MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_020564	T	6	6	2205940	2205945	0 %	100 %	0 %	0 %	470219498
40003	NC_020564	CAA	2	6	2205946	2205951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219498
40004	NC_020564	TCA	2	6	2205954	2205959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219498
40005	NC_020564	ATTT	2	8	2205970	2205977	25 %	75 %	0 %	0 %	470219498
40006	NC_020564	TTG	2	6	2206004	2206009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219498
40007	NC_020564	CTCTT	2	10	2206019	2206028	0 %	60 %	0 %	40 %	470219498
40008	NC_020564	ATA	2	6	2206092	2206097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219498
40009	NC_020564	ACA	2	6	2206410	2206415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219499
40010	NC_020564	TC	3	6	2206439	2206444	0 %	50 %	0 %	50 %	470219499
40011	NC_020564	CGAA	2	8	2206507	2206514	50 %	0 %	25 %	25 %	470219499
40012	NC_020564	TTGAAC	2	12	2206531	2206542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470219499
40013	NC_020564	ATT	2	6	2206543	2206548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219499
40014	NC_020564	ATTT	2	8	2206584	2206591	25 %	75 %	0 %	0 %	470219499
40015	NC_020564	T	8	8	2206589	2206596	0 %	100 %	0 %	0 %	470219499
40016	NC_020564	TA	3	6	2206599	2206604	50 %	50 %	0 %	0 %	470219499
40017	NC_020564	CAT	2	6	2206701	2206706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219499
40018	NC_020564	GCA	2	6	2206790	2206795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219499
40019	NC_020564	GAAG	2	8	2206830	2206837	50 %	0 %	50 %	0 %	470219499
40020	NC_020564	TAC	2	6	2206900	2206905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219499
40021	NC_020564	TAA	2	6	2206909	2206914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219499
40022	NC_020564	CCT	2	6	2206956	2206961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219499
40023	NC_020564	AATT	2	8	2207117	2207124	50 %	50 %	0 %	0 %	470219500
40024	NC_020564	GAA	2	6	2207141	2207146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219500
40025	NC_020564	TTAA	2	8	2207177	2207184	50 %	50 %	0 %	0 %	470219500
40026	NC_020564	TTA	2	6	2207189	2207194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219500
40027	NC_020564	TTC	2	6	2207209	2207214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219500
40028	NC_020564	ATC	2	6	2207240	2207245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219500
40029	NC_020564	GCA	2	6	2207273	2207278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219500
40030	NC_020564	TAA	2	6	2207284	2207289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219500
40031	NC_020564	ACC	2	6	2207308	2207313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219500
40032	NC_020564	AAT	2	6	2207336	2207341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219500
40033	NC_020564	ATA	2	6	2207456	2207461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219500
40034	NC_020564	AAGTA	2	10	2207464	2207473	60 %	20 %	20 %	0 %	470219500
40035	NC_020564	TGT	2	6	2207504	2207509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219500
40036	NC_020564	GCT	2	6	2207537	2207542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219500
40037	NC_020564	GTAA	2	8	2207571	2207578	50 %	25 %	25 %	0 %	470219500
40038	NC_020564	AC	3	6	2207676	2207681	50 %	0 %	0 %	50 %	470219500
40039	NC_020564	AATA	2	8	2207686	2207693	75 %	25 %	0 %	0 %	470219500
40040	NC_020564	CCA	2	6	2207719	2207724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219500
40041	NC_020564	CAA	2	6	2207865	2207870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219500
40042	NC_020564	TAC	2	6	2207887	2207892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219500
40043	NC_020564	ATA	2	6	2207967	2207972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219500
40044	NC_020564	TAAA	2	8	2208024	2208031	75 %	25 %	0 %	0 %	470219500
40045	NC_020564	A	6	6	2208029	2208034	100 %	0 %	0 %	0 %	470219500
40046	NC_020564	GCA	2	6	2208077	2208082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219500
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40049	NC_020564	CATG	2	8	2208251	2208258	25 %	25 %	25 %	25 %	470219500
40050	NC_020564	TGCAT	2	10	2208284	2208293	20 %	40 %	20 %	20 %	470219500
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40052	NC_020564	TAATG	2	10	2208460	2208469	40 %	40 %	20 %	0 %	470219500
40053	NC_020564	AAAAT	2	10	2208483	2208492	80 %	20 %	0 %	0 %	470219500
40054	NC_020564	AC	3	6	2208495	2208500	50 %	0 %	0 %	50 %	470219500
40055	NC_020564	AAATA	2	10	2208505	2208514	80 %	20 %	0 %	0 %	470219500
