MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_020566	TCA	2	6	1516368	1516373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222834
28002	NC_020566	TCT	2	6	1516374	1516379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222834
28003	NC_020566	CTT	2	6	1516447	1516452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222834
28004	NC_020566	T	6	6	1516451	1516456	0 %	100 %	0 %	0 %	470222834
28005	NC_020566	TTG	2	6	1516507	1516512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222834
28006	NC_020566	TCTACA	2	12	1516548	1516559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222834
28007	NC_020566	T	6	6	1516594	1516599	0 %	100 %	0 %	0 %	470222834
28008	NC_020566	A	6	6	1516698	1516703	100 %	0 %	0 %	0 %	470222835
28009	NC_020566	A	7	7	1516770	1516776	100 %	0 %	0 %	0 %	470222835
28010	NC_020566	CAG	2	6	1516829	1516834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222835
28011	NC_020566	GTT	2	6	1516864	1516869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222835
28012	NC_020566	CTT	2	6	1516879	1516884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222835
28013	NC_020566	CAA	2	6	1516891	1516896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222835
28014	NC_020566	GAT	2	6	1516900	1516905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222835
28015	NC_020566	ACA	2	6	1516954	1516959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222835
28016	NC_020566	TGA	2	6	1517061	1517066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222835
28017	NC_020566	TGA	2	6	1517094	1517099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222835
28018	NC_020566	AAG	2	6	1517108	1517113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222835
28019	NC_020566	TCT	2	6	1517137	1517142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222835
28020	NC_020566	ATT	3	9	1517162	1517170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222835
28021	NC_020566	TCAAT	2	10	1517202	1517211	40 %	40 %	0 %	20 %	470222835
28022	NC_020566	TTGA	2	8	1517212	1517219	25 %	50 %	25 %	0 %	470222835
28023	NC_020566	ATT	2	6	1517235	1517240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222835
28024	NC_020566	CAA	2	6	1517253	1517258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222835
28025	NC_020566	ATT	2	6	1517298	1517303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222835
28026	NC_020566	ATT	2	6	1517357	1517362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222835
28027	NC_020566	ATG	2	6	1517366	1517371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222835
28028	NC_020566	CAT	2	6	1517466	1517471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222835
28029	NC_020566	AAT	2	6	1518097	1518102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222836
28030	NC_020566	A	6	6	1518120	1518125	100 %	0 %	0 %	0 %	470222836
28031	NC_020566	ATG	2	6	1518156	1518161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222836
28032	NC_020566	TTGTT	2	10	1518189	1518198	0 %	80 %	20 %	0 %	470222836
28033	NC_020566	TCT	2	6	1518217	1518222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222836
28034	NC_020566	TGA	2	6	1518292	1518297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222836
28035	NC_020566	CATT	2	8	1518365	1518372	25 %	50 %	0 %	25 %	470222836
28036	NC_020566	GCA	2	6	1518409	1518414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222836
28037	NC_020566	TG	3	6	1518421	1518426	0 %	50 %	50 %	0 %	470222836
28038	NC_020566	CTTGA	2	10	1518437	1518446	20 %	40 %	20 %	20 %	470222836
28039	NC_020566	TA	3	6	1518494	1518499	50 %	50 %	0 %	0 %	470222836
28040	NC_020566	AATTA	2	10	1518513	1518522	60 %	40 %	0 %	0 %	470222836
28041	NC_020566	ATG	2	6	1518611	1518616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222836
28042	NC_020566	CAA	2	6	1518738	1518743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222836
28043	NC_020566	TAAACC	2	12	1518786	1518797	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470222836
28044	NC_020566	ACC	2	6	1518804	1518809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222836
28045	NC_020566	TGT	2	6	1518823	1518828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222836
28046	NC_020566	TCA	2	6	1518833	1518838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222836
28047	NC_020566	ATT	2	6	1519032	1519037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222837
28048	NC_020566	AT	4	8	1519063	1519070	50 %	50 %	0 %	0 %	470222837
28049	NC_020566	AAAT	2	8	1519076	1519083	75 %	25 %	0 %	0 %	470222837
28050	NC_020566	ATG	3	9	1519138	1519146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222837
28051	NC_020566	ATT	2	6	1519151	1519156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222837
28052	NC_020566	T	7	7	1519174	1519180	0 %	100 %	0 %	0 %	470222837
28053	NC_020566	GATT	2	8	1519277	1519284	25 %	50 %	25 %	0 %	470222837
28054	NC_020566	ACA	2	6	1519292	1519297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222837
28055	NC_020566	AAC	2	6	1519383	1519388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222837
28056	NC_020566	GAA	2	6	1519575	1519580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222837
28057	NC_020566	TTA	2	6	1519594	1519599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222837
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28059	NC_020566	A	6	6	1519652	1519657	100 %	0 %	0 %	0 %	470222837
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28062	NC_020566	GTA	2	6	1519759	1519764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222837
