MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_020564	ATTT	2	8	2300410	2300417	25 %	75 %	0 %	0 %	470219570
41503	NC_020564	ATA	2	6	2300450	2300455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219570
41504	NC_020564	TTA	2	6	2300498	2300503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219570
41505	NC_020564	T	6	6	2300520	2300525	0 %	100 %	0 %	0 %	470219570
41506	NC_020564	ATT	2	6	2300536	2300541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219570
41507	NC_020564	GAT	2	6	2300634	2300639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219570
41508	NC_020564	GAT	2	6	2300682	2300687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219570
41509	NC_020564	AT	3	6	2300686	2300691	50 %	50 %	0 %	0 %	470219570
41510	NC_020564	TA	3	6	2300707	2300712	50 %	50 %	0 %	0 %	470219570
41511	NC_020564	AGT	2	6	2300746	2300751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219570
41512	NC_020564	TTAA	2	8	2300762	2300769	50 %	50 %	0 %	0 %	470219570
41513	NC_020564	CTA	2	6	2300820	2300825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
41514	NC_020564	TAC	2	6	2300890	2300895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
41515	NC_020564	TAA	2	6	2300926	2300931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219570
41516	NC_020564	TAA	2	6	2301035	2301040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219570
41517	NC_020564	TCCA	2	8	2301041	2301048	25 %	25 %	0 %	50 %	470219570
41518	NC_020564	GAA	2	6	2301143	2301148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219570
41519	NC_020564	TAT	2	6	2301159	2301164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219570
41520	NC_020564	AAT	2	6	2301167	2301172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219570
41521	NC_020564	TAAT	2	8	2301246	2301253	50 %	50 %	0 %	0 %	470219570
41522	NC_020564	AAT	2	6	2301300	2301305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219570
41523	NC_020564	ACT	2	6	2301319	2301324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
41524	NC_020564	TTC	2	6	2301331	2301336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219570
41525	NC_020564	CTT	2	6	2301343	2301348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219570
41526	NC_020564	TTTG	2	8	2301448	2301455	0 %	75 %	25 %	0 %	470219570
41527	NC_020564	TGG	2	6	2301500	2301505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219570
41528	NC_020564	TTGT	2	8	2301506	2301513	0 %	75 %	25 %	0 %	470219570
41529	NC_020564	AAT	2	6	2301516	2301521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219570
41530	NC_020564	CTT	2	6	2301528	2301533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219570
41531	NC_020564	CTA	2	6	2301537	2301542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
41532	NC_020564	GAC	2	6	2301546	2301551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219570
41533	NC_020564	GTAT	2	8	2301559	2301566	25 %	50 %	25 %	0 %	470219570
41534	NC_020564	AC	3	6	2301584	2301589	50 %	0 %	0 %	50 %	470219570
41535	NC_020564	TAAT	2	8	2301593	2301600	50 %	50 %	0 %	0 %	470219570
41536	NC_020564	TGT	2	6	2301626	2301631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219570
41537	NC_020564	CAT	2	6	2301709	2301714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
41538	NC_020564	ACTT	2	8	2301751	2301758	25 %	50 %	0 %	25 %	470219570
41539	NC_020564	CAA	2	6	2301759	2301764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219570
41540	NC_020564	ATC	2	6	2301778	2301783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
41541	NC_020564	ATA	2	6	2301815	2301820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219570
41542	NC_020564	CAT	2	6	2301828	2301833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
41543	NC_020564	CAT	2	6	2301843	2301848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
41544	NC_020564	TTG	2	6	2301850	2301855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219570
41545	NC_020564	GATT	2	8	2301858	2301865	25 %	50 %	25 %	0 %	470219570
41546	NC_020564	AT	3	6	2301892	2301897	50 %	50 %	0 %	0 %	470219570
41547	NC_020564	CTTC	2	8	2301912	2301919	0 %	50 %	0 %	50 %	470219570
41548	NC_020564	ACT	2	6	2301922	2301927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219570
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41550	NC_020564	GAA	2	6	2302584	2302589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219571
41551	NC_020564	CTA	2	6	2302601	2302606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219571
41552	NC_020564	CAT	2	6	2302703	2302708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219571
41553	NC_020564	CTA	2	6	2302800	2302805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219571
41554	NC_020564	TAC	3	9	2302813	2302821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219571
