MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020566	CGT	2	6	878699	878704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222405
16002	NC_020566	TAT	2	6	878730	878735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222405
16003	NC_020566	A	6	6	878747	878752	100 %	0 %	0 %	0 %	470222405
16004	NC_020566	AATT	2	8	878869	878876	50 %	50 %	0 %	0 %	470222405
16005	NC_020566	TTG	2	6	878881	878886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222405
16006	NC_020566	ATTT	2	8	878987	878994	25 %	75 %	0 %	0 %	470222405
16007	NC_020566	TTC	2	6	878997	879002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222405
16008	NC_020566	ATCG	2	8	879024	879031	25 %	25 %	25 %	25 %	470222405
16009	NC_020566	A	6	6	879057	879062	100 %	0 %	0 %	0 %	470222405
16010	NC_020566	AT	3	6	879137	879142	50 %	50 %	0 %	0 %	470222405
16011	NC_020566	TTA	2	6	879154	879159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222405
16012	NC_020566	TA	3	6	879217	879222	50 %	50 %	0 %	0 %	470222405
16013	NC_020566	TATT	2	8	879240	879247	25 %	75 %	0 %	0 %	470222405
16014	NC_020566	TTAT	2	8	879290	879297	25 %	75 %	0 %	0 %	470222405
16015	NC_020566	ACC	2	6	879311	879316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222405
16016	NC_020566	A	6	6	879438	879443	100 %	0 %	0 %	0 %	470222405
16017	NC_020566	CTT	2	6	879491	879496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222405
16018	NC_020566	GCA	2	6	879555	879560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222405
16019	NC_020566	TAT	2	6	879579	879584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222405
16020	NC_020566	TCT	2	6	879685	879690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222405
16021	NC_020566	TA	3	6	879701	879706	50 %	50 %	0 %	0 %	470222405
16022	NC_020566	T	6	6	879972	879977	0 %	100 %	0 %	0 %	470222406
16023	NC_020566	TAT	2	6	880016	880021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222406
16024	NC_020566	AGA	2	6	880065	880070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222406
16025	NC_020566	TAT	2	6	880144	880149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222406
16026	NC_020566	TA	3	6	880152	880157	50 %	50 %	0 %	0 %	470222406
16027	NC_020566	CAA	2	6	880224	880229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222406
16028	NC_020566	A	6	6	880228	880233	100 %	0 %	0 %	0 %	470222406
16029	NC_020566	TTA	2	6	880240	880245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222406
16030	NC_020566	TGG	2	6	880251	880256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222406
16031	NC_020566	TTAA	2	8	880267	880274	50 %	50 %	0 %	0 %	470222406
16032	NC_020566	TAT	2	6	880329	880334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222406
16033	NC_020566	CAC	2	6	880337	880342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222406
16034	NC_020566	CAG	2	6	880420	880425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222406
16035	NC_020566	CGT	2	6	880450	880455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222406
16036	NC_020566	TTA	2	6	880468	880473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222406
16037	NC_020566	CTT	2	6	880658	880663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222406
16038	NC_020566	GATGA	2	10	880666	880675	40 %	20 %	40 %	0 %	470222406
16039	NC_020566	TAC	2	6	880707	880712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222406
16040	NC_020566	AATT	2	8	880748	880755	50 %	50 %	0 %	0 %	470222406
16041	NC_020566	TGC	2	6	880848	880853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222406
16042	NC_020566	GTATG	2	10	880894	880903	20 %	40 %	40 %	0 %	470222406
16043	NC_020566	CGT	2	6	880927	880932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222406
16044	NC_020566	A	7	7	880945	880951	100 %	0 %	0 %	0 %	470222406
16045	NC_020566	TGT	2	6	880962	880967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222406
16046	NC_020566	TGG	2	6	880974	880979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222406
16047	NC_020566	TTTTAA	2	12	882113	882124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222407
16048	NC_020566	TA	3	6	882138	882143	50 %	50 %	0 %	0 %	470222407
16049	NC_020566	GTC	2	6	882177	882182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222407
16050	NC_020566	AT	3	6	882203	882208	50 %	50 %	0 %	0 %	470222407
16051	NC_020566	TGA	2	6	882413	882418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222407
16052	NC_020566	AAC	2	6	882472	882477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222407
16053	NC_020566	CTG	2	6	882495	882500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222407
16054	NC_020566	TCA	2	6	882530	882535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222407
16055	NC_020566	TA	3	6	882540	882545	50 %	50 %	0 %	0 %	470222407
16056	NC_020566	TTA	2	6	882563	882568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222407
16057	NC_020566	AAC	2	6	882583	882588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222407
16058	NC_020566	ATT	2	6	882595	882600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222407
16059	NC_020566	TACT	2	8	882623	882630	25 %	50 %	0 %	25 %	470222407
16060	NC_020566	AT	3	6	882679	882684	50 %	50 %	0 %	0 %	470222407
16061	NC_020566	TTC	2	6	882838	882843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222407
16062	NC_020566	TCA	2	6	882896	882901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222407
