MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_020564	AC	3	6	1830478	1830483	50 %	0 %	0 %	50 %	470219243
34002	NC_020564	AGA	2	6	1830494	1830499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219243
34003	NC_020564	GAC	2	6	1830510	1830515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219243
34004	NC_020564	GAT	2	6	1830522	1830527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219243
34005	NC_020564	AAAAG	2	10	1830530	1830539	80 %	0 %	20 %	0 %	470219243
34006	NC_020564	CAA	2	6	1830540	1830545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219243
34007	NC_020564	CAT	2	6	1830555	1830560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219243
34008	NC_020564	AAAC	2	8	1830595	1830602	75 %	0 %	0 %	25 %	470219243
34009	NC_020564	CAA	2	6	1830606	1830611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219243
34010	NC_020564	ATC	2	6	1830667	1830672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219243
34011	NC_020564	TAGA	2	8	1830691	1830698	50 %	25 %	25 %	0 %	470219243
34012	NC_020564	CAAT	2	8	1830823	1830830	50 %	25 %	0 %	25 %	470219244
34013	NC_020564	GAA	3	9	1830839	1830847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219244
34014	NC_020564	CAA	2	6	1830884	1830889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219244
34015	NC_020564	A	6	6	1830926	1830931	100 %	0 %	0 %	0 %	470219244
34016	NC_020564	TGG	2	6	1830949	1830954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219244
34017	NC_020564	TAT	2	6	1830963	1830968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219244
34018	NC_020564	ATC	2	6	1830980	1830985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219244
34019	NC_020564	TGG	2	6	1831024	1831029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470219244
34020	NC_020564	AAG	2	6	1831041	1831046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219244
34021	NC_020564	CAA	2	6	1831149	1831154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219244
34022	NC_020564	AAG	2	6	1831206	1831211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219244
34023	NC_020564	ATA	2	6	1831272	1831277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219244
34024	NC_020564	GTA	2	6	1831311	1831316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219244
34025	NC_020564	A	6	6	1831415	1831420	100 %	0 %	0 %	0 %	470219244
34026	NC_020564	TTTA	2	8	1831438	1831445	25 %	75 %	0 %	0 %	470219244
34027	NC_020564	AAG	2	6	1831451	1831456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219244
34028	NC_020564	A	7	7	1831481	1831487	100 %	0 %	0 %	0 %	470219244
34029	NC_020564	A	6	6	1831499	1831504	100 %	0 %	0 %	0 %	470219244
34030	NC_020564	CAAG	2	8	1831507	1831514	50 %	0 %	25 %	25 %	470219244
34031	NC_020564	CTA	2	6	1831572	1831577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219244
34032	NC_020564	A	6	6	1831683	1831688	100 %	0 %	0 %	0 %	470219244
34033	NC_020564	CAC	2	6	1831755	1831760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219244
34034	NC_020564	AAT	2	6	1831769	1831774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219244
34035	NC_020564	ATG	2	6	1831794	1831799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219244
34036	NC_020564	A	6	6	1831883	1831888	100 %	0 %	0 %	0 %	470219245
34037	NC_020564	CTGC	2	8	1831937	1831944	0 %	25 %	25 %	50 %	470219245
34038	NC_020564	ATA	2	6	1831967	1831972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219245
34039	NC_020564	ACT	2	6	1831987	1831992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219245
34040	NC_020564	ACA	2	6	1832012	1832017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219245
34041	NC_020564	AAG	2	6	1832054	1832059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219245
34042	NC_020564	ATT	2	6	1832239	1832244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219245
34043	NC_020564	TGA	2	6	1832253	1832258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219245
34044	NC_020564	AGA	2	6	1832277	1832282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219245
34045	NC_020564	AGA	2	6	1832358	1832363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219245
34046	NC_020564	CAT	2	6	1832371	1832376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219245
34047	NC_020564	ATA	2	6	1832384	1832389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219245
34048	NC_020564	TAA	2	6	1832454	1832459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219245
34049	NC_020564	AGA	2	6	1832460	1832465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219245
34050	NC_020564	A	6	6	1832484	1832489	100 %	0 %	0 %	0 %	470219245
34051	NC_020564	CAG	2	6	1832492	1832497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470219245
34052	NC_020564	TCATA	2	10	1832963	1832972	40 %	40 %	0 %	20 %	470219246
34053	NC_020564	ATT	2	6	1833041	1833046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219246
34054	NC_020564	TACT	2	8	1833053	1833060	25 %	50 %	0 %	25 %	470219246
34055	NC_020564	TAAA	2	8	1833082	1833089	75 %	25 %	0 %	0 %	470219246
34056	NC_020564	GAT	2	6	1833105	1833110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219246
34057	NC_020564	TAT	2	6	1833111	1833116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219246
34058	NC_020564	TCA	2	6	1833206	1833211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219246
34059	NC_020564	AGAA	2	8	1833289	1833296	75 %	0 %	25 %	0 %	470219246
34060	NC_020564	ATT	2	6	1833342	1833347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219246
34061	NC_020564	ATTG	2	8	1833411	1833418	25 %	50 %	25 %	0 %	470219246
34062	NC_020564	CCA	2	6	1833460	1833465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219246
