MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020566	A	6	6	543179	543184	100 %	0 %	0 %	0 %	470222155
10002	NC_020566	GTA	2	6	543208	543213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222155
10003	NC_020566	TATT	2	8	543238	543245	25 %	75 %	0 %	0 %	470222155
10004	NC_020566	TAT	2	6	543284	543289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222155
10005	NC_020566	CAA	2	6	543319	543324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222155
10006	NC_020566	TAA	2	6	543331	543336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222155
10007	NC_020566	TCATT	2	10	543401	543410	20 %	60 %	0 %	20 %	470222155
10008	NC_020566	A	6	6	543462	543467	100 %	0 %	0 %	0 %	470222155
10009	NC_020566	AATGTT	2	12	543476	543487	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470222155
10010	NC_020566	ATT	2	6	543564	543569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222155
10011	NC_020566	TTA	2	6	543637	543642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222155
10012	NC_020566	TTG	2	6	543655	543660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222155
10013	NC_020566	AGCT	2	8	543799	543806	25 %	25 %	25 %	25 %	470222155
10014	NC_020566	TAT	2	6	543824	543829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222155
10015	NC_020566	TAAA	2	8	543847	543854	75 %	25 %	0 %	0 %	470222155
10016	NC_020566	GAT	2	6	543996	544001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222155
10017	NC_020566	GTT	2	6	544014	544019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222155
10018	NC_020566	AGT	2	6	544061	544066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222155
10019	NC_020566	GAA	2	6	544090	544095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222155
10020	NC_020566	A	7	7	544107	544113	100 %	0 %	0 %	0 %	470222155
10021	NC_020566	A	7	7	544687	544693	100 %	0 %	0 %	0 %	470222156
10022	NC_020566	ATT	2	6	544767	544772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222156
10023	NC_020566	A	6	6	544834	544839	100 %	0 %	0 %	0 %	470222156
10024	NC_020566	AGA	2	6	544848	544853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10025	NC_020566	ACCA	2	8	544967	544974	50 %	0 %	0 %	50 %	470222156
10026	NC_020566	AGA	2	6	544995	545000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10027	NC_020566	AGA	3	9	545025	545033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10028	NC_020566	GTG	2	6	545066	545071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222156
10029	NC_020566	TGG	2	6	545085	545090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222156
10030	NC_020566	GAA	2	6	545110	545115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10031	NC_020566	CAA	2	6	545122	545127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222156
10032	NC_020566	TGA	2	6	545193	545198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222156
10033	NC_020566	A	7	7	545256	545262	100 %	0 %	0 %	0 %	470222156
10034	NC_020566	GAT	2	6	545299	545304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222156
10035	NC_020566	GTG	2	6	545333	545338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222156
10036	NC_020566	GAA	2	6	545434	545439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10037	NC_020566	TTA	2	6	545539	545544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222156
10038	NC_020566	GAA	3	9	545563	545571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10039	NC_020566	AGA	2	6	545583	545588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10040	NC_020566	TGA	2	6	545604	545609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222156
10041	NC_020566	TAA	2	6	545664	545669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222156
10042	NC_020566	AT	3	6	545673	545678	50 %	50 %	0 %	0 %	470222156
10043	NC_020566	TTAA	2	8	545725	545732	50 %	50 %	0 %	0 %	470222156
10044	NC_020566	AGA	2	6	545760	545765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10045	NC_020566	AATT	2	8	545786	545793	50 %	50 %	0 %	0 %	470222156
10046	NC_020566	GAA	3	9	545878	545886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10047	NC_020566	CAA	2	6	545887	545892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222156
10048	NC_020566	AAG	2	6	545993	545998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222156
10049	NC_020566	GCAA	2	8	546023	546030	50 %	0 %	25 %	25 %	470222156
10050	NC_020566	TTAT	2	8	546031	546038	25 %	75 %	0 %	0 %	470222156
10051	NC_020566	GAG	2	6	546561	546566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470222157
10052	NC_020566	GA	3	6	546590	546595	50 %	0 %	50 %	0 %	470222157
10053	NC_020566	A	8	8	546715	546722	100 %	0 %	0 %	0 %	470222157
10054	NC_020566	GCA	2	6	546729	546734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222157
10055	NC_020566	CG	3	6	546735	546740	0 %	0 %	50 %	50 %	470222157
10056	NC_020566	ATCC	2	8	546777	546784	25 %	25 %	0 %	50 %	470222157
10057	NC_020566	TGG	2	6	546893	546898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222157
10058	NC_020566	GAAA	2	8	546905	546912	75 %	0 %	25 %	0 %	470222157
10059	NC_020566	AGC	2	6	546953	546958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222157
10060	NC_020566	AAAT	2	8	546985	546992	75 %	25 %	0 %	0 %	470222157
10061	NC_020566	GTT	2	6	547020	547025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222157
10062	NC_020566	GTT	2	6	547053	547058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470222157
10063	NC_020566	ATC	2	6	547114	547119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222157
10064	NC_020566	GA	3	6	547189	547194	50 %	0 %	50 %	0 %	470222157
10065	NC_020566	GAT	2	6	547200	547205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222157
10066	NC_020566	TA	3	6	547211	547216	50 %	50 %	0 %	0 %	470222157
10067	NC_020566	AAG	2	6	547235	547240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222158
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10069	NC_020566	TA	3	6	547295	547300	50 %	50 %	0 %	0 %	470222158
10070	NC_020566	AATT	2	8	547332	547339	50 %	50 %	0 %	0 %	470222158
