MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_020566	ATT	2	6	1042956	1042961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222517
19003	NC_020566	GCTA	2	8	1042980	1042987	25 %	25 %	25 %	25 %	470222517
19004	NC_020566	AGC	2	6	1043061	1043066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222517
19005	NC_020566	CAT	2	6	1043118	1043123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222517
19006	NC_020566	AAG	2	6	1043203	1043208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222517
19007	NC_020566	AGG	2	6	1043211	1043216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470222517
19008	NC_020566	GTT	2	6	1043264	1043269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222518
19009	NC_020566	ATT	2	6	1043286	1043291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222518
19010	NC_020566	GCATT	2	10	1043322	1043331	20 %	40 %	20 %	20 %	470222518
19011	NC_020566	TGA	2	6	1043345	1043350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222518
19012	NC_020566	TCT	2	6	1043422	1043427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222518
19013	NC_020566	TTTC	2	8	1043444	1043451	0 %	75 %	0 %	25 %	470222518
19014	NC_020566	TCAA	2	8	1043457	1043464	50 %	25 %	0 %	25 %	470222518
19015	NC_020566	GAT	2	6	1043576	1043581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222518
19016	NC_020566	ATT	2	6	1043600	1043605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222518
19017	NC_020566	GTA	2	6	1043724	1043729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222518
19018	NC_020566	ATT	2	6	1043739	1043744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222518
19019	NC_020566	TA	3	6	1043752	1043757	50 %	50 %	0 %	0 %	470222518
19020	NC_020566	TCA	2	6	1043760	1043765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222518
19021	NC_020566	A	6	6	1043787	1043792	100 %	0 %	0 %	0 %	470222518
19022	NC_020566	GAT	2	6	1043852	1043857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222518
19023	NC_020566	ACT	2	6	1043929	1043934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222518
19024	NC_020566	A	6	6	1043997	1044002	100 %	0 %	0 %	0 %	470222518
19025	NC_020566	ATG	2	6	1044036	1044041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222518
19026	NC_020566	TTA	2	6	1044171	1044176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222518
19027	NC_020566	ATT	3	9	1044191	1044199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222518
19028	NC_020566	ATT	2	6	1044203	1044208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222518
19029	NC_020566	GAAA	2	8	1044235	1044242	75 %	0 %	25 %	0 %	470222518
19030	NC_020566	GTA	2	6	1044424	1044429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222519
19031	NC_020566	TCGT	2	8	1044430	1044437	0 %	50 %	25 %	25 %	470222519
19032	NC_020566	ATG	2	6	1044478	1044483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222519
19033	NC_020566	TGAA	2	8	1044493	1044500	50 %	25 %	25 %	0 %	470222519
19034	NC_020566	GTT	2	6	1044525	1044530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222519
19035	NC_020566	ACA	2	6	1044537	1044542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222519
19036	NC_020566	TCAA	2	8	1044614	1044621	50 %	25 %	0 %	25 %	470222519
19037	NC_020566	GAC	2	6	1044629	1044634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222519
19038	NC_020566	A	7	7	1044659	1044665	100 %	0 %	0 %	0 %	470222519
19039	NC_020566	TAAA	2	8	1044706	1044713	75 %	25 %	0 %	0 %	470222519
19040	NC_020566	ATT	2	6	1044906	1044911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222519
19041	NC_020566	TCA	2	6	1044934	1044939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222519
19042	NC_020566	CCAAAT	2	12	1044945	1044956	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470222519
19043	NC_020566	A	7	7	1045021	1045027	100 %	0 %	0 %	0 %	470222519
19044	NC_020566	CGA	2	6	1045033	1045038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222519
19045	NC_020566	ATT	2	6	1045288	1045293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222520
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19047	NC_020566	AAAT	2	8	1045367	1045374	75 %	25 %	0 %	0 %	470222520
19048	NC_020566	AGA	2	6	1045397	1045402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222520
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19050	NC_020566	CAT	2	6	1045477	1045482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222520
19051	NC_020566	AATT	2	8	1045484	1045491	50 %	50 %	0 %	0 %	470222520
