MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020564	ATG	2	6	814116	814121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218538
15002	NC_020564	TCT	2	6	814134	814139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218538
15003	NC_020564	AGC	2	6	814159	814164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218538
15004	NC_020564	ATA	2	6	814302	814307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218538
15005	NC_020564	TTAC	2	8	814380	814387	25 %	50 %	0 %	25 %	470218538
15006	NC_020564	GTG	2	6	814395	814400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218538
15007	NC_020564	CGT	2	6	814430	814435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218538
15008	NC_020564	ATT	2	6	814507	814512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218538
15009	NC_020564	AGA	2	6	814513	814518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218538
15010	NC_020564	TAAA	2	8	814521	814528	75 %	25 %	0 %	0 %	470218538
15011	NC_020564	ATT	2	6	814544	814549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218538
15012	NC_020564	TGA	2	6	814624	814629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218538
15013	NC_020564	ATT	2	6	814679	814684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218538
15014	NC_020564	CTG	2	6	814686	814691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218538
15015	NC_020564	GAT	3	9	814721	814729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218538
15016	NC_020564	AAG	2	6	814779	814784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218538
15017	NC_020564	ATT	2	6	814831	814836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218538
15018	NC_020564	TTA	2	6	814841	814846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218538
15019	NC_020564	AAC	2	6	814854	814859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218538
15020	NC_020564	TTAA	2	8	814883	814890	50 %	50 %	0 %	0 %	470218538
15021	NC_020564	ATT	2	6	815033	815038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218539
15022	NC_020564	GAAGTA	2	12	815090	815101	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470218539
15023	NC_020564	ATC	2	6	815246	815251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218539
15024	NC_020564	ATT	2	6	815261	815266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218539
15025	NC_020564	ATG	2	6	815309	815314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218539
15026	NC_020564	CAAA	2	8	815334	815341	75 %	0 %	0 %	25 %	470218539
15027	NC_020564	TATC	2	8	815373	815380	25 %	50 %	0 %	25 %	470218539
15028	NC_020564	GCA	2	6	815393	815398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218539
15029	NC_020564	TTA	2	6	815405	815410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218539
15030	NC_020564	ATG	2	6	815468	815473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218539
15031	NC_020564	TGG	2	6	815485	815490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218539
15032	NC_020564	GGT	2	6	815648	815653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218539
15033	NC_020564	AGC	2	6	815713	815718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218539
15034	NC_020564	GAA	2	6	815735	815740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218539
15035	NC_020564	CAT	2	6	815763	815768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218539
15036	NC_020564	ACT	2	6	815853	815858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218539
15037	NC_020564	TAG	2	6	815868	815873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218539
15038	NC_020564	AAC	2	6	815934	815939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218539
15039	NC_020564	TAG	2	6	815970	815975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218539
15040	NC_020564	AACA	2	8	815992	815999	75 %	0 %	0 %	25 %	470218539
15041	NC_020564	TTAA	2	8	816047	816054	50 %	50 %	0 %	0 %	470218539
15042	NC_020564	CAG	2	6	816123	816128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218539
15043	NC_020564	AGA	2	6	816154	816159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218539
15044	NC_020564	ACA	2	6	816161	816166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218539
15045	NC_020564	CAAT	2	8	816247	816254	50 %	25 %	0 %	25 %	470218539
15046	NC_020564	ATT	2	6	816274	816279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218539
15047	NC_020564	ATAA	2	8	816324	816331	75 %	25 %	0 %	0 %	470218539
15048	NC_020564	AT	3	6	816651	816656	50 %	50 %	0 %	0 %	470218540
15049	NC_020564	GAG	2	6	816657	816662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470218540
15050	NC_020564	ATT	2	6	816741	816746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218540
15051	NC_020564	ATT	2	6	816748	816753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218540
15052	NC_020564	GATT	2	8	816831	816838	25 %	50 %	25 %	0 %	470218540
15053	NC_020564	TAT	2	6	816867	816872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218540
15054	NC_020564	TCA	2	6	816899	816904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218540
15055	NC_020564	TG	3	6	816927	816932	0 %	50 %	50 %	0 %	470218540
15056	NC_020564	GTTT	2	8	816965	816972	0 %	75 %	25 %	0 %	470218540
15057	NC_020564	ATCA	2	8	816987	816994	50 %	25 %	0 %	25 %	470218540
15058	NC_020564	TTA	2	6	817052	817057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218540
15059	NC_020564	TTG	2	6	817088	817093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218540
15060	NC_020564	CTTT	2	8	817566	817573	0 %	75 %	0 %	25 %	470218541
15061	NC_020564	T	6	6	817571	817576	0 %	100 %	0 %	0 %	470218541
15062	NC_020564	GAA	2	6	817577	817582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218541
15063	NC_020564	TTA	3	9	817598	817606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218541
15064	NC_020564	A	7	7	817659	817665	100 %	0 %	0 %	0 %	470218541