10071	NC_020566	GAT	2	6	547411	547416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222158
10072	NC_020566	ATTA	2	8	547419	547426	50 %	50 %	0 %	0 %	470222158
10073	NC_020566	AT	3	6	547473	547478	50 %	50 %	0 %	0 %	470222158
10074	NC_020566	GCT	2	6	547480	547485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222158
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10076	NC_020566	TTA	2	6	547571	547576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222158
10077	NC_020566	TGG	2	6	547583	547588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222158
10078	NC_020566	GTG	2	6	547610	547615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222158
10079	NC_020566	TCA	2	6	547665	547670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222158
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10082	NC_020566	GGT	2	6	547873	547878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470222158
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10085	NC_020566	A	6	6	547991	547996	100 %	0 %	0 %	0 %	470222158
10086	NC_020566	ATT	2	6	548035	548040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222158
10087	NC_020566	AAG	2	6	548042	548047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222158
10088	NC_020566	AATT	2	8	548168	548175	50 %	50 %	0 %	0 %	470222158
10089	NC_020566	GC	3	6	548181	548186	0 %	0 %	50 %	50 %	470222158
10090	NC_020566	CTA	2	6	548195	548200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222158
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10092	NC_020566	ATGA	2	8	548266	548273	50 %	25 %	25 %	0 %	470222158
10093	NC_020566	AATA	2	8	548329	548336	75 %	25 %	0 %	0 %	470222158
10094	NC_020566	ACA	2	6	548350	548355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470222158
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10100	NC_020566	AAG	2	6	549088	549093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222159
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10103	NC_020566	A	6	6	549142	549147	100 %	0 %	0 %	0 %	470222159
10104	NC_020566	T	6	6	549182	549187	0 %	100 %	0 %	0 %	470222159
10105	NC_020566	CAC	2	6	549196	549201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470222159
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10109	NC_020566	CGT	2	6	549390	549395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222159
10110	NC_020566	TAA	2	6	549533	549538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470222159
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10112	NC_020566	ATG	2	6	549705	549710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222159
10113	NC_020566	ATG	2	6	549733	549738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222159
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10115	NC_020566	ATT	2	6	549899	549904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222160
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10117	NC_020566	ATC	2	6	550117	550122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222160
10118	NC_020566	GA	3	6	550135	550140	50 %	0 %	50 %	0 %	470222160
10119	NC_020566	GAT	2	6	550178	550183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222160
10120	NC_020566	TCT	2	6	550220	550225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470222160
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10122	NC_020566	CAT	2	6	550262	550267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222160
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10131	NC_020566	ATAAA	2	10	550895	550904	80 %	20 %	0 %	0 %	470222161
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10135	NC_020566	AGT	2	6	551560	551565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222162
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10243	NC_020566	CGA	2	6	558330	558335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222166
10244	NC_020566	TA	3	6	558371	558376	50 %	50 %	0 %	0 %	470222166
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10479	NC_020566	GCT	2	6	569967	569972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470222172
10480	NC_020566	ATG	2	6	569995	570000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222172
10481	NC_020566	ATT	2	6	570033	570038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222172
10482	NC_020566	GATG	2	8	570039	570046	25 %	25 %	50 %	0 %	470222172
10483	NC_020566	ATT	2	6	570066	570071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222172
10484	NC_020566	GAT	2	6	570093	570098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222172
10485	NC_020566	AAG	2	6	570115	570120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222172
10486	NC_020566	CAATA	2	10	570135	570144	60 %	20 %	0 %	20 %	470222172
10487	NC_020566	ATGG	2	8	570177	570184	25 %	25 %	50 %	0 %	470222172
10488	NC_020566	AGA	2	6	570221	570226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222172
10489	NC_020566	TTA	2	6	570234	570239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222172
10490	NC_020566	GAC	2	6	570249	570254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470222172
10491	NC_020566	GGC	2	6	570366	570371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470222172
10492	NC_020566	CAT	2	6	570439	570444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470222172
10493	NC_020566	A	6	6	570542	570547	100 %	0 %	0 %	0 %	470222172
10494	NC_020566	ATT	2	6	570606	570611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470222172
10495	NC_020566	TGA	2	6	570614	570619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222172
10496	NC_020566	A	6	6	570619	570624	100 %	0 %	0 %	0 %	470222172
10497	NC_020566	TAAG	2	8	571101	571108	50 %	25 %	25 %	0 %	470222173
10498	NC_020566	CAAC	2	8	571109	571116	50 %	0 %	0 %	50 %	470222173
10499	NC_020566	AGA	2	6	571129	571134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470222173
10500	NC_020566	TGA	2	6	571245	571250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470222173

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