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28070	NC_020566	TTG	2	6	1520086	1520091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222838
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28072	NC_020566	CATCA	2	10	1520133	1520142	40 %	20 %	0 %	40 %	470222838
28073	NC_020566	TGAT	2	8	1520238	1520245	25 %	50 %	25 %	0 %	470222838
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28080	NC_020566	GAT	2	6	1520444	1520449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222838
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28082	NC_020566	CCAA	2	8	1520539	1520546	50 %	0 %	0 %	50 %	470222838
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28085	NC_020566	ATG	2	6	1520670	1520675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222838
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28088	NC_020566	A	6	6	1520799	1520804	100 %	0 %	0 %	0 %	470222838
28089	NC_020566	AT	3	6	1520815	1520820	50 %	50 %	0 %	0 %	470222838
28090	NC_020566	AAAC	2	8	1521140	1521147	75 %	0 %	0 %	25 %	470222839
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28105	NC_020566	AT	3	6	1521755	1521760	50 %	50 %	0 %	0 %	470222839
28106	NC_020566	TCT	2	6	1521780	1521785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222839
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28110	NC_020566	ATT	2	6	1521878	1521883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222839
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28114	NC_020566	AAG	2	6	1522201	1522206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222839
28115	NC_020566	TAT	2	6	1522405	1522410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222839
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28117	NC_020566	TTG	2	6	1522477	1522482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222839
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28235	NC_020566	TCTT	2	8	1529503	1529510	0 %	75 %	0 %	25 %	470222844
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28239	NC_020566	CTT	2	6	1529708	1529713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222844
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28343	NC_020566	T	6	6	1535320	1535325	0 %	100 %	0 %	0 %	470222848
28344	NC_020566	TCA	2	6	1535332	1535337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222848
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28466	NC_020566	T	7	7	1540346	1540352	0 %	100 %	0 %	0 %	470222851
28467	NC_020566	AATT	2	8	1540390	1540397	50 %	50 %	0 %	0 %	470222851
28468	NC_020566	TAA	2	6	1540413	1540418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222851
28469	NC_020566	CAC	2	6	1540440	1540445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222851
28470	NC_020566	TTC	2	6	1540483	1540488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222851
28471	NC_020566	AAT	2	6	1540489	1540494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222851
28472	NC_020566	TTGA	2	8	1540505	1540512	25 %	50 %	25 %	0 %	470222851
28473	NC_020566	AAAT	2	8	1541445	1541452	75 %	25 %	0 %	0 %	470222852
28474	NC_020566	TAA	2	6	1541463	1541468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222852
28475	NC_020566	TCA	2	6	1541488	1541493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
28476	NC_020566	CTG	2	6	1541513	1541518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222852
28477	NC_020566	TCT	2	6	1541542	1541547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222852
28478	NC_020566	TAA	2	6	1541562	1541567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222852
28479	NC_020566	ACGT	2	8	1541572	1541579	25 %	25 %	25 %	25 %	470222852
28480	NC_020566	TAT	2	6	1541585	1541590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222852
28481	NC_020566	T	6	6	1541610	1541615	0 %	100 %	0 %	0 %	470222852
28482	NC_020566	TCA	2	6	1541629	1541634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
28483	NC_020566	TAA	2	6	1541646	1541651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222852
28484	NC_020566	ATC	2	6	1541652	1541657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
28485	NC_020566	CAT	2	6	1541670	1541675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
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28487	NC_020566	CAT	2	6	1541717	1541722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
28488	NC_020566	CTG	2	6	1541738	1541743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222852
28489	NC_020566	TAA	2	6	1541763	1541768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222852
28490	NC_020566	TGTTTT	2	12	1541775	1541786	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470222852
28491	NC_020566	TTGG	2	8	1541816	1541823	0 %	50 %	50 %	0 %	470222852
28492	NC_020566	CCG	2	6	1541851	1541856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470222852
28493	NC_020566	TCA	2	6	1541914	1541919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
28494	NC_020566	ATC	2	6	1541928	1541933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
28495	NC_020566	TAA	2	6	1541961	1541966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222852
28496	NC_020566	TCG	2	6	1542027	1542032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222852
28497	NC_020566	ATC	2	6	1542036	1542041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
28498	NC_020566	TCA	2	6	1542061	1542066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222852
28499	NC_020566	TAA	2	6	1542156	1542161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222852
28500	NC_020566	ACA	2	6	1542203	1542208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222852

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