16063	NC_020566	GAT	2	6	882987	882992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222407
16064	NC_020566	AGT	2	6	883117	883122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222407
16065	NC_020566	CCG	2	6	883157	883162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470222407
16066	NC_020566	A	6	6	884579	884584	100 %	0 %	0 %	0 %	470222408
16067	NC_020566	GTACTT	2	12	884585	884596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470222408
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16069	NC_020566	TTA	2	6	884673	884678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222408
16070	NC_020566	CAG	2	6	884724	884729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222408
16071	NC_020566	TAT	2	6	884751	884756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222408
16072	NC_020566	GAA	2	6	884776	884781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222408
16073	NC_020566	TAG	3	9	884877	884885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222408
16074	NC_020566	GCA	2	6	885008	885013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222408
16075	NC_020566	AAAAGA	2	12	885016	885027	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470222408
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16077	NC_020566	TGG	2	6	885052	885057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222408
16078	NC_020566	ACAG	2	8	885095	885102	50 %	0 %	25 %	25 %	470222408
16079	NC_020566	AGC	2	6	885166	885171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222408
16080	NC_020566	AGA	2	6	885196	885201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222408
16081	NC_020566	AGA	2	6	885229	885234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222408
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16085	NC_020566	CAAT	2	8	885432	885439	50 %	25 %	0 %	25 %	470222408
16086	NC_020566	ACA	2	6	885447	885452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222408
16087	NC_020566	GAA	2	6	885494	885499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222408
16088	NC_020566	TGCAA	2	10	885526	885535	40 %	20 %	20 %	20 %	470222408
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16091	NC_020566	GGTAT	2	10	885650	885659	20 %	40 %	40 %	0 %	470222408
16092	NC_020566	A	6	6	885680	885685	100 %	0 %	0 %	0 %	470222408
16093	NC_020566	GCA	2	6	885686	885691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222408
16094	NC_020566	A	6	6	885698	885703	100 %	0 %	0 %	0 %	470222408
16095	NC_020566	TGAT	2	8	885705	885712	25 %	50 %	25 %	0 %	470222408
16096	NC_020566	GGT	2	6	885734	885739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222408
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16101	NC_020566	AC	3	6	885922	885927	50 %	0 %	0 %	50 %	470222409
16102	NC_020566	AAAT	2	8	885937	885944	75 %	25 %	0 %	0 %	470222409
16103	NC_020566	ATT	2	6	885951	885956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222409
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16105	NC_020566	GTA	2	6	886054	886059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222409
16106	NC_020566	ATTT	2	8	886238	886245	25 %	75 %	0 %	0 %	470222409
16107	NC_020566	AAG	2	6	886335	886340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222409
16108	NC_020566	TTA	2	6	886366	886371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222409
16109	NC_020566	TCAT	2	8	886396	886403	25 %	50 %	0 %	25 %	470222409
16110	NC_020566	AGA	2	6	886490	886495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222409
16111	NC_020566	GTA	2	6	886597	886602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222409
16112	NC_020566	CAAAGA	2	12	886640	886651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470222409
16113	NC_020566	TGG	2	6	886697	886702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222409
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16115	NC_020566	TG	3	6	886750	886755	0 %	50 %	50 %	0 %	470222409
16116	NC_020566	TGCT	2	8	886825	886832	0 %	50 %	25 %	25 %	470222409
16117	NC_020566	GAT	2	6	886872	886877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222409
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16119	NC_020566	TAT	2	6	886959	886964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222409
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16121	NC_020566	GCT	2	6	887046	887051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222409
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16238	NC_020566	GCTTG	2	10	895466	895475	0 %	40 %	40 %	20 %	470222414
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16479	NC_020566	GAA	2	6	908153	908158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222423
16480	NC_020566	AGA	2	6	908176	908181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222423
16481	NC_020566	ACA	2	6	908237	908242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222423
16482	NC_020566	AATG	2	8	908282	908289	50 %	25 %	25 %	0 %	470222423
16483	NC_020566	ATT	2	6	908299	908304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222423
16484	NC_020566	TATC	2	8	908335	908342	25 %	50 %	0 %	25 %	470222423
16485	NC_020566	AAG	2	6	908394	908399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222423
16486	NC_020566	CGT	2	6	908402	908407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222423
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