MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_020564	CTT	2	6	2608443	2608448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219800
47002	NC_020564	TCA	2	6	2608458	2608463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219800
47003	NC_020564	GCA	2	6	2608556	2608561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219800
47004	NC_020564	CAC	3	9	2608644	2608652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219800
47005	NC_020564	TTCA	2	8	2608705	2608712	25 %	50 %	0 %	25 %	470219800
47006	NC_020564	ATTA	2	8	2608939	2608946	50 %	50 %	0 %	0 %	470219801
47007	NC_020564	ACTA	2	8	2608987	2608994	50 %	25 %	0 %	25 %	470219801
47008	NC_020564	GTC	2	6	2609039	2609044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219801
47009	NC_020564	TACG	2	8	2609098	2609105	25 %	25 %	25 %	25 %	470219801
47010	NC_020564	AGC	2	6	2609122	2609127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219801
47011	NC_020564	GGT	2	6	2609195	2609200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219801
47012	NC_020564	ATT	2	6	2609248	2609253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219801
47013	NC_020564	AGA	2	6	2609254	2609259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219801
47014	NC_020564	AAT	2	6	2609288	2609293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219801
47015	NC_020564	TA	3	6	2609405	2609410	50 %	50 %	0 %	0 %	470219801
47016	NC_020564	ACG	2	6	2609433	2609438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219801
47017	NC_020564	ACA	2	6	2609534	2609539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219801
47018	NC_020564	A	6	6	2609543	2609548	100 %	0 %	0 %	0 %	470219801
47019	NC_020564	ATC	2	6	2609651	2609656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219801
47020	NC_020564	TAA	2	6	2609698	2609703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219801
47021	NC_020564	GAA	2	6	2609708	2609713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219801
47022	NC_020564	GTC	2	6	2609727	2609732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219801
47023	NC_020564	ATT	2	6	2609734	2609739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219801
47024	NC_020564	CAAA	2	8	2609777	2609784	75 %	0 %	0 %	25 %	470219801
47025	NC_020564	GGC	2	6	2609810	2609815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470219801
47026	NC_020564	ATG	2	6	2609843	2609848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219801
47027	NC_020564	TCA	2	6	2609879	2609884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219801
47028	NC_020564	ATC	2	6	2609949	2609954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219801
47029	NC_020564	CTT	2	6	2610643	2610648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219802
47030	NC_020564	TTG	2	6	2610674	2610679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219802
47031	NC_020564	T	6	6	2610805	2610810	0 %	100 %	0 %	0 %	470219802
47032	NC_020564	AAT	2	6	2610880	2610885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219802
47033	NC_020564	GCT	2	6	2610903	2610908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219802
47034	NC_020564	GCC	2	6	2610956	2610961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470219802
47035	NC_020564	TCA	2	6	2610969	2610974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219802
47036	NC_020564	CGT	2	6	2611098	2611103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219802
47037	NC_020564	AAAT	2	8	2611140	2611147	75 %	25 %	0 %	0 %	470219802
47038	NC_020564	TAC	2	6	2611189	2611194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219802
47039	NC_020564	CAA	2	6	2611203	2611208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219802
47040	NC_020564	TTC	2	6	2611263	2611268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219802
47041	NC_020564	TAAT	2	8	2611281	2611288	50 %	50 %	0 %	0 %	470219802
47042	NC_020564	T	6	6	2611288	2611293	0 %	100 %	0 %	0 %	470219802
47043	NC_020564	ATA	2	6	2611311	2611316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219802
47044	NC_020564	TTATT	2	10	2612212	2612221	20 %	80 %	0 %	0 %	470219803
47045	NC_020564	TTGA	2	8	2612250	2612257	25 %	50 %	25 %	0 %	470219803
47046	NC_020564	ATT	2	6	2612275	2612280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219803