40056	NC_020564	AATA	2	8	2208527	2208534	75 %	25 %	0 %	0 %	470219500
40057	NC_020564	GTA	2	6	2208563	2208568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219500
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40060	NC_020564	TA	3	6	2208990	2208995	50 %	50 %	0 %	0 %	470219501
40061	NC_020564	ATTG	2	8	2209017	2209024	25 %	50 %	25 %	0 %	470219501
40062	NC_020564	CAA	2	6	2209031	2209036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219501
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40101	NC_020564	AAG	2	6	2211523	2211528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219503
40102	NC_020564	TGT	2	6	2211574	2211579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219503
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40104	NC_020564	TACCTT	2	12	2211725	2211736	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470219503
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40107	NC_020564	TTGT	2	8	2211873	2211880	0 %	75 %	25 %	0 %	470219503
40108	NC_020564	TCA	2	6	2211914	2211919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219503
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40111	NC_020564	T	6	6	2212169	2212174	0 %	100 %	0 %	0 %	470219503
40112	NC_020564	TGCT	2	8	2212176	2212183	0 %	50 %	25 %	25 %	470219503
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40116	NC_020564	TAA	2	6	2212313	2212318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219503
40117	NC_020564	TAA	2	6	2212328	2212333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219503
40118	NC_020564	TAA	2	6	2212355	2212360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219503
40119	NC_020564	TTC	2	6	2212372	2212377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219503
40120	NC_020564	ATT	2	6	2212644	2212649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219504
40121	NC_020564	TGT	2	6	2212850	2212855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219504
40122	NC_020564	CAT	3	9	2212875	2212883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219504
40123	NC_020564	T	6	6	2212890	2212895	0 %	100 %	0 %	0 %	470219504
40124	NC_020564	AAC	2	6	2212972	2212977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219504
40125	NC_020564	ATC	2	6	2213012	2213017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219504
40126	NC_020564	GTA	2	6	2213161	2213166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219504
40127	NC_020564	AAG	2	6	2213177	2213182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219504
40128	NC_020564	ATTTA	2	10	2213233	2213242	40 %	60 %	0 %	0 %	470219504
40129	NC_020564	AGATA	2	10	2213254	2213263	60 %	20 %	20 %	0 %	470219504
40130	NC_020564	TAT	2	6	2213328	2213333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219504
40131	NC_020564	GAT	2	6	2213335	2213340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219504
40132	NC_020564	TCT	2	6	2213342	2213347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219504
40133	NC_020564	CTG	2	6	2213352	2213357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219504
40134	NC_020564	TTG	2	6	2213397	2213402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219504
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40136	NC_020564	GCC	2	6	2213437	2213442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470219504
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40138	NC_020564	CAT	2	6	2213479	2213484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219504
40139	NC_020564	TGTGA	2	10	2213487	2213496	20 %	40 %	40 %	0 %	470219504
40140	NC_020564	CTA	2	6	2213544	2213549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219504
40141	NC_020564	AGT	2	6	2213646	2213651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219504
40142	NC_020564	ATG	2	6	2213710	2213715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219504
40143	NC_020564	TTC	2	6	2213938	2213943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219504
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40145	NC_020564	CCA	2	6	2214020	2214025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219504
40146	NC_020564	AAAAT	2	10	2214026	2214035	80 %	20 %	0 %	0 %	470219504
40147	NC_020564	TTG	3	9	2214087	2214095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219505
40148	NC_020564	GCT	2	6	2214109	2214114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219505
40149	NC_020564	AT	3	6	2214136	2214141	50 %	50 %	0 %	0 %	470219505
40150	NC_020564	ATCT	2	8	2214176	2214183	25 %	50 %	0 %	25 %	470219505
40151	NC_020564	GCT	3	9	2214283	2214291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219505
