MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_020564	TGT	2	6	2438980	2438985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219678
44003	NC_020564	AAT	2	6	2438997	2439002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219678
44004	NC_020564	CAAT	2	8	2439044	2439051	50 %	25 %	0 %	25 %	470219678
44005	NC_020564	CTT	2	6	2439080	2439085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219678
44006	NC_020564	T	6	6	2439089	2439094	0 %	100 %	0 %	0 %	470219678
44007	NC_020564	GTT	2	6	2439182	2439187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219678
44008	NC_020564	CAC	2	6	2439191	2439196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219678
44009	NC_020564	TAA	2	6	2439354	2439359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219678
44010	NC_020564	CAA	2	6	2439374	2439379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219678
44011	NC_020564	GTT	2	6	2439398	2439403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219678
44012	NC_020564	TTTATA	2	12	2439418	2439429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219678
44013	NC_020564	CGA	2	6	2439515	2439520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219678
44014	NC_020564	ATT	2	6	2439531	2439536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219678
44015	NC_020564	ATT	2	6	2439606	2439611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219678
44016	NC_020564	CTT	2	6	2439636	2439641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219678
44017	NC_020564	TTG	2	6	2439647	2439652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219678
44018	NC_020564	CTA	2	6	2439755	2439760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219678
44019	NC_020564	ATA	2	6	2439770	2439775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219678
44020	NC_020564	GATA	2	8	2439813	2439820	50 %	25 %	25 %	0 %	470219678
44021	NC_020564	T	6	6	2439954	2439959	0 %	100 %	0 %	0 %	470219678
44022	NC_020564	GATT	2	8	2439973	2439980	25 %	50 %	25 %	0 %	470219678
44023	NC_020564	ATT	2	6	2440038	2440043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219678
44024	NC_020564	T	6	6	2440089	2440094	0 %	100 %	0 %	0 %	470219678
44025	NC_020564	AAATTG	2	12	2440103	2440114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470219678
44026	NC_020564	TAA	2	6	2440125	2440130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219678
44027	NC_020564	CAAT	2	8	2440147	2440154	50 %	25 %	0 %	25 %	470219678
44028	NC_020564	AGC	2	6	2440176	2440181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219678
44029	NC_020564	AAGT	2	8	2440188	2440195	50 %	25 %	25 %	0 %	470219678
44030	NC_020564	AT	3	6	2440259	2440264	50 %	50 %	0 %	0 %	470219678
44031	NC_020564	T	6	6	2440264	2440269	0 %	100 %	0 %	0 %	470219678
44032	NC_020564	T	6	6	2440332	2440337	0 %	100 %	0 %	0 %	470219678
44033	NC_020564	ACA	2	6	2440398	2440403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219678
44034	NC_020564	ATC	2	6	2440477	2440482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219678
44035	NC_020564	AAT	2	6	2440488	2440493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219678
44036	NC_020564	TGA	2	6	2440535	2440540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219678
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44038	NC_020564	CTA	2	6	2442221	2442226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219679
44039	NC_020564	A	6	6	2442236	2442241	100 %	0 %	0 %	0 %	470219679
44040	NC_020564	TGG	2	6	2442366	2442371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219679
44041	NC_020564	ATGC	2	8	2442394	2442401	25 %	25 %	25 %	25 %	470219679
44042	NC_020564	AAC	2	6	2442482	2442487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219679
44043	NC_020564	ATT	2	6	2442496	2442501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219679
44044	NC_020564	GGC	2	6	2442507	2442512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470219679
44045	NC_020564	TTA	2	6	2442529	2442534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219679
44046	NC_020564	CAT	3	9	2442563	2442571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219679
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44048	NC_020564	TGG	2	6	2442636	2442641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219679
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44051	NC_020564	TTA	2	6	2442715	2442720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219679
44052	NC_020564	AATG	2	8	2442723	2442730	50 %	25 %	25 %	0 %	470219679
44053	NC_020564	GAT	2	6	2442888	2442893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219679
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44055	NC_020564	GCA	2	6	2443000	2443005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219679
44056	NC_020564	TTA	2	6	2443006	2443011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219679
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44077	NC_020564	A	6	6	2443828	2443833	100 %	0 %	0 %	0 %	470219680
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44088	NC_020564	GTAC	2	8	2444364	2444371	25 %	25 %	25 %	25 %	470219681
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44102	NC_020564	TAT	2	6	2444922	2444927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219681
44103	NC_020564	TTA	2	6	2444990	2444995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219681
44104	NC_020564	CAA	2	6	2445022	2445027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219681
44105	NC_020564	GTCA	2	8	2445070	2445077	25 %	25 %	25 %	25 %	470219681
44106	NC_020564	TAG	2	6	2445092	2445097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219681
44107	NC_020564	ATT	2	6	2445117	2445122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219681
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44111	NC_020564	TG	3	6	2445225	2445230	0 %	50 %	50 %	0 %	470219681
44112	NC_020564	GAA	2	6	2445274	2445279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219681
44113	NC_020564	AT	3	6	2445390	2445395	50 %	50 %	0 %	0 %	470219681
44114	NC_020564	ATT	2	6	2445397	2445402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219681
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44117	NC_020564	GTA	2	6	2445649	2445654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219682
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44231	NC_020564	ATTA	2	8	2450773	2450780	50 %	50 %	0 %	0 %	470219686
44232	NC_020564	TAC	2	6	2450833	2450838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219686
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44234	NC_020564	TTA	2	6	2450981	2450986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219686
44235	NC_020564	TAA	2	6	2450998	2451003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219686
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44239	NC_020564	CAT	2	6	2451156	2451161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219686
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44253	NC_020564	TAAAT	2	10	2451815	2451824	60 %	40 %	0 %	0 %	470219687
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44262	NC_020564	AAG	2	6	2452256	2452261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219687
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44346	NC_020564	TCT	3	9	2455812	2455820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219689
44347	NC_020564	ACCA	2	8	2455823	2455830	50 %	0 %	0 %	50 %	470219689
44348	NC_020564	CATA	2	8	2455912	2455919	50 %	25 %	0 %	25 %	470219689
44349	NC_020564	CGC	2	6	2455964	2455969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470219689
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44351	NC_020564	T	6	6	2456028	2456033	0 %	100 %	0 %	0 %	470219689
44352	NC_020564	AT	3	6	2456107	2456112	50 %	50 %	0 %	0 %	470219689
44353	NC_020564	AT	3	6	2456118	2456123	50 %	50 %	0 %	0 %	470219689
44354	NC_020564	AGC	2	6	2456138	2456143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219689
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44356	NC_020564	GTA	2	6	2456169	2456174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219689
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