MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_020564	GTA	2	6	2382820	2382825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219636
43002	NC_020564	GAA	2	6	2382838	2382843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219636
43003	NC_020564	AATAT	2	10	2382863	2382872	60 %	40 %	0 %	0 %	470219636
43004	NC_020564	AGA	2	6	2382906	2382911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219636
43005	NC_020564	ATT	2	6	2382958	2382963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219636
43006	NC_020564	ATT	3	9	2383027	2383035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219636
43007	NC_020564	TAT	2	6	2383044	2383049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219636
43008	NC_020564	CAG	2	6	2383122	2383127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219636
43009	NC_020564	ACT	2	6	2383147	2383152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219636
43010	NC_020564	TAA	2	6	2383188	2383193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219636
43011	NC_020564	A	6	6	2383221	2383226	100 %	0 %	0 %	0 %	470219636
43012	NC_020564	AACA	2	8	2383237	2383244	75 %	0 %	0 %	25 %	470219636
43013	NC_020564	A	6	6	2383268	2383273	100 %	0 %	0 %	0 %	470219636
43014	NC_020564	ATT	2	6	2383315	2383320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219636
43015	NC_020564	GAA	2	6	2383357	2383362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219636
43016	NC_020564	GAA	2	6	2383366	2383371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219636
43017	NC_020564	AGA	2	6	2383377	2383382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219636
43018	NC_020564	ACA	2	6	2383414	2383419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219636
43019	NC_020564	CAT	2	6	2383454	2383459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219636
43020	NC_020564	TTA	2	6	2383468	2383473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219636
43021	NC_020564	TTC	2	6	2383552	2383557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219636
43022	NC_020564	TGA	2	6	2383581	2383586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219636
43023	NC_020564	TA	3	6	2383594	2383599	50 %	50 %	0 %	0 %	470219636
43024	NC_020564	ATT	2	6	2383606	2383611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219636
43025	NC_020564	GGTA	2	8	2383614	2383621	25 %	25 %	50 %	0 %	470219636
43026	NC_020564	T	6	6	2383761	2383766	0 %	100 %	0 %	0 %	470219637
43027	NC_020564	CTT	2	6	2383776	2383781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219637
43028	NC_020564	CTTTT	2	10	2383788	2383797	0 %	80 %	0 %	20 %	470219637
43029	NC_020564	ATG	2	6	2383826	2383831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219637
43030	NC_020564	CAA	2	6	2383848	2383853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219637
43031	NC_020564	AGT	2	6	2383854	2383859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219637
43032	NC_020564	GATT	2	8	2383881	2383888	25 %	50 %	25 %	0 %	470219637
43033	NC_020564	AAAT	2	8	2383890	2383897	75 %	25 %	0 %	0 %	470219637
43034	NC_020564	CAG	2	6	2383908	2383913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219637
43035	NC_020564	GAA	2	6	2383939	2383944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219637
43036	NC_020564	AT	3	6	2383949	2383954	50 %	50 %	0 %	0 %	470219637
43037	NC_020564	CTT	2	6	2384086	2384091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219637
43038	NC_020564	TAA	3	9	2384100	2384108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219637
43039	NC_020564	TGC	2	6	2384122	2384127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219637
43040	NC_020564	ACC	2	6	2384128	2384133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219637
43041	NC_020564	ATG	2	6	2384230	2384235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219637
43042	NC_020564	TAA	2	6	2384244	2384249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219637
43043	NC_020564	AAT	2	6	2384264	2384269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219637
43044	NC_020564	CCA	2	6	2384282	2384287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219637
43045	NC_020564	CAC	2	6	2384292	2384297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219637
43046	NC_020564	GCT	2	6	2384480	2384485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219637
43047	NC_020564	GATG	2	8	2384609	2384616	25 %	25 %	50 %	0 %	470219637
43048	NC_020564	CCA	2	6	2384657	2384662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219637
43049	NC_020564	TGC	2	6	2384671	2384676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219637
43050	NC_020564	TAA	2	6	2384698	2384703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219637
43051	NC_020564	TA	3	6	2384760	2384765	50 %	50 %	0 %	0 %	470219637
43052	NC_020564	TAA	2	6	2384830	2384835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219637