40152	NC_020564	TTC	2	6	2214309	2214314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219505
40153	NC_020564	GCT	2	6	2214316	2214321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219505
40154	NC_020564	TTA	2	6	2214322	2214327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219505
40155	NC_020564	TAA	2	6	2214339	2214344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219505
40156	NC_020564	ACC	3	9	2214354	2214362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219505
40157	NC_020564	TTTG	2	8	2214382	2214389	0 %	75 %	25 %	0 %	470219505
40158	NC_020564	T	6	6	2214456	2214461	0 %	100 %	0 %	0 %	470219505
40159	NC_020564	TGC	2	6	2214474	2214479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219505
40160	NC_020564	CTTT	2	8	2214505	2214512	0 %	75 %	0 %	25 %	470219505
40161	NC_020564	CTT	3	9	2214518	2214526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219505
40162	NC_020564	GTA	2	6	2214564	2214569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219505
40163	NC_020564	AAT	3	9	2214570	2214578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219505
40164	NC_020564	ACA	2	6	2214583	2214588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219505
40165	NC_020564	ATTC	2	8	2214690	2214697	25 %	50 %	0 %	25 %	470219505
40166	NC_020564	GTG	2	6	2214785	2214790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219505
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40171	NC_020564	ATCC	2	8	2215114	2215121	25 %	25 %	0 %	50 %	470219505
40172	NC_020564	CTG	3	9	2215124	2215132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219505
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40175	NC_020564	ATG	2	6	2215219	2215224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219505
40176	NC_020564	CGG	2	6	2215272	2215277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470219505
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40179	NC_020564	TAA	2	6	2215365	2215370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219505
40180	NC_020564	CCA	2	6	2215402	2215407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219505
40181	NC_020564	CA	3	6	2215442	2215447	50 %	0 %	0 %	50 %	470219505
40182	NC_020564	GCT	2	6	2215450	2215455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219505
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40185	NC_020564	AT	3	6	2215625	2215630	50 %	50 %	0 %	0 %	470219505
40186	NC_020564	AAAT	2	8	2215688	2215695	75 %	25 %	0 %	0 %	470219505
40187	NC_020564	AT	3	6	2215716	2215721	50 %	50 %	0 %	0 %	470219505
40188	NC_020564	CAT	2	6	2215782	2215787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219505
40189	NC_020564	TCA	2	6	2215790	2215795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219505
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40191	NC_020564	TCA	2	6	2216178	2216183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
40192	NC_020564	AGC	2	6	2216219	2216224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219506
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40194	NC_020564	TGC	2	6	2216387	2216392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219506
40195	NC_020564	AAT	2	6	2216526	2216531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219506
40196	NC_020564	TGT	2	6	2216596	2216601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219506
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40198	NC_020564	TCT	2	6	2216637	2216642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219506
40199	NC_020564	CTTT	2	8	2216677	2216684	0 %	75 %	0 %	25 %	470219506
40200	NC_020564	CAT	2	6	2216704	2216709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
40201	NC_020564	CAT	2	6	2216713	2216718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
40202	NC_020564	AGTAA	2	10	2216719	2216728	60 %	20 %	20 %	0 %	470219506
40203	NC_020564	CTA	2	6	2216779	2216784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
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40205	NC_020564	AAT	2	6	2216844	2216849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219506
40206	NC_020564	TAA	2	6	2216900	2216905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219506
40207	NC_020564	TTC	2	6	2216930	2216935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219506
40208	NC_020564	CAT	2	6	2216999	2217004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219506
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40210	NC_020564	TTA	2	6	2217057	2217062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219506
