MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020566	TATC	2	8	815320	815327	25 %	50 %	0 %	25 %	470222360
15002	NC_020566	GCA	2	6	815340	815345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222360
15003	NC_020566	TTA	2	6	815352	815357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222360
15004	NC_020566	ATG	2	6	815415	815420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222360
15005	NC_020566	TGG	2	6	815432	815437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222360
15006	NC_020566	GGT	2	6	815595	815600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222360
15007	NC_020566	AGC	2	6	815660	815665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222360
15008	NC_020566	GAA	2	6	815682	815687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222360
15009	NC_020566	CAT	2	6	815710	815715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222360
15010	NC_020566	ACT	2	6	815800	815805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222360
15011	NC_020566	TAG	2	6	815815	815820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222360
15012	NC_020566	AAC	2	6	815881	815886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222360
15013	NC_020566	TAG	2	6	815917	815922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222360
15014	NC_020566	AACA	2	8	815939	815946	75 %	0 %	0 %	25 %	470222360
15015	NC_020566	TTAA	2	8	815994	816001	50 %	50 %	0 %	0 %	470222360
15016	NC_020566	CAG	2	6	816070	816075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222360
15017	NC_020566	AGA	2	6	816101	816106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222360
15018	NC_020566	ACA	2	6	816108	816113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222360
15019	NC_020566	CAAT	2	8	816194	816201	50 %	25 %	0 %	25 %	470222360
15020	NC_020566	ATT	2	6	816221	816226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222360
15021	NC_020566	ATAA	2	8	816271	816278	75 %	25 %	0 %	0 %	470222360
15022	NC_020566	AT	3	6	816598	816603	50 %	50 %	0 %	0 %	470222361
15023	NC_020566	GAG	2	6	816604	816609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470222361
15024	NC_020566	ATT	2	6	816688	816693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222361
15025	NC_020566	ATT	2	6	816695	816700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222361
15026	NC_020566	GATT	2	8	816778	816785	25 %	50 %	25 %	0 %	470222361
15027	NC_020566	TAT	2	6	816814	816819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222361
15028	NC_020566	TCA	2	6	816846	816851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222361
15029	NC_020566	TG	3	6	816874	816879	0 %	50 %	50 %	0 %	470222361
15030	NC_020566	GTTT	2	8	816912	816919	0 %	75 %	25 %	0 %	470222361
15031	NC_020566	ATCA	2	8	816934	816941	50 %	25 %	0 %	25 %	470222361
15032	NC_020566	TTA	2	6	816999	817004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222361
15033	NC_020566	TTG	2	6	817035	817040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222361
15034	NC_020566	CTTT	2	8	817513	817520	0 %	75 %	0 %	25 %	470222362
15035	NC_020566	T	6	6	817518	817523	0 %	100 %	0 %	0 %	470222362
15036	NC_020566	GAA	2	6	817524	817529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222362
15037	NC_020566	TTA	3	9	817545	817553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222362
15038	NC_020566	A	7	7	817606	817612	100 %	0 %	0 %	0 %	470222362
15039	NC_020566	CAC	2	6	817630	817635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222362
15040	NC_020566	CAC	2	6	817654	817659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222362
15041	NC_020566	TTG	2	6	817726	817731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222362
15042	NC_020566	ATG	2	6	817741	817746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222362
15043	NC_020566	TTG	3	9	817750	817758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222362
15044	NC_020566	TG	3	6	817831	817836	0 %	50 %	50 %	0 %	470222362
15045	NC_020566	TGA	2	6	818015	818020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222362
15046	NC_020566	TGAT	2	8	818065	818072	25 %	50 %	25 %	0 %	470222362
15047	NC_020566	TA	4	8	818088	818095	50 %	50 %	0 %	0 %	470222362
15048	NC_020566	TGA	2	6	818111	818116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222362
15049	NC_020566	TTA	2	6	818152	818157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222362
15050	NC_020566	AAAGAA	2	12	818166	818177	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470222362
15051	NC_020566	CAAT	2	8	818277	818284	50 %	25 %	0 %	25 %	470222363
15052	NC_020566	AGA	2	6	818285	818290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222363
15053	NC_020566	ATT	2	6	818292	818297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222363
15054	NC_020566	TGTCAG	2	12	818320	818331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470222363
15055	NC_020566	AGT	2	6	818355	818360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222363
15056	NC_020566	TTAA	2	8	818379	818386	50 %	50 %	0 %	0 %	470222363
15057	NC_020566	ACAG	2	8	818433	818440	50 %	0 %	25 %	25 %	470222363
15058	NC_020566	A	7	7	818446	818452	100 %	0 %	0 %	0 %	470222363
15059	NC_020566	A	6	6	818505	818510	100 %	0 %	0 %	0 %	470222363
15060	NC_020566	AT	3	6	818551	818556	50 %	50 %	0 %	0 %	470222363
15061	NC_020566	CAA	2	6	818566	818571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222363
15062	NC_020566	GTT	2	6	818691	818696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222363
15063	NC_020566	GAT	2	6	818739	818744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222363
15064	NC_020566	TAT	2	6	818750	818755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222363
15065	NC_020566	TAT	2	6	818915	818920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222363
15066	NC_020566	TGA	2	6	818951	818956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222363
