MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020564	CAT	2	6	202407	202412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218090
4002	NC_020564	A	6	6	202535	202540	100 %	0 %	0 %	0 %	470218090
4003	NC_020564	ATG	2	6	202653	202658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218090
4004	NC_020564	AAC	2	6	202679	202684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218090
4005	NC_020564	TAA	2	6	202738	202743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218090
4006	NC_020564	TGA	2	6	202777	202782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218090
4007	NC_020564	AAT	2	6	202874	202879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218090
4008	NC_020564	TAA	2	6	202891	202896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218090
4009	NC_020564	ATT	2	6	202949	202954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218090
4010	NC_020564	TTAA	2	8	202985	202992	50 %	50 %	0 %	0 %	470218090
4011	NC_020564	AATG	2	8	203008	203015	50 %	25 %	25 %	0 %	470218090
4012	NC_020564	TTTG	2	8	203226	203233	0 %	75 %	25 %	0 %	470218091
4013	NC_020564	ATA	3	9	203327	203335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218091
4014	NC_020564	TA	3	6	203366	203371	50 %	50 %	0 %	0 %	470218091
4015	NC_020564	CAA	3	9	203476	203484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218091
4016	NC_020564	AAT	2	6	203512	203517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218091
4017	NC_020564	TAT	2	6	203526	203531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218091
4018	NC_020564	ATT	2	6	203575	203580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218091
4019	NC_020564	CAT	2	6	203594	203599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218091
4020	NC_020564	TAC	2	6	203616	203621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218091
4021	NC_020564	ATT	2	6	203623	203628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218091
4022	NC_020564	CA	3	6	203634	203639	50 %	0 %	0 %	50 %	470218091
4023	NC_020564	AAT	2	6	203670	203675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218091
4024	NC_020564	ACA	2	6	203697	203702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218091
4025	NC_020564	ATC	2	6	203805	203810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218092
4026	NC_020564	TCT	2	6	203817	203822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218092
4027	NC_020564	TTA	2	6	203824	203829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218092
4028	NC_020564	A	7	7	203856	203862	100 %	0 %	0 %	0 %	470218092
4029	NC_020564	CTG	3	9	203863	203871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218092
4030	NC_020564	AAG	2	6	203902	203907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218092
4031	NC_020564	TGA	2	6	203933	203938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218092
4032	NC_020564	AGA	2	6	204029	204034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218092
4033	NC_020564	A	7	7	204066	204072	100 %	0 %	0 %	0 %	470218092
4034	NC_020564	A	7	7	204089	204095	100 %	0 %	0 %	0 %	470218092
4035	NC_020564	GTAG	2	8	204117	204124	25 %	25 %	50 %	0 %	470218092
4036	NC_020564	AAT	3	9	204201	204209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218092
4037	NC_020564	TA	3	6	204226	204231	50 %	50 %	0 %	0 %	470218092
4038	NC_020564	ACT	2	6	204319	204324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218092
4039	NC_020564	ATT	2	6	204366	204371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218092
4040	NC_020564	A	7	7	204387	204393	100 %	0 %	0 %	0 %	470218092
4041	NC_020564	A	6	6	204402	204407	100 %	0 %	0 %	0 %	470218092
4042	NC_020564	TAAA	2	8	204421	204428	75 %	25 %	0 %	0 %	470218092
4043	NC_020564	A	6	6	204426	204431	100 %	0 %	0 %	0 %	470218092
4044	NC_020564	TATACA	2	12	204456	204467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470218092
4045	NC_020564	GAA	2	6	204474	204479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218092
4046	NC_020564	AGC	2	6	204527	204532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218092
4047	NC_020564	TA	3	6	204585	204590	50 %	50 %	0 %	0 %	470218092
4048	NC_020564	AGA	2	6	204608	204613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218092
4049	NC_020564	ACG	2	6	204623	204628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218092
4050	NC_020564	AG	3	6	204674	204679	50 %	0 %	50 %	0 %	470218092
4051	NC_020564	TG	3	6	204690	204695	0 %	50 %	50 %	0 %	470218092
4052	NC_020564	GTGTT	2	10	204724	204733	0 %	60 %	40 %	0 %	470218092
4053	NC_020564	CAA	2	6	204736	204741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218092
4054	NC_020564	GTA	2	6	204777	204782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218092
4055	NC_020564	GT	3	6	204811	204816	0 %	50 %	50 %	0 %	470218092
4056	NC_020564	CTT	2	6	204831	204836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218092
4057	NC_020564	TGGA	2	8	204839	204846	25 %	25 %	50 %	0 %	470218092
4058	NC_020564	GCA	2	6	204858	204863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218092
4059	NC_020564	AAGA	2	8	204867	204874	75 %	0 %	25 %	0 %	470218092
4060	NC_020564	AAT	2	6	205398	205403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218093
4061	NC_020564	TAC	2	6	205490	205495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218093
4062	NC_020564	TTAA	2	8	205509	205516	50 %	50 %	0 %	0 %	470218093
4063	NC_020564	T	6	6	205522	205527	0 %	100 %	0 %	0 %	470218093
4064	NC_020564	TAT	3	9	205534	205542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4065	NC_020564	TAT	2	6	205553	205558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4066	NC_020564	ATT	2	6	205600	205605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4067	NC_020564	TTTA	2	8	205620	205627	25 %	75 %	0 %	0 %	470218093
4068	NC_020564	ATT	2	6	205661	205666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4069	NC_020564	TA	3	6	205693	205698	50 %	50 %	0 %	0 %	470218093
