MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_020566	ATC	2	6	1752524	1752529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223013
32503	NC_020566	ATC	2	6	1752536	1752541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223013
32504	NC_020566	TA	3	6	1752543	1752548	50 %	50 %	0 %	0 %	470223013
32505	NC_020566	AT	3	6	1752562	1752567	50 %	50 %	0 %	0 %	470223013
32506	NC_020566	TCA	2	6	1752654	1752659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223013
32507	NC_020566	GAT	2	6	1752688	1752693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223013
32508	NC_020566	TAA	2	6	1752698	1752703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223013
32509	NC_020566	A	7	7	1752702	1752708	100 %	0 %	0 %	0 %	470223013
32510	NC_020566	ATT	2	6	1752732	1752737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223013
32511	NC_020566	ATA	2	6	1752743	1752748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223013
32512	NC_020566	TAT	2	6	1752758	1752763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223013
32513	NC_020566	ACTC	2	8	1752785	1752792	25 %	25 %	0 %	50 %	470223013
32514	NC_020566	CAT	2	6	1752839	1752844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223013
32515	NC_020566	TTTAT	2	10	1752855	1752864	20 %	80 %	0 %	0 %	470223013
32516	NC_020566	ATG	2	6	1752869	1752874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223013
32517	NC_020566	GGT	2	6	1752940	1752945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470223013
32518	NC_020566	ACA	2	6	1752957	1752962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223013
32519	NC_020566	A	6	6	1752992	1752997	100 %	0 %	0 %	0 %	470223013
32520	NC_020566	TAG	2	6	1753002	1753007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223013
32521	NC_020566	ATTAG	2	10	1753033	1753042	40 %	40 %	20 %	0 %	470223013
32522	NC_020566	TA	4	8	1753068	1753075	50 %	50 %	0 %	0 %	470223013
32523	NC_020566	GTTT	2	8	1753151	1753158	0 %	75 %	25 %	0 %	470223013
32524	NC_020566	CCA	2	6	1753165	1753170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223013
32525	NC_020566	TTG	2	6	1753210	1753215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223013
32526	NC_020566	ACA	2	6	1753296	1753301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223013
32527	NC_020566	ACG	2	6	1753355	1753360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223013
32528	NC_020566	A	6	6	1753398	1753403	100 %	0 %	0 %	0 %	470223013
32529	NC_020566	ATT	2	6	1753612	1753617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32530	NC_020566	GAAT	2	8	1753639	1753646	50 %	25 %	25 %	0 %	470223014
32531	NC_020566	TAA	2	6	1753661	1753666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223014
32532	NC_020566	CCA	2	6	1753679	1753684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223014
32533	NC_020566	GTT	2	6	1753698	1753703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223014
32534	NC_020566	GTTT	2	8	1753738	1753745	0 %	75 %	25 %	0 %	470223014
32535	NC_020566	GTT	2	6	1753827	1753832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223014
32536	NC_020566	T	7	7	1753831	1753837	0 %	100 %	0 %	0 %	470223014
32537	NC_020566	TAT	3	9	1753855	1753863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32538	NC_020566	TGC	2	6	1753889	1753894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223014
32539	NC_020566	ATT	2	6	1753907	1753912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32540	NC_020566	TTTATT	2	12	1753949	1753960	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470223014
32541	NC_020566	TAT	2	6	1754002	1754007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32542	NC_020566	ATT	2	6	1754075	1754080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32543	NC_020566	CAT	2	6	1754107	1754112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223014
32544	NC_020566	ATT	2	6	1754132	1754137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32545	NC_020566	TTG	2	6	1754206	1754211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223014
32546	NC_020566	TGC	2	6	1754215	1754220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223014
32547	NC_020566	ACCTT	2	10	1754247	1754256	20 %	40 %	0 %	40 %	470223014
32548	NC_020566	ATC	3	9	1754306	1754314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223014
32549	NC_020566	TA	3	6	1754420	1754425	50 %	50 %	0 %	0 %	470223014
32550	NC_020566	ATT	2	6	1754447	1754452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32551	NC_020566	AGT	2	6	1754471	1754476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223014
32552	NC_020566	TCA	2	6	1754530	1754535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223014
32553	NC_020566	CAA	2	6	1754581	1754586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223014
32554	NC_020566	TTC	2	6	1754612	1754617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223014