19052	NC_020566	AT	3	6	1045506	1045511	50 %	50 %	0 %	0 %	470222520
19053	NC_020566	AAT	2	6	1045526	1045531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222520
19054	NC_020566	ATTT	2	8	1045549	1045556	25 %	75 %	0 %	0 %	470222520
19055	NC_020566	AAC	3	9	1045574	1045582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222520
19056	NC_020566	CTT	2	6	1045594	1045599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222520
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19058	NC_020566	TTA	2	6	1045621	1045626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222520
19059	NC_020566	CAA	2	6	1045660	1045665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222520
19060	NC_020566	GT	3	6	1045709	1045714	0 %	50 %	50 %	0 %	470222520
19061	NC_020566	TCT	2	6	1045755	1045760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222520
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19064	NC_020566	TGA	2	6	1045991	1045996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222520
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19066	NC_020566	TGC	2	6	1046066	1046071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222520
19067	NC_020566	CGGTA	2	10	1046120	1046129	20 %	20 %	40 %	20 %	470222520
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19077	NC_020566	TTTAG	2	10	1046628	1046637	20 %	60 %	20 %	0 %	470222520
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19086	NC_020566	TAA	2	6	1046843	1046848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222520
19087	NC_020566	ATC	2	6	1046852	1046857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222520
19088	NC_020566	ATT	2	6	1046985	1046990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222520
19089	NC_020566	TAT	2	6	1047859	1047864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222521
19090	NC_020566	ATC	2	6	1047890	1047895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222521
19091	NC_020566	CTT	2	6	1047931	1047936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222521
19092	NC_020566	CAT	2	6	1047997	1048002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222521
19093	NC_020566	CT	3	6	1048121	1048126	0 %	50 %	0 %	50 %	470222521
19094	NC_020566	TTTCTT	2	12	1048141	1048152	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470222521
19095	NC_020566	GCT	2	6	1048179	1048184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222521
19096	NC_020566	ATG	2	6	1048215	1048220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222521
19097	NC_020566	AT	3	6	1048236	1048241	50 %	50 %	0 %	0 %	470222521
19098	NC_020566	CCTT	2	8	1048246	1048253	0 %	50 %	0 %	50 %	470222521
19099	NC_020566	GTT	2	6	1048289	1048294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222521
19100	NC_020566	AGT	2	6	1048625	1048630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222522
19101	NC_020566	CTTG	2	8	1048646	1048653	0 %	50 %	25 %	25 %	470222522
19102	NC_020566	TAC	2	6	1048661	1048666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222522
19103	NC_020566	A	6	6	1048671	1048676	100 %	0 %	0 %	0 %	470222522
19104	NC_020566	GAA	2	6	1048722	1048727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222522
19105	NC_020566	GAAAAA	2	12	1048769	1048780	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470222522
19106	NC_020566	CAG	2	6	1048810	1048815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222522
19107	NC_020566	TTAA	2	8	1048839	1048846	50 %	50 %	0 %	0 %	470222522
19108	NC_020566	GAT	2	6	1048854	1048859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222522
19109	NC_020566	AGA	3	9	1048880	1048888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222522
19110	NC_020566	AAG	2	6	1048896	1048901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222522
19111	NC_020566	ATG	2	6	1048951	1048956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222522
19112	NC_020566	AAG	2	6	1048966	1048971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222522
19113	NC_020566	GAT	2	6	1048983	1048988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222522
19114	NC_020566	ATT	2	6	1049063	1049068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222522
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19232	NC_020566	ATATG	2	10	1055165	1055174	40 %	40 %	20 %	0 %	470222527
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19349	NC_020566	GAT	2	6	1059816	1059821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222532
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