MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_020566	CATC	2	8	1620410	1620417	25 %	25 %	0 %	50 %	470222917
30002	NC_020566	ATA	2	6	1620463	1620468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222917
30003	NC_020566	CTT	2	6	1620502	1620507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222917
30004	NC_020566	TAA	2	6	1620579	1620584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222917
30005	NC_020566	ATGG	2	8	1620602	1620609	25 %	25 %	50 %	0 %	470222917
30006	NC_020566	TCG	2	6	1620631	1620636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222917
30007	NC_020566	GTTA	2	8	1620720	1620727	25 %	50 %	25 %	0 %	470222917
30008	NC_020566	GTT	2	6	1620730	1620735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222917
30009	NC_020566	CCA	2	6	1620751	1620756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222917
30010	NC_020566	GTA	2	6	1620772	1620777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222917
30011	NC_020566	TCA	2	6	1620802	1620807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222918
30012	NC_020566	TGT	2	6	1620808	1620813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222918
30013	NC_020566	AT	3	6	1620818	1620823	50 %	50 %	0 %	0 %	470222918
30014	NC_020566	ATGG	2	8	1620856	1620863	25 %	25 %	50 %	0 %	470222918
30015	NC_020566	CGC	2	6	1620866	1620871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470222918
30016	NC_020566	CTT	2	6	1620886	1620891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222918
30017	NC_020566	CAT	2	6	1620892	1620897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222918
30018	NC_020566	CTA	2	6	1620907	1620912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222918
30019	NC_020566	GTT	2	6	1620979	1620984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222918
30020	NC_020566	T	6	6	1621049	1621054	0 %	100 %	0 %	0 %	470222918
30021	NC_020566	TTG	3	9	1621058	1621066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222918
30022	NC_020566	TTC	2	6	1621079	1621084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222918
30023	NC_020566	CAT	2	6	1621292	1621297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222918
30024	NC_020566	ATC	2	6	1621391	1621396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222918
30025	NC_020566	TAA	2	6	1621403	1621408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222918
30026	NC_020566	ACA	2	6	1621596	1621601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222918
30027	NC_020566	CTT	3	9	1621612	1621620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222918
30028	NC_020566	TTG	2	6	1621655	1621660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222918
30029	NC_020566	CTT	2	6	1621693	1621698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222918
30030	NC_020566	CAA	2	6	1621726	1621731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222918
30031	NC_020566	TCA	2	6	1621794	1621799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222918
30032	NC_020566	AAT	2	6	1621805	1621810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222918
30033	NC_020566	TTC	2	6	1621871	1621876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222918
30034	NC_020566	ACC	2	6	1621919	1621924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222918
30035	NC_020566	CAG	2	6	1621981	1621986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222918
30036	NC_020566	TAA	2	6	1621991	1621996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222918
30037	NC_020566	TTC	2	6	1622004	1622009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222918
30038	NC_020566	TCT	2	6	1622037	1622042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222918
30039	NC_020566	CCT	2	6	1622060	1622065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470222919
30040	NC_020566	TGTT	2	8	1622074	1622081	0 %	75 %	25 %	0 %	470222919
30041	NC_020566	TA	3	6	1622082	1622087	50 %	50 %	0 %	0 %	470222919
30042	NC_020566	GAT	2	6	1622109	1622114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222919
30043	NC_020566	TTC	2	6	1622125	1622130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222919
30044	NC_020566	ATCA	2	8	1622137	1622144	50 %	25 %	0 %	25 %	470222919
30045	NC_020566	AT	3	6	1622228	1622233	50 %	50 %	0 %	0 %	470222919
30046	NC_020566	A	6	6	1622284	1622289	100 %	0 %	0 %	0 %	470222919
30047	NC_020566	TTC	2	6	1622299	1622304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222919
30048	NC_020566	ATT	2	6	1622368	1622373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222919
30049	NC_020566	TCTT	2	8	1622377	1622384	0 %	75 %	0 %	25 %	470222919
30050	NC_020566	CAT	2	6	1622385	1622390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222919
30051	NC_020566	TAA	2	6	1622395	1622400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222919
30052	NC_020566	TCA	2	6	1622408	1622413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222919
30053	NC_020566	TAA	2	6	1622453	1622458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222919
30054	NC_020566	TAG	2	6	1622464	1622469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222919
30055	NC_020566	TAA	2	6	1622547	1622552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222919
30056	NC_020566	TAC	2	6	1622695	1622700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222919
30057	NC_020566	AAT	2	6	1622716	1622721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222919
30058	NC_020566	A	6	6	1622744	1622749	100 %	0 %	0 %	0 %	470222919
30059	NC_020566	TCT	2	6	1622759	1622764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222919
30060	NC_020566	AAT	2	6	1622789	1622794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222919
30061	NC_020566	T	6	6	1622815	1622820	0 %	100 %	0 %	0 %	470222919
30062	NC_020566	TGT	2	6	1622858	1622863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222919
30063	NC_020566	A	6	6	1623034	1623039	100 %	0 %	0 %	0 %	470222920
30064	NC_020566	TTA	2	6	1623062	1623067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222920
