MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_020564	AAT	2	6	2328230	2328235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219589
42003	NC_020564	AAAG	2	8	2328259	2328266	75 %	0 %	25 %	0 %	470219589
42004	NC_020564	TCT	2	6	2328321	2328326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219589
42005	NC_020564	TAATGA	2	12	2328692	2328703	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470219590
42006	NC_020564	CA	3	6	2328779	2328784	50 %	0 %	0 %	50 %	470219590
42007	NC_020564	TAA	2	6	2328872	2328877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219590
42008	NC_020564	AC	3	6	2328879	2328884	50 %	0 %	0 %	50 %	470219590
42009	NC_020564	CTT	2	6	2328966	2328971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219590
42010	NC_020564	A	6	6	2328976	2328981	100 %	0 %	0 %	0 %	470219590
42011	NC_020564	CAA	2	6	2328994	2328999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219590
42012	NC_020564	ATG	2	6	2329093	2329098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219590
42013	NC_020564	TAT	2	6	2329151	2329156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219590
42014	NC_020564	ATT	2	6	2329181	2329186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219590
42015	NC_020564	TAC	2	6	2329235	2329240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219590
42016	NC_020564	ATA	2	6	2329249	2329254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219590
42017	NC_020564	TCA	2	6	2329336	2329341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219590
42018	NC_020564	AT	3	6	2329348	2329353	50 %	50 %	0 %	0 %	470219590
42019	NC_020564	TAC	2	6	2329390	2329395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219590
42020	NC_020564	TTG	2	6	2329476	2329481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219591
42021	NC_020564	CAT	2	6	2329544	2329549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219591
42022	NC_020564	T	6	6	2329557	2329562	0 %	100 %	0 %	0 %	470219591
42023	NC_020564	TCTT	2	8	2329593	2329600	0 %	75 %	0 %	25 %	470219591
42024	NC_020564	ATA	2	6	2329617	2329622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219591
42025	NC_020564	A	6	6	2329656	2329661	100 %	0 %	0 %	0 %	470219591
42026	NC_020564	GTT	2	6	2329781	2329786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219591
42027	NC_020564	CTT	2	6	2329811	2329816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219591
42028	NC_020564	CAA	2	6	2329872	2329877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219591
42029	NC_020564	TCTT	2	8	2329879	2329886	0 %	75 %	0 %	25 %	470219591
42030	NC_020564	TTTCAA	2	12	2329931	2329942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470219591
42031	NC_020564	T	6	6	2330174	2330179	0 %	100 %	0 %	0 %	470219592
42032	NC_020564	TAAA	2	8	2330193	2330200	75 %	25 %	0 %	0 %	470219592
42033	NC_020564	TAA	2	6	2330224	2330229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219592
42034	NC_020564	TAA	2	6	2330314	2330319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219592
42035	NC_020564	AGC	2	6	2330328	2330333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219592
42036	NC_020564	AT	3	6	2330340	2330345	50 %	50 %	0 %	0 %	470219592
42037	NC_020564	CAT	2	6	2330376	2330381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219592
42038	NC_020564	ATA	3	9	2330417	2330425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219592
42039	NC_020564	GTT	2	6	2330434	2330439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219592
42040	NC_020564	CAA	2	6	2330527	2330532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219592
42041	NC_020564	ACC	2	6	2330542	2330547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219592
42042	NC_020564	AAT	2	6	2330557	2330562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219592
42043	NC_020564	ACC	2	6	2330572	2330577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219592
42044	NC_020564	TAG	2	6	2330638	2330643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219592
42045	NC_020564	TAA	2	6	2330689	2330694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219592
42046	NC_020564	CAAT	2	8	2330703	2330710	50 %	25 %	0 %	25 %	470219592
42047	NC_020564	TAA	2	6	2330731	2330736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219592
42048	NC_020564	AAT	3	9	2330836	2330844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219592
42049	NC_020564	TGT	2	6	2330909	2330914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219592