47047	NC_020564	TCT	2	6	2612308	2612313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219803
47048	NC_020564	TCATTT	2	12	2612392	2612403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470219803
47049	NC_020564	ATGT	2	8	2612538	2612545	25 %	50 %	25 %	0 %	470219803
47050	NC_020564	TAACT	2	10	2612556	2612565	40 %	40 %	0 %	20 %	470219803
47051	NC_020564	TCA	2	6	2612581	2612586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219803
47052	NC_020564	TGAA	2	8	2612587	2612594	50 %	25 %	25 %	0 %	470219803
47053	NC_020564	TCC	2	6	2612605	2612610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219803
47054	NC_020564	CTG	2	6	2612613	2612618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219803
47055	NC_020564	ATA	2	6	2612652	2612657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219803
47056	NC_020564	TAC	2	6	2612672	2612677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219803
47057	NC_020564	TTG	2	6	2612703	2612708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219803
47058	NC_020564	TCT	2	6	2612719	2612724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219803
47059	NC_020564	CA	3	6	2612888	2612893	50 %	0 %	0 %	50 %	470219804
47060	NC_020564	ACAA	2	8	2612920	2612927	75 %	0 %	0 %	25 %	470219804
47061	NC_020564	TA	3	6	2613107	2613112	50 %	50 %	0 %	0 %	470219804
47062	NC_020564	ATA	2	6	2613182	2613187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219804
47063	NC_020564	GAA	2	6	2613259	2613264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219804
47064	NC_020564	TGT	2	6	2613300	2613305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219804
47065	NC_020564	ATT	2	6	2613380	2613385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219804
47066	NC_020564	GCA	2	6	2613403	2613408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219804
47067	NC_020564	TGG	2	6	2613472	2613477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219804
47068	NC_020564	CAT	2	6	2613482	2613487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219804
47069	NC_020564	CCA	2	6	2613493	2613498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219804
47070	NC_020564	CAA	2	6	2613658	2613663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219804
47071	NC_020564	GAT	2	6	2613679	2613684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219804
47072	NC_020564	CTA	2	6	2613730	2613735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219804
47073	NC_020564	AGA	2	6	2613807	2613812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219804
47074	NC_020564	TAC	2	6	2613853	2613858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219804
47075	NC_020564	AGA	2	6	2613909	2613914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219804
47076	NC_020564	AT	3	6	2613946	2613951	50 %	50 %	0 %	0 %	470219804
47077	NC_020564	TCAGCG	2	12	2613988	2613999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470219804
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47082	NC_020564	TCG	2	6	2614245	2614250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219804
47083	NC_020564	TGGT	2	8	2614308	2614315	0 %	50 %	50 %	0 %	470219804
47084	NC_020564	GTT	2	6	2614477	2614482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219804
47085	NC_020564	GAA	2	6	2614546	2614551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219804
47086	NC_020564	ATAA	2	8	2614555	2614562	75 %	25 %	0 %	0 %	470219804
47087	NC_020564	TGG	2	6	2614584	2614589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219804
47088	NC_020564	TAT	2	6	2614725	2614730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219805
47089	NC_020564	TAC	2	6	2614769	2614774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219805
47090	NC_020564	AATA	2	8	2614790	2614797	75 %	25 %	0 %	0 %	470219805
47091	NC_020564	ATT	2	6	2614803	2614808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219805
47092	NC_020564	GTT	2	6	2614823	2614828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219805
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47097	NC_020564	TG	3	6	2614931	2614936	0 %	50 %	50 %	0 %	470219805
47098	NC_020564	TAT	2	6	2614972	2614977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219805
47099	NC_020564	TAA	2	6	2615008	2615013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219805
47100	NC_020564	ATT	2	6	2615108	2615113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219805