30065	NC_020566	GTG	2	6	1623197	1623202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222920
30066	NC_020566	TA	3	6	1623203	1623208	50 %	50 %	0 %	0 %	470222920
30067	NC_020566	A	6	6	1623213	1623218	100 %	0 %	0 %	0 %	470222920
30068	NC_020566	TGC	2	6	1623237	1623242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222920
30069	NC_020566	AATA	2	8	1623246	1623253	75 %	25 %	0 %	0 %	470222920
30070	NC_020566	TCATA	2	10	1623254	1623263	40 %	40 %	0 %	20 %	470222920
30071	NC_020566	AAT	2	6	1623309	1623314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222920
30072	NC_020566	ATC	2	6	1623367	1623372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222920
30073	NC_020566	TCA	2	6	1623406	1623411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222920
30074	NC_020566	ATT	2	6	1623477	1623482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222920
30075	NC_020566	AATT	2	8	1623489	1623496	50 %	50 %	0 %	0 %	470222920
30076	NC_020566	TTAA	2	8	1623499	1623506	50 %	50 %	0 %	0 %	470222920
30077	NC_020566	TGATGT	2	12	1623583	1623594	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470222920
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30079	NC_020566	TAA	2	6	1625015	1625020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222921
30080	NC_020566	GAC	2	6	1625078	1625083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222921
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30082	NC_020566	TTTG	2	8	1625114	1625121	0 %	75 %	25 %	0 %	470222921
30083	NC_020566	ATC	2	6	1625187	1625192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222921
30084	NC_020566	ATC	2	6	1625241	1625246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222921
30085	NC_020566	TTC	2	6	1625316	1625321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222921
30086	NC_020566	GTGAT	2	10	1625351	1625360	20 %	40 %	40 %	0 %	470222921
30087	NC_020566	TAA	2	6	1625388	1625393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222921
30088	NC_020566	TTC	2	6	1625400	1625405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222921
30089	NC_020566	ACT	2	6	1625431	1625436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222921
30090	NC_020566	ATC	2	6	1625439	1625444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222921
30091	NC_020566	TCT	2	6	1625494	1625499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222921
30092	NC_020566	GCT	2	6	1625512	1625517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222921
30093	NC_020566	ACG	2	6	1625538	1625543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222921
30094	NC_020566	ACC	2	6	1625616	1625621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222921
30095	NC_020566	TAC	2	6	1625652	1625657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222921
30096	NC_020566	AAT	2	6	1625686	1625691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222921
30097	NC_020566	TTC	2	6	1625763	1625768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222921
30098	NC_020566	TCA	2	6	1625797	1625802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222921
30099	NC_020566	GA	3	6	1625822	1625827	50 %	0 %	50 %	0 %	470222921
30100	NC_020566	CTA	2	6	1625852	1625857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222921
30101	NC_020566	TAA	2	6	1625910	1625915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222921
30102	NC_020566	CAG	2	6	1625969	1625974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222921
30103	NC_020566	TAC	2	6	1626009	1626014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222921
30104	NC_020566	CCA	2	6	1626112	1626117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222921
30105	NC_020566	CTT	2	6	1626185	1626190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222921
30106	NC_020566	TA	3	6	1626197	1626202	50 %	50 %	0 %	0 %	470222921
30107	NC_020566	GT	3	6	1626207	1626212	0 %	50 %	50 %	0 %	470222921
30108	NC_020566	GTT	2	6	1626217	1626222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222921
30109	NC_020566	CAA	2	6	1626245	1626250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222921
30110	NC_020566	ATTG	2	8	1626298	1626305	25 %	50 %	25 %	0 %	470222921
30111	NC_020566	GTT	3	9	1626338	1626346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222921
30112	NC_020566	TGT	2	6	1626363	1626368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222921
30113	NC_020566	TTC	2	6	1626402	1626407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222921
30114	NC_020566	CGTA	2	8	1626428	1626435	25 %	25 %	25 %	25 %	470222921
30115	NC_020566	TGT	2	6	1626474	1626479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222921
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30117	NC_020566	AATT	2	8	1626495	1626502	50 %	50 %	0 %	0 %	470222921
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30223	NC_020566	AC	3	6	1632740	1632745	50 %	0 %	0 %	50 %	470222924
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30227	NC_020566	AGT	2	6	1632995	1633000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222925
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30229	NC_020566	CTC	2	6	1633040	1633045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470222925
30230	NC_020566	CTG	2	6	1633090	1633095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222925
30231	NC_020566	GAC	2	6	1633110	1633115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222925
30232	NC_020566	CAA	2	6	1633136	1633141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222925
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30350	NC_020566	TCA	2	6	1640670	1640675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222929
30351	NC_020566	TTC	2	6	1640687	1640692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222929
30352	NC_020566	TGG	2	6	1640705	1640710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222929
30353	NC_020566	TTA	2	6	1640721	1640726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222929