43053	NC_020564	ACC	2	6	2384836	2384841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219637
43054	NC_020564	CTT	2	6	2384955	2384960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219637
43055	NC_020564	AAT	3	9	2385013	2385021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219637
43056	NC_020564	TCA	2	6	2385098	2385103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219637
43057	NC_020564	TTCTC	2	10	2385152	2385161	0 %	60 %	0 %	40 %	470219637
43058	NC_020564	TCT	2	6	2385182	2385187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219637
43059	NC_020564	AT	3	6	2385206	2385211	50 %	50 %	0 %	0 %	470219637
43060	NC_020564	TCA	2	6	2385506	2385511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219638
43061	NC_020564	CAA	2	6	2385516	2385521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219638
43062	NC_020564	TGAT	2	8	2385523	2385530	25 %	50 %	25 %	0 %	470219638
43063	NC_020564	A	6	6	2385600	2385605	100 %	0 %	0 %	0 %	470219638
43064	NC_020564	GAA	3	9	2385615	2385623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219638
43065	NC_020564	ACT	2	6	2385638	2385643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219638
43066	NC_020564	TTA	2	6	2385655	2385660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219638
43067	NC_020564	T	6	6	2385692	2385697	0 %	100 %	0 %	0 %	470219638
43068	NC_020564	TAA	2	6	2385710	2385715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219638
43069	NC_020564	ATG	2	6	2385718	2385723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219638
43070	NC_020564	TAC	2	6	2385733	2385738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219638
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43075	NC_020564	TTAA	2	8	2387430	2387437	50 %	50 %	0 %	0 %	470219639
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43088	NC_020564	CAA	2	6	2388103	2388108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219639
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43090	NC_020564	GAT	2	6	2388156	2388161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219639
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43092	NC_020564	A	7	7	2388370	2388376	100 %	0 %	0 %	0 %	470219639
43093	NC_020564	CAACA	2	10	2388403	2388412	60 %	0 %	0 %	40 %	470219639
43094	NC_020564	CAAG	2	8	2388472	2388479	50 %	0 %	25 %	25 %	470219639
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43099	NC_020564	TATTGA	2	12	2388674	2388685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470219639
43100	NC_020564	ATC	2	6	2388730	2388735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219639
43101	NC_020564	ATTT	2	8	2388767	2388774	25 %	75 %	0 %	0 %	470219639
43102	NC_020564	ATC	2	6	2388788	2388793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219639
43103	NC_020564	TA	3	6	2388805	2388810	50 %	50 %	0 %	0 %	470219639
43104	NC_020564	CTGT	2	8	2388816	2388823	0 %	50 %	25 %	25 %	470219639
43105	NC_020564	ATG	2	6	2388844	2388849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219639
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43107	NC_020564	ATT	2	6	2388896	2388901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219639
43108	NC_020564	ATT	2	6	2388929	2388934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219639
43109	NC_020564	ACA	2	6	2388964	2388969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219639
43110	NC_020564	TA	3	6	2389000	2389005	50 %	50 %	0 %	0 %	470219639
43111	NC_020564	AAT	2	6	2389047	2389052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219639
43112	NC_020564	ATA	2	6	2389072	2389077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219639
43113	NC_020564	TTA	2	6	2389089	2389094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219639
43114	NC_020564	AT	3	6	2389115	2389120	50 %	50 %	0 %	0 %	470219639
43115	NC_020564	TGA	2	6	2389174	2389179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219639
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43117	NC_020564	TTCAA	2	10	2389208	2389217	40 %	40 %	0 %	20 %	470219639
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43223	NC_020564	A	6	6	2396643	2396648	100 %	0 %	0 %	0 %	470219643
43224	NC_020564	TAA	2	6	2396649	2396654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219643
43225	NC_020564	CATACA	2	12	2396675	2396686	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470219643
43226	NC_020564	TTA	2	6	2396908	2396913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219644
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43228	NC_020564	TTA	2	6	2396984	2396989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219644
43229	NC_020564	CT	4	8	2396995	2397002	0 %	50 %	0 %	50 %	470219644
43230	NC_020564	AAG	2	6	2397050	2397055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219644
43231	NC_020564	ATCA	2	8	2397086	2397093	50 %	25 %	0 %	25 %	470219644
