MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020566	TGT	3	9	652956	652964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222233
12003	NC_020566	TTA	2	6	652983	652988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
12004	NC_020566	AAG	2	6	653026	653031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222233
12005	NC_020566	TTA	2	6	653066	653071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
12006	NC_020566	ATTT	2	8	653090	653097	25 %	75 %	0 %	0 %	470222233
12007	NC_020566	TTA	2	6	653129	653134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
12008	NC_020566	TTA	2	6	653148	653153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
12009	NC_020566	TCGC	2	8	653184	653191	0 %	25 %	25 %	50 %	470222233
12010	NC_020566	GCT	2	6	653192	653197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222233
12011	NC_020566	A	6	6	653224	653229	100 %	0 %	0 %	0 %	470222233
12012	NC_020566	CA	4	8	653237	653244	50 %	0 %	0 %	50 %	470222233
12013	NC_020566	ATT	2	6	653254	653259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222233
12014	NC_020566	A	6	6	653306	653311	100 %	0 %	0 %	0 %	470222233
12015	NC_020566	TGT	2	6	653725	653730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222234
12016	NC_020566	TATT	2	8	653808	653815	25 %	75 %	0 %	0 %	470222234
12017	NC_020566	AATTT	2	10	653832	653841	40 %	60 %	0 %	0 %	470222234
12018	NC_020566	AT	3	6	653926	653931	50 %	50 %	0 %	0 %	470222234
12019	NC_020566	TGA	3	9	653940	653948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222234
12020	NC_020566	TAC	2	6	653968	653973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222234
12021	NC_020566	TTTA	2	8	653989	653996	25 %	75 %	0 %	0 %	470222234
12022	NC_020566	AGC	2	6	654028	654033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222234
12023	NC_020566	TGC	2	6	654043	654048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222234
12024	NC_020566	GCAA	2	8	654079	654086	50 %	0 %	25 %	25 %	470222234
12025	NC_020566	AAAGG	2	10	654092	654101	60 %	0 %	40 %	0 %	470222234
12026	NC_020566	ATT	2	6	654142	654147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12027	NC_020566	ATG	2	6	654150	654155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222234
12028	NC_020566	CTG	2	6	654156	654161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222234
12029	NC_020566	TAT	2	6	654163	654168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12030	NC_020566	TTG	2	6	654216	654221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222234
12031	NC_020566	GTT	2	6	654232	654237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222234
12032	NC_020566	TGG	2	6	654253	654258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222234
12033	NC_020566	TGGT	2	8	654264	654271	0 %	50 %	50 %	0 %	470222234
12034	NC_020566	ATT	2	6	654350	654355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12035	NC_020566	GCA	2	6	654419	654424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222234
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12037	NC_020566	T	6	6	654543	654548	0 %	100 %	0 %	0 %	470222234
12038	NC_020566	TTA	3	9	654576	654584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12039	NC_020566	TTG	3	9	654636	654644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222234
12040	NC_020566	TCTA	2	8	654654	654661	25 %	50 %	0 %	25 %	470222234
12041	NC_020566	TTTG	2	8	654668	654675	0 %	75 %	25 %	0 %	470222234
12042	NC_020566	TTATTT	2	12	654694	654705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470222234
12043	NC_020566	A	6	6	654723	654728	100 %	0 %	0 %	0 %	470222234
12044	NC_020566	TGA	2	6	654729	654734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222234
12045	NC_020566	ATG	3	9	654741	654749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222234
12046	NC_020566	ACC	2	6	654769	654774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222234
12047	NC_020566	T	6	6	654859	654864	0 %	100 %	0 %	0 %	470222234
12048	NC_020566	CAT	2	6	654872	654877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222234
12049	NC_020566	TTA	2	6	654899	654904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12050	NC_020566	TTA	3	9	654924	654932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12051	NC_020566	TAT	2	6	654951	654956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12052	NC_020566	ATT	2	6	654961	654966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12053	NC_020566	TA	3	6	655025	655030	50 %	50 %	0 %	0 %	470222234
12054	NC_020566	GAT	2	6	655148	655153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222234
12055	NC_020566	A	6	6	655182	655187	100 %	0 %	0 %	0 %	470222234
12056	NC_020566	TAG	2	6	655224	655229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222234
12057	NC_020566	TA	3	6	655293	655298	50 %	50 %	0 %	0 %	470222234
12058	NC_020566	CAT	2	6	655305	655310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222234
12059	NC_020566	TAA	2	6	655311	655316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222234
12060	NC_020566	GAA	2	6	655317	655322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222234
12061	NC_020566	TAT	2	6	655329	655334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12062	NC_020566	TTA	2	6	655346	655351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222234