15067	NC_020566	AAG	2	6	818965	818970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222363
15068	NC_020566	TGA	2	6	819029	819034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222363
15069	NC_020566	TTA	2	6	819146	819151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222363
15070	NC_020566	AAG	2	6	819178	819183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222363
15071	NC_020566	TTG	2	6	819211	819216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222363
15072	NC_020566	GAT	2	6	819230	819235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222363
15073	NC_020566	GTT	2	6	819330	819335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222363
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15075	NC_020566	ATT	2	6	819402	819407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222363
15076	NC_020566	ACG	2	6	819506	819511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222363
15077	NC_020566	TTTA	2	8	819681	819688	25 %	75 %	0 %	0 %	470222363
15078	NC_020566	TTA	2	6	819739	819744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222363
15079	NC_020566	CAT	2	6	819755	819760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222363
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15082	NC_020566	CAA	2	6	819850	819855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222363
15083	NC_020566	CAA	2	6	819873	819878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222363
15084	NC_020566	ATG	3	9	819886	819894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222363
15085	NC_020566	AAG	2	6	820024	820029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222363
15086	NC_020566	CGT	2	6	820086	820091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222363
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15088	NC_020566	A	6	6	820125	820130	100 %	0 %	0 %	0 %	470222363
15089	NC_020566	AT	3	6	820136	820141	50 %	50 %	0 %	0 %	470222363
15090	NC_020566	TGA	2	6	820157	820162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222363
15091	NC_020566	TGA	2	6	820256	820261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222363
15092	NC_020566	TTA	2	6	820262	820267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222363
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15099	NC_020566	AGC	2	6	820637	820642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222363
15100	NC_020566	ACT	2	6	823137	823142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222364
15101	NC_020566	GTC	2	6	823146	823151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222364
15102	NC_020566	CTTTT	2	10	823161	823170	0 %	80 %	0 %	20 %	470222364
15103	NC_020566	TC	3	6	823175	823180	0 %	50 %	0 %	50 %	470222364
15104	NC_020566	GTTCTT	2	12	823181	823192	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470222364
15105	NC_020566	T	6	6	823191	823196	0 %	100 %	0 %	0 %	470222364
15106	NC_020566	CTT	2	6	823202	823207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222364
15107	NC_020566	TTCTTT	2	12	823212	823223	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470222364
15108	NC_020566	CTT	2	6	823232	823237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222364
15109	NC_020566	TCT	2	6	823315	823320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222364
15110	NC_020566	T	6	6	823398	823403	0 %	100 %	0 %	0 %	470222364
15111	NC_020566	T	6	6	823440	823445	0 %	100 %	0 %	0 %	470222364
15112	NC_020566	ATTT	2	8	823472	823479	25 %	75 %	0 %	0 %	470222364
15113	NC_020566	ATC	2	6	823491	823496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222364
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15116	NC_020566	AT	3	6	823585	823590	50 %	50 %	0 %	0 %	470222364
15117	NC_020566	TGA	2	6	823613	823618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222364
15118	NC_020566	TTTTA	2	10	823629	823638	20 %	80 %	0 %	0 %	470222364
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15120	NC_020566	TTC	2	6	823716	823721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222364
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15271	NC_020566	AAAG	2	8	831353	831360	75 %	0 %	25 %	0 %	470222369
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15357	NC_020566	TCGT	2	8	837432	837439	0 %	50 %	25 %	25 %	470222373
15358	NC_020566	TTG	2	6	839117	839122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222374
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15360	NC_020566	GCTCAA	2	12	839222	839233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470222374
15361	NC_020566	TTA	2	6	839245	839250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222374
15362	NC_020566	CAT	2	6	839283	839288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222374
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15364	NC_020566	AGTC	2	8	839394	839401	25 %	25 %	25 %	25 %	470222374
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15375	NC_020566	TAA	2	6	839821	839826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222375
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15388	NC_020566	GATA	2	8	840203	840210	50 %	25 %	25 %	0 %	470222375
15389	NC_020566	AAT	3	9	840224	840232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222375
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15392	NC_020566	AAT	2	6	840374	840379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222375
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15400	NC_020566	ATACA	2	10	840878	840887	60 %	20 %	0 %	20 %	470222376
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15463	NC_020566	TATG	2	8	846329	846336	25 %	50 %	25 %	0 %	470222380
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15468	NC_020566	AT	3	6	846516	846521	50 %	50 %	0 %	0 %	470222380
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