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15067	NC_020564	TTG	2	6	817779	817784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218541
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15069	NC_020564	TTG	3	9	817803	817811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218541
15070	NC_020564	TG	3	6	817884	817889	0 %	50 %	50 %	0 %	470218541
15071	NC_020564	TGA	2	6	818068	818073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218541
15072	NC_020564	TGAT	2	8	818118	818125	25 %	50 %	25 %	0 %	470218541
15073	NC_020564	TA	4	8	818141	818148	50 %	50 %	0 %	0 %	470218541
15074	NC_020564	TGA	2	6	818164	818169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218541
15075	NC_020564	TTA	2	6	818205	818210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218541
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15077	NC_020564	CAAT	2	8	818330	818337	50 %	25 %	0 %	25 %	470218542
15078	NC_020564	AGA	2	6	818338	818343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218542
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15080	NC_020564	TGTCAG	2	12	818373	818384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470218542
15081	NC_020564	AGT	2	6	818408	818413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218542
15082	NC_020564	TTAA	2	8	818432	818439	50 %	50 %	0 %	0 %	470218542
15083	NC_020564	ACAG	2	8	818486	818493	50 %	0 %	25 %	25 %	470218542
15084	NC_020564	A	7	7	818499	818505	100 %	0 %	0 %	0 %	470218542
15085	NC_020564	A	6	6	818558	818563	100 %	0 %	0 %	0 %	470218542
15086	NC_020564	AT	3	6	818604	818609	50 %	50 %	0 %	0 %	470218542
15087	NC_020564	CAA	2	6	818619	818624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218542
15088	NC_020564	GTT	2	6	818744	818749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218542
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15090	NC_020564	TAT	2	6	818803	818808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218542
15091	NC_020564	TAT	2	6	818968	818973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218542
15092	NC_020564	TGA	2	6	819004	819009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218542
15093	NC_020564	AAG	2	6	819018	819023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218542
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15099	NC_020564	GTT	2	6	819383	819388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218542
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15101	NC_020564	ATT	2	6	819455	819460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218542
15102	NC_020564	ACG	2	6	819559	819564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218542
15103	NC_020564	TTTA	2	8	819734	819741	25 %	75 %	0 %	0 %	470218542
15104	NC_020564	TTA	2	6	819792	819797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218542
15105	NC_020564	CAT	2	6	819808	819813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218542
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15107	NC_020564	AAG	3	9	819864	819872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218542
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15109	NC_020564	CAA	2	6	819926	819931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218542
15110	NC_020564	ATG	3	9	819939	819947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218542
15111	NC_020564	AAG	2	6	820077	820082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218542
15112	NC_020564	CGT	2	6	820139	820144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218542
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15114	NC_020564	A	6	6	820178	820183	100 %	0 %	0 %	0 %	470218542
15115	NC_020564	AT	3	6	820189	820194	50 %	50 %	0 %	0 %	470218542
15116	NC_020564	TGA	2	6	820210	820215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218542
15117	NC_020564	TGA	2	6	820309	820314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218542
15118	NC_020564	TTA	2	6	820315	820320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218542
15119	NC_020564	TTG	2	6	820446	820451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218542
15120	NC_020564	TGA	2	6	820549	820554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218542
15121	NC_020564	A	6	6	820568	820573	100 %	0 %	0 %	0 %	470218542
15122	NC_020564	TAA	2	6	820603	820608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218542
15123	NC_020564	CGT	2	6	820673	820678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218542
15124	NC_020564	A	6	6	820682	820687	100 %	0 %	0 %	0 %	470218542
15125	NC_020564	AGC	2	6	820690	820695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218542
15126	NC_020564	ACT	2	6	823190	823195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218543
15127	NC_020564	GTC	2	6	823199	823204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218543
15128	NC_020564	CTTTT	2	10	823214	823223	0 %	80 %	0 %	20 %	470218543
15129	NC_020564	TC	3	6	823228	823233	0 %	50 %	0 %	50 %	470218543
15130	NC_020564	GTTCTT	2	12	823234	823245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470218543
15131	NC_020564	T	6	6	823244	823249	0 %	100 %	0 %	0 %	470218543
15132	NC_020564	CTT	2	6	823255	823260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218543
15133	NC_020564	TTCTTT	2	12	823265	823276	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470218543
15134	NC_020564	CTT	2	6	823285	823290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218543
15135	NC_020564	TCT	2	6	823368	823373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218543
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15137	NC_020564	T	6	6	823493	823498	0 %	100 %	0 %	0 %	470218543
15138	NC_020564	ATTT	2	8	823525	823532	25 %	75 %	0 %	0 %	470218543
15139	NC_020564	ATC	2	6	823544	823549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218543