40211	NC_020564	T	6	6	2217085	2217090	0 %	100 %	0 %	0 %	470219506
40212	NC_020564	ATT	2	6	2217105	2217110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219506
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40214	NC_020564	TCA	2	6	2217144	2217149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219507
40215	NC_020564	ATT	2	6	2217152	2217157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219507
40216	NC_020564	CTT	2	6	2217181	2217186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219507
40217	NC_020564	T	7	7	2217215	2217221	0 %	100 %	0 %	0 %	470219507
40218	NC_020564	AACC	2	8	2217289	2217296	50 %	0 %	0 %	50 %	470219507
40219	NC_020564	AAT	2	6	2217383	2217388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
40220	NC_020564	TCA	2	6	2217447	2217452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219507
40221	NC_020564	AAT	2	6	2217593	2217598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
40222	NC_020564	ATA	2	6	2217605	2217610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
40223	NC_020564	TAA	2	6	2217668	2217673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
40224	NC_020564	TAA	2	6	2217688	2217693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219507
40225	NC_020564	TGTT	2	8	2217743	2217750	0 %	75 %	25 %	0 %	470219507
40226	NC_020564	ATGC	2	8	2217805	2217812	25 %	25 %	25 %	25 %	470219507
40227	NC_020564	T	6	6	2217833	2217838	0 %	100 %	0 %	0 %	470219507
40228	NC_020564	ACC	2	6	2217932	2217937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219507
40229	NC_020564	TACT	2	8	2217946	2217953	25 %	50 %	0 %	25 %	470219507
40230	NC_020564	CAT	2	6	2217970	2217975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219507
40231	NC_020564	GGAT	2	8	2218013	2218020	25 %	25 %	50 %	0 %	470219507
40232	NC_020564	GTTAAA	2	12	2218026	2218037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470219507
40233	NC_020564	TCA	2	6	2218095	2218100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219508
40234	NC_020564	T	6	6	2218163	2218168	0 %	100 %	0 %	0 %	470219508
40235	NC_020564	TAA	2	6	2218198	2218203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219508
40236	NC_020564	ATA	2	6	2218212	2218217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219508
40237	NC_020564	TAA	2	6	2218226	2218231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219508
40238	NC_020564	CCA	2	6	2218248	2218253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219508
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40241	NC_020564	TTTA	2	8	2218340	2218347	25 %	75 %	0 %	0 %	470219508
40242	NC_020564	AAC	2	6	2218409	2218414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219508
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40250	NC_020564	TCA	2	6	2219584	2219589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219509
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40261	NC_020564	T	6	6	2219896	2219901	0 %	100 %	0 %	0 %	470219509
40262	NC_020564	CAC	2	6	2219971	2219976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219509
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40333	NC_020564	ATG	2	6	2224532	2224537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219513
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40338	NC_020564	TTG	2	6	2224721	2224726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219513
40339	NC_020564	GAT	2	6	2224745	2224750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219513
40340	NC_020564	CAA	2	6	2224752	2224757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219513
40341	NC_020564	A	7	7	2224769	2224775	100 %	0 %	0 %	0 %	470219513
40342	NC_020564	CTA	2	6	2224884	2224889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219513
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40344	NC_020564	AT	3	6	2224913	2224918	50 %	50 %	0 %	0 %	470219513
40345	NC_020564	AGACTT	2	12	2224951	2224962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470219513
40346	NC_020564	GA	3	6	2225019	2225024	50 %	0 %	50 %	0 %	470219513
40347	NC_020564	TTAT	2	8	2225059	2225066	25 %	75 %	0 %	0 %	470219513
40348	NC_020564	ACA	2	6	2225135	2225140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219513
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40350	NC_020564	A	6	6	2225276	2225281	100 %	0 %	0 %	0 %	470219513
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40468	NC_020564	T	7	7	2233019	2233025	0 %	100 %	0 %	0 %	470219518
40469	NC_020564	ACTT	2	8	2233115	2233122	25 %	50 %	0 %	25 %	470219518
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