42050	NC_020564	GCA	2	6	2330924	2330929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219592
42051	NC_020564	TTG	2	6	2330931	2330936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219592
42052	NC_020564	CAA	2	6	2330979	2330984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219592
42053	NC_020564	GCA	2	6	2331053	2331058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219592
42054	NC_020564	AAAC	2	8	2331090	2331097	75 %	0 %	0 %	25 %	470219592
42055	NC_020564	AAT	2	6	2331121	2331126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219592
42056	NC_020564	T	6	6	2331183	2331188	0 %	100 %	0 %	0 %	470219592
42057	NC_020564	TAAAA	2	10	2331214	2331223	80 %	20 %	0 %	0 %	470219592
42058	NC_020564	CAT	2	6	2331229	2331234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219592
42059	NC_020564	AAT	2	6	2331238	2331243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219593
42060	NC_020564	T	6	6	2331280	2331285	0 %	100 %	0 %	0 %	470219593
42061	NC_020564	TAA	2	6	2331310	2331315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219593
42062	NC_020564	ATA	2	6	2331377	2331382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219593
42063	NC_020564	AAC	2	6	2331395	2331400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219593
42064	NC_020564	ATA	2	6	2331408	2331413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219593
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42068	NC_020564	AAT	2	6	2331747	2331752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219594
42069	NC_020564	TAA	2	6	2331755	2331760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219594
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42071	NC_020564	AC	3	6	2331812	2331817	50 %	0 %	0 %	50 %	470219594
42072	NC_020564	TGTT	2	8	2331880	2331887	0 %	75 %	25 %	0 %	470219594
42073	NC_020564	T	6	6	2331901	2331906	0 %	100 %	0 %	0 %	470219594
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42078	NC_020564	TA	4	8	2332155	2332162	50 %	50 %	0 %	0 %	470219594
42079	NC_020564	ATA	2	6	2332223	2332228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219594
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42091	NC_020564	CTT	2	6	2333354	2333359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219595
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42100	NC_020564	CAA	2	6	2333761	2333766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219596
42101	NC_020564	TCT	2	6	2333892	2333897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219596
42102	NC_020564	CAT	2	6	2333918	2333923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219596
42103	NC_020564	TCA	2	6	2333979	2333984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219596
42104	NC_020564	TCA	2	6	2333986	2333991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219596
42105	NC_020564	AATT	2	8	2334019	2334026	50 %	50 %	0 %	0 %	470219596
42106	NC_020564	TCCG	2	8	2334050	2334057	0 %	25 %	25 %	50 %	470219596
42107	NC_020564	TAC	2	6	2334185	2334190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219596
42108	NC_020564	TCA	2	6	2334195	2334200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219596
42109	NC_020564	AGAT	2	8	2334206	2334213	50 %	25 %	25 %	0 %	470219596
42110	NC_020564	CTA	2	6	2334216	2334221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219596
42111	NC_020564	GCA	2	6	2334291	2334296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219596
42112	NC_020564	ACC	2	6	2334299	2334304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219596
42113	NC_020564	CTG	2	6	2334337	2334342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219596
42114	NC_020564	TACC	2	8	2334373	2334380	25 %	25 %	0 %	50 %	470219596
42115	NC_020564	AAT	2	6	2334443	2334448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219596
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42117	NC_020564	CGCA	2	8	2334577	2334584	25 %	0 %	25 %	50 %	470219596
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42226	NC_020564	CTTG	2	8	2340851	2340858	0 %	50 %	25 %	25 %	470219601
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42232	NC_020564	TTTAT	2	10	2341474	2341483	20 %	80 %	0 %	0 %	470219602
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42351	NC_020564	TTC	2	6	2347705	2347710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219607
42352	NC_020564	T	6	6	2347750	2347755	0 %	100 %	0 %	0 %	470219607
42353	NC_020564	GTT	2	6	2347817	2347822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219607