12063	NC_020566	TAAA	2	8	655419	655426	75 %	25 %	0 %	0 %	470222234
12064	NC_020566	TAA	2	6	655429	655434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222234
12065	NC_020566	ACA	2	6	655475	655480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222234
12066	NC_020566	ATA	2	6	655485	655490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222234
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12068	NC_020566	ATTAA	2	10	655592	655601	60 %	40 %	0 %	0 %	470222234
12069	NC_020566	GA	3	6	655609	655614	50 %	0 %	50 %	0 %	470222234
12070	NC_020566	TTGA	2	8	655637	655644	25 %	50 %	25 %	0 %	470222234
12071	NC_020566	ATG	2	6	655698	655703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222234
12072	NC_020566	TAT	2	6	655835	655840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222235
12073	NC_020566	GGC	2	6	655843	655848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470222235
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12082	NC_020566	TAA	2	6	656121	656126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222235
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12089	NC_020566	TTG	2	6	656512	656517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222235
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12091	NC_020566	AATCG	2	10	656529	656538	40 %	20 %	20 %	20 %	470222235
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12094	NC_020566	TCT	2	6	656765	656770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222235
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12100	NC_020566	CAA	2	6	657014	657019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222235
12101	NC_020566	T	7	7	657067	657073	0 %	100 %	0 %	0 %	470222235
12102	NC_020566	TA	3	6	657103	657108	50 %	50 %	0 %	0 %	470222235
12103	NC_020566	GTTTGG	2	12	657180	657191	0 %	50 %	50 %	0 %	470222235
12104	NC_020566	TCA	2	6	658317	658322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222236
12105	NC_020566	GTA	2	6	658327	658332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222236
12106	NC_020566	CTT	2	6	658350	658355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222236
12107	NC_020566	TCTT	2	8	658391	658398	0 %	75 %	0 %	25 %	470222236
12108	NC_020566	TTC	2	6	658402	658407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222236
12109	NC_020566	CTA	2	6	658446	658451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222236
12110	NC_020566	GTT	2	6	658611	658616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222236
12111	NC_020566	ATT	2	6	658651	658656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222236
12112	NC_020566	T	6	6	658714	658719	0 %	100 %	0 %	0 %	470222236
12113	NC_020566	TGTT	2	8	658735	658742	0 %	75 %	25 %	0 %	470222236
12114	NC_020566	CTT	2	6	658815	658820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222236
12115	NC_020566	ATAG	2	8	658831	658838	50 %	25 %	25 %	0 %	470222236
12116	NC_020566	T	6	6	658867	658872	0 %	100 %	0 %	0 %	470222236
12117	NC_020566	AACC	2	8	658913	658920	50 %	0 %	0 %	50 %	470222236
12118	NC_020566	CGTCAG	2	12	658959	658970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470222236
12119	NC_020566	CCA	2	6	659057	659062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222236
12120	NC_020566	CATAT	2	10	659074	659083	40 %	40 %	0 %	20 %	470222236
12121	NC_020566	T	6	6	659200	659205	0 %	100 %	0 %	0 %	470222237
12122	NC_020566	TTTC	2	8	659223	659230	0 %	75 %	0 %	25 %	470222237
12123	NC_020566	TGA	2	6	659258	659263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222237
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12130	NC_020566	TAAT	2	8	659426	659433	50 %	50 %	0 %	0 %	470222237
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12227	NC_020566	TTTA	2	8	664621	664628	25 %	75 %	0 %	0 %	470222243
12228	NC_020566	ATCA	2	8	664662	664669	50 %	25 %	0 %	25 %	470222243
12229	NC_020566	AATT	2	8	664696	664703	50 %	50 %	0 %	0 %	470222243
12230	NC_020566	AAG	2	6	664754	664759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222243
12231	NC_020566	TTGG	2	8	664800	664807	0 %	50 %	50 %	0 %	470222243
12232	NC_020566	TTC	2	6	664821	664826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222243
12233	NC_020566	ATA	2	6	664908	664913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222243
12234	NC_020566	AT	3	6	664919	664924	50 %	50 %	0 %	0 %	470222243
12235	NC_020566	TTACTT	2	12	664956	664967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470222243
12236	NC_020566	ATGT	2	8	664979	664986	25 %	50 %	25 %	0 %	470222243
12237	NC_020566	ATT	2	6	665021	665026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222243
12238	NC_020566	AT	3	6	665028	665033	50 %	50 %	0 %	0 %	470222243
12239	NC_020566	GTTTT	2	10	665039	665048	0 %	80 %	20 %	0 %	470222243
12240	NC_020566	T	6	6	665045	665050	0 %	100 %	0 %	0 %	470222243
12241	NC_020566	TTA	2	6	665070	665075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222243
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12243	NC_020566	GCAA	2	8	665120	665127	50 %	0 %	25 %	25 %	470222243
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