34063	NC_020564	TAG	2	6	1833493	1833498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219246
34064	NC_020564	ACT	2	6	1833503	1833508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219246
34065	NC_020564	AT	3	6	1833543	1833548	50 %	50 %	0 %	0 %	470219246
34066	NC_020564	T	6	6	1833763	1833768	0 %	100 %	0 %	0 %	470219247
34067	NC_020564	GAA	2	6	1833822	1833827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219247
34068	NC_020564	TTG	2	6	1833840	1833845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219247
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34070	NC_020564	TTTTA	2	10	1833992	1834001	20 %	80 %	0 %	0 %	470219247
34071	NC_020564	CTG	2	6	1834095	1834100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219247
34072	NC_020564	CAA	2	6	1834150	1834155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219247
34073	NC_020564	TAAA	2	8	1834177	1834184	75 %	25 %	0 %	0 %	470219247
34074	NC_020564	TCC	2	6	1834202	1834207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470219247
34075	NC_020564	GTT	2	6	1834249	1834254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219247
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34078	NC_020564	TGA	2	6	1835431	1835436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219248
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34083	NC_020564	AAT	2	6	1835664	1835669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219248
34084	NC_020564	TTGG	2	8	1835689	1835696	0 %	50 %	50 %	0 %	470219248
34085	NC_020564	TTC	2	6	1835726	1835731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219248
34086	NC_020564	AGT	2	6	1835823	1835828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219248
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34089	NC_020564	T	6	6	1836330	1836335	0 %	100 %	0 %	0 %	470219249
34090	NC_020564	T	6	6	1836346	1836351	0 %	100 %	0 %	0 %	470219249
34091	NC_020564	ATCT	2	8	1836396	1836403	25 %	50 %	0 %	25 %	470219249
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34100	NC_020564	GAA	2	6	1836997	1837002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470219250
34101	NC_020564	T	6	6	1837011	1837016	0 %	100 %	0 %	0 %	470219250
34102	NC_020564	GTT	2	6	1837017	1837022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470219250
34103	NC_020564	ATA	2	6	1837134	1837139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219250
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34105	NC_020564	TAA	2	6	1837160	1837165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219250
34106	NC_020564	T	7	7	1837171	1837177	0 %	100 %	0 %	0 %	470219250
34107	NC_020564	TAA	2	6	1837182	1837187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219250
34108	NC_020564	TACA	2	8	1837188	1837195	50 %	25 %	0 %	25 %	470219250
34109	NC_020564	CTA	2	6	1837295	1837300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219250
34110	NC_020564	TCATC	2	10	1837305	1837314	20 %	40 %	0 %	40 %	470219250
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34112	NC_020564	TTTG	2	8	1837399	1837406	0 %	75 %	25 %	0 %	470219250
34113	NC_020564	GTA	2	6	1837454	1837459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470219250
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34116	NC_020564	CTT	3	9	1837657	1837665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219251
34117	NC_020564	T	6	6	1837818	1837823	0 %	100 %	0 %	0 %	470219251
34118	NC_020564	GTC	2	6	1837865	1837870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470219251
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34235	NC_020564	AACT	2	8	1846636	1846643	50 %	25 %	0 %	25 %	470219257
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34333	NC_020564	TAA	2	6	1853512	1853517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219262
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34340	NC_020564	ACAA	2	8	1853915	1853922	75 %	0 %	0 %	25 %	470219262
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34349	NC_020564	TA	3	6	1854850	1854855	50 %	50 %	0 %	0 %	470219263
34350	NC_020564	T	7	7	1854893	1854899	0 %	100 %	0 %	0 %	470219263
34351	NC_020564	TAAT	2	8	1855014	1855021	50 %	50 %	0 %	0 %	470219263
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34353	NC_020564	ATAC	2	8	1855063	1855070	50 %	25 %	0 %	25 %	470219263
34354	NC_020564	AAC	2	6	1855071	1855076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470219263
34355	NC_020564	TAT	2	6	1855114	1855119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470219263
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34472	NC_020564	TAA	2	6	1862877	1862882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470219269
34473	NC_020564	ATC	2	6	1862884	1862889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219269
34474	NC_020564	CTT	2	6	1863078	1863083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470219269
34475	NC_020564	TCA	2	6	1863108	1863113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219269
34476	NC_020564	ACC	2	6	1863145	1863150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219269
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34478	NC_020564	ACC	2	6	1863346	1863351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470219269
34479	NC_020564	ATTT	2	8	1863366	1863373	25 %	75 %	0 %	0 %	470219269
34480	NC_020564	AT	3	6	1863383	1863388	50 %	50 %	0 %	0 %	470219269
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34484	NC_020564	TCA	2	6	1863694	1863699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470219270
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34491	NC_020564	TTAA	2	8	1863979	1863986	50 %	50 %	0 %	0 %	470219270
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