43232	NC_020564	TTA	2	6	2397095	2397100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219644
43233	NC_020564	ATCCA	2	10	2397188	2397197	40 %	20 %	0 %	40 %	470219644
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43235	NC_020564	GAT	2	6	2397295	2397300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219644
43236	NC_020564	CAT	2	6	2397347	2397352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219644
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43352	NC_020564	CTG	2	6	2403339	2403344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
43353	NC_020564	CAG	2	6	2403396	2403401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219650
43354	NC_020564	TTC	2	6	2403442	2403447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
43355	NC_020564	ATC	2	6	2403562	2403567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219650
43356	NC_020564	TTC	2	6	2403604	2403609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
43357	NC_020564	GCT	2	6	2404022	2404027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219650
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43359	NC_020564	TCT	2	6	2404127	2404132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
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43364	NC_020564	CTT	2	6	2404374	2404379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219650
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43371	NC_020564	GAC	2	6	2404638	2404643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219650
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43464	NC_020564	GTG	2	6	2409478	2409483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219652
43465	NC_020564	CATCA	2	10	2409557	2409566	40 %	20 %	0 %	40 %	470219652
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43467	NC_020564	AAC	2	6	2409644	2409649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219652
43468	NC_020564	CAT	2	6	2409697	2409702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219652
43469	NC_020564	TAA	2	6	2409857	2409862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219652
43470	NC_020564	CCA	2	6	2409894	2409899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219652
43471	NC_020564	CTTT	2	8	2409910	2409917	0 %	75 %	0 %	25 %	470219652
43472	NC_020564	TCA	2	6	2409934	2409939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219652
43473	NC_020564	ATC	2	6	2409950	2409955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219652
43474	NC_020564	CCAA	2	8	2409965	2409972	50 %	0 %	0 %	50 %	470219652
43475	NC_020564	CTGGAA	2	12	2409994	2410005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470219652
43476	NC_020564	AGT	2	6	2410070	2410075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219652
43477	NC_020564	TGAT	2	8	2410079	2410086	25 %	50 %	25 %	0 %	470219652
43478	NC_020564	TTC	2	6	2410172	2410177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219652
43479	NC_020564	ATTTT	2	10	2410185	2410194	20 %	80 %	0 %	0 %	470219652
43480	NC_020564	ATG	2	6	2410212	2410217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219652
43481	NC_020564	GC	3	6	2410275	2410280	0 %	0 %	50 %	50 %	470219652
43482	NC_020564	TTC	2	6	2410289	2410294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219652
43483	NC_020564	TTTGC	2	10	2410339	2410348	0 %	60 %	20 %	20 %	470219652
43484	NC_020564	TAA	2	6	2410518	2410523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219653
43485	NC_020564	TCAT	2	8	2410529	2410536	25 %	50 %	0 %	25 %	470219653
43486	NC_020564	TGC	2	6	2410538	2410543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219653
43487	NC_020564	AAT	2	6	2410577	2410582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219653
43488	NC_020564	CAAT	2	8	2410590	2410597	50 %	25 %	0 %	25 %	470219653
43489	NC_020564	TC	3	6	2410644	2410649	0 %	50 %	0 %	50 %	470219653
43490	NC_020564	TTA	2	6	2410676	2410681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219653
43491	NC_020564	CAA	2	6	2410755	2410760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219653
43492	NC_020564	TTG	2	6	2410774	2410779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219653
43493	NC_020564	GTT	2	6	2410809	2410814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219653
43494	NC_020564	TG	3	6	2410838	2410843	0 %	50 %	50 %	0 %	470219653
43495	NC_020564	CGT	2	6	2410883	2410888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219653
43496	NC_020564	TTCAT	2	10	2410889	2410898	20 %	60 %	0 %	20 %	470219653
43497	NC_020564	CGT	2	6	2410990	2410995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219653
43498	NC_020564	ATC	2	6	2411056	2411061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219653
43499	NC_020564	AAAT	2	8	2411076	2411083	75 %	25 %	0 %	0 %	470219653
43500	NC_020564	GTC	2	6	2411103	2411108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219653

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