47101	NC_020564	ATC	2	6	2615126	2615131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219805
47102	NC_020564	T	6	6	2615186	2615191	0 %	100 %	0 %	0 %	470219805
47103	NC_020564	TTCA	2	8	2615264	2615271	25 %	50 %	0 %	25 %	470219805
47104	NC_020564	CAA	2	6	2615335	2615340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219805
47105	NC_020564	T	6	6	2615354	2615359	0 %	100 %	0 %	0 %	470219805
47106	NC_020564	TAC	2	6	2615384	2615389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219806
47107	NC_020564	CATC	2	8	2615417	2615424	25 %	25 %	0 %	50 %	470219806
47108	NC_020564	T	7	7	2615427	2615433	0 %	100 %	0 %	0 %	470219806
47109	NC_020564	CGT	2	6	2615434	2615439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219806
47110	NC_020564	T	6	6	2615504	2615509	0 %	100 %	0 %	0 %	470219806
47111	NC_020564	AATT	2	8	2615510	2615517	50 %	50 %	0 %	0 %	470219806
47112	NC_020564	TAT	2	6	2615518	2615523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219806
47113	NC_020564	T	6	6	2615529	2615534	0 %	100 %	0 %	0 %	470219806
47114	NC_020564	AT	4	8	2615555	2615562	50 %	50 %	0 %	0 %	470219806
47115	NC_020564	ACTT	2	8	2615563	2615570	25 %	50 %	0 %	25 %	470219806
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47117	NC_020564	TTA	2	6	2615589	2615594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219806
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47467	NC_020564	T	6	6	2637995	2638000	0 %	100 %	0 %	0 %	470219823
47468	NC_020564	TTA	2	6	2638007	2638012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219823
47469	NC_020564	TCT	2	6	2638040	2638045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219823
47470	NC_020564	AT	3	6	2638058	2638063	50 %	50 %	0 %	0 %	470219823
47471	NC_020564	AC	3	6	2638074	2638079	50 %	0 %	0 %	50 %	470219823
47472	NC_020564	ATT	2	6	2638138	2638143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219823
47473	NC_020564	T	7	7	2638142	2638148	0 %	100 %	0 %	0 %	470219823
47474	NC_020564	ATC	2	6	2638162	2638167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219823
47475	NC_020564	TTC	2	6	2638171	2638176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219823
47476	NC_020564	TCA	2	6	2638196	2638201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219823
47477	NC_020564	ATA	2	6	2638211	2638216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219823
47478	NC_020564	TTCAT	2	10	2638223	2638232	20 %	60 %	0 %	20 %	470219823
47479	NC_020564	ATTT	2	8	2638980	2638987	25 %	75 %	0 %	0 %	470219824
47480	NC_020564	TCA	2	6	2639022	2639027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219824
47481	NC_020564	TAA	2	6	2639043	2639048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219824
47482	NC_020564	AT	3	6	2639052	2639057	50 %	50 %	0 %	0 %	470219824
47483	NC_020564	CTG	2	6	2639092	2639097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219824
47484	NC_020564	ACT	2	6	2639217	2639222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219824
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47488	NC_020564	TCT	3	9	2639427	2639435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219824
47489	NC_020564	ATAA	2	8	2639440	2639447	75 %	25 %	0 %	0 %	470219824
47490	NC_020564	GATTT	2	10	2639484	2639493	20 %	60 %	20 %	0 %	470219824
47491	NC_020564	CAT	2	6	2639569	2639574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219824
47492	NC_020564	TGC	3	9	2639669	2639677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219824
47493	NC_020564	GTA	2	6	2639884	2639889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219824
47494	NC_020564	CCA	2	6	2639910	2639915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219824
47495	NC_020564	CTT	2	6	2640127	2640132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219824
47496	NC_020564	CAT	2	6	2640244	2640249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219824
47497	NC_020564	T	6	6	2640286	2640291	0 %	100 %	0 %	0 %	470219824
47498	NC_020564	T	6	6	2640296	2640301	0 %	100 %	0 %	0 %	470219824
47499	NC_020564	TTC	2	6	2640470	2640475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219824
47500	NC_020564	GCA	2	6	2640528	2640533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219824

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