41555	NC_020564	ACA	2	6	2302838	2302843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219571
41556	NC_020564	ACA	2	6	2302847	2302852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219571
41557	NC_020564	AAT	2	6	2302867	2302872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219571
41558	NC_020564	ACA	2	6	2302883	2302888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219571
41559	NC_020564	ACT	2	6	2302889	2302894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219571
41560	NC_020564	ATA	2	6	2302898	2302903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219571
41561	NC_020564	ATCA	2	8	2302904	2302911	50 %	25 %	0 %	25 %	470219571
41562	NC_020564	ACA	2	6	2302937	2302942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219571
41563	NC_020564	TGG	2	6	2302959	2302964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219571
41564	NC_020564	CAA	2	6	2302992	2302997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219571
41565	NC_020564	CAT	2	6	2303024	2303029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219571
41566	NC_020564	TAC	2	6	2303098	2303103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219571
41567	NC_020564	GGT	2	6	2303119	2303124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219571
41568	NC_020564	AAC	2	6	2303226	2303231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219571
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41570	NC_020564	TTCA	2	8	2303374	2303381	25 %	50 %	0 %	25 %	470219571
41571	NC_020564	ATAA	2	8	2303893	2303900	75 %	25 %	0 %	0 %	470219572
41572	NC_020564	GA	3	6	2304037	2304042	50 %	0 %	50 %	0 %	470219572
41573	NC_020564	AC	3	6	2304073	2304078	50 %	0 %	0 %	50 %	470219572
41574	NC_020564	ATA	2	6	2304084	2304089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219572
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41582	NC_020564	TAA	2	6	2304611	2304616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219572
41583	NC_020564	TGAT	2	8	2304622	2304629	25 %	50 %	25 %	0 %	470219572
41584	NC_020564	TCG	2	6	2304637	2304642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219572
41585	NC_020564	CAT	2	6	2304647	2304652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219572
41586	NC_020564	AT	3	6	2304670	2304675	50 %	50 %	0 %	0 %	470219572
41587	NC_020564	GGA	2	6	2304777	2304782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470219572
41588	NC_020564	A	6	6	2304878	2304883	100 %	0 %	0 %	0 %	470219572
41589	NC_020564	A	6	6	2304894	2304899	100 %	0 %	0 %	0 %	470219572
41590	NC_020564	ATA	2	6	2304926	2304931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219572
41591	NC_020564	CTA	2	6	2304970	2304975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219572
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41593	NC_020564	TAA	2	6	2305109	2305114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219572
41594	NC_020564	A	6	6	2305133	2305138	100 %	0 %	0 %	0 %	470219572
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41597	NC_020564	TCA	2	6	2305213	2305218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219572
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41599	NC_020564	TC	4	8	2305387	2305394	0 %	50 %	0 %	50 %	470219573
41600	NC_020564	CAATTA	2	12	2305409	2305420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470219573
41601	NC_020564	AAAC	2	8	2305563	2305570	75 %	0 %	0 %	25 %	470219573
41602	NC_020564	TCT	2	6	2305585	2305590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219573
41603	NC_020564	CTT	2	6	2305724	2305729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219573
41604	NC_020564	TA	3	6	2305730	2305735	50 %	50 %	0 %	0 %	470219573
41605	NC_020564	CGAC	2	8	2305762	2305769	25 %	0 %	25 %	50 %	470219573
41606	NC_020564	AAT	2	6	2305774	2305779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219573
41607	NC_020564	TTAA	2	8	2305825	2305832	50 %	50 %	0 %	0 %	470219573
41608	NC_020564	AGA	2	6	2305916	2305921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219573
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41852	NC_020564	ATAG	2	8	2320493	2320500	50 %	25 %	25 %	0 %	470219584
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41854	NC_020564	A	7	7	2320527	2320533	100 %	0 %	0 %	0 %	470219584
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41965	NC_020564	TAT	2	6	2326534	2326539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219588
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41968	NC_020564	CTA	2	6	2326788	2326793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219589
41969	NC_020564	TTG	2	6	2326837	2326842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219589
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