30354	NC_020566	ACA	2	6	1640826	1640831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222929
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30357	NC_020566	GTT	2	6	1641024	1641029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222929
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30378	NC_020566	TTGG	2	8	1642015	1642022	0 %	50 %	50 %	0 %	470222930
30379	NC_020566	AT	3	6	1642050	1642055	50 %	50 %	0 %	0 %	470222930
30380	NC_020566	TTATAA	2	12	1642212	1642223	50 %	50 %	0 %	0 %	470222930
30381	NC_020566	AAAT	2	8	1642789	1642796	75 %	25 %	0 %	0 %	470222931
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30388	NC_020566	TCTTG	2	10	1642939	1642948	0 %	60 %	20 %	20 %	470222931
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30395	NC_020566	CTTCAA	2	12	1643393	1643404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222931
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30432	NC_020566	TCA	2	6	1645546	1645551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222932
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30448	NC_020566	CTG	2	6	1646239	1646244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222932
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30450	NC_020566	GTT	2	6	1646297	1646302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222932
30451	NC_020566	TTA	2	6	1646730	1646735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222933
30452	NC_020566	TCG	2	6	1646737	1646742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222933
30453	NC_020566	T	6	6	1646777	1646782	0 %	100 %	0 %	0 %	470222933
30454	NC_020566	TCAAT	2	10	1646801	1646810	40 %	40 %	0 %	20 %	470222933
30455	NC_020566	CTA	2	6	1646825	1646830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222933
30456	NC_020566	TGC	2	6	1646862	1646867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222933
30457	NC_020566	ACC	2	6	1646877	1646882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222933
30458	NC_020566	TAA	2	6	1646889	1646894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222933
30459	NC_020566	ATC	2	6	1646895	1646900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222933
30460	NC_020566	AC	3	6	1646909	1646914	50 %	0 %	0 %	50 %	470222933
30461	NC_020566	CTT	2	6	1647011	1647016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222933
30462	NC_020566	GTA	2	6	1647178	1647183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222933
30463	NC_020566	T	6	6	1647298	1647303	0 %	100 %	0 %	0 %	470222934
30464	NC_020566	ATA	2	6	1647323	1647328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222934
30465	NC_020566	GTT	2	6	1647350	1647355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222934
30466	NC_020566	AATC	2	8	1647380	1647387	50 %	25 %	0 %	25 %	470222934
30467	NC_020566	GTT	2	6	1647401	1647406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222934
30468	NC_020566	GATT	2	8	1647407	1647414	25 %	50 %	25 %	0 %	470222934
30469	NC_020566	TCT	2	6	1647427	1647432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222934
30470	NC_020566	TTA	2	6	1647551	1647556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222934
30471	NC_020566	TA	3	6	1647633	1647638	50 %	50 %	0 %	0 %	470222934
30472	NC_020566	GTT	2	6	1647656	1647661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222934
30473	NC_020566	TAC	2	6	1647708	1647713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222934
30474	NC_020566	TGT	2	6	1647724	1647729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222934
30475	NC_020566	TTC	2	6	1647735	1647740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222934
30476	NC_020566	ATA	3	9	1647744	1647752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222934
30477	NC_020566	TCA	2	6	1647805	1647810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222934
30478	NC_020566	TTCA	2	8	1647864	1647871	25 %	50 %	0 %	25 %	470222934
30479	NC_020566	AAT	2	6	1647885	1647890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222934
30480	NC_020566	TGAT	2	8	1647900	1647907	25 %	50 %	25 %	0 %	470222934
30481	NC_020566	CCATT	2	10	1647910	1647919	20 %	40 %	0 %	40 %	470222934
30482	NC_020566	AT	3	6	1647941	1647946	50 %	50 %	0 %	0 %	470222934
30483	NC_020566	GCG	2	6	1648003	1648008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470222934
30484	NC_020566	GAT	2	6	1648037	1648042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222934
30485	NC_020566	T	7	7	1648042	1648048	0 %	100 %	0 %	0 %	470222934
30486	NC_020566	GAA	2	6	1648069	1648074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222934
30487	NC_020566	ATC	2	6	1648083	1648088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222934
30488	NC_020566	TAA	2	6	1648179	1648184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222934
30489	NC_020566	GTT	2	6	1648216	1648221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222934
30490	NC_020566	ATTT	2	8	1648241	1648248	25 %	75 %	0 %	0 %	470222934
30491	NC_020566	ATG	2	6	1648305	1648310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222934
30492	NC_020566	GCC	2	6	1648311	1648316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470222934
30493	NC_020566	GCAAA	2	10	1648436	1648445	60 %	0 %	20 %	20 %	470222934
30494	NC_020566	CAA	2	6	1648466	1648471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222934
30495	NC_020566	AAAT	2	8	1648515	1648522	75 %	25 %	0 %	0 %	470222934
30496	NC_020566	CTT	2	6	1648559	1648564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222934
30497	NC_020566	TCTTT	2	10	1648585	1648594	0 %	80 %	0 %	20 %	470222934
30498	NC_020566	CTT	3	9	1648634	1648642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222934
30499	NC_020566	CGT	2	6	1648643	1648648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222934
30500	NC_020566	TCA	2	6	1648652	1648657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222934

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