4070	NC_020564	GA	3	6	205709	205714	50 %	0 %	50 %	0 %	470218093
4071	NC_020564	AT	3	6	205734	205739	50 %	50 %	0 %	0 %	470218093
4072	NC_020564	A	6	6	205754	205759	100 %	0 %	0 %	0 %	470218093
4073	NC_020564	TTG	2	6	205762	205767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218093
4074	NC_020564	TTG	2	6	205779	205784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218093
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4079	NC_020564	ATG	2	6	205962	205967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218093
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4081	NC_020564	TAA	2	6	206023	206028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218093
4082	NC_020564	T	6	6	206041	206046	0 %	100 %	0 %	0 %	470218093
4083	NC_020564	TAA	2	6	206056	206061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218093
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4087	NC_020564	AT	3	6	206197	206202	50 %	50 %	0 %	0 %	470218093
4088	NC_020564	ATT	2	6	206211	206216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4089	NC_020564	TTTA	2	8	206225	206232	25 %	75 %	0 %	0 %	470218093
4090	NC_020564	TAT	2	6	206241	206246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4091	NC_020564	TAA	2	6	206249	206254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218093
4092	NC_020564	AGA	2	6	206276	206281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218093
4093	NC_020564	TATC	3	12	206282	206293	25 %	50 %	0 %	25 %	470218093
4094	NC_020564	CAA	2	6	206296	206301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218093
4095	NC_020564	AAC	2	6	206339	206344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218093
4096	NC_020564	AGA	2	6	206375	206380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218093
4097	NC_020564	TCT	2	6	206401	206406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218093
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4100	NC_020564	TAT	2	6	206687	206692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
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4103	NC_020564	TA	4	8	206728	206735	50 %	50 %	0 %	0 %	470218093
4104	NC_020564	ATA	2	6	206748	206753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218093
4105	NC_020564	ATC	2	6	206754	206759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218093
4106	NC_020564	TAA	2	6	206767	206772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218093
4107	NC_020564	ATT	2	6	206786	206791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4108	NC_020564	ATC	2	6	206818	206823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218093
4109	NC_020564	GAA	2	6	206850	206855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218093
4110	NC_020564	T	6	6	206897	206902	0 %	100 %	0 %	0 %	470218093
4111	NC_020564	TCA	2	6	206907	206912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218093
4112	NC_020564	T	6	6	206915	206920	0 %	100 %	0 %	0 %	470218093
4113	NC_020564	ATT	2	6	206979	206984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4114	NC_020564	GTT	2	6	207014	207019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218093
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4116	NC_020564	ATTTAT	2	12	207067	207078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218093
4117	NC_020564	TAA	2	6	207122	207127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218094
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4119	NC_020564	TTA	2	6	207160	207165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218094
4120	NC_020564	TAATT	2	10	207228	207237	40 %	60 %	0 %	0 %	470218094
4121	NC_020564	TCT	2	6	207242	207247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218094
4122	NC_020564	T	6	6	207322	207327	0 %	100 %	0 %	0 %	470218094
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4124	NC_020564	TCTAT	2	10	207361	207370	20 %	60 %	0 %	20 %	470218094
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4367	NC_020564	GAAA	2	8	218811	218818	75 %	0 %	25 %	0 %	470218102
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4369	NC_020564	TCA	3	9	218905	218913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218102
4370	NC_020564	AAAT	2	8	218988	218995	75 %	25 %	0 %	0 %	470218102
4371	NC_020564	TCA	3	9	219010	219018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218102
4372	NC_020564	TGT	3	9	219022	219030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218102
4373	NC_020564	GCC	2	6	219058	219063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470218102
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4375	NC_020564	ATT	2	6	219163	219168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218102
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4401	NC_020564	CAT	2	6	221061	221066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218104
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4489	NC_020564	ATG	2	6	225026	225031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218108
4490	NC_020564	ATGTG	2	10	225137	225146	20 %	40 %	40 %	0 %	470218108
4491	NC_020564	CAG	2	6	225170	225175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218108
4492	NC_020564	A	6	6	225182	225187	100 %	0 %	0 %	0 %	470218108
4493	NC_020564	GATA	2	8	225189	225196	50 %	25 %	25 %	0 %	470218108
4494	NC_020564	A	6	6	225214	225219	100 %	0 %	0 %	0 %	470218108
4495	NC_020564	AGC	2	6	225273	225278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218108
4496	NC_020564	TCG	3	9	225327	225335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218108
4497	NC_020564	GAA	2	6	225367	225372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218108
4498	NC_020564	GGA	2	6	225382	225387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218108
4499	NC_020564	ACGC	2	8	225406	225413	25 %	0 %	25 %	50 %	470218108
4500	NC_020564	GAT	2	6	225432	225437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218108

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