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15141	NC_020564	T	6	6	823607	823612	0 %	100 %	0 %	0 %	470218543
15142	NC_020564	AT	3	6	823638	823643	50 %	50 %	0 %	0 %	470218543
15143	NC_020564	TGA	2	6	823666	823671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218543
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15145	NC_020564	T	8	8	823743	823750	0 %	100 %	0 %	0 %	470218543
15146	NC_020564	TTC	2	6	823769	823774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218543
15147	NC_020564	TTC	2	6	823781	823786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218543
15148	NC_020564	TCTT	2	8	823797	823804	0 %	75 %	0 %	25 %	470218543
15149	NC_020564	CT	3	6	823818	823823	0 %	50 %	0 %	50 %	470218543
15150	NC_020564	T	7	7	823823	823829	0 %	100 %	0 %	0 %	470218543
15151	NC_020564	TGA	2	6	823839	823844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218543
15152	NC_020564	TAA	2	6	823877	823882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218543
15153	NC_020564	T	6	6	823895	823900	0 %	100 %	0 %	0 %	470218543
15154	NC_020564	TAT	2	6	824542	824547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218544
15155	NC_020564	TTTAT	2	10	824551	824560	20 %	80 %	0 %	0 %	470218544
15156	NC_020564	TCAGTT	2	12	824567	824578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470218544
15157	NC_020564	TTA	2	6	824633	824638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218544
15158	NC_020564	AGA	2	6	824680	824685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218544
15159	NC_020564	CAT	3	9	824687	824695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218544
15160	NC_020564	TA	3	6	824712	824717	50 %	50 %	0 %	0 %	470218544
15161	NC_020564	TGC	2	6	824731	824736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218544
15162	NC_020564	A	7	7	824738	824744	100 %	0 %	0 %	0 %	470218544
15163	NC_020564	A	6	6	824786	824791	100 %	0 %	0 %	0 %	470218544
15164	NC_020564	AAG	2	6	824814	824819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218544
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15167	NC_020564	AGAA	2	8	824860	824867	75 %	0 %	25 %	0 %	470218544
15168	NC_020564	AAT	2	6	824876	824881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218544
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15173	NC_020564	TAG	2	6	825312	825317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218545
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15177	NC_020564	TAT	2	6	825530	825535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218545
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15181	NC_020564	A	6	6	825681	825686	100 %	0 %	0 %	0 %	470218545
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15220	NC_020564	TAGT	2	8	827887	827894	25 %	50 %	25 %	0 %	470218547
15221	NC_020564	TTTAG	2	10	827931	827940	20 %	60 %	20 %	0 %	470218547
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15225	NC_020564	ATA	2	6	828256	828261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218547
15226	NC_020564	ATA	2	6	828457	828462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218547
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15228	NC_020564	A	6	6	828569	828574	100 %	0 %	0 %	0 %	470218547
15229	NC_020564	TTA	2	6	828626	828631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218547
15230	NC_020564	ATTTC	2	10	828675	828684	20 %	60 %	0 %	20 %	470218547
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15234	NC_020564	GTT	2	6	828912	828917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218547
15235	NC_020564	AAC	2	6	828922	828927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218547
15236	NC_020564	TGA	2	6	828929	828934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218547
15237	NC_020564	GATTCA	2	12	829071	829082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
15238	NC_020564	GATTCA	2	12	829107	829118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
15239	NC_020564	GATTCA	2	12	829125	829136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
15240	NC_020564	GATTCA	2	12	829143	829154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
15241	NC_020564	GATTCA	2	12	829179	829190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
15242	NC_020564	GATTCA	2	12	829197	829208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
15243	NC_020564	GATTCA	2	12	829215	829226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
15244	NC_020564	GCGA	2	8	829227	829234	25 %	0 %	50 %	25 %	470218547
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15248	NC_020564	GATTCA	2	12	829557	829568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
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15252	NC_020564	GACTCA	2	12	829665	829676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218547
15253	NC_020564	GATTCA	2	12	829755	829766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
15254	NC_020564	GACTCA	2	12	829791	829802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218547
15255	NC_020564	GATTCA	2	12	829809	829820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470218547
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15481	NC_020564	A	7	7	846094	846100	100 %	0 %	0 %	0 %	470218559
15482	NC_020564	AGA	2	6	846109	846114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218559
15483	NC_020564	ATT	2	6	846159	846164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218559
15484	NC_020564	GAA	2	6	846216	846221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218559
15485	NC_020564	CAT	2	6	846239	846244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218559
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15489	NC_020564	TATG	2	8	846382	846389	25 %	50 %	25 %	0 %	470218559
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