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42449	NC_020564	ATTT	2	8	2353792	2353799	25 %	75 %	0 %	0 %	470219613
42450	NC_020564	AGA	2	6	2353814	2353819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219613
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42453	NC_020564	CA	3	6	2353869	2353874	50 %	0 %	0 %	50 %	470219613
42454	NC_020564	CGT	2	6	2353875	2353880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219613
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42457	NC_020564	CA	3	6	2353984	2353989	50 %	0 %	0 %	50 %	470219613
42458	NC_020564	TTA	2	6	2354527	2354532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219614
42459	NC_020564	TGA	2	6	2354657	2354662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219614
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42462	NC_020564	TGG	2	6	2354737	2354742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219614
42463	NC_020564	T	6	6	2354809	2354814	0 %	100 %	0 %	0 %	470219614
42464	NC_020564	TTA	2	6	2354882	2354887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219614
42465	NC_020564	CAC	2	6	2354985	2354990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219614
42466	NC_020564	GATA	2	8	2355105	2355112	50 %	25 %	25 %	0 %	470219614
42467	NC_020564	CAA	2	6	2355154	2355159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219614
42468	NC_020564	AT	3	6	2355206	2355211	50 %	50 %	0 %	0 %	470219614
42469	NC_020564	ATC	2	6	2355262	2355267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219614
42470	NC_020564	GCT	2	6	2355312	2355317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219614
42471	NC_020564	T	7	7	2355322	2355328	0 %	100 %	0 %	0 %	470219614
42472	NC_020564	A	7	7	2355351	2355357	100 %	0 %	0 %	0 %	470219614
42473	NC_020564	CAAATC	2	12	2355662	2355673	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470219615
42474	NC_020564	TGA	2	6	2355690	2355695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219615
42475	NC_020564	CAA	2	6	2355703	2355708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219615
42476	NC_020564	A	6	6	2355742	2355747	100 %	0 %	0 %	0 %	470219615
42477	NC_020564	ATT	2	6	2355766	2355771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219615
42478	NC_020564	TTG	2	6	2355779	2355784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219615
42479	NC_020564	AAC	2	6	2355821	2355826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219615
42480	NC_020564	ACA	2	6	2355945	2355950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219615
42481	NC_020564	ATCG	2	8	2355955	2355962	25 %	25 %	25 %	25 %	470219615
42482	NC_020564	AGT	2	6	2356056	2356061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219615
42483	NC_020564	TAT	2	6	2356113	2356118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219615
42484	NC_020564	A	7	7	2356152	2356158	100 %	0 %	0 %	0 %	470219615
42485	NC_020564	TAT	2	6	2356159	2356164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219615
42486	NC_020564	ACC	2	6	2356173	2356178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219615
42487	NC_020564	CAT	2	6	2356218	2356223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219615
42488	NC_020564	TTC	2	6	2356264	2356269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219615
42489	NC_020564	TATTT	2	10	2356534	2356543	20 %	80 %	0 %	0 %	470219616
42490	NC_020564	GCTT	2	8	2356563	2356570	0 %	50 %	25 %	25 %	470219616
42491	NC_020564	GCTTTT	2	12	2356588	2356599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470219616
42492	NC_020564	TTA	2	6	2356600	2356605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219616
42493	NC_020564	GAT	2	6	2356635	2356640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219616
42494	NC_020564	CAT	2	6	2356667	2356672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219616
42495	NC_020564	TTTA	2	8	2356695	2356702	25 %	75 %	0 %	0 %	470219616
42496	NC_020564	TAA	2	6	2356710	2356715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219616
42497	NC_020564	CTT	2	6	2356730	2356735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219616
42498	NC_020564	ACC	2	6	2356737	2356742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219616
42499	NC_020564	ACA	2	6	2356777	2356782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219616
42500	NC_020564	TGT	2	6	2356822	2356827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219616

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