32555	NC_020566	ACA	2	6	1754628	1754633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223014
32556	NC_020566	CTT	2	6	1754641	1754646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223014
32557	NC_020566	CTG	2	6	1754698	1754703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223014
32558	NC_020566	ACTCT	2	10	1754722	1754731	20 %	40 %	0 %	40 %	470223014
32559	NC_020566	TAA	2	6	1754846	1754851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470223014
32560	NC_020566	GTC	2	6	1754885	1754890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223014
32561	NC_020566	TTA	2	6	1754895	1754900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32562	NC_020566	TC	3	6	1754988	1754993	0 %	50 %	0 %	50 %	470223014
32563	NC_020566	TTC	2	6	1755096	1755101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223014
32564	NC_020566	GAT	2	6	1755269	1755274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470223014
32565	NC_020566	CTG	2	6	1755310	1755315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223014
32566	NC_020566	ATT	2	6	1755482	1755487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223014
32567	NC_020566	TTG	2	6	1755492	1755497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223014
32568	NC_020566	GTTT	2	8	1755530	1755537	0 %	75 %	25 %	0 %	470223014
32569	NC_020566	TTGA	2	8	1755556	1755563	25 %	50 %	25 %	0 %	470223014
32570	NC_020566	TAC	2	6	1755572	1755577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223014
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32573	NC_020566	CAT	2	6	1755670	1755675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470223014
32574	NC_020566	GAA	2	6	1755687	1755692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470223014
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32576	NC_020566	TCT	2	6	1755747	1755752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223014
32577	NC_020566	CTTT	2	8	1755859	1755866	0 %	75 %	0 %	25 %	470223014
32578	NC_020566	CTG	2	6	1755883	1755888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223014
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32583	NC_020566	AATAG	2	10	1756247	1756256	60 %	20 %	20 %	0 %	470223014
32584	NC_020566	TGTT	2	8	1756278	1756285	0 %	75 %	25 %	0 %	470223014
32585	NC_020566	TGT	2	6	1756288	1756293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223014
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32588	NC_020566	TGC	2	6	1756669	1756674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470223015
32589	NC_020566	T	6	6	1756678	1756683	0 %	100 %	0 %	0 %	470223015
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32593	NC_020566	CATA	2	8	1756834	1756841	50 %	25 %	0 %	25 %	470223015
32594	NC_020566	TAATTC	2	12	1756966	1756977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470223015
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32598	NC_020566	ATT	2	6	1757191	1757196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223015
32599	NC_020566	TCT	2	6	1757246	1757251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223015
32600	NC_020566	ACC	2	6	1757272	1757277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223015
32601	NC_020566	CAA	3	9	1757304	1757312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223015
32602	NC_020566	CCA	2	6	1757480	1757485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223015
32603	NC_020566	ATTG	2	8	1757510	1757517	25 %	50 %	25 %	0 %	470223015
32604	NC_020566	TCAT	2	8	1757777	1757784	25 %	50 %	0 %	25 %	470223015
32605	NC_020566	ATT	2	6	1757875	1757880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223015
32606	NC_020566	ACC	3	9	1757953	1757961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223015
32607	NC_020566	CAC	2	6	1757967	1757972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470223015
32608	NC_020566	CT	3	6	1758004	1758009	0 %	50 %	0 %	50 %	470223015
32609	NC_020566	TTTA	2	8	1758028	1758035	25 %	75 %	0 %	0 %	470223015
32610	NC_020566	AAC	2	6	1758118	1758123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470223015
32611	NC_020566	TTA	2	6	1758152	1758157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223015
32612	NC_020566	GCA	2	6	1758221	1758226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470223015
32613	NC_020566	TTGA	2	8	1758249	1758256	25 %	50 %	25 %	0 %	470223015
32614	NC_020566	T	6	6	1758290	1758295	0 %	100 %	0 %	0 %	470223015
32615	NC_020566	ATT	2	6	1758727	1758732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470223016
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32617	NC_020566	CTT	2	6	1758868	1758873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470223016
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32731	NC_020566	TTG	2	6	1764963	1764968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470223020
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