213961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223326
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40152	NC_020566	ATCT	2	8	2214125	2214132	25 %	50 %	0 %	25 %	470223327
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40154	NC_020566	TTC	2	6	2214258	2214263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223327
40155	NC_020566	GCT	2	6	2214265	2214270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223327
40156	NC_020566	TTA	2	6	2214271	2214276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223327
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40160	NC_020566	T	6	6	2214405	2214410	0 %	100 %	0 %	0 %	470223327
40161	NC_020566	TGC	2	6	2214423	2214428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223327
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40193	NC_020566	TCA	2	6	2216127	2216132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223328
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40202	NC_020566	CAT	2	6	2216653	2216658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223328
40203	NC_020566	CAT	2	6	2216662	2216667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223328
40204	NC_020566	AGTAA	2	10	2216668	2216677	60 %	20 %	20 %	0 %	470223328
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40220	NC_020566	AACC	2	8	2217238	2217245	50 %	0 %	0 %	50 %	470223329
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40224	NC_020566	ATA	2	6	2217554	2217559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223329
40225	NC_020566	TAA	2	6	2217617	2217622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223329
40226	NC_020566	TAA	2	6	2217637	2217642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223329
40227	NC_020566	TGTT	2	8	2217692	2217699	0 %	75 %	25 %	0 %	470223329
40228	NC_020566	ATGC	2	8	2217754	2217761	25 %	25 %	25 %	25 %	470223329
40229	NC_020566	T	6	6	2217782	2217787	0 %	100 %	0 %	0 %	470223329
40230	NC_020566	ACC	2	6	2217881	2217886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223329
40231	NC_020566	TACT	2	8	2217895	2217902	25 %	50 %	0 %	25 %	470223329
40232	NC_020566	CAT	2	6	2217919	2217924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223329
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40234	NC_020566	GTTAAA	2	12	2217975	2217986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470223329
40235	NC_020566	TCA	2	6	2218044	2218049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223330
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40347	NC_020566	AGACTT	2	12	